WCSdb: A database of wild Coffea species

Guyot Romain, Hamon Perla, Couturon Emmanuel, Raharimalala Nathalie, Rakotomalala Jean-Jacques, Lakkanna Sreenath, Sabatier Sylvie-Annabel, Affouard Antoine, Bonnet Pierre. 2020. WCSdb: A database of wild Coffea species. Database, 2020, 6 p.

https://doi.org/10.1093/database/baaa069

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Quartile : Q1, Sujet : MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY

Résumé : Coffee is a beverage enjoyed by millions of people worldwide and an important commodity for millions of people. Beside the two cultivated species (Coffea arabica and Coffea canephora), the 139 wild coffee species/taxa belonging to the Coffea genus are largely unknown to coffee scientists and breeders although these species may be crucial for future coffee crop development to face climate changes. Here we present the Wild Coffee Species database (WCSdb) hosted by Pl@ntNet platform (http://publish.plantnet-project.org/project/wildcofdb_en), providing information for 141 coffee species/taxa, for which 84 contain a photo gallery and 82 contain sequencing data (genotyping-by-sequencing, chloroplast or whole genome sequences). The objective of this database is to better understand and characterize the species (identification, morphology, biochemical compound, genetic diversity and sequence data) in order to better protect and promote them.

Mots-clés Agrovoc : Coffea, base de données sur le matériel génétique, diversité génétique (comme ressource), phytogénétique, biodiversité, identification, morphologie végétale, composé biochimique, taxonomie, analyse de données

Mots-clés géographiques Agrovoc : Madagascar, La Réunion, France

Mots-clés libres : Coffea, Pl@ntNet, Sequencing data, Madagascar, La Réunion

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie
F50 - Anatomie et morphologie des plantes
U10 - Informatique, mathématiques et statistiques

Champ stratégique Cirad : CTS 1 (2019-) - Biodiversité

Auteurs et affiliations