État des lieux et caractérisation de l'antibiorésistance des enterobacteriaceae des carnivores domestiques errants, divagants et confinés sur l'Île de La Réunion

Rabaly Clément. 2023. État des lieux et caractérisation de l'antibiorésistance des enterobacteriaceae des carnivores domestiques errants, divagants et confinés sur l'Île de La Réunion. Toulouse : ENVT, 55 p. Mémoire de master 2 : Gestion intégrée des zoonoses et maladies animales tropicales : Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse

Encadrement : Squarzoni, Cécile ; Albrechtova, Katerina

Résumé : L'antibiorésistance (ABR) est une menace pour la santé humaine, animale et environnementale. L'île de La Réunion est un terrain d'étude intéressant, du fait de son climat subtropical propice à la prolifération bactérienne, de sa densité de population humaine et animale associée à un fort taux d'errance, et des échanges que l'île entretient avec des territoires africain et asiatique particulièrement touchés par ce phénomène. L'étude réalisée dans le cadre de ce stage a pour but de mettre en évidences les caractéristiques phénotypiques et épidémiologiques des résistances aux Bêta-Lactamines de Spectre Étendu (BLSE) et aux Carbapénémases des enterobacteriaceae chez les chiens et chats de l'île, en étudiant les populations domestiques confinées, divagantes et errantes dont l'accès au prélèvement est rendu possible par un programme associatif de stérilisation et la collaboration de 14 cliniques vétérinaires. Les analyses des phénotypes de résistance, réalisées sur la base de milieux de cultures sélectifs et d'antibiogrammes sont comparées aux données collectées parallèlement chez l'Homme par le CHU de La Réunion. Elles ont permis d'isoler certains phénotypes d'intérêt soumis à des analyses moléculaires permettant d'identifier et de comparer les gènes de résistance impliqués. Les résultats mettent en évidence une prévalence de portage d'enterobacteriaceae multi résistantes de 8,6% (IC 95% [5.71 ; 11.51]) chez le chien et de 3,6% (IC 95% [0.76 ; 6.38]) chez le chat. Les analyses ont permis d'isoler pour la première fois chez l'animal à La Réunion, une souche d'Enterobacter cloacae porteuse du gène blaIMI-4 de résistance aux carbapénèmes. Les résultats préliminaires sont cohérents avec un partage de gènes de résistance entre le compartiment humain et animal.

Résumé (autre langue) : Antimicrobial resistance (AMR) is a threat for human, animal and environmental health. La Réunion island is an interesting context to study this phenomenon because of its tropical climate suitable for bacterial growth, its high human and animal population density associated with high proportion of stray animals, and the Island's exchanges with countries with high occurrence of AMR. The study carried out in frame of this internship aims to increase the knowledge about AMR of dogs and cats of the Island, studying house or garden-confined, roaming and stray animals. Sampling of such specific population have been permitted by an associative program of animal sterilization and control and large collaboration with 14 private veterinary clinics. Phenotypic and genotypic analysis of resistance determinants, using selective-growth media, antibiograms and sequencing, are compared with analogous data collected on Human-originating strains obtained in routine diagnosis in La Réunion public hospital. Results show an estimated 8,6% (IC 95% [5.71 ; 11.51] prevalence of multi-resistant enterobacteriaceae among dogs, and 3,6% (IC 95% [0.76 ; 6.38]) among cats. Analysis performed allowed the first isolation of an Enterobacter cloacae strain carrying blaIMI-4, in La Réunion Island. Molecular analysis of phenotypically similar strains originating from human and animal populations is suggestive of possible transmissions occurring between these two populations.

Mots-clés libres : Antibiorésistance, One Health, Errance animale, Surveillance, Genotype

Auteurs et affiliations

• Rabaly Clément, ENVT (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/605636/)

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