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Alternative double strand break repair pathways shape the evolution of high recombination in the honey bee, Apis mellifera. Fouks Bertrand, Miller Kathleen J., Ross Caitlin, Jones Corbin, Rueppell Olav. 2024. Insect Molecular Biology, 18 p.

DNA transposons favor de novo transcript emergence through enrichment of transcription factor binding motifs. Lebherz Marie Kristin, Fouks Bertrand, Schmidt Julian, Bornberg-Bauer Erich, Grandchamp Anna. 2024. Genome Biology and Evolution, 16 (7), 16 p.

Genome-wide association studies reveals new candidate genes associated with resistance to Striga gesneroides in Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] accessions from sub-Saharan Africa. Koura Abdoulaye Ali, Wireko Kena Alexander, Annor Benjamin, Adejumobi Idris I., Sayadi Maazou Abdoul-raouf, Awuku Fredercik Justice, Attamah Patrick, Boukar Ousmane, Richard Akromah. 2024. Ecological Genetics and Genomics, 32:100267, 8 p.

The bZIP transcription factor BIP1 of the rice blast fungus is essential for infection and regulates a specific set of appressorium genes. Lambou Karine, Tag Andrew, Lassagne Alexandre, Collemare Jérôme, Clergeot Pierre-Henri, Barbisan Crystel, Perret Phillippe, Tharreau Didier, Millazo Joelle, Chartier Elia, De Vries Ronald P., Hirsch Judith, Morel Jean-Benoit, Beffa Roland, Kroj Thomas, Thomas Terry, Lebrun Marc-Henri. 2024. PLoS Pathogens, 20 (1):e1011945, 30 p.

CRISPRi in Xanthomonas demonstrates functional convergence of transcription activator-like effectors in two divergent pathogens. Zárate-Chaves Carlos Andrés, Audran Corinne, Medina Culma César Augusto, Escalon Aline, Javegny Stéphanie, Gagnevin Lionel, Thomas Emilie, Pimparé Léa-Lou, López Camilo, Jacobs Jonathan M., Noel Laurent D., Koebnik Ralf, Bernal Adriana Jimena, Szurek Boris. 2023. New Phytologist, 238 (4) : 1593-1604.

Genetic mapping, candidate gene identification and marker validation for host plant resistance to the race 4 of Fusarium oxysporum f. sp. cubense using Musa acuminata ssp. malaccensis. Chen Andrew, Sun Jiaman, Viljoen Altus, Mostert Diane, Xie Yucong, Mangila Leroy, Bothma Sheryl, Lyons Rebecca, Hribova Eva, Christelová Pavla, Uwimana Brigitte, Amah Delphine, Pearce Stephen, Chen Ning, Batley Jacqueline, Edwards David P., Dolezel Jaroslav, Crisp Peter, Brown Allan F., Martin Guillaume, Yahiaoui Nabila, D'Hont Angélique, Coin Lachlan, Swennen Rony, Aitken Elizabeth A. B.. 2023. Pathogens, 12 (6), n.spéc. Current Research on Fusarium:820, 27 p.

Growth-defence trade-off in rice: Fast-growing and acquisitive genotypes have lower expression of genes involved in immunity. de Tombeur Felix, Pélissier Rémi, Shihan Ammar, Rahajaharilaza Koloina, Fort Florian, Mahaut Brigitte, Lemoine Taïna, Thorne Sarah J., Hartley Sue E., Luquet Delphine, Fabre Denis, Lambers Hans, Morel Jean-Benoit, Ballini Elsa, Violle Cyrille. 2023. Journal of Experimental Botany, 74 (10) : 3094-3103.

Marker-assisted pyramiding of blast-resistance genes in a japonica elite rice cultivar through forward and background selection. Zampieri Elisa, Volante Andrea, Maré Caterina, Orasen Gabriele, Desiderio Francesca, Biselli Chiara, Canella Marco, Carmagnola Lorena, Milazzo Joëlle, Adreit Henri, Tharreau Didier, Poncelet Nicolas, Vaccino Patrizia, Valè Giampiero. 2023. Plants, 12 (4), n.spéc. Advances in Genetics and Breeding of Grain Crops:757, 17 p.

Molecular detection of Loxodontofilaria spp. in Asian elephants (Elephas maximus) from elephant training camps in Thailand. Saengsawang Phirabhat, Desquesnes Marc, Yangtara Sarawut, Chalermwong Piangjai, Thongtip Nikorn, Jittapalapong Sathaporn, Inpankaew Tawin. 2023. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases, 92:101910, 8 p.

Multi-environment association study highlights candidate genes for robust agronomic quantitative trait loci in a novel worldwide Capsicum core collection. McLeod Louis, Barchi Lorenzo, Tumino Giorgio, Tripodi Pasquale, Salinier Jérémy, Gros Christophe, Boyaci Filiz, Ozalp Ramazan, Borovsky Yelena, Schafleitner Roland, Barchenger Derek, Finkers Richard, Brouwer Matthijs, Stein Nils, Rabanus-Wallace Mark Timothy, Giuliano Giovanni, Voorrips Roeland, Paran Ilan, Lefebvre Véronique. 2023. The Plant Journal, 116 (5) : 1508-1528.

Multiple gene co-options underlie the rapid evolution of sexually deceptive flowers in Gorteria diffusa. Kellenberger Roman T., Ponraj Udhaya, Delahaie Boris, Fattorini Róisín, Balk Janneke, Lopez-Gomollon Sara, Müller Karin H., Ellis Allan G., Glover Beverley J.. 2023. Current Biology, 33 (8) : 1502-1512.

