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Identification des éléments génétiques du virus West Nile impliqués dans la transmission vectorielle et dans la virulence chez l'hôte

Fiacre Lise. 2023. Identification des éléments génétiques du virus West Nile impliqués dans la transmission vectorielle et dans la virulence chez l'hôte. Pointe-à-Pitre : Université des Antilles, 354 p. Thèse de doctorat : Biologie cellulaire et moléculaire : Université des Antilles

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Version publiée - Français
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Encadrement : Albina, Emmanuel ; Lecollinet, Sylvie ; Gonzalez, Gaëlle ; Pagès, Nonito

Résumé : Le virus West Nile (VWN) est un virus neurotrope du genre flavivirus retrouvé sur l'ensemble de la surface du globe. Il est entretenu dans un cycle faisant intervenir les oiseaux comme hôtes amplificateurs et les moustiques, principalement du genre Culex, comme vecteurs. La sévérité des cas d'infection chez l'Homme, le cheval et dans l'avifaune varie en fonction des souches de virus et en fonction de l'hôte considéré. Il est de ce fait responsable de foyers d'intensité variable chez les hôtes vertébrés comme ça a été le cas en Israël en 1998 (fortement pathogène, nombreux cas humains et cas aviaires) et en Italie en 2008 (faiblement pathogène, quelques cas humains). L'importance des épizooties ou des épidémies liées au VWN peuvent s'expliquer par une différence de virulence et de pathogenèse des souches. C'est dans ce contexte que nous avons caractérisé les déterminants moléculaires de virulence du VWN entre les souches Israël 1998 et Italie 2008. Nous avons généré plusieurs chimères virales entre les souches Israël 1998 et Italie2008 et un mutant dans la partie hélicase de la protéine non structurale 3 (NS3P249T) par des méthodes de génétique inverse classique (clone infectieux) ou récemment développée (ISA -Infectious Subgenomic Amplicons). La mutation NS3P249T réduit très fortement la réplication du virus West Nile dans les modèles cellulaires testés (Vero, Aag2), ainsi que la virulence chez un hôte aviaire naturel (corneille, Corvus corone) et dans un modèle mammifère (souris BALB/c). La capacité réplicative des chimères a d'une part été étudiée in vitro sur des cellules de mammifères Vero et cellules de moustiques C6/36. L'infection de cellules Vero suggère un rôle des protéinesNS3, NS4A, NS4B et NS5 dans la modulation de la réplication virale 24h et 48h après infection alors que la protéine NS5 et la région 3'UTR seraient celles impliquées dans la fitness des chimères enC6/36. Ces résultats suggèrent un rôle différent des protéines dans la réplication des souches en fonction de l'hôte considéré. L'analyse in vivo après infection de souris BALB/c, de jeunes poussins ainsi que par le gorgement de moustiques Culex pipiens a permis d'approfondir ces observations,permettant de mieux comprendre le rôle des protéines virales dans la pathogenèse du virus afin de proposer de nouvelles solutions vaccinales contre le VWN.

Résumé (autre langue) : West Nile virus (WNV) is a neurotropic flavivirus with a worldwide distribution. It persists in a cycle involving birds as amplifying hosts and mosquitoes, mainly of the Culex genus, as vectors.The severity of WNV infection in humans, horses and birds varies according to virus strain and host.It is indeed responsible for outbreaks with varying severity in vertebrate hosts, as for example in Israel in 1998 (highly pathogenic, numerous human and avian cases) and in Italy in 2008 (weakly pathogenic, a few human cases). The importance of WNV epizootics or epidemics can be explained by differences in strains virulence and pathogenesis. In this context, we characterized the virulence and molecular determinants of WNV virulence in Israel 1998 and Italy 2008 WNV strains. We generated several viral chimeras between both strains, and a mutant in the helicase part of non-structural protein 3(NS3-P249T), using conventional reverse genetics (infectious clone) or recently developed methods(ISA - Infectious Subgenomic Amplicons). The NS3-P249T mutation greatly reduced West Nilevirus replication in the cell models tested (Vero, Aag2), as well as virulence in a natural avian host(crow, Corvus corone) and in a mammalian model (BALB/c mouse). The replicative capacity of chimeras was analyzed in vitro on mammalian Vero cells and C6/36 mosquito cells. Infection of Vero cells suggested a role for NS3, NS4A, NS4B and NS5 in modulating viral replication 17 and24h after infection, while NS5 and the 3'UTR region were implicated in chimera fitness in C6/36.These results suggest a different role for proteins in strain replication, depending on the host considered. In vivo analysis after infection of BALB/c mice, young chickens and Culex pipiens mosquitoes has enabled us to extend these observations, providing a better understanding of the role of viral proteins in the pathogenesis of the virus, with the aim to propose new preventive vaccines against WNV.

Auteurs et affiliations

  • Fiacre Lise, CIRAD-BIOS-UMR ASTRE (GLP)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/609867/)

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