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Partial endoreplication challenges whole genome assembly: the case of Vanilla planifolia (Orchidaceae)

Piet Quentin, Droc Gaëtan, Marande William, Sarah Gautier, Bocs Stéphanie, Klopp Christophe, Bourge Mickael, Siljak-Yakovlev Sonja, Bouchez Olivier, Lopez-Roques Céline, Lepers-Andrzejewski Sandra, Bourgois Laurent, Zucca Joseph, Dron Michel, Besse Pascale, Grisoni Michel, Jourda Cyril, Charron Carine. 2022. Partial endoreplication challenges whole genome assembly: the case of Vanilla planifolia (Orchidaceae). In : Exploring the latest developments in omic technologies, breeding techniques and the application of ai in bioinformatics and phenotyping. The Hague : s.n., 1 poster Plant Genomics and Gene Editing Congress: Europe. 9, The Hague, Pays-Bas, 11 Avril 2022/12 Avril 2022.

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Auteurs et affiliations

  • Piet Quentin, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
  • Droc Gaëtan, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0003-1849-1269
  • Marande William, CNRGV (FRA)
  • Sarah Gautier, INRAE (FRA)
  • Bocs Stéphanie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0001-7850-4426
  • Klopp Christophe, INRAE (FRA)
  • Bourge Mickael, CNRS (FRA)
  • Siljak-Yakovlev Sonja, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Bouchez Olivier, INRAE (FRA)
  • Lopez-Roques Céline, INRAE (FRA)
  • Lepers-Andrzejewski Sandra, Etablissement vanille de Tahiti (PYF)
  • Bourgois Laurent, Eurovanille (FRA)
  • Zucca Joseph, V. Mane Fils (FRA)
  • Dron Michel, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Besse Pascale, Université de la Réunion (REU)
  • Grisoni Michel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (MDG) ORCID: 0000-0001-9867-9098
  • Jourda Cyril, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0002-7799-3501
  • Charron Carine, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0003-0281-9936

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/601692/)

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