Phylogeny, ecology, and gene families covariation shaped the olfactory subgenome of rodents. Courcelle Maxime, Fabre Pierre-Henri, Douzery Emmanuel. 2023. Genome Biology and Evolution, 15 (11):evad197, 15 p.

When morphology does not fit the genomes: the case of rodent olfaction. Martinez Quentin, Courcelle Maxime, Douzery Emmanuel, Fabre Pierre-Henri. 2023. Biology Letters, 19 (4):20230080, 7 p.

The compact genome of the sponge Oopsacas minuta (Hexactinellida) is lacking key metazoan core genes. Santini Sébastien, Schenkelaars Quentin, Jourda Cyril, Duchesne Marc, Belahbib Hassiba, Rocher Caroline, Selva Marjorie, Riesgo Ana, Vervoort Michel, Leys Sally P., Kodjabachian Laurent, Le Bivic André, Borchiellini Carole, Claverie Jean-Michel, Renard Emmanuelle. 2023. BMC Biology, 21:139, 21 p.

A major genetic locus in neighbours controls changes of gene expression and susceptibility in intraspecific rice mixtures. Pélissier Rémi, Ducasse Aurélie, Ballini Elsa, Frouin Julien, Violle Cyrille, Morel Jean-Benoit. 2023. New Phytologist, 238 (2) : 835-844.

A multi-level approach reveals key physiological and molecular traits in the response of two rice genotypes subjected to water deficit at the reproductive stage. Favreau Bénédicte, Gaal Camille, Pereira De Lima Isabela, Droc Gaëtan, Roques Sandrine, Sotillo Armelle, Guérard Florence, Cantonny Valérie, Gakière Bertrand, Leclercq Julie, Lafarge Tanguy, De Raissac Marcel. 2023. Plant-Environment Interactions, 4 (5) : 229-257.

CRISPR/Cas9-Targeted knockout of rice susceptibility genes OsDjA2 and OsERF104 reveals alternative sources of resistance to Pyricularia oryzae. Tavora Fabiano T.P.K., Meunier Anne Cecile, Vernet Aurore, Portefaix Murielle, Milazzo Joëlle, Adreit Henri, Tharreau Didier, Franco Octávio L., Mehta Angela. 2022. Rice Science, 29 (6) : 535-544.

Characterization of peroxidase and laccase gene families and in silico identification of potential genes involved in upstream steps of lignan formation in sesame. Bovys Zoclanclounon Yedomon Ange, Rostás Michael, Chung Nam-Jin, Mo Youngjun, Karlovsky Petr, Dossa Komivi. 2022. Life, 12 (8), n.spéc. Research Advances in Plant Genomics: 2nd Edition:1200, 18 p.

Distribution of invasive versus native whitefly species and their pyrethroid knock‑down resistance allele in a context of interspecific hybridization. Taquet Alizée, Jourdan-Pineau Hélène, Simiand Christophe, Grondin Martial, Barrès Benoit, Delatte Hélène. 2022. Scientific Reports, 12:8448, 14 p.

Divergence of olfactory receptors associated with the evolution of assortative mating and reproductive isolation in mice. Smadja Carole M., Loire Etienne, Caminade Pierre, Severac Dany, Gautier Mathieu, Ganem Guila. 2022. Peer Community Journal, 2:e72, 29 p.

Expression of an A20/AN1 stress-associated protein from Aeluropus littoralis in rice deregulates stress-related genes. Ben Romdhane Walid, Ben Saad Rania, Meynard Donaldo, Zouari Nabil, Tarroum Mohamed, Ali Ahmed, Droc Gaëtan, Perin Christophe, Morel Jean-Benoit, Fki Lotfi, Al-Doss Abdullah, Guiderdoni Emmanuel, Hassairi Afif. 2022. Journal of Plant Growth Regulation, 41 (2) : 848-862.

Genome-wide characterization and identification of candidate ERF genes involved in various abiotic stress responses in sesame (Sesamum indicum L.). Su Ruqi, Dossou Senouwa Segla Koffi, Dossa Komivi, Zhou Rong, Liu Aili, Zhong Yanping, Fang Sheng, Zhang Xiurong, Wu Ziming, You Jun. 2022. BMC Plant Biology, 22:256, 13 p.

Micro-RNA-Regulated SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE (SPL) gene expression and Cytokinin Accumulation Distinguish Early-Developing Male and Female inflorescences in oil palm (Elaeis guineensis). Tregear James, Richaud Frédérique, Collin Myriam, Esbelin Jennifer, Parrinello Hugues, Cochard Benoît, Nodichao Leifi, Morcillo Fabienne, Adam Hélène, Jouannic Stefan. 2022. Plants, 11 (5), n.spéc. Developmental and Genetic Mechanisms of Floral Structure:685, 17 p.

Specificity and genetic polymorphism in the Vfm quorum sensing system of plant pathogenic bacteria of the genus Dickeya. Hugouvieux-Cotte-Pattat Nicole, Royer Monique, Gueguen Erwan, Le Guen Paul, Süssmuth Roderich, Reverchon Sylvie, Cociancich Stéphane. 2022. Environmental Microbiology, 24 (3), n.spéc. Pathogen and Antimicrobial Resistance Ecology : 1467-1483.

