Cartographie des zones à risque stomoxes : Stomoxys calcitrans et Stomoxys niger

Jallerat Titouan. 2017. Cartographie des zones à risque stomoxes : Stomoxys calcitrans et Stomoxys niger. Saint-Denis : Université de la Réunion, 42 p. Mémoire de master 2 : Ressources et risques naturels des environnements tropicaux. Sciences de la terre, des planètes et de l'environnement : Université de la Réunion

Encadrement : Dernburg, Ann ; Tran, Annelise

Résumé : Le Groupement de Défense Sanitaire (GDS) de La Réunion, une association d'éleveurs créée en 1988, est reconnu Organisme à Vocation Sanitaire depuis juin 2012. Le GDS, en tant que repésentant des éleveurs, est un interlocuteur de l'Etat français et représente les éleveurs en matière d'amélioration et de protection sanitaire du cheptel réunionnais. Il existe 18 espèces de stomoxes dans le monde mais seulement deux d'entre elles se trouvent sur l'île de la Réunion : Stomoxys calcitrans et S. niger. Ce sont des mouches piqueuses hématophages diurnes et des vecteurs mécaniques de nombreux agents pathogènes à l'origine de maladies pour les bovins, comme l'anaplasmose (due à Anaplasma marginale). Malgré des moyens de lutte permettant de diminuer le nombre de stomoxes, les pertes économiques restent très importantes dans les filières bovines réunionnaises. Des techniques de prédiction du nombre de stomoxes en fonction de critères environnementaux tels que la température ou l'humidité pourraient contribuer à cibler les efforts de lutte contre ces ectoparasites. La géomatique a été utilisée pour cartographier la distribution de la maladie et du vecteur mais aussi rechercher des modèles prédictifs. Pour cela, il a fallu rassembler des données environnementales, climatiques, entomologiques et épidémiologiques obtenues sur le terrain ou par télédétection puis les intégrer dans un Système d'Information Géographique (SIG). Nous avons tout d'abord essayé de caractériser la signature spectrale des lieux de pontes en utilisant une image satellite SPOT6 du catalogue de SEAS-OI. Ensuite, nous avons cartographié le risque de stomoxes à partir d'un comptage par captures et d'un sondage sérologique d'anaplasma afin de le modéliser à l'échelle régionale. Ces travaux ont été effectués avec les logicels QGIS 2.16.3 Nødebo et RStudio. Les résultats montrent que la signature spectrale des lieux de ponte des stomoxes ne diffère que très peu de la plupart des types d'occupation du sol. En revanche, les cartographies donnent une vision claire des lieux de prolifération des stomoxes ou des séroprévalence d'anaplasma. La modélisation, quant à elle, a permis d'obtenir une carte de population de stomoxes sur toute la région.

Résumé (autre langue) : The Health Protection Association (GDS) of Réunion Island, an organization of breeders created in 1988, is recognized health organization since June 2012. The GDS, as a breeder's representative, is an interlocutor of the french State and represents breeders in terms of sanitary improvement and protection quality of cattle from Reunion. 18 species of stomoxes exist in the world but only two of them was in Réunion Island : S. calcitrans and S. niger. They are diurnal hematophagous sticky fly and the mechanical vectors of numerous pathogens at the origin of diseases for cattle, like anaplasma (due to the marginal anaplasma). In spite of existing means of struggle to decrease the number of stable fly, the economic losses remain very important in the Reunion beef industry. Techniques of prediction of the number of stomoxes according to environmental criteria such as temperature or humidity could contribute to focus efforts to stabble these pests. The geomatic was used to map the distribution of the disease and the vector but also to create predictive models. So it is necessary to gather environmental, climatic, entomological and epidemiological data obtained in the field or by the remote sensing then integrate them into Geographical Information System (GIS). First of all, we tried to characterize the spectral signature of egg laying sites using SPOT6 satellite image of the SEAS-OI catalog. After that, we mapped the stable fly risk from a counting by captures and from the serological survey of anaplasma, in order to model it on a regional scale. This work was done with the softwares QGIS 2.16.3 Nødebo and RStudio. The results show that the spectral signature of stomoxes egg laying sites differs only very few from most types of land use. On the other hand, the mappings give a clear vision of the places of proliferation of stable fly or case of anaplasma. The modelling allowed to obtain a card of population of stomoxes on all the region.

Mots-clés libres : Télédétection, Modélisation, Cartographie, Stomoxes, Île de La Réunion

Auteurs et affiliations

• Jallerat Titouan, Université de la Réunion (REU)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/600341/)

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