Mignon-Grasteau Sandrine, Carré Bernard, Gabriel Irène, Rideau Nicole, Chantry-Darmon Céline, Boscher Marie-Yvonne, Bastianelli Denis, Sellier Nadine, Chabault Marie, Le Bihan-Duval Elisabeth, Narcy Agnès.
2015. Détection de QTL pour des caractères liés aux rejets chez le poulet de chair.
In : Onzièmes journées de la recherche avicole et palmipèdes à foie gras. ITAVI
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Résumé : L'efficacité digestive influe fortement sur l'excrétion et par conséquent l'impact environnemental de la production de poulet de chair. Nous avons recherché les zones du génome contrôlant des caractéristiques importantes des rejets sur un croisement F2 entre deux lignées sélectionnées de façon divergente sur l'efficacité digestive. Au total, 865 animaux ont été mesurés pour les quantités brutes de fientes fraîches et sèches (PFF, PFS) et leur rapport à la consommation alimentaire de fientes fraîches et sèches (PFFC, PFSC), le contenu en eau des fientes (EAU), le rapport entre azote et phosphore dans les fientes (N/P), le pH des fientes, du contenu du gésier et du contenu du jéjunum (PHF, PHG, PHJ). L'ensemble des animaux (F0, F1, F2) a été génotypé avec 6000 marqueurs SNP couvrant 28 autosomes, un groupe de liaison non assigné et le chromosome Z. Au total, 11 QTLs ont été identifiés pour : PFS (GGA19, GGA26), PFFC (GGA8), PFSC (GGA16), N/P (GGA11, GGA26), EAU (GGA28), PHG (GGA2, GGA16, GGA27) et PHJ (GGA19). Le QTL du pH du gésier sur le chromosome 2 est le plus significatif (P=0,15 au niveau du génome), les autres QTLs n'étant significatifs qu'au niveau du chromosome. Sur les chromosomes 16 et 27, ces QTLs co-localisent avec des QTLs d'efficacité digestive. Sur les chromosomes 8, 16 et 26, ces QTLs co-localisent avec des QTLs de longueur relative de l'intestin. Des travaux sont actuellement en cours pour confronter les données d'expression de gènes sur les tissus du tractus gastro-intestinal et les données de génomique positionnelle présentées ici afin de suggérer des gènes candidats expliquant ces QTLs.
Résumé (autre langue) : Digestive efficiency (DE) has a large impact on excretion traits and on environmental impact of poultry production. An F2 cross between 2 lines of chickens divergently selected on DE has been used to detect QTL. A total of 865 birds were measured for the quantity of fresh and dry excreta as raw values (FEW, DEW) and relative to consumption values (FEWC, DEWC), for water content (WC), pH (PHE) and nitrogen to phosphorus content ratio (NP) of excreta, and for pH of gizzard and jejunum contents (PHG, PHJ). All birds from F0, F1 and F2 generations have been genotyped for 6000 SNP markers spread over 28 autosomes and the Z chromosome. Eleven QTL were found for: DEW (GGA19, GGA26), FEWC (GGA8), DEWC (GGA16), NP (GGA11, GGA26), WC (GGA28), PHG (GGA2, GGA16, GGA27), PHJ (GGA19). The QTL for pH of the gizzard on chromosome 2 is the most significant (P=0.15 on a genome-wide scale). On chromosomes 16 and 27, these QTL co-localized with QTL for DE. On chromosomes 8, 16 and 26, QTLs for excretion traits co-localized with QTLs for relative intestine length. Further work is under progress to compare results of positional genomics presented here with gene expression data obtained on tissue of gastro-intestinal tract.
Classification Agris : L51 - Physiologie animale - Nutrition
L02 - Alimentation animale
Auteurs et affiliations
- Mignon-Grasteau Sandrine, INRA (FRA)
- Carré Bernard, INRA (FRA)
- Gabriel Irène, INRA (FRA)
- Rideau Nicole, INRA (FRA)
- Chantry-Darmon Céline, INRA (FRA)
- Boscher Marie-Yvonne, INRA (FRA)
-
Bastianelli Denis, CIRAD-ES-UMR SELMET (FRA)
ORCID: 0000-0002-6394-5920
- Sellier Nadine, INRA (FRA)
- Chabault Marie, INRA (FRA)
- Le Bihan-Duval Elisabeth, INRA (FRA)
- Narcy Agnès, INRA (FRA)
Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/576059/)
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