Transcriptome responses of wild Arachis to UV-C exposure reveal genes involved in general plant defense and priming. Martins Andressa Cunha Quintana, Zotta Mota Ana, Carvalho Paula Andrea Sampaio Vasconcelos, Passos Mario Alfredo Saraiva, Gimenes Marcos Aparecido, Guimarães Patricia Messenberg, Brasileiro Ana Christina Miranda. 2022. Plants, 11 (3), n.spéc. Exploring Resilient Crop Species to Understand the Genetic Basis of Stress Adaptation:408, 23 p.

Transcriptomic analysis of the sugarcane orange rust pathogen Puccinia kuehnii. Cardenas Daniela E., Auer Lucas, Morin Emmanuelle, Carrillo-Tarazona Yisel, Sood Sushma, Huguet-Tapia Jose, Saunders Diane G.O., Duplessis Sébastien, Rott Philippe, Cano Liliana M.. 2022. Sugar Journal (June) : 33-34. ASSCT 2022 Annual Meeting, Bonita Springs, États-Unis, 21 Juin 2022/23 Juin 2022.

Transgenic expression of Nix converts genetic females into males and allows automated sex sorting in Aedes albopictus. Lutrat Célia, Olmo Roenick P., Baldet Thierry, Bouyer Jérémy, Marois Eric. 2022. Communications Biology, 5:210, 10 p.

Transgenic tomato expressing an oxalate decarboxylase gene from Flammulina sp. shows increased survival to Moniliophthora perniciosa. Pereira Menezes Reis Sara, De Andrade Silva Edson Mario, Peres Gramacho Karina, Freitas Sena Kaleandra, Da Costa Silva Delmira, Lima Aragão Francisco José, Cardoso Costa Marcio Gilberto, Micheli Fabienne. 2022. Scientia Horticulturae, 299:111004, 12 p.

The rice ILI2 locus is a bidirectional target of the African Xanthomonas oryzae pv. oryzae major transcription activator-like effector TalC but does not contribute to disease susceptibility. Doucoure Hinda, Auguy Florence, Baufume Servane, Fabre Sandrine, Gabriel Marc, Thomas Emilie, Dambreville Fleur, Sciallano Coline, Szurek Boris, Koita Ousmane, Verdier Valérie, Cunnac Sébastien. 2022. International Journal of Molecular Sciences, 23 (10):5559, 20 p.

GreenPhylDB v5: A comparative pangenomic database for plant genomes. Guignon Valentin, Toure Abdel, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Conte Matthieu, Rouard Mathieu. 2021. Nucleic Acids Research, 49 (D1) : D1464-D1471.

Periodontitis associates with species-specific gene expression of the oral microbiota. Belstrom Daniel, Constancias Florentin, Drautz-Moses Daniela I., Schuster Stephan C., Veleba Mark, Mahé Frédéric, Givskov Michael. 2021. npj Biofilms and Microbiomes, 7:76, 10 p.

Time-calibrated genomic evolution of a monomorphic bacterium during its establishment as an endemic crop pathogen. Richard Damien, Pruvost Olivier, Balloux François, Boyer Claudine, Rieux Adrien, Lefeuvre Pierre. 2021. Molecular Ecology, 30 (8) : 1823-1835.

An atypical class of non-coding small RNAs is produced in rice leaves upon bacterial infection. Reshetnyak Ganna, Jacobs Jonathan M., Auguy Florence, Sciallano Coline, Claude Lisa, Medina Clemence, Pérez-Quintero Alvaro L., Comte Aurore, Thomas Emilie, Bogdanove Adam J., Koebnik Ralf, Szurek Boris, Diévart Anne, Brugidou Christophe, Lacombe Séverine, Cunnac Sébastien. 2021. Scientific Reports, 11 (1):24141, 20 p.

Analysis of the allelic variation in the Shell gene homolog of E. oleifera and design of species specific Shell primers. Astorkia Maider, Hernandez Mónica, Bocs Stéphanie, Ponce Kevin, León Olga, Morales Shone, Quezada Nathalie, Orellana Francisco, Wendra Fahni, Sembiring Zulhermana, Asmono Dwi, Ritter Enrique. 2020. Euphytica, 216:5, 16 p.

Evolutionarily conserved plant genes responsive to root-knot nematodes identified by comparative genomics. Zotta Mota Ana, Fernandez Diana, Arraes Fabricio B.M., Petitot Anne-Sophie, Paes de Melo Bruno, Lisei de Sa Maria E., Grynberg Priscila, Passos Saraiva Mario A., Messenberg Guimaraes Patricia, Brasileiro Ana Christina Miranda, Albuquerque Erika Valeria Saliba, Danchin Etienne G. J., Grossi-de-Sa Maria Fatima. 2020. Molecular Genetics and Genomics, 295 (4) : 1063-1078.

Fine scale spatial investigation of multiple insecticide resistance and underlying target-site and metabolic mechanisms in Anopheles gambiae in central Côte d'Ivoire. Oumbouke Welbeck A., Pignatelli Patricia, Barreaux Antoine, Tia Innocent Zran, Koffi Alphonsine A., Ahoua Alou Ludovic P., Sternberg Eleanore D., Thomas Matthew B., Weetman David, N'Guessan Raphaël. 2020. Scientific Reports, 10:15066, 13 p

Identification and fine mapping of Pi69(t), a new gene conferring broad-spectrum resistance against Magnaporthe oryzae from Oryza glaberrima steud. Dong Liying, Liu Shuguang, Sandar Kyaing May, Xu Peng, Tharreau Didier, Deng Wei, Li Xundong, Bi Yunqing, Zeng Li, Li Jing, Zhou Jiawu, Tao Dayun, Yang Qinzhong. 2020. Frontiers in Plant Science, 11:1190, 8 p.

