Diversité et partage des communautés mycorhiziennes au sein de bananeraies soumises à différentes pratiques agronomiques en Martinique

Julan Coralie, Vincent Bryan, Coulis Mathieu, Hannibal Laure, Bâ Amadou, Galiana Antoine. 2022. Diversité et partage des communautés mycorhiziennes au sein de bananeraies soumises à différentes pratiques agronomiques en Martinique. In : Fixation biologique de l’azote et biofertilisation : des outils agro-écologiques pour le développement durable et la sécurité alimentaire dans le contexte du changement climatique. Dakar : ISRA, Résumé, 1 p. Congrès de l’Association Africaine pour la Fixation Biologique de l’Azote. 19, Dakar, Sénégal, 29 Novembre 2022/2 Décembre 2022.

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Résumé : Dans le contexte actuel de transition agroécologique, l'intégration de légumineuses de service en jachère ou en association au sein des systèmes bananiers est l'un des outils majeurs permettant d'améliorer naturellement à la fois la fertilité des sols et le contrôle des plantes adventices et des bio-agresseurs. Ces propriétés, qui permettent de réduire l'utilisation d'intrants chimiques polluants et coûteux, sont principalement dues à leur double association symbiotique avec les bactéries fixatrices d'azote (rhizobium) et les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMAs) qui facilitent le transfert de nutriments entre plantes associées. Afin d'étudier le rôle et la contribution des CMAs dans la gestion durable des bananeraies, nous avons analysé l'effet de différentes pratiques agronomiques sur les taux de mycorhization, la diversité et le partage des communautés de CMAs associées aux bananiers et aux espèces de plantes compagnes. Ces analyses ont été réalisées au sein d'un essai au champ du programme de recherche BANABIO (projet Ecophyto/UR GECO CIRAD) en Martinique. Dans ce dispositif en blocs, trois modes de gestion agronomique sont testés : Culture Conventionnelle avec intrants chimiques ; Culture Biologique avec fertilisation organique et Culture Agroforestière avec fertilisation organique et intégration de légumineuses ligneuses (Inga ingoides et Indigofera zollingeriana) et de cacaoyers. Des racines ont été échantillonnées et conditionnées pour évaluer les taux de mycorhization (F% et I%) et la diversité des CMAs par séquençage haut débit du gène ADNr 18S (Illumina Seq). Le mode de gestion n'a pas eu d'effet significatif sur les taux de mycorhization qui restaient élevés dans tous les traitements et chez toutes les espèces analysées. L'analyse des séquences a montré une grande diversité de CMAs sur l'ensemble de l'essai avec environ 1600 OTUs identifiés dont une majorité appartenaient aux Glomeraceae et étaient répartis dans 7 genres où Rhizophagus dominait (28% des séquences). Les diversités alpha des communautés de CMAs des trois traitements n'étaient pas significativement différentes à l'inverse des diversités béta entre Cultures Agroforestières et Conventionnelles. Un faible partage des communautés de CMAs était également observé entre celles associées aux bananiers et celles des espèces accompagnatrices dans les différents traitements. Une nouvelle analyse est nécessaire pour étudier un effet éventuel de la saison sur la diversité et le partage des communautés de CMAs au sein de ces systèmes bananiers.

Mots-clés libres : Agroforesterie, Champignons mycorhiziens à arbuscules, Séquençage haut débit, Transition agroécologique

Agences de financement hors UE : Ministère de l'Agriculture et de la Souveraineté alimentaire, Office Français de la Biodiversité

Projets sur financement : (FRA) Evaluation de systèmes de culture innovants de BANAne BIOlogique, (FRA) Ecophyto

Auteurs et affiliations