Caracterização molecular e seleção de genes candidatos à resistência do clone 14 de Coffea canephora conilon a Meloidogyne paranaensis

Araújo de Lima Edriana, De Araújo Carneiro Fernanda, Silva Rêgo Erica Cristina, Santos Costa Tatiana, Guitton Cotta Michelle, Jorge-Junior Aldemiro, Marraccini Pierre, Dechechi Gomes Carneiro Regina Maria, Carvalho Andrade Alan. 2015. Caracterização molecular e seleção de genes candidatos à resistência do clone 14 de Coffea canephora conilon a Meloidogyne paranaensis. In : Anais do IX Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. Consórcio Pesquisa Café. Curitiba : Consórcio Pesquisa Café, 5, 5 p. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 9, Curitiba, Brésil, 24 Juin 2015/26 Juin 2015.

Type d'url non précisé : http://www.sapc.embrapa.br/arquivos/consorcio/spcb_anais/simposio9/253.pdf

Titre anglais : Molecular characterization and selection of candidate genes to Meloidogyne paranaensis resistance in clone 14 of Coffea canephora conilon

Note générale : Ensemble des résumés : http://www.consorciopesquisacafe.com.br/index.php/consorcio/separador2/simposio-de-pesquisa-dos-cafes-do-brasil/606-anais-do-iX-simposio-de-pesquisa-dos-cafes-do-brasil

Résumé : Os nematoides das galhas estão entre os patógenos mais nocivos para a agricultura cafeeira no Brasil e C. canephora tem se mostrado fonte de resistência a esses patógenos. Com o objetivo de identificar genes candidatos a resistência a M. paranaensis, dois clones de Coffea canephora Conilon previamente identificados como resistente (clone 14) e suscetível (clone 22), inoculados ou não em diferentes tempos com M. paranaensis, tiveram seus RNA s extraídos a partir das raizes , sequenciados, mapeado s em genoma de referência de C. canephora e avaliados quantitativamente (expressão in silico) por meio de RNAseq e Excel. Dessa forma, foi possível identificar os genes que mais se expressaram no clone resistente em relação ao clone suscetível, e a respectiva expressão temporal foi relacionada à resistência a M. paranaensis.

Résumé (autre langue) : Root-knot nematodes are among the most harmful pathogens for coffee farming in Brazil and C. canephora has proven to be source of resistance to them. With the goal of finding candidate genes to resistance to M. paranaensis, two clones of Coffea canephora Conilon, previously identified as resistant (clone 14) and susceptible (clone 22), were inoculated or not at different times with M. paranaensis, then had their RNAs were extracted, sequenced, mapped using a reference genome of C. canephora and evaluated quantitatively (in silico expression) by RNAseq and Excel. Following this process, genes were obtained that were higher expressed in resistant clones than in susceptible ones, and their temporal expression was correlated to the resistance to M. paranaensis.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
H10 - Ravageurs des plantes

Auteurs et affiliations

• Araújo de Lima Edriana, CNPq (BRA)
• De Araújo Carneiro Fernanda, CAPES [Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior] (BRA)
• Silva Rêgo Erica Cristina, UNIP (BRA)
• Santos Costa Tatiana, UFLA (BRA)
• Guitton Cotta Michelle, UFLA (BRA)
• Jorge-Junior Aldemiro, UNB [Universidade de Brasilia] (BRA)
• Marraccini Pierre, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (BRA) ORCID: 0000-0001-7637-6811
• Dechechi Gomes Carneiro Regina Maria, EMBRAPA (BRA)
• Carvalho Andrade Alan, EMBRAPA (BRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/577132/)

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