Identification of differentially expressed proteins in sugarcane in response to infection by Xanthomonas albilineans using iTRAQ quantitative proteomics. Meng Jian-Yu, Ntambo Mbuya Sylvain, Rott Philippe, Fu Hua-Ying, Huang Mei-Ting, Zhang Hui-Li, Gao San-Ji. 2020. Microorganisms, 8 (1):76, 21 p.

Prehaustorial local resistance to coffee leaf rust in a Mexican cultivar involves expression of salicylic acid-responsive genes. Couttolenc-Brenis Edgar, Carrion Gloria, Villain Luc, Ortega-Escalona Fernando, Ramírez-Martínez Daniel, Mata-Rosas Martín, Méndez-Bravo Alfonso. 2020. PeerJ, 8:e8345, 21 p.

Depicting the core transcriptome modulating multiple abiotic stresses responses in sesame (Sesamum indicum L.). Dossa Komivi, Mmadi Marie Ali, Zhou Rong, Zhang Tianyuan, Su Ruqi, Zhang Yujuan, Wang Linhai, You Jun, Zhang Xiurong. 2019. International Journal of Molecular Sciences, 20 (16), n.spéc. Plant Genomics 2019:3930, 19 p.

Ebb and flow of vascular pathogenesis through repeated gain. Gluck-Thaler E., Cerutti Aude, Perez Quintero A.L., Pesce C., Jauneau Alain, Vancheva T., Lang Jillian M., Allen Caitilyn, Verdier-Michel V., Gagnevin Lionel, Szurek Boris, Cunnac Sébastien, Bragard Claude, Leach Jan E., Noel Laurent D., Slot J., Koebnik Ralf, Jacobs J.M.. 2019. Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10S), suppl., p. S1.22 IS-MPMI Congress. 18, Glasgow, Royaume-Uni, 14 Juillet 2019/18 Juillet 2019.

Engineering meiotic recombination pathways in rice. Fayos Ian, Mieulet Delphine, Petit Julie, Meunier Anne Cecile, Périn Christophe, Nicolas Alain, Guiderdoni Emmanuel. 2019. Plant Biotechnology Journal, 17 (11) : 2062-2077.

Genome-wide analysis of the barley non-specific lipid transfer protein gene family. Zhang Mengyue, Kim Yujin, Zong Jie, Lin Hong, Diévart Anne, Li Huanjun, Zhang Dabing, Liang Wanqi. 2019. Crop Journal, 7 (1) : 65-76.

Genome-wide association mapping of date palm fruit traits. Hazzouri Khaled M., Gros-Balthazard Muriel, Flowers Jonathan M., Copetti Dario, Lemansour Alain, Lebrun Marc, Masmoudi Khaled, Ferrand Sylvie, Dhar Michael I., Fresquez Zoë A., Rosas Ulises, Zhang Jianwei, Talag Jayson, Lee Seunghee, Kudrna Dave, Powell Robyn F., Leitch Ilia J., Krueger Robert, Wing Rod A., Amiri Khaled M. A., Purugganan Michael D.. 2019. Nature Communications, 10 (1):4680, 14 p.

HVA22 from citrus: A small gene family whose some members are involved in plant response to abiotic stress. Gomes Ferreira Monique Drielle, Araújo Castro Jacqueline, Santana Silva Raner José, Micheli Fabienne. 2019. Plant Physiology and Biochemistry, 142 : 395-404.

Identification de gènes impliqués dans la régulation de la mise en place de la paroi secondaire chez le sorgho. Hennet Lauriane. 2019. Montpellier : Université de Montpellier, 332 p. Thèse de doctorat : Agronomie : Université de Montpellier

Live attenuated bacterial strain and its use as a vaccine. Meyer Damien, Gordon Jonathan, Vachiéry Nathalie, Martinez Dominique. 2019. Genève : OMPI, 44 p. N° de dépôt international : PCT/EP2018/075634, N° de brevet international : WO2019057909A1, N° de dépôt européen : 17306235.7, N° de brevet européen : EP3459561

Rôle de la cassiicoline dans l'interaction compatible Hevea brasiliensis / Corynespora cassiicola : vers la sélection assistée par effecteur. Ribeiro Sébastien. 2019. Clermont-Ferrand : Université Clermont Auvergne, 250 p. Thèse de doctorat : Physiologie et génétique moléculaire : Université Clermont Auvergne

Seed comparative genomics in three coffee species identify desiccation tolerance mechanisms in intermediate seeds. Stavrinides Anna K., Dussert Stéphane, Combes Marie-Christine, Fock-Bastide Isabelle, Severac Dany, Minier Jérôme, Bastos-Siqueira Aldecinei, Demolombe Vincent, Hem Sonia, Lashermes Philippe, Joët Thierry. 2019. Journal of Experimental Botany, 71 (4) : 1418-1433.

Comparative transcriptome profiling of virulent and attenuated Ehrlichia ruminantium strains highlighted strong regulation of map1- and metabolism related genes. Pruneau Ludovic, Lebrigand Kevin, Mari Bernard, Lefrançois Thierry, Meyer Damien, Vachiéry Nathalie. 2018. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 8:153, 16 p.

