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Does seasonal flowering and fruiting patterns of cacao only depend on climatic factors? The case study of mixed genotype populations in Côte d'Ivoire. Wibaux Thomas, Normand Frédéric, Vezy Rémi, Durand Jean-Baptiste, Lauri Pierre-Eric. 2024. Scientia Horticulturae, 337:113529, 15 p.

Modelling the architecture of hazelnut (Corylus avellana) Tonda di Giffoni over two successive years. Grisafi Francesca, Tombesi Sergio, Farinelli Daniela, Costes Evelyne, Durand Jean-Baptiste, Boudon Frédéric. 2024. In Silico Plants, 6 (1), 14 p.

Ornamental plants architectural characteristics in relation to visual sensory attributes: A new approach on the rose bush for objective evaluation of the visual quality. Garbez M., Symoneaux R., Belin E., Caraglio Yves, Chéné Y., Dones Nicolas, Durand Jean-Baptiste, Hunault G., Relion D., Sigogne M., Rousseau D., Galopin G.. 2018. European Journal of Horticultural Science, 83 (3) : 187-201.

Localizing the latent structure canonical uncertainty: entropy profiles for hidden Markov models. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2016. Statistics and Computing, 26 (1) : 549-567.

New insights for estimating the genetic value of segregating apple progenies for irregular bearing during the first years of tree production. Durand Jean-Baptiste, Guitton Baptiste, Peyhardi Jean, Holtz Yan, Guédon Yann, Trottier Catherine, Costes Evelyne. 2013. Journal of Experimental Botany, 64 (16) : 5099-5113.

Characteristics of Acacia mangium shoot apical meristems in natural and in vitro conditions in relation to heteroblasty. Hatt Clémence, Mankessi François, Durand Jean-Baptiste, Boudon Frédéric, Montes Fabienne, Lartaud Marc, Verdeil Jean-Luc, Monteuuis Olivier. 2012. Trees, 26 (3) : 1031-1044.

Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden markov tree models. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2005. New Phytologist, 166 (3) : 813-825.

Computational methods for hidden markov tree models : An application to wavelet trees. Durand Jean-Baptiste, Goncalves Paulo, Guédon Yann. 2004. IEEE Transactions on Signal Processing, 52 (9) : 2551-2560.

Semantic segmentation of forest point clouds using neural network. Bai Yuchen, Durand Jean-Baptiste, Vincent Grégoire, Forbes Florence. 2024. In : Recueil des résumés longs : 55èmes Journées de statistique de la SFdS. SFdS. Bordeaux : SFdS, 250-259. Journées de statistique de la SFdS (JDS2024). 55, Bordeaux, France, 27 Mai 2024/31 Mai 2024.

Analysing the architecture of Corylus avellana and parametrizing L-HAZELNUT FSPM. Grisafi Francesca, Tombesi Sergio, Farinelli Daniela, Boudon Frédéric, Durand Jean-Baptiste, Costes Evelyne. 2023. In : Book of abstracts the 10th International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM2023). Tsu-Wei Chen (ed.), Andreas Fricke (ed.), Katrin Kahlen (ed.), Susann Müller (ed.), Hartmut Stützel (ed.). Hannover : Institute of Horticultural Production Systems, Résumé, 70-71. International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM2023). 10, Berlin, Allemagne, 27 Mars 2023/31 Mars 2023.

Architecture and yield relationship in hazelnut tree. Grisafi Francesca, Farinelli Daniela, Costes Evelyne, Boudon Frédéric, Durand Jean-Baptiste, Tombesi Sergio. 2023. In : Proceedings of the International Symposium on Innovative Perennial Crops Management. Serra S. (ed.), Lauri P.E. (ed.). ISHS. Louvain : ISHS, 331-336. (Acta Horticulturae, 1366) ISBN 978-94-6261-365-2 International Horticultural Congress (IHC2022): International Symposium on Innovative Perennial Crops Management. 31, Angers, France, 14 Août 2022/20 Août 2022.

Characterization of mango tree patchiness using a tree-segmentation/clustering approach. Fernique Pierre, Dambreville Anaëlle, Durand Jean-Baptiste, Pradal Christophe, Lauri Pierre-Eric, Normand Frédéric, Guédon Yann. 2016. In : 2016 IEEE International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (FSPMA). IEEE, FSPMA. Qingdao : IEEE, 68-74. ISBN 978-1-5090-1659-4 IEEE International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (FSPMA 2016), Qingdao, Chine, 7 Novembre 2016/11 Novembre 2016.

Estimation of discrete partially directed acyclic graphical models in multitype branching processes. Fernique Pierre, Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2014. In : Proceedings of COMPSTAT 2014, August 19-22, 2014, Geneva, Switzerland. Manfred Gilli, Gil Gonzalez-Rodriguez, Alicia Nieto-Reyes (eds.) - Genève : Université de Genève, 2014. s.l. : s.n., 561-568. ISBN 978-2-8399-1347-8 International Conference on Computational Statistics. 21, Genève, Suisse, 19 Août 2014/22 Août 2014.

Quantifying and localizing state uncertainty in hidden Markov models using conditional entropy profiles. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2014. In : Proceedings of COMPSTAT 2014, August 19-22, 2014, Geneva, Switzerland. Manfred Gilli, Gil Gonzalez-Rodriguez, Alicia Nieto-Reyes (eds.) - Genève : Université de Genève, 2014. s.l. : s.n., 213-221. ISBN 978-2-8399-1347-8 International Conference on Computational Statistics. 21, Genève, Suisse, 19 Août 2014/22 Août 2014.

Deciphering mango tree asynchronisms using Markov tree and probabilistic graphical models. Dambreville Anaëlle, Fernique Pierre, Pradal Christophe, Lauri Pierre-Eric, Normand Frédéric, Guédon Yann, Durand Jean-Baptiste. 2013. In : Proceedings of the 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM2013), Saariselkä, Finland, 9-14 June 2013. Eds. Risto Sievänen, Eero Nikinmaa, Christophe Godin, Anna Lintunen, Pekka Nygren. Vantaa : Finnish Society of Forest Science, 210-212. ISBN 978-951-651-408-9 International Conference on Functional-Structural Plant Models. 7, Saariselkä, Finlande, 9 Juin 2013/14 Juin 2013.

Estimating the genetic value of F1 apple progenies for irregular bearing during first years of production. Durand Jean-Baptiste, Guitton Baptiste, Peyhardi Jean, Holtz Yan, Guédon Yann, Trottier Catherine, Costes Evelyne. 2013. In : Proceedings of the 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM2013), Saariselkä, Finland, 9-14 June 2013. Eds. Risto Sievänen, Eero Nikinmaa, Christophe Godin, Anna Lintunen, Pekka Nygren. Vantaa : Finnish Society of Forest Science, Résumé, 13-15. ISBN 978-951-651-408-9 International Conference on Functional-Structural Plant Models. 7, Saariselkä, Finlande, 9 Juin 2013/14 Juin 2013.

Semantic segmentation of sparse irregular point clouds for leaf/wood discrimination. Bai Yuchen, Durand Jean-Baptiste, Vincent Grégoire, Forbes Florence. 2023. . NeurIPS. San Diego : Neural Information Procssing Systems Foundation, 1-21. Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2023). 37, New Orleans, États-Unis, 10 Décembre 2023/16 Décembre 2023.

Détection de motifs disruptifs au sein de plantes : une approche de quotientement/classification d'arborescences. Fernique Pierre, Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2015. . Lille : SFdS, 6 p. Journées de Statistique de la SFdS. 47, Lille, France, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.

Modèles graphiques paramétriques pour la modélisation des lois de génération dans des processus de branchement multitypes. Fernique Pierre, Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2014. In : 46ème Journées de statistique, Rennes, France, du 2 au 6 juin 2014. Société française de statistique. s.l. : s.n., 6 p. Journées de statistique. 46, Rennes, France, 2 Juin 2014/6 Juin 2014.

Quantification de l'incertitude sur la structure latente dans les modèles de Markow cachés. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2014. In : 46ème Journées de statistique, Rennes, France, du 2 au 6 juin 2014. Société française de statistique. s.l. : s.n., 6 p. Journées de statistique. 46, Rennes, France, 2 Juin 2014/6 Juin 2014.

Reconstructing plant architecture from 3D laser scanner data. Preuksakarn Chakkrit, Boudon Frédéric, Ferraro Pascal, Durand Jean-Baptiste, Nikinmaa Eero, Godin Christophe. 2010. In : Proceedings of the 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models, FSPM 2010, September 12-17, 2010, University of California, Davis (USA). Dejong Thedore M. (ed.), Da Silva David (ed.). University of California-Department of Plant Sciences. Davis : University of California, 16-18. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 6, Davis, États-Unis, 12 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

OpenAlea: An open-source platform for the integration of heterogeneous FSPM components. Dufour-Kowalski Samuel, Pradal Christophe, Dones Nicolas, Barbier de Reuille Pierre, Boudon Frédéric, Chopard Jérôme, DaSilva D., Durand Jean-Baptiste, Ferraro Pascal, Fournier Christian, Guédon Yann, Ouangraoua A., Smith C., Stoma Szymon, Théveny Frédéric, Sinoquet Hervé, Godin C.. 2007. In : Proceedings : Abstracts of papers and posters of the 5th International Workshop on Functional Structural Plant Models, November 4-9, 2007, Napier, New Zealand. Eds by Prusinkiewicz P., Hanan J., Lane B. Napier : HortResearch, 36-1. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 5, Napier, Nouvelle-Zélande, 4 Novembre 2007/9 Novembre 2007.

OpenAlea : a platform for plant modelling analysis and simulation. Pradal Christophe, Boudon Frédéric, Dones Nicolas, Durand Jean-Baptiste, Barbier de Reuille Pierre, Fournier Christian, Sinoquet Hervé, Godin Christophe. 2006. In : Europhyton 2006, Genève, Suisse, 03-05 juillet 2006. s.l. : s.n., Diaporama, (27 vues) Europhyton 2006, Genève, Suisse, 3 Juillet 2006/5 Juillet 2006.

Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden Markov trees. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 61-64. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

Localizing the latent structure canonical uncertainty: Entropy profiles for hidden Markov models. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann. 2007. Le Chesnay : INRIA, 40 p. (Rapport de recherche : INRIA. Thème BIO, 7896)