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Bioinformatics solutions for addressing post-processing challenges in Nanopore sequencing data. Filloux Denis, Fernandez Emmanuel, Mahe Frédéric, Roumagnac Philippe. 2025. In : 20e Rencontres de virologie végétale (RVV2025). Résumés. SFV, Université de Liège, INRAE, SFP, Université de Montpellier. Aussois : SFV, Résumé, p. 106 Rencontres de virologie végétale (RVV2025). 20, Aussois, France, 19 Janvier 2025/23 Janvier 2025.

Using anti-dsRNA antibody and Nanopore sequencing for characterizing mycoviruses infecting the rice blast fungus Pyricularia oryzae. Blondin Laurence, Filloux Denis, Fernandez Emmanuel, Adreit Henri, Tharreau Didier, Roumagnac Philippe. 2025. In : 20e Rencontres de virologie végétale (RVV2025). Résumés. SFV, Université de Liège, INRAE, SFP, Université de Montpellier. Aussois : SFV, Résumé, p. 73 Rencontres de virologie végétale (RVV2025). 20, Aussois, France, 19 Janvier 2025/23 Janvier 2025.

Nanopore sequencing is a credible alternative to recover complete genomes of geminiviruses. Ben Chehida Sélim, Filloux Denis, Fernandez Emmanuel, Moubset Oumaima, Hoareau Murielle, Julian Charlotte, Blondin Laurence, Lett Jean-Michel, Roumagnac Philippe, Lefeuvre Pierre. 2021. Microorganisms, 9:903, 15 p.