Functional analysis of different promoter haplotypes of the coffee (Coffea canephora) CcDREB1D gene through genetic transformation of Nicotiana tabacum. De Aquino Oliveira Sinara, De Araújo Carneiro Fernanda, Silva Rêgo Erica Cristina, Costa Alves Gabriel Sergio, Carvalho Andrade Alan, Marraccini Pierre. 2018. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 132 (2) : 279-294.

Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. Chen Nicolas W.G., Serres-Giardi Laurana, Ruh Mylène, Briand Martial, Bonneau Sophie, Darrasse Armelle, Barbe Valérie, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Jacques Marie Agnès. 2018. BMC Genomics, 19:606, 20 p.

Identification des gènes impliqués dans la production et la détoxication des espèces activées de l'oxygène chez Hevea brasiliensis et leur caractérisation dans le latex. Zhang Yi. 2018. Montpellier : Université de Montpellier, 144 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université de Montpellier

Iron starvation conditions upregulate Ehrlichia ruminantium type IV secretion system, tr1 transcription factor and map1 genes family through the master regulatory protein ErxR. Moumène Amal, Gonzalez-Rizzo Silvina, Lefrançois Thierry, Vachiéry Nathalie, Meyer Damien. 2018. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 7:535, 11 p.

La régénération par graines et par multiplication végétative à faible coût (drageons et boutures de segments de racine). Bellefontaine Ronald, Meunier Quentin (collab.), Ichaou Aboubacar (collab.), Morin Amélie (collab.), Mapongmetsem Pierre Marie (collab.), Belem Bassirou (collab.), Azihou Akomian Fortuné (collab.), Houngnon Alfred (collab.), Abdourhamane Hamidou (collab.). 2018. Montpellier : CIRAD, 463 p.

Nucleotide diversity of the coding and promoter rRegions of DREB1D, a candidate gene for drought tolerance in Coffea Species. Costa Alves Gabriel Sergio, Ferreira Torres Luana, De Aquino Oliveira Sinara, Reichel Tharyn, Freire Luciana Pereira, Gomes Vieira Natalia, Vinecky Felipe, This Dominique, Pot David, Etienne Hervé, Vilela Paiva Luciano, Marraccini Pierre, Carvalho Andrade Alan. 2018. Tropical Plant Biology, 11 (1-2) : 31-48.

Ten broad spectrum resistances to downy mildew physically mapped on the sunflower genome. Pecrix Yann, Penouilh-Suzette Charlotte, Muños Stéphane, Vear Felicity, Godiard Laurence. 2018. Frontiers in Plant Science, 9:1780, 15 p.

Tolerance to mild salinity stress in japonica rice: A genome-wide association mapping study highlights calcium signaling and metabolism genes. Frouin Julien, Languillaume Antoine, Mas Justine, Mieulet Delphine, Boisnard Arnaud, Labeyrie Axel, Bettembourg Mathilde, Bureau Charlotte, Lorenzini Eve, Portefaix Murielle, Turquay Patricia, Vernet Aurore, Périn Christophe, Ahmadi Nourollah, Courtois Brigitte. 2018. PloS One, 13 (1):e0190964, 27 p.

Adaptation of genetically monomorphic bacteria: evolution of copper resistance through multiple horizontal gene transfers of complex and versatile mobile genetic elements. Richard Damien, Ravigné Virginie, Rieux Adrien, Facon Benoît, Boyer Claudine, Boyer Karine, Grygiel Pierre, Javegny Stéphanie, Terville Marie Annabelle, Canteros B.I., Robene Isabelle, Vernière Christian, Chabirand Aude, Pruvost Olivier, Lefeuvre Pierre. 2017. Molecular Ecology, 26 (7), n.spéc. Microbial Local Adaptation : 2131-2149.

Alternative oxidase (AOX) constitutes a small family of proteins in Citrus clementina and Citrus sinensis L. Osb. Araújo Castro Jacqueline, Drielle Gomes Ferreira Monique, Santana Silva Raner José, Andrade Bruno Silva, Micheli Fabienne. 2017. PloS One, 12 (5):e0176878, 17 p.

Analyse des déterminants génétiques contrôlant la production et la composition de la tige chez le sorgho (Sorghum bicolor [L.] Moench). Intégration des approches bi-et multi-parentales. Thera Korotimi. 2017. Montpellier : Montpellier SupAgro, 245 p. Thèse de doctorat : Sciences agronomiques et écologie : Montpellier SupAgro

Comparison of the efficiency of different newcastle disease virus reverse genetics systems. Liu Haijin, Servan de Almeida Renata, Gil Patricia, Albina Emmanuel. 2017. Journal of Virological Methods, 249 : 111-116.

Crop-model assisted phenomics and genome-wide association study for climate adaptation of indica rice. 1. Phenology. Dingkuhn Michael, Pasco Richard, Pasuquin Julie, Damo Jean, Soulie Jean-Christophe, Raboin Louis-Marie, Dusserre Julie, Sow Abdoulaye, Manneh Baboucarr, Shrestha Suchit, Balde Alpha Bocar, Kretzschmar Tobias. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (15) : 4369-4388.

Crop-model assisted phenomics and genome-wide association study for climate adaptation of indica rice. 2. Thermal stress and spikelet sterility. Dingkuhn Michael, Pasco Richard, Pasuquin Julie, Damo Jean, Soulie Jean-Christophe, Raboin Louis-Marie, Dusserre Julie, Sow Abdoulaye, Manneh Baboucarr, Shrestha Suchit, Kretzschmar Tobias. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (15) : 4389-4406.

