Intraspecific genomic variation within Xanthomonas albilineans, the sugarcane leaf scald pathogen

Davis Michael J., Rott Philippe, Warmuth C.J., Chatenet Michèle, Baudin Pierre. 1997. Intraspecific genomic variation within Xanthomonas albilineans, the sugarcane leaf scald pathogen. Phytopathology, 87 (3) : 316-324.

Autre titre : Variation génomique intraspécifique à l'intérieur de Xanthomonas albilineans, agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : Pour mieux comprendre la nature des récentes épidémies d'échaudure des feuilles de canne à sucre dans de nombreuses régions de production de canne à sucre du monde dont la Floride, la Guadeloupe, la Louisiane, Maurice, Taiwan et le Texas, une étude de la variation génétique mondiale du pathogène a été entreprise. Un total de 218 souches issues de 31 localisations géographiques ont été examinées. L'ADN génomique de chaque souche a été analysé avec l'enzyme de restriction SpeI, et les fragments ont été séparés par électrophorèse sur gel (PFGE). Un total de 102 bandes ont été identifiées et 54 schémas d'ADN différents (haplotypes) ont été observés. Les différentes épidémies ont été attribuées à l'introduction de souches appartenant à tel ou tel groupe PFGE. La dispersion par inadvertance du pathogène à l'intérieur des plantes a été détectée par une expérience complémentaire. De plus, la variation des souches pourrait être associée au moins en partie avec des facteurs gouvernant la diffusion de plante à plante du pathogène dans la nature

Mots-clés Agrovoc : maladie des plantes, Saccharum, échaudure, agent pathogène, Xanthomonas albilineans, variation génétique, empreinte ADN, épidémiologie, quarantaine

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Auteurs et affiliations

• Davis Michael J.
• Rott Philippe, CIRAD-CA-Phytopathologie-malherbologie (FRA) ORCID: 0000-0001-6085-6159
• Warmuth C.J.
• Chatenet Michèle, CIRAD-CA-Phytopathologie-malherbologie (FRA)
• Baudin Pierre

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/389097/)

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