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Possible biased virulence attenuation in the Senegal strain of Ehrlichia ruminantium by ntrX gene conversion from an inverted segmental duplication. Gordon Jonathan, Oliva Chavez Adela Sarahi, Martinez Dominique, Vachiéry Nathalie, Meyer Damien. 2023. PloS One, 18 (2):e0266234, 17 p.

Recombination is a major driving force of genetic diversity in the Anaplasmataceae Ehrlichia ruminantium. Cangi Nidia, Gordon Jonathan, Bournez Laure, Pinarello Valérie, Aprelon Rosalie, Huber Karine, Lefrançois Thierry, Neves Luis, Meyer Damien, Vachiery Nathalie. 2016. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 6:111, 14 p.

Clade- and species-specific features of genome evolution in the Saccharomycetaceae. Wolfe Kenneth H., Armisén David, Proux-Wera Estelle, ÓhÉigeartaigh Seán S., Azam Haleema, Gordon Jonathan, Byrne Kevin P.. 2015. FEMS Yeast Research, 15 (5), 12 p.

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

QueTAL: A suite of tools to classify and compare TAL effectors functionally and phylogenetically. Pérez-Quintero Alvaro L., Lamy Léo, Gordon Jonathan, Escalon Aline, Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Gagnevin Lionel. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (545), 16 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas axonopodis pv. allii strain CFBP 6369. Gagnevin Lionel, Bolot Stéphanie, Gordon Jonathan, Pruvost Olivier, Vernière Christian, Robène Isabelle, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès, Koebnik Ralf. 2014. Genome Announcements, 2 (4):e00727, 2 p.

Tandem repeats as genotyping tools for understanding the genetic structure and epidemiology of Xanthomonas citri pv. citri. Leduc Alice, Traoré Yaya Nadia, Boyer Karine, Magne Maxime, Grygiel Pierre, Gordon Jonathan, Boyer Claudine, Guérin Fabien, Wonni Issa, Ouédraogo Léonard, Koebnik Ralf, Verdier Valérie, Gagnevin Lionel, Vernière Christian, Ravigné Virginie, Pruvost Olivier. 2015. In : Xanthomonas Genomics Conference 2015 Book of Abstracts. Universidad de los Andes. Bogota : Universidad de los Andes, Résumé, 22. Xanthomonas Genomics Conference 2015, Bogota, Colombie, 8 Juillet 2015/11 Juillet 2015.

Ehrlichia ruminantium prevalence in ticks and its genetic diversity in Mozambique. [0113]. Cangi Nidia, Bournez Laure, Gordon Jonathan, Aprelon Rosalie, Pinarello Valérie, Lefrançois Thierry, Neves Luis, Vachiéry Nathalie. 2017. In : Book of abstracts of 9th International conference on tick and tick borne pathogens: One health. TTP9-APRC1. Cairns : TTP9-APRC1, Résumé, 57. International conference on tick and tick borne pathogens: One health. 9, Cairns, Australie, 27 Août 2017/1 Septembre 2017.

Global gene expression profiling of virulent and attenuated strains of Ehrlichia ruminantium: Toward the comprehension of pathogenesis. Pruneau Ludovic, Meyer Damien, Marcelino Isabel, Mari Bernard, Lebrigand Kevin, Viari Alain, Emboule Loïc, Gordon Jonathan, Pinarello Valérie, Sheikboudou Christian, Martinez Dominique, Lefrançois Thierry, Vachiery Nathalie. 2014. In : 12th Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM12) and the VIII International Conference on Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8), 24-29 August 2014, Cape Town, South Africa. STVM. s.l. : s.n., 1 p. Biennial Society for Tropical Veterinary Medicine Conference. 12, Cape Town, Afrique du Sud, 24 Août 2014/29 Août 2014.

Genetic diversity of Ehrlichia ruminantium in Mozambique. Bournez Laure, Cangi N., Gordon Jonathan, Aprelon Rosalie, Pinarello Valérie, Lefrançois Thierry, Neves Luis, Vachiéry Nathalie. 2018. . Buenos Aires : s.n., Résumé, 2 p. Joint AITVM-STVM Meeting Animal Health in the Tropics: Building the puzzle from research to application. 2, Buenos Aires, Argentine, 23 Septembre 2018/28 Septembre 2018.

Association vecteur-pathogène : étude de la co-structuration entre la tique vectrice Amblyomma variegatum (Acari: Ixodidae) et la Rickettsie Ehrlichia ruminantium. Huber Karine, Vachiery Nathalie, Adakal Hassane, Cangi N., Gordon Jonathan, Haddad Nadia, das Neves L., Stachurski Frédéric. 2015. In : Réunion annuelle 2015 du Réseau écologie des interactions durables (REID) "Tiques et maladies à tiques", 25-26 mars 2015, Lyon, France. s.l. : s.n., 79. Réunion annuelle 2015 du Réseau écologie des interactions durables, Lyon, France, 25 Mars 2015/26 Mars 2015.

Vector-pathogen association: lack of congruence of phylogeograpical pattern of the vector tick Amblyomma variegatum (Acari: Ixodidae) and of the Ricketssiales Ehrlichia ruminantium. Huber Karine, Vachiery Nathalie, Adakal Hassane, Cangi N., Gordon Jonathan, Haddad Nadia, das Neves L., Stachurski Frédéric. 2014. In : E-SOVE the 19th Conference 'When epidemic becomes endemic: a global challenge towards vector control', Thessaloniki, Greece, 13th-17th October 2014. Abstract book. European Society for Vector Ecology. s.l. : s.n., Résumé, 72. E-SOVE 2014. 19, Thessalonique, Grèce, 13 Octobre 2014/17 Octobre 2014.

A new minisatellite-based scheme for the global surveillance of Xanthomonas citri pv. citri, the causal agent of Asiatic Citrus Canker. : S12O12. Magne Maxime, Leduc Alice, Vernière Christian, Vital Karine, Gordon Jonathan, Escalon Aline, Guérin Fabien, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2012. In : XII International Citrus Congress : Book of abstract. Navarro Luis (ed.). ISC, IVIA, Fundación agroalimed. Riverside : ISC, Résumé, 197-198. International Citrus congress "Citrus and health. 12, Valence, Espagne, 18 Novembre 2012/23 Novembre 2012.

Live attenuated bacterial strain and its use as a vaccine. Meyer Damien, Gordon Jonathan, Vachiéry Nathalie, Martinez Dominique. 2019. Genève : OMPI, 44 p. N° de dépôt international : PCT/EP2018/075634, N° de brevet international : WO2019057909A1, N° de dépôt européen : 17306235.7, N° de brevet européen : EP3459561