Cyanobacteria as source of marine bioactive compounds: Molecular specific detection based on Δ9 desaturase gene. Ben Amor Faten, Barkallah Mohamed, Elleuch Fatma, Karkouch Nesrine, Dammak Mouna, Baréa Bruno, Villeneuve Pierre, Abdelkafi Slim, Fendri Imen. 2017. International Journal of Biological Macromolecules, 105 (Part 2) : 1440-1445.

Deciphering the Theobroma cacao self-incompatibility system: from genomics to diagnostic markers for self-compatibility. Lanaud Claire, Fouet Olivier, Legavre Thierry, Lopes Uilson Vanderlei, Sounigo Olivier, Eyango Marie Claire, Mermaz Benoit, da Silva Marcos Ramos, Loor Solorzano Rey Gaston, Argout Xavier, Gyapay Gabor, Ebaiarrey Herman Ebai, Colonges Kelly, Sanier Christine, Rivallan Ronan, Mastin Géraldine, Cryer Nicholas, Boccara Michel, Verdeil Jean-Luc, Efombagn Mousseni Ives Bruno, Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (17) : 4775-4790.

Development of SNP markers present in expressed genes of the plant-pathogen interaction: Theobroma cacao - Moniliophtora perniciosa. Lemos Lívia Santos Lima, Gramacho Karina Peres, Pires José Luis, Ferreira Santos Rogério Mercês, Ganem Rodrigo Sousa, Costa Marcio Gilberto Cardoso, Micheli Fabienne. 2017. AgroTropica, 29 (2) : 111-118.

Diversité et origine génétique des espèces de la sous famille des Aurantioideae et décryptage des structures interspécifiques des génomes des agrumes modernes. Oueslati Bahri Amel. 2017. Tunis : Université de Tunis El Manar, 200 p. Thèse de doctorat : Biologie. Génétique et biologie moléculaire : Université de Tunis El Manar

Do changes in gene expression contribute to sexual isolation and reinforcement in the house mouse? Loire Etienne, Tusso Sergio, Caminade Pierre, Severac Dany, Boursot Pierre, Ganem Guila, Smadja Carole. 2017. Molecular Ecology, 26 (19) : 5189-5202.

Eggplant resistance to the Ralstonia solanacearum species complex involves both broad-spectrum and strain-specific quantitative trait loci. Salgon Sylvia, Jourda Cyril, Sauvage Christopher, Daunay Marie-Christine, Reynaud Bernard, Wicker Emmanuel, Dintinger Jacques. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:828, 21 p.

Evidence that agricultural use of pesticides selects pyrethroid resistance within Anopheles gambiae s.l. populations from cotton growing areas in Burkina Faso, West Africa. Hien Aristide Sawdetuo, Soma Dieudonné Diloma, Hema Omer S.A., Bayili Bazoma, Namountougou Moussa, Gnankine Olivier, Baldet Thierry, Diabaté Abdoulaye, Roch Dabiré Kounbobr. 2017. PloS One, 12 (3):e0173098, 15 p.

Fine mapping of Pi57 conferring broad spectrum resistance against Magnaporthe oryzae in introgression line IL-E1454 derived from Oryza longistaminata. Dong Liying, Liu Shuguang, Xu Peng, Deng Wei, Li Xundong, Tharreau Didier, Li Jing, Zhou Jiawu, Wang Qun, Tao Dayun, Yang Qinzhong. 2017. PloS One, 12 (10):e0186201, 11 p.

From east to west across the Palearctic: Phylogeography of the invasive lime leaf miner Phyllonorycter issikii (Lepidoptera: Gracillariidae) and discovery of a putative new cryptic species in East Asia. Kirichenko Natalia, Triberti Paolo, Ohshima Issei, Haran Julien, Byun Bong-Kyu, Li Houhun, Augustin Sylvie, Roques Alain, Lopez-Vaamonde Carlos. 2017. PloS One, 12 (2):e0171104, 22 p.

Functional characterization of the versatile myb gene family uncovered their important roles in plant development and responses to drought and waterlogging in sesame. Mmadi Marie Ali, Dossa Komivi, Wang Linhai, Zhou Rong, Wang Yanyan, Cissé Ndiaga, Sy Mame Ourèye, Zhang Xiurong. 2017. Genes, 8 (12), n.spéc. Genetic Regulation of Abiotic Stress Responses:362, 18 p.

Functional genes of microorganisms, comprehending the dynamics of agricultural ecosystems. Reali Catiusca, Pilz Júnior Harry Luiz, Meile Jean-Christophe, Shorr Galindo Sabine, Fiuza Lidia Mariana. 2017. Brazilian Archives of Biology and Technology, 60:e17160370, 18 p.

Identification of Ganoderma disease resistance loci using natural field infection of an oil palm multiparental population. Tisne Sébastien, Pomies Virginie, Riou Virginie, Syahputra Indra, Cochard Benoît, Denis Marie. 2017. G3 - Genes Genomes Genetics, 7 : 1683-1692.

A L-type lectin gene is involved in the response to hormonal treatment and water deficit in Volkamer lemon. Vieira Dayse Drielly Sousa Santana, Emiliani Giovanni, Bartolini Paola, Podda Alessandra, Centritto Mauro, Luro François, Del Carratore Renata, Morillon Raphaël, Gesteira Abelmon S., Maserti Bianca Elena. 2017. Journal of Plant Physiology, 218 : 94-99.

