Développement et calibration d'un modèle de simulation hôte-pathogène : le cas de la cercosporiose noire du bananier

Landry Clara, Bonnot François, Ravigné Virginie, Carlier Jean, Vaillant Jean, Abadie Catherine. 2016. Développement et calibration d'un modèle de simulation hôte-pathogène : le cas de la cercosporiose noire du bananier. . Aussois : INRA, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de Mycologie-Phytopathologie. 11, Aussois, France, 25 Janvier 2016/29 Janvier 2016.

Résumé : La cercosporiose noire du bananier, causée par le champignon phytopathogène Mycosphaerella fijiensis, est considérée comme la maladie foliaire la plus dommageable pour les productions bananières. Dans le but d'approfondir les connaissances sur la dynamique du pathogène et sur les composantes de résistance partielle des variétés de bananier, un modèle mécaniste de simulation de la cercosporiose noire a été développé, calibré et évalué. Le modèle simule avec un pas de temps journalier la croissance d'un bananier et la dynamique du pathogène pendant plusieurs cycles de culture en conditions épidémiologiques optimales. Le modèle est constitué de deux sous-modèles et comporte 31 paramètres. Le premier sous-modèle simule l'architecture et la croissance simplifiées du bananier. Le second sous-modèle simule le cycle épidémique détaillé du pathogène incluant le processus d'infection, la croissance et la coalescence des lésions sur les feuilles, la sporulation asexuée et sexuée, et la dispersion des spores sur la plante. L'analyse de sensibilité globale du modèle a permis d'identifier l'influence principale de trois paramètres épidémiologiques : l'efficacité d'infection, la durée d'incubation et la vitesse de croissance des lésions. Ces trois paramètres ont été estimés dans un cadre bayésien avec des méthodes MCMC (Markov Chain Monte Carlo) sur des données de dynamique des lésions (nombre et surface) sur une variété sensible de plantain. L'évaluation du modèle avec un jeu de données indépendant de sévérité de maladie pendant un cycle de culture a mis en évidence la bonne qualité de la prédiction du modèle. Des simulations ont confirmé l'effet des trois composantes de résistance sur la maladie et ont mis en évidence la forte influence de certains paramètres de la croissance du bananier, en particulier le rythme d'émission foliaire, sur la sévérité de la cercosporiose noire.

Auteurs et affiliations

• Landry Clara
• Bonnot François, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
• Ravigné Virginie, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0002-4252-2574
• Carlier Jean, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (CAN) ORCID: 0000-0002-6967-1852
• Vaillant Jean, UAG (GLP)
• Abadie Catherine, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (GLP)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/592110/)

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