Effects of quantitative and qualitative principal component score strategies on the structure of coffee, rubber tree, rice and sorghum core collections

Hamon Serge, Dussert Stéphane, Deu Monique, Hamon Perla, Seguin Marc, Glaszmann Jean-Christophe, Grivet Laurent, Chantereau Jacques, Chevallier Marie-Hélène, Flori Albert, Lashermes Philippe, Legnaté Hyacinthe, Noirot Michel. 1998. Effects of quantitative and qualitative principal component score strategies on the structure of coffee, rubber tree, rice and sorghum core collections. Genetics Selection Evolution, 30suppl.1, S237-S258 Colloque national BRG/USTL. 2, Lille, France, 8 Octobre 1997/10 Octobre 1997.

https://doi.org/10.1051/gse:19980714

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact

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Titre anglais : Effects of quantitative and qualitative principal component score strategies on the structure of coffee, rubber tree, rice and sorghum core collections

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : La stratégie PCSS (Principal Component Score Strategy) est une méthode de sélection, basée sur des analyses multivariées, proposée pour constituer des "core collection" à partir de collections importantes de ressources génétiques. La méthode décrite sur des données quantitatives est adaptée ici à des données qualitatives de type moléculaire. Ces deux méthodes ont été testées pour leurs impacts sur la structure de quatre plantes tropicales : caféier, hévéa, riz et sorgho.Les résultats montrent, dans tous les cas, que l'augmentation des contributions relatives cumulées (CRC) sont très rapides mais diffèrent d'une espèce à l'autre. Dix pour cent de la collection totale permet d'obtenir de 22 à 58 % de CRC. Comme prévu, la variabilité des caractères quantitatifs dans les échantillons, est peu ou pas modifiée lorsque la sélection est qualitative mais elle l'est fortement par une sélection quantitative. La sélection qualitative apparaît comme la plus efficace pour conserver les allèles rares et augmenter la diversité globale avec des effets limités au niveau quantitatif. L'utilisation d'espèces très différentes a permis de comparer les impacts respectifs des deux méthodes et de mettre en lumière les avantages d'une sélection combinée sur les deux types d'approches.

Mots-clés Agrovoc : Coffea canephora, Hevea brasiliensis, Oryza sativa, Sorghum bicolor, banque de gènes, ressource génétique, gestion des ressources, méthode d'amélioration génétique, sélection, méthode statistique, variation génétique, gène, anatomie végétale