Le génome du cacaoyer : du décodage de sa séquence jusqu'à l'étude de gènes impliqués dans des caractères agronomiques d'intérêt. Argout Xavier. 2017. Montpellier : Montpellier SupAgro, 238 p. Thèse de doctorat : Biologie, interactions, diversité adaptative des plantes : Montpellier SupAgro

Molecular insights into the origin of the brown rust resistance gene Bru1 among Saccharum species. Wang Heng-Bo, Chen Ping-Hua, Yang Yan-Qing, D'Hont Angélique, Lu Yun-Hai. 2017. Theoretical and Applied Genetics, 130 (11) : 2431-2443.

New insights on leucine-rich repeats receptor-like kinase orthologous relationships in angiosperms. Dufayard Jean François, Bettembourg Mathilde, Fischer Iris, Droc Gaëtan, Guiderdoni Emmanuel, Périn Christophe, Chantret Nathalie, Diévart Anne. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:381, 18 p.

Phylogenetic, structural, and functional characterization of AMT3;1, an ammonium transporter induced by mycorrhization among model grasses. Koegel Sally, Mieulet Delphine, Baday Sefer, Chatagnier Odile, Lehmann Moritz F., Wiemken Andres, Boller Thomas, Wipf Daniel, Bernèche Simon, Guiderdoni Emmanuel, Courty Pierre-Emmanuel. 2017. Mycorrhiza, 27 (7) : 695-708.

Phytophthora megakarya and Phytophthora palmivora, closely related causal agents of cacao black pod rot, underwent increases in genome sizes and gene numbers by different mechanisms. Ali Shahin, Shao Jonathan, Lary David J., Kronmiller Brent A., Shen Danyu, Strem Mary, Amoako-Attah Ishmael, Yaw Akrofi Andrew, Begoude Dider, Ten Hoopen Gerben Martijn, Coulibaly Klotioloma, Kébé Boubacar Ismaël, Melnick Rachel L., Guiltinan Mark J., Tyler Brett, Meinhardt Lyndel W., Bailey Bryan. 2017. Genome Biology and Evolution, 9 (3) : 536-557.

Root cone angle is enlarged in docs1 LRR- RLK mutants in rice. Bettembourg Mathilde, Dal-Soglio M., Bureau Charlotte, Vernet Aurore, Dardou Audrey, Portefaix Murielle, Bes Martine, Meynard Donaldo, Mieulet Delphine, Cayrol Bastien, Périn Christophe, Courtois Brigitte, Ma J.F., Diévart Anne. 2017. Rice, 10:50, 8 p.

SHR overexpression induces the formation of supernumerary cell layers with cortex cell identity in rice. Henry Sophia, Diévart Anne, Divol Fanchon, Pauluzzi Germain, Meynard Donaldo, Swarup Ranjan, Wu Shuangyang, Gallagher Kimberly, Périn Christophe. 2017. Developmental Biology, 425 (1) : 1-7.

Targeted promoter editing for rice resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae reveals differential activities for SWEET14-inducing TAL effectors. Blanvillain-Baufumé Servane, Reschke Maik, Solé Montserrat, Auguy Florence, Doucoure Hinda, Szurek Boris, Meynard Donaldo, Portefaix Murielle, Cunnac Sébastien, Guiderdoni Emmanuel, Boch Jen, Koebnik Ralf. 2017. Plant Biotechnology Journal, 15 (3) : 306-317.

Transcriptome analysis of cell wall and NAC domain transcription factor genes during Elaeis guineensis fruit ripening: Evidence for widespread conservation within monocot and eudicot lineages. Tranbarger Timothy John, Fooyontphanich Kim, Roongsattham Peerapat, Pizot Maxime, Collin Myriam, Jantasuriyarat Chatchawan, Suraningpong Potjamarn, Tragoonrung Somvong, Dussert Stéphane, Verdeil Jean-Luc, Morcillo Fabienne. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:603, 13 p.

Un antibiotique découvert dans la canne à sucre. Cociancich Stéphane, Royer Monique, Rott Philippe. 2017. La Recherche (524) : 62-65.

Using TropGeneDB: a database containing data on molecular markers, QTLs, maps, genotypes, and phenotypes for tropical crops. Ruiz Manuel, Sempere Guilhem, Hamelin Chantal. 2017. In : Plant genomics databases: methods and protocols. Van Dijk Aalt D.J. (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 161-172. (Methods in Molecular Biology, 1533) ISBN 978-1-4939-6656-1

A dual role for the OsK5.2 ion channel in stomatal movements and K + loading into xylem sap. Nguyen Thanh Hao, Huang Shouguang, Meynard Donaldo, Chaine Christian, Michel Rémy, Roelfsema M. Rob G., Guiderdoni Emmanuel, Sentenac Hervé, Very Anne-Aliénor. 2017. Plant Physiology, 174 (4) : 2409-2418.

Combating a global threat to a clonal crop: Banana black sigatoka pathogen Pseudocercospora fijiensis (Synonym Mycosphaerella fijiensis) genomes reveal clues for disease control. Arango Isaza Rafael E., Diaz-Trujillo Caucasella, Dhillon Braham, Aerts Andrea, Carlier Jean, Crane Charles F., de Jong Tristan V., De Vries Ineke, Dietrich Robert, Farmer Andrew, Fortes Fereira Claudia, Garcia Suzana, Guzman Mauricio, Hamelin Richard C., Lindquist Erika, Mehrabi Rahim, Quiros Madrigal Olman, Schmutz Jeremy, Shapiro Harris, Reynolds Elizabeth, Scalliet Gabriel, Souza Manoel, Stergiopoulos Ioannis, Van der Lee Theo A.J., De Wit Pierre J. G. M., Zapater Marie-Françoise, Zwiers Lute-Harm, Grigoriev Igor, Goodwin Stephen B., Kema Gert H.J.. 2016. PLoS Genetics, 12 (8):e1005876, 36 p.

Dissemination of the mcr-1 colistin resistance gene. Olaitan Abiola Olumuyiwa, Chabou Selma, Okdah Liliane, Morand Serge, Rolain Jean-Marc. 2016. Lancet Infectious Diseases, 16 (2) : 147.

Evolutionary dynamics of the Leucine-Rich Repeats Receptor-Like Kinase (LRR-RLK) subfamily in angiosperms. Fischer Iris, Diévart Anne, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Chantret Nathalie. 2016. Plant Physiology, 170 (3) : 1595-1610.

Fine mapping for identification of citrus alternaria brown spot candidate resistance genes and development of new SNP markers for marker-assisted selection. Cuenca José, Aleza Pablo, Garcia-Lor Andrés, Ollitrault Patrick, Navarro Luis. 2016. Frontiers in Plant Science, 7 (1948), 13 p.

Functional analysis in Hevea brasiliensis of HbERF-IXc4 and HbERF-IXc5 genes, two potential orthologs of the ERF1 gene from Arabidopsis. Lestari Retno. 2016. Montpellier : Montpellier SupAgro, 160 p. Thesis Ph. D. : Plant Biology : Montpellier SupAgro

Genome-wide association mapping of sexual incompatibility genes in cacao (Theobroma cacao L.). da Silva Marcos Ramos, Clément Didier, Gramacho Karina Peres, Monteiro Wilson Reis, Argout Xavier, Lanaud Claire, Lopes Uilson Vanderlei. 2016. Tree Genetics and Genomes, 12 (3):62, 13 p.

Genome-wide investigation of hsf genes in sesame reveals their segmental duplication expansion and their active role in drought stress response. Dossa Komivi, Diouf Diaga, Cissé Ndiaga. 2016. Frontiers in Plant Science, 7:1522, 16 p.

Geographic differentiation and population genetic structure of Moniliophthora roreri in the principal cocoa production areas in Colombia. Jaimes Yeirme, Gonzalez Carolina, Rojas Jairo, Cornejo Omar E., Mideros Maria F., Restrepo Silvia, Cilas Christian, Furtado Edson L.. 2016. Plant Disease, 100 (8) : 1548-1558.

Healthy tropical plants to mitigate the impact of climate change - as exemplified in coffee. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2016. In : Climate change and agriculture worldwide. Torquebiau Emmanuel (ed.), Manley David (trad.), Cowan Paul (trad.). Heidelberg : Springer, 83-95. ISBN 978-94-017-7460-4

The Hevea brasiliensis AP2/ERF superfamily: From ethylene signalling to latex harvesting and physiological disease response. Putranto Riza Arief, Montoro Pascal. 2016. Menara Perkebunan, 84 (1) : 49-62.

Identification of candidate genes for drought tolerance in coffee by high-throughput sequencing in the shoot apex of different Coffea arabica cultivars. Souto Mofatto Luciana, De Araújo Carneiro Fernanda, Gomes Vieira Natalia, Duarte Karoline Estefani, Vidal Ramon Oliveira, Alekcevetch Jean Carlos, Guitton Cotta Michelle, Verdeil Jean-Luc, Lapeyre-Montes Fabienne, Lartaud Marc, Leroy Thierry, De Bellis Fabien, Pot David, Costa Rodrigues Gustavo, Falsarella Carazzolle Marcelo, Guimarães Pereira Gonçalo Amarante, Carvalho Andrade Alan, Marraccini Pierre. 2016. BMC Plant Biology, 16 (94), 18 p.

In planta comparative transcriptomics of host-adapted strains of Ralstonia solanacearum. Ailloud Florent, Lowe Tiffany, Robène Isabelle, Cruveiller Stéphane, Allen Caitilyn, Prior Philippe. 2016. PeerJ, 4:e1549, 18 p.

Insight into the AP2/ERF transcription factor superfamily in sesame and expression profiling of DREB subfamily under drought stress. Dossa Komivi, Wei Xin, Li Donghua, Foncéka Daniel, Zhang Yanxin, Wang Linhai, Yu Jingyin, Liao Boshou, Diouf Diaga, Cissé Ndiaga, Zhang Xiurong. 2016. BMC Plant Biology, 16 (171), 16 p.

Lineage-specific evolutionary histories and regulation of major starch metabolism genes during banana ripening. Jourda Cyril, Cardi Céline, Gibert Olivier, Giraldo Toro Andres, Ricci Julien, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Yahiaoui Nabila. 2016. Frontiers in Plant Science, 7 (1778), 21 p.

Marker-assisted breeding of Musa balbisiana genitors devoid of infectious endogenous Banana streak virus sequences. Umber Marie, Pichaut Jean-Philippe, Farinas Benoît, Laboureau Nathalie, Janzac Bérenger, Plaisir Kaïssa, Pressat Gersende, Baurens Franc-Christophe, Chabannes Matthieu, Duroy Pierre-Olivier, Guiougou Chantal, Delos Jean-Marie Eric, Jenny Christophe, Iskra Caruana Marie-Line, Salmon Frédéric, Teycheney Pierre-Yves. