The genome of Theobroma cacao

Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pitollat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. The genome of Theobroma cacao. Nature Genetics, 43 (2) : 101-108.

https://doi.org/10.1038/ng.736

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact

Version publiée - Anglais
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Quartile : Outlier, Sujet : GENETICS & HEREDITY

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : We sequenced and assembled the draft genome of #Theobroma cacao#, an economically important tropical-fruit tree crop that is the source of chocolate. This assembly corresponds to 76% of the estimated genome size and contains almost all previously described genes, with 82% of these genes anchored on the 10 #T. cacao# chromosomes. Analysis of this sequence information highlighted specific expansion of some gene families during evolution, for example, flavonoid-related genes. It also provides a major source of candidate genes for #T. cacao# improvement. Based on the inferred paleohistory of the #T. cacao# genome, we propose an evolutionary scenario whereby the ten #T. cacao# chromosomes were shaped from an ancestor through eleven chromosome fusions.

Mots-clés Agrovoc : Theobroma cacao

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations