Résultats pour : "agent pathogène"

First report of black leaf streak disease in banana caused by Pseudocercospora fijiensis on Mauritius island. Vally V., Jouen Emmanuel, Pécheur Max Jean Bernard, Carval Dominique, De Lapeyre de Bellaire Luc, Teycheney Pierre-Yves, Roussel Véronique, Fabre Sandrine, Pages Christine, Adreit Henri, Carlier Jean, Rieux Adrien. 2024. Plant Disease, 108 (3), p. 802

Microclimatic variations in cocoa-based agroforestry systems affect citrus Phytophthora foot rot disease intensity. Akoutou Mvondo Etienne, Dzokouo Dzoyem Camille Ulrich, Bissohon Mélaine, Bidzanga Nomo Lucien, Bella Manga Faustin, Ambang Zachée, Cilas Christian, Ndo Eunice Golda Danièle. 2024. Agroforestry Systems, 15 p.

The bZIP transcription factor BIP1 of the rice blast fungus is essential for infection and regulates a specific set of appressorium genes. Lambou Karine, Tag Andrew, Lassagne Alexandre, Collemare Jérôme, Clergeot Pierre-Henri, Barbisan Crystel, Perret Phillippe, Tharreau Didier, Millazo Joelle, Chartier Elia, De Vries Ronald P., Hirsch Judith, Morel Jean-Benoit, Beffa Roland, Kroj Thomas, Thomas Terry, Lebrun Marc-Henri. 2024. PLoS Pathogens, 20 (1):e1011945, 30 p.

Bacterial plant pathogens affect the locomotor behavior of the insect vector: A case study of Citrus volkameriana-Triozae erytreae-Candidatus Liberibacter asiaticus system. Ameline Arnaud, Karkach Alain, Denoirjean Thomas, Grondin Martial, Molinari Maria Florencia, Turpin Patrick, Delatte Hélène, Reynaud Bernard. 2023. Insect Science, 10 p.

Crop protection practices and risks associated with human fungal infectious diseases: A One Health perspective. Ratnadass Alain, Sester Mathilde. 2023. Cahiers Agricultures, 32:7, 10 p.

Evolution of the rice blast pathogen on spatially structured rice landraces maintains multiple generalist fungal lineages. Ali Sajid, Gladieux Pierre, Ravel Sébastien, Adreit Henri, Meusnier Isabelle, Milazzo Joëlle, Cros-Arteil Sandrine, Bonnot François, Jin Baihui, Dumartinet Thomas, Charriat Florian, Lassagne Alexandre, He Xiahong, Tharreau Didier, Huang Huichuan, Morel Jean-Benoit, Fournier Elisabeth. 2023. Molecular Ecology, 32 (10), n.spéc. Evolutionary ecology of human associated microbes : 2519-2533.

First report of african eggplant yellowing virus on tomato exhibiting necrotic yellowing symptoms in Northern Côte d'Ivoire. N'Cho A.J., Seka Koutoua, Bele L., Diallo H., Martin Thibaud, Coulibaly Noupe, Fondio Lassina, Hoareau Murielle, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel. 2023. Plant Disease, 107 (2) : p. 590.

First report of fusarium wilt of cavendish bananas caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 in the Grande Comoros Island. Mmadi Mouzdalifa, Azali Hamza Abdou, Mostert Diane, Robène Isabelle, Viljoen Altus. 2023. Plant Disease, 107 (12) : p. 4029.

Flying syringes for emerging enzootic virus screening: proof of concept for the development of noninvasive xenosurveillance tools based on tsetse flies. Valente Adeline, Jiolle Davy, Ravel Sophie, Porciani Angélique, Vial Laurence, Michaud Vincent, Kwiatek Olivier, Pédarrieu Aurélie, Missé Dorothée, Ferraris Pauline, Bretagnolle François, Bitome-Essono Paul Yannick, Makanga Boris, Rougeron Virginie, Prugnolle Franck, Paupy Christophe. 2023. Transboundary and Emerging Diseases, 2023:9145289, 10 p.

Herbarium specimen sequencing allows precise dating of Xanthomonas citri pv. citri diversification history. Campos Paola, Pruvost Olivier, Boyer Karine, Chiroleu Frédéric, Cao Thuy Trang, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Utteridge Timothy M. A., Becker Nathalie, Rieux Adrien, Gagnevin Lionel. 2023. Nature Communications, 14:4306, 13 p.

How agricultural practices affect the risk of human contamination by infectious pathogens: The need for a 'One Health' perspective. Ratnadass Alain, Sarter Samira. 2023. CABI Reviews, 2023, 30 p.

Leaf functional traits and pathogens: Linking coffee leaf rust with intraspecific trait variation in diversified agroecosystems. Gagliardi Stephanie, Avelino Jacques, Martin Adam R., Cadotte Marc W., de Melo Virginio Filho Elias, Isaac Marney E.. 2023. PloS One, 18 (4):e0284203, 16 p.

Microbe Profile: Ehrlichia ruminantium - stealthy as it goes. Meyer Damien, Moumène Amal, Rodrigues Valérie. 2023. Microbiology, 169 (11), 4 p.

No evidence of foliar disease impact on crop root functional strategies and soil microbial communities: what does this mean for organic coffee? Gagliardi Stephanie, Avelino Jacques, Fulthorpe Roberta, de Melo Virginio Filho Elias, Isaac Marney E.. 2023. Oikos, 2023 (1):e08987, 12 p.

The Ralstonia research community rejects the proposal to classify phylotype I Ralstonia into the new species Ralstonia nicotianae. Lowe-Power Tiffany M., Sharma Parul, Alfenas-Zerbini Poliane, Alvarez Belén, Arif Mohammad, Baroukh Caroline, Bocsanczy Ana Maria, Biosca Elena G., Castillo Jose A., Cellier Gilles, Coutinho Teresa A., Drenth André, Friman Ville-Petri, Genin Stéphane, Guidot Alice, Hikichi Yasufumi, Huang Qi, Iyer-Pascuzzi Anjali S., Kai Kenji, Pecrix Yann, Poussier Stéphane, Ray Jane D., Rossato Maurício, Schomer Rebecca, Siri Maria Inés, Vinatzer Boris A., Allen Caitilyn. 2023. PhytoFrontiers, 3 (4) : 761-766.

An update of evidence for pathogen transmission by ticks of the genus Hyalomma. Bonnet Sarah, Bertagnoli Stéphane, Falchi Alessandra, Figoni Julie, Fite Johanna, Hoch Thierry, Quillery Elsa, Moutailler Sara, Raffetin Alice, René-Martellet Magalie, Vourc'h Gwenaël, Vial Laurence. 2023. Pathogens, 12 (4), n.spéc. Current Status and Challenges Associated with Tick-Borne Pathogens and Diseases:513, 19 p.

Childhood encephalitis in the Greater Mekong region (the SouthEast Asia Encephalitis Project): A multicentre prospective study. Pommier Jean-David, Gorman Christopher, Crabol Yoann, Bleakley Kevin, Sothy Heng, Santy Ky, Tran Huong Thi Thu, Nguyen Lam Van, Bunnakea Em, Hlaing Chaw Su, Aye Mya Min Aye, Cappelle Julien, Herrant Magali, Piola Patrice, Rosset Bruno, Chevalier Véronique, Tarantola Arnaud, Channa Mey, SEAe Consortium, et al.. 2022. Lancet. Global Health, 10 (7) : e989-e1002.

Complex adaptive architecture of quantitative resistance erosion in a plant fungal pathogen. Dumartinet Thomas, Ravel Sébastien, Roussel Véronique, Perez-Vicente Luis, Aguayo Jaime, Abadie Catherine, Carlier Jean. 2022. Molecular Ecology, 31 (4) : 1160-1179.

Exploring the emergence and evolution of plant pathogenic microbes using historical and paleontological sources. Malmstrom Carolyn M., Martin Michael, Gagnevin Lionel. 2022. Annual Review of Phytopathology, 60 (1) : 187-209.

Identification des principaux phytopathogènes du poivre (Piper nigrum L.) de Penja et contrôle du dépérissement lent par Trichoderma asperellum et l'extrait hydroéthanolique de Chromoleana odorata. Petchayo Tigang Sandrine. 2022. Yaoundé : Université de Yaoundé 1, 271 p. Thèse de doctorat : Biochimie : Université de Yaoundé 1

Population structure of Moniliophthora perniciosa in the main cacao producing departments of Colombia. Jaimes Yeirme, Gonzalez Carolina, Rojas Jairo, Rivera Jessica Johana, Cilas Christian, Argout Xavier. 2022. Plant Disease, 106 (5) : 1492-1501.

Using haematophagous fly blood meals to study the diversity of blood-borne pathogens infecting wild mammals. Mwakasungula Solomon, Rougeron Virginie, Arnathau Céline, Boundenga Larson, Miguel Eve, Boissière Manuel, Jiolle Davy, Durand Patrick, Msigwa Alphonce, Mswata Sarah, Olotu Ally, Sterkers Yvon, Roche Benjamin, Killeen Gerard, Cerqueira Frédérique, Bitome-Essono Paul Yannick, Bretagnolle François, Masanja Honorati, Paupy Christophe, Sumaye Robert, Prugnolle Franck. 2022. Molecular Ecology Resources, 22 (8) : 2915-2927.

The stochastic world of emerging viral diseases. Gavotte Laurent, Frutos Roger. 2022. PNAS Nexus, 1 (4):pgac185, 8 p.

Antimicrobial resistance in Africa—How to relieve the burden on family farmers. Ducrot Christian, Hobeika Alexandre, Lienhardt Christian, Wieland Barbara, Dehays Charlotte, Delabouglise Alexis, Bordier Bouchot Marion, Goutard Flavie, Patel Ekta, Figuié Muriel, Peyre Marie-Isabelle, Moodley Arshnee, Roger François. 2021. Emerging Infectious Diseases, 27 (10) : 2515-2520.

Apport de l'ADN ancien dans l'étude de l'émergence et de l'évolution d'agents pathogènes de cultures. Campos Paola. 2021. Paris : MNHN, 224 p. Thèse de doctorat : Biologie des organismes. Phylogénétique, épidémiologie moléculaire, phytopathologie : Muséum national d'histoire naturelle

Biocontrol agents reduce progression and mycotoxin production of Fusarium graminearum in spikelets and straws of wheat. Pellan Lucile, Dieye Cheikh Ahmeth Tidiane, Durand Noel, Fontana Angélique, Schorr-Galindo Sabine, Strub Caroline. 2021. Toxins, 13 (9), n.spéc. Fusarium and Fusarium Toxins:597, 16 p.

Biologie et génétique des populations de Pyricularia oryzae pour le contrôle de la pyriculariose du riz au Mali. Diagne Diariatou. 2021. Montpellier : Université de Montpellier, 156 p. Thèse de doctorat : Mécanismes des interactions parasitaires pathogènes et symbiotiques : Université de Montpellier

Clustering analyses of secreted proteins of the sugarcane orange rust pathogen Puccinia kuehnii. Cardenas Daniela E., Cheema J., Sood Sushma, Carrillo-Tarazona Yisel, Huguet-Tapia Jose, Saunders Diane G.O., Rott Philippe, Cano Liliana M.. 2021. Phytopathology, 111 (10S), suppl. Plant Health 2021, Résumé, S2.58 Plant Health 2022, Pittsburgh, États-Unis, 6 Août 2022/10 Août 2022.

Coévolution plantes-parasites en populations naturelles. Ravigné Virginie, Halkett Fabien, Tollenaere Charlotte. 2021. In : L'immunité des plantes : pour des cultures résistantes aux maladies. Lannou Christian (ed.), Roby Dominique (ed.), Ravigné Virginie (ed.), Hannachi Mourad (ed.), Moury Benoit (ed.). Versailles : Ed. Quae, 115-123. (Savoir faire) ISBN 978-2-7592-3233-08

First historical genome of a crop bacterial pathogen from herbarium specimen: Insights into citrus canker emergence. Campos Paola, Groot Crego Clara, Boyer Karine, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Richard Damien, Pruvost Olivier, Roumagnac Philippe, Szurek Boris, Becker Nathalie, Gagnevin Lionel, Rieux Adrien. 2021. PLoS Pathogens, 17 (7):e1009714, 25 p.

Inter‐group social behavior, contact patterns and risk for pathogen transmission in cape buffalo populations. Wielgus Elodie, Caron Alexandre, Bennitt Emily, De Garine-Wichatitsky Michel, Cain Bradley, Fritz Hervé, Miguel Eve, Cornélis Daniel, Chamaille-Jammes Simon. 2021. Journal of Wildlife Management, 85 (8) : 1574-1590.

