Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune

Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique. 2012. Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune. In : La canne à sucre source de développement et d'innovation : Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, 10-14 septembre 2012, Saint Denis, La Rénion et du 15 au 19 septembre 2012 à Maurice. ARTAS ; AFCAS. s.l. : s.n., 10 p. Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, Saint Gilles, Réunion, 10 Septembre 2012/14 Septembre 2012.

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Résumé : Les cultivars modernes de canne à sucre (Saccharum spp., 2n=100 à 130) sont hautement polyploïdes, aneuploïdes et d'origine interspécifique. Un gène majeur (Bru1) conférant la résistance à la rouille brune, causée par le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Nous avons analysé 380 cultivars modernes et clones en cours de sélection, représentatifs de la diversité mondiale, à l'aide de 22 marqueurs moléculaires regroupés dans un segment de 8,2cM génétiquement lié à Bru1 chez R570. Nos résultats révèlent un fort déséquilibre de liaison dans la région autour de Bru1 et de fortes associations entre la plupart des marqueurs et la résistance à la rouille. Deux marqueurs PCR flanquant le segment portant Bru1 sont complètement associés et sont présents uniquement chez les clones résistants. Ces marqueurs constituent des marqueurs moléculaires diagnostics de Bru1. 86% des 194 clones de canne à sucre résistants possèdent les marqueurs diagnostics de Bru1, révélant que ce gène constitue la principale source de résistance à la rouille brune chez les cultivars modernes. Les marqueurs PCR diagnostics de Bru1 devraient être particulièrement utiles pour identifier des cultivars possédant des sources de résistance alternatives à Bru1 afin de diversifier la base génétique de la résistance à la rouille brune dans les programmes de sélection.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

• Costet Laurent, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0003-3199-2885
• Le Cunff Loïc, INRA (FRA)
• Royaert Stefan
• Raboin Louis-Marie, CIRAD-PERSYST-UPR SCA (MDG) ORCID: 0000-0002-8749-0406
• Hervouet Catherine, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
• Toubi Lyonel, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (GLP)
• Telismart Hugues, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
• Garsmeur Olivier, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0001-8869-3689
• Rousselle Yves, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
• Pauquet Jérôme
• Nibouche Samuel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0003-2675-1382
• Glaszmann Jean-Christophe, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0001-9918-875X
• Hoarau Jean-Yves, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (GLP) ORCID: 0000-0001-9734-4165
• D'Hont Angélique, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/568747/)

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