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Influence de covariables climatiques et paysagères sur l'entomofaune des agrosystèmes canniers et leurs interactions

Komendanczyk Laurine. 2023. Influence de covariables climatiques et paysagères sur l'entomofaune des agrosystèmes canniers et leurs interactions. Rennes : Institut Agro Rennes-Angers, 31 p. Mémoire de fin d'études : Institut agro Rennes-Angers

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Encadrement : Soti, Valérie ; Heuclin, Benjamin

Résumé : Aujourd'hui, l'emploi d'intrants est une méthode répandue d'optimisation de productivité des cultures. Dans les agrosystèmes canniers de la Réunion, le projet Territoires Durables s'intéresse à la mise en place d'une méthode alternative raisonnée : la lutte biologique par conservation. Depuis début 2022, des relevés faunistiques et floristiques ont été réalisés chaque semaine sur 16 parcelles situées dans 2 contextes paysagers choisis (canne majoritaire ou diversifié). Durant ce stage, une méthode d'analyse conjointe de données de comptages multivariées a été appliquée sur les abondances d'insectes en 2022. Les insectes d'intérêt pour la canne ont été regroupés par ressemblance et par fonction dans l'agrosystème. Le modèle Poisson Log-Normal multivarié a été mis en oeuvre afin d'étudier séparément les interactions directes entre des groupes d'insectes et l'effet de 5 covariables (température, pluie, altitude, paysage, mois). Des pénalisations lasso ont été effectuées sur la matrice de précision de différents modèles (PLN-network) afin de comparer les corrélations résiduelles entre les groupes d'insectes via des graphes en réseau. D'après les premiers résultats, le paysage favorisait la présence de ravageurs de la canne, et la saison fraîche entraînerait une baisse de l'abondance de la plupart des insectes. Les graphes en réseau sont pour le moment difficilement interprétables. Par la suite, une réflexion approfondie sur le choix des données de départ, les procédures de sélection de modèle et la prise en compte de la spatio-temporalité des données devra être effectuée.

Résumé (autre langue) : Nowadays, farm inputs are widely used to optimize crop productivity. In sugarcane agrosystems in La Réunion, France, the Territoires Durables project aims at introducing a new sustainable substitute method: conservation biological control. Since early 2022, faunistic and floristic surveys have been carried weekly on 16 plots located in two chosen landscape contexts (mostly sugarcane or diversified). During this internship, a joint analysis method on multivariate count data has been applied on 2022 arthropods count data. Insects of interest for sugarcane have been grouped by similarity and function in the agrosystem. A multivariate Poisson Lognormal model has been used in order to distinctly study the influence of 5 covariates (temperature, rain, elevation, landscape, month) and direct interactions between insect groups. Lasso shrinkage has been applied to the precision matrix of several models (PLN-network) in order to compare residual correlations between insect groups with network graphs. The first results showed that the landscape favored the presence of sugarcane pests, and that the cool season led to a drop in the abundance of most insects. Network graphs are currently hardly interpretable. After that, a deeper work on the dataset choice, the model selection procedures and the spatio-temporal nature of the data will have to be taken into account.

Mots-clés libres : Interactions entre espèces, Données de comptage, Modèle Poisson Log-Normal, Covariables environnementales, Canne à sucre

Auteurs et affiliations

  • Komendanczyk Laurine, Institut agro Rennes-Angers (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/607399/)

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