L'adaptation des agents pathogènes de plantes aux systèmes cultivés : une évolution sous contraintes anthropiques. Halkett Fabien, Lannou Christian, Le May christophe, Montarry Josselin, Papaïx Julien, Ravigné Virginie. 2021. In : L'immunité des plantes : pour des cultures résistantes aux maladies. Lannou Christian (ed.), Roby Dominique (ed.), Ravigné Virginie (ed.), Hannachi Mourad (ed.), Moury Benoit (ed.). Versailles : Ed. Quae, 125-134. (Savoir faire) ISBN 978-2-7592-3233-08

Mitochondrial genomes reveal diverse lineages of Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Sternorrhyncha: Psyllidae) in Kenya and La Réunion. Wang Yanjing, Halbert Susan, Mohamed Samira A., Delatte Hélène, Reynaud Bernard, Beattie George A.C., Holford Paul, Lu Jinming, Cen Yijing. 2021. Biological Invasions, 23 : 3109-3117.

Molecular and environmental triggering factors of pathogenicity of Fusarium oxysporum and F. solani isolates involved in the coffee corky-root disease. Gamboa-Becerra Roberto, Lopez-Lima Daniel, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Carrion Gloria, Desgarennes Damaris. 2021. Journal of Fungi, 7 (4), n.spéc. Plant and Fungal Interactions:253, 23 p.

Molecular epidemiology of Xanthomonas euvesicatoria strains from the Balkan Peninsula revealed by a new multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis scheme. Vancheva Taca, Bogatzevska Nevena, Moncheva Penka, Mitrev Sasa, Vernière Christian, Koebnik Ralf. 2021. Microorganisms, 9 (3):536, 19 p.

Occurrence of two races of Puccinia kuehnii causing orange rust of sugarcane in Florida. Sanjel Santosh, Hincapie Martha, Wang Yunwen, Todd James, Chaulagain Bhim, Sood Sushma, Comstock Jack C., Raid Richard Neil, Rott Philippe. 2021. Plant Pathology, 70 (7) : 1616-1625.

Phenotyping chlorogenic acids and coumarins in sweet potato [Ipomoea batatas (L.) Lam.] breeding lines for enhanced tolerance to periderm pathogens. Lebot Vincent, Leo P., Legendre Laurent. 2021. Euphytica, 217 (4):59, 14 p.

Revisiting Ehrlichia ruminantium replication cycle using proteomics: The host and the bacterium perspectives. Marcelino Isabel, Holzmuller Philippe, Coelho Ana, Mazzucchelli Gabriel, Fernandez Bernard, Vachiéry Nathalie. 2021. Microorganisms, 9 (6):1144, 29 p.

Shade tree traits and microclimate modifications: Implications for pathogen management in biodiverse coffee agroforests. Gagliardi Stephanie, Avelino Jacques, de Melo Virginio Filho Elias, Isaac Marney E.. 2021. Biotropica, 53 (5) : 1356-1367.

Ticks and tick-borne diseases in Central America and the Caribbean: A one health Perspective. Charles Roxanne A., Bermúdez Sergio, Banovic Pavle, Alvarez Dasiel Obregón, Díaz-Sánchez Adrian Alberto, Corona-González Belkis, Etter Eric, Rodríguez González Islay, Ghafar Abdul, Jabbar Abdul, Moutailler Sara, Cabezas-Cruz Alejandro. 2021. Pathogens, 10 (10), n.spéc. Regional Impact of Ticks and Tick-Borne Diseases:1273, 22 p.

Tracing the origin and evolutionary history of Pyricularia oryzae infecting maize and barnyard grass. Pordel Adel, Ravel Sébastien, Charriat FLorian, Gladieux Pierre, Cros-Arteil Sandrine, Milazzo Joëlle, Adreit Henri, Javan-Nikkhah Mohammad, Mirzadi Gohari Amir, Moumeni Ali, Tharreau Didier. 2021. Phytopathology, 111 (1), n.spéc. : 128-136.

Where to find questing Ixodes frontalis ticks? Under bamboo bushes! Plantard Olivier, Hoch Thierry, Daveu Romain, Rispe Claude, Stachurski Frédéric, Boué Franck, Poux Valérie, Cebe Nicolas, Verheyden Hélène, René-Martellet Magalie, Chalvet-Monfray Karine, Cafiso Alessandra, Olivieri Emanuela, Moutailler Sara, Pollet Thomas, Agoulon Albert. 2021. Ticks and Tick-borne Diseases, 12 (2):101625, 6 p.

Adaptation in general temporally changing environments. Roques Lionel, Patout Florian, Bonnefon Olivier, Martin Guillaume. 2020. SIAM Journal on Applied Mathematics, 80 (6) : 2420-2447.

Attention-based recurrent neural network for plant disease classification. Lee Sue Han, Goeau Hervé, Bonnet Pierre, Joly Alexis. 2020. Frontiers in Plant Science, 11:601250, 8 p.

