Molecular characterization of Cordyline virus 1 isolates infecting yam (Dioscorea spp)

Diouf Mame Boucar, Gaspard Olyvia, Marais Armelle, Filloux Denis, Gomez Rose-Marie, Faure Chantal, Roumagnac Philippe, Candresse Thierry, Theil Sébastien, Contreras Sandy, Teycheney Pierre-Yves, Umber Marie. 2022. Molecular characterization of Cordyline virus 1 isolates infecting yam (Dioscorea spp). Archives of Virology, 167 : 2275-2280.

https://doi.org/10.1007/s00705-022-05535-2

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact

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Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MZ648045

Résumé : Cordyline virus 1 (CoV1) is a velarivirus that has so far only been reported in ornamental Ti plants (Cordyline fruticosa). Using high-throughput sequencing, we identified CoV1 infection in yam accessions from Vanuatu. Using a specific RT-PCR assay, we found that CoV1 is also present and highly prevalent in Dioscorea alata, D. cayenensis, and D. trifida in Guadeloupe. Phylogenetic analysis showed that CoV1 isolates infecting yam in Guadeloupe display a low level of molecular diversity. These data provide insights into the transmission of CoV1 in yam in Guadeloupe.

Mots-clés Agrovoc : Closteroviridae, Clostérovirus, Dioscorea, génétique moléculaire, Transcription inverse, PCR, séquençage à haut débit

Mots-clés géographiques Agrovoc : Vanuatu, Guadeloupe, France

Mots-clés complémentaires : Cordyline Virus 1 (CoV1)

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

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