Analyse moléculaire de la diversité des vers de terre arboricoles endémiques de Martinique

Brunet Carla-Marie. 2021. Analyse moléculaire de la diversité des vers de terre arboricoles endémiques de Martinique. Toulouse : Université Toulouse III Paul Sabatier, 30 p. Mémoire de master 2 : Ecologie et évolution : Université Toulouse 3 - Paul Sabatier

Encadrement : Dupont, Lise ; Coulis, Mathieu

Résumé : La Martinique est une zone insulaire possédant deux vastes zones naturelles protégées qui peuvent être considérées comme des réservoirs de biodiversité : la Montagne Pelée et les Pitons du carbet. Le premier objectif de ce stage était de combler le manque de connaissances taxonomiques chez les espèces de vers de terre tropicaux en estimant la diversité spécifique présente en Martinique. Cette analyse a été réalisée en utilisant une méthode de code barre ADN (ou barcoding ADN) en se focalisant sur les espèces de vers qui ne vivent pas au sol mais qui occupent des micro-habitats à des hauteurs plus élevées de la canopée ; elles sont qualifiées d'espèces " arboricoles ". Une étude de l'effet de la pression anthropique sur la diversité des espèces arboricoles dans les zones perturbées par l'activité humaine a ensuite été réalisée. Un résultat majeur de cette analyse est la présence en forte abondance de Dichogaster andina, espèce supposée invasive, dans les micro-habitats récoltés au niveau du sol et jusqu'à 6,8 mètres de hauteur dans la canopée. Ce succès de colonisation peut être expliqué par un mode de reproduction parthénogénétique tel que c'est le cas pour d'autres espèces invasives de vers de terre comme Pontoscolex corethrurus. Trois espèces putatives ont été identifiées et sont probablement endémiques de l'île, mais leur présence est rare dans la zone échantillonnée. Ces espèces sont présentes uniquement dans des zones préservées à fort couvert forestier et ne sont pas observées dans la matrice agricole où, au contraire, D. andina est très abondante. Ces résultats suggèrent un remplacement des espèces natives par D. andina . L'absence de ces espèces putatives " arboricoles " en zones anthropisées permet de penser que leur capacité à disperser entre les deux réservoirs de biodiversité est compromise dans les zones à fortes pressions anthropiques.

Résumé (autre langue) : The island of Martinique in the Lesser Antilles has two vast protected natural areas in which can be found a huge pool of biodiversity: La “montagne Pelée” and “les Pitons du Carbet”. The first objective of this internship was to fill the lack of taxonomic knowledge in tropical earthworm taxonomy with an assess of the Martinique species diversity. This analysis was carried out using a method of DNA barcoding, focusing on species of worms that do not live-in soil, but which occupy micro-habitats at higher levels in the canopy; they are called "arboricolous" species. A study of the effect of anthropogenic pressures on the diversity of arboricolous species in areas disturbed by human activity was carried out. A major result of this analysis is the presence in high abundance of Dichogaster andina, probably an invasive species. This species have been found in micro-habitats collected at ground level and up to 6.8 meters high in the canopy. This colonization success can be explained by a parthenogenetic mode of reproduction, it has been already reported for others invasive earthworm species such as Pontoscolex corethrurus. Three putative species have been identified and are probably endemic of the island, but their presence is rare in the sampled area. These species are present only in preserved zones with high forest cover and are not observed where agriculture activities are important, the opposite situation was observed with D. andina. These results suggest a replacement of the three native species by D. andina. The absence of these putative "arboricolous" species in perturbed areas suggests that their ability to disperse between the two reservoirs of biodiversity is compromised in areas with strong anthropogenic pressure.

Mots-clés libres : Vers de terre, Arboricole, Biodiversité, Barcoding, Invasive species, Martinique, Antilles, Caribbean

Auteurs et affiliations

• Brunet Carla-Marie, Université Toulouse III Paul Sabatier (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/602287/)

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