Forests and emerging infectious diseases: Unleashing the beast within. Guégan Jean-François, Ayouba Ahidjo, Cappelle Julien, De Thoisy Benoit. 2020. Environmental Research Letters, 15 (8):083007, 22 p.

Fungal diversity and Fusarium oxysporum pathogenicity associated with coffee corky-root disease in Mexico. Lopez-Lima Daniel, Carrion Gloria, Sanchez-Nava Petra, Desgarennes Damaris, Villain Luc. 2020. Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias. Universidad Nacional de Cuyo, 52 (1) : 276-292.

Genome resources of three west African strains of Pantoea ananatis causing bacterial blight and grain discoloration of rice. Kini Kossi, Lefeuvre Pierre, Poulin Lucie, Silué Drissa, Koebnik Ralf. 2020. Phytopathology, 110 (9) : 1500-1502.

Genomic acquisitions in emerging populations of Xanthomonas vasicola pv. vasculorum infecting corn in the United States and Argentina. Pérez-Quintero Alvaro L., Ortiz-Castro Mary, Lang Jillian M., Rieux Adrien, Wu Guangxi, Liu Sanzhen, Chapman Toni A., Chang Christine, Ziegle Janet, Peng Zhao, White Frank F., Plazas Maria Cristina, Leach Jan E., Broders Kirk. 2020. Phytopathology, 110 (6) : 1161-1173.

Multi-scale spatial genetic structure of the vector-borne pathogen 'Candidatus Phytoplasma prunorum' in orchards and in wild habitats. Marie-Jeanne Véronique, Bonnot François, Thébaud Gaël, Peccoud Jean, Labonne Gérard, Sauvion Nicolas. 2020. Scientific Reports, 10 (1):5002, 13 p.

Plant pathogen life-history traits and adaptation to environmental constraints. Le May christophe (ed.), Montarry Josselin (ed.), Morris Cindy E. (ed.), Frenkel Omer (ed.), Ravigné Virginie (ed.). 2020. Lausanne : Frontière Media, 126 p. (Frontiers Research Topics) ISBN 978-2-88963-530-6

Repeated gain and loss of a single gene modulates the evolution of vascular plant pathogen lifestyles. Gluck-Thaler E., Cerutti Aude, Pérez-Quintero Alvaro L., Butchacas Jules, Roman-Reyna Verónica, Madhavan Vishnu Narayanan, Shantharaj Deepak, Merfa Marcus V., Pesce Céline, Jauneau Alain, Vancheva T., Lang Jillian M., Allen Caitilyn, Verdier Valérie, Gagnevin Lionel, Szurek Boris, Beckham Gregg T., De La Fuente Leonardo, Patel Hitendra Kumar, Sonti Ramesh V., Bragard Claude, Leach Jan E., Noel Laurent D., Slot J., Koebnik Ralf, Jacobs Jonathan M.. 2020. Science Advances, 6 (46), 10 p.

Transfer of Xanthomonas campestris pv. arecae and X. campestris pv. musacearum to X. vasicola (Vauterin) as X. vasicola pv. arecae comb. nov. and X. vasicola pv. musacearum comb. nov. and Description of X. vasicola pv. vasculorum pv. nov. Studholme David J., Wicker Emmanuel, Muzemil Abrare Sadik, Aspin Andrew, Bogdanove Adam J., Broders Kirk, Dubrow Zoe, Grant Murray, Jones Jeffrey B., Karamura Deborah, Lang Jillian M., Leach Jan E., Mahuku George, Nakato Gloria Valentine, Coutinho Teresa A., Smith Julian, Bull Carolee T.. 2020. Phytopathology, 110 (6) : 1153-1160.

The genetics of exapted resistance to two exotic pathogens in pedunculate oak. Bartholome Jérôme, Brachi Benjamin, Marçais Benoît, Mougou‐Hamdane Amira, Bodenes Catherine, Plomion Christophe, Robin Cécile, Desprez‐Loustau Marie‐Laure. 2020. New Phytologist, 226 (4), n.spéc. Featured papers on 'Oak genomics' : 1088-1103.

A genomic approach to develop a new qPCR test enabling detection of the Pyricularia oryzae lineage causing wheat blast. Thierry Maud, Gladieux Pierre, Fournier Elisabeth, Tharreau Didier, Ioos Renaud. 2020. Plant Disease, 104 (1) : 60-70.

A simple method for high molecular-weight genomic DNA extraction suitable for long-read sequencing from spores of an obligate biotroph oomycete. Penouilh-Suzette Charlotte, Fourre Sandra, Besnard Guillaume, Godiard Laurence, Pecrix Yann. 2020. Journal of Microbiological Methods, 178:106054, 8 p.

Assessment of the interaction between the spatial organization of citrus trees populations in cocoa agroforests and Phytophthora foot rot disease of citrus severity. Akoutou Mvondo Etienne, Ndo Eunice Golda Danièle, Ngo Bieng Marie-Ange, Ambang Zachée, Bella Manga, Cilas Christian, Tsouga Manga Milie Lionnelle, Bidzanga Nomo Lucien. 2019. Agroforestry Systems, 93 (2) : 493-502.

Banane. Maladies et ravageurs. Fouré Eric, De Lapeyre de Bellaire Luc. 2019. Fruitrop (Ed. Française) (263) : 90-99.

CRISPR elements provide a new framework for the genealogy of the citrus canker pathogen Xanthomonas citri pv. citri. Jeong Kwanho, Muñoz-Bodnar Alejandra, Arias Rojas Nathalia, Poulin Lucie, Rodríguez-R Luis Miguel, Gagnevin Lionel, Vernière Christian, Pruvost Olivier, Koebnik Ralf. 2019. BMC Genomics, 20:917, 19 p.

Development of the automated primer design workflow uniqprimer and diagnostic primers for the broad-host-range plant pathogen Dickeya dianthicola. Karim Shaista, McNally R. Ryan, Nasaruddin Afnan S., Dereeper Alexis, Mauleon Ramil P., Charkowski Amy O., Leach Jan E., Ben-Hur Asa, Triplett Lindsay R.. 2019. Plant Disease, 103 (11) : 2893-2902.

Effector profile analysis of the tomato and pepper pathogens Xanthomonas perforans and X. euvesicatoria. Iruegas-Bocardo Fernanda, Timilsina Sujan, Jibrin Mustafa O., Minsavage Gerald V., Abrahamian Peter, Egel Daniel S., Creswell Tom, Miller Sydney, Rotondo Francesca, Louws Frank John, Adhikari Tushar, Trueman Cheryl L., Roach Rebecca, Coutinho Teresa A., Pruvost Olivier, Nga Nguyen Thi Thu, Luo Laixin, Kebede Misrak, Potnis Neha, Vallad Gary E., Jones Jeffrey B., Goss Erica. 2019. Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10S), Résumé : 186-187. Congress of International-Society-for-Molecular-Plant-Microbe-Interactions (IS-MPMI), Glasgow, Royaume-Uni, 14 Juillet 2019/18 Juillet 2019.

Forêts tropicales, changements d'usage des sols et risques infectieux émergents. Guégan Jean-François, De Thoisy Benoit, Ayouba Ahidjo, Cappelle Julien. 2019. Revue Forestière Française, 70 (2-3-4) : 209-230.

Identification and characterization of Xanthomonas albilineans causing sugarcane leaf scald in China using multilocus sequence analysis. Ntambo Mbuya Sylvain, Meng Jian-Yu, Rott Philippe, Royer Monique, Lin L. H., Zhang Hui-Li, Gao San-Ji. 2019. Plant Pathology, 68 (2) : 269-277.

Multilocus sequence analysis reveals three distinct populations of 'Candidatus Phytoplasma palmicola' with a specific geographical distribution on the African continent. Pilet Fabian, Nketsia Quaicoe Robert, Osagie Isaac Jesuorobo, Freire Marcos, Foissac Xavier. 2019. Applied and Environmental Microbiology, 85 (8):e02716-18, 16 p.

Not shade, but economic pressures as important drivers of coffee rust epidemics in Nicaragua. Villarreyna Acuna Rogelio Antonio, Barrios Mirna, Vilchez Sergio, Cerda Rolando, Vignola Raffaele, Avelino Jacques. 2019. In : 4th World Congress on Agroforestry. Book of abstracts. Dupraz Christian (ed.), Gosme Marie (ed.), Lawson Gerry (ed.), members of the Scientific Committee of the Congress. CIRAD, INRA, World Agroforestry, Agropolis International, MUSE. Montpellier : CIRAD-INRA, p. 799. World Congress on Agroforestry. 4, Montpellier, France, 20 Mai 2019/22 Mai 2019.

Surface sterilization methods impact measures of internal microbial diversity in ticks. Binetruy Florian, Dupraz Marlène, Buysse Marie, Duron Olivier. 2019. Parasites and Vectors, 12:268, 10 p.

An optimized microsatellite scheme for assessing populations of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis. Rache Leidy, Blondin Laurence, Flores Carolina, Trujillo Cesar, Szurek Boris, Restrepo Silvia, Koebnik Ralf, Bernal Adriana Jimena, Vernière Christian. 2019. Phytopathology, 109 (5) : 859-869.

Diversité des agents pathogènes de l'abeille dans le Sud-Ouest de l'Océan Indien dans un contexte d'invasion récente de Varroa destructor et mortalités associées. Esnault Olivier. 2018. Saint-Denis : Université de la Réunion, 499 p. Thèse de doctorat : Sciences. Biologie animale : Université de la Réunion

Geometagenomics illuminates the impact of agriculture on the distribution and prevalence of plant viruses at the ecosystem scale. Bernardo Pauline, Charles-Dominique Tristan, Barakat Mohamed, Ortet Philippe, Fernandez Emmanuel, Filloux Denis, Hartnady Penelope, Rebelo Tony A., Cousins Stephen, Mesleard François, Cohez Damien, Yaverkovski Nicole, Varsani Arvind, Harkins Gordon William, Peterschmitt Michel, Malmstrom Carolyn, Martin Darren Patrick, Roumagnac Philippe. 2018. ISME Journal, 12 : 174-184.

Nonhuman primates across sub-Saharan Africa are infected with the yaws bacterium Treponema pallidum subsp. pertenue. Knauf Sascha, Gogarten Jan F., Schuenemann Verena J., De Nys Hélène, Düx Ariane, Strouhal Michal, Mikalová Lenka, Bos Kirsten I., Armstrong Roy, Batamuzi Emmanuel K., Chuma Idrissa S., Davoust Bernard, Diatta Georges, Fyumagwa Robert, Kazwala Reuben R., Keyyu Julius, Lejora Inyasi A. V., Levasseur Anthony, Liu Hsi, Mayhew Michael A., Mediannikov Oleg, Raoult Didier, Wittig Roman M., Roos Christian, Leendertz Fabian Hubertus, Smajs David, Nieselt Kay, Krause Johannes, Calvignac-Spencer Sébastien. 2018. Emerging Microbes and Infections, 7 (1) : 1-4.

Recent progress in understanding three major bacterial diseases of sugarcane: gumming, leaf scald and ratoon stunting. Royer Monique, Pieretti Isabelle, Cociancich Stéphane, Rott Philippe. 2018. In : Achieving sustainable cultivation of sugarcane. Volume 2: Breeding, pests and diseases. Rott Philippe (ed.). Cambridge : Burleigh Dodds Science Publishing, 311-336. ISBN 978-1-78676-148-4

Viral metagenomics and sugarcane pathogens. Roumagnac Philippe, Mollov Dimitre S., Daugrois Jean-Heinrich, Filloux Denis. 2018. In : Achieving sustainable cultivation of sugarcane. Volume 2: Breeding, pests and diseases. Rott Philippe (ed.). Cambridge : Burleigh Dodds Science Publishing, 183-200. (Burleigh Dodds Series in Agricultural Science) ISBN 978-1-78676-148-4

Which ecosystem services for disease regulation and health improvement, taking into account biodiversity and health interactions? Binot Aurélie, Morand Serge. 2018. In : Biodiversity conservation in Southeast Asia: challenges in a changing environment. Morand Serge (ed.), Lajaunie Claire (ed.), Satrawaha Rojchai (ed.). Abingdon : Routledge, 165-172. (Earthscan conservation and development series) ISBN 978-1-138-23204-4

A highly specific tool for identification of Xanthomonas vasicola pv. musacearum based on five Xvm-specific coding sequences. Nakato Gloria Valentine, Wicker Emmanuel, Coutinho Teresa A., Mahuku George, Studholme David J.. 2018. Heliyon, 4 (12):e01080, 11 p.

About Ganoderma boninense in oil palm plantations of Sumatra and peninsular Malaysia: Ancient population expansion, extensive gene flow and large scale dispersion ability. Merciere Maxime, Boulord Romain, Carasco-Lacombe Catherine, Klopp Christophe, Lee Yang-Ping, Tan Joon Sheong, Syed Alwee Sharifah Shahrul Rabiah, Zaremski Alba, De Franqueville Hubert, Breton Frédéric, Camus-Kulandaivelu Létizia. 2017. Fungal Biology, 121 (6-7) : 529-540.

Bioassay to Study the Attachment of Xanthomonas albilineans Attachment on sugarcane leaves. Mensi Imène, Daugrois Jean-Heinrich, Rott Philippe. 2017. Bio-Protocol, 7 (2):e2111, 15 p.

Changements globaux et émergence d'infections à transmission vectorielle. Lancelot Renaud, Hendrickx Guy, Guis Hélène. 2017. In : Entomologie médicale et vétérinaire. Duvallet Gérard (ed.), Fontenille Didier (ed.), Robert Vincent (ed.). Marseille : IRD-Ed. Quae, 145-161. ISBN 978-2-7099-2376-7

Comparative genomics of the zoonotic pathogen Ehrlichia chaffeensis reveals candidate type IV effectors and putative host cell targets. Noroy Christophe, Meyer Damien. 2017. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 6 (204), 15 p.

Cryptic lineage diversity in the zoonotic pathogen Angiostrongylus cantonensis. Dusitsittipon Sirilak, Criscione Charles D., Morand Serge, Komalamisra Chalit, Thaenkham Urisa. 2017. Molecular Phylogenetics and Evolution, 107 : 404-414.

Heterogeneity in hidden developmental processes: interference and analysis for stage-structured populations in fluctuating environments. Castano Maria Soledad. 2017. Pointe-à-Pitre : UAG, 185 p. Thesis Ph. D. : Philosophy. Physiology and biology of organisms, population and interactions : Université des Antilles et de la Guyane

Les tabanides (Diptera: Tabanidae). Baldacchino Frédéric, Desquesnes Marc, Duvallet Gérard. 2017. In : Entomologie médicale et vétérinaire. Duvallet Gérard (ed.), Fontenille Didier (ed.), Robert Vincent (ed.). Marseille : IRD-Ed. Quae, 413-424. ISBN 978-2-7099-2376-7

Liver microbiome of Peromyscus leucopus, a key reservoir host species for emerging infectious diseases in North America. André A., Mouton Alice, Millien Virginie, Michaux Johan. 2017. Infection, Genetics and Evolution, 52 : 10-18.

New molecular high throughput methods for Ehrlichia ruminantium tick screening and characterization of strain genetic structure in Mozambique and at worldwide scale. Cangi Nidia. 2017. Pointe-à-Pitre : Université des Antilles, 166 p. Thesis Ph.D. : Life science. Molecular biology and Genetic : Université des Antilles et de la Guyane

Quantitative assessment of the microbiological risk associated with the consumption of attieke in Côte d'Ivoire. Akmel Djedjro Clément, Aw Sadat, Montet Didier, Assidjo Nogbou Emmanuel, Degni Marie Louise, Akaki David, Moretti Christine, Elleingand Eric, Brabet Catherine, Baud Guillaume, Mens Frédéric, Yao Benjamin, Michel Thomas, Durand Noel, Assin Hubert, Berthiot Laurent, Tapé Thierry. 2017. Food Control, 81 : 65-73.

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The success story of the implementation of the national food safety agency in Ivory Coast. Montet Didier, Akaki David, Moretti Christine, Brabet Catherine, Manizan Ama Lethicia, Elleingand Eric, Baud Guillaume, Mens Frédéric, Yao Benjamin, Michel Thomas, Assidjo Nogbou Emmanuel, Aw Sadat, Akmel Djedjro Clément, Assin Hubert, Durand Noel, Alter Pascaline, Berthiot Laurent, Metayer Isabelle, Tapé Thierry. 2017. Egyptian Journal of Basic and Applied Sciences, 4 (4) : 366-371.

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The streamlined genome of Phytomonas spp. relative to human pathogenic kinetoplastids reveals a parasite tailored for plants. Porcel Betina M., Denoeud France, Opperdoes Fred, Noël Benjamin, Madoui Mohammed-Amine, Hammarton Tansy, Field Mark, Da Silva Corinne, Couloux Arnaud, Poulain Julie, Katinka Michael, Jabbari Kamel, Aury Jean-Marc, Campbell David A., Cintron Roxana, Dickens Nicolas, Docampo Roberto, Sturm Nancy R., Koumandou Lila, Fabre Sandrine, Flegontov Pavel, Lukes Julius, Michaeli Shula, Mottram Jeremy, Szoor Balazs, Zilberstein Dan, Bringaud Frédéric, Wincker Patrick, Dollet Michel. 2014. PLoS Genetics, 10 (2):e1004007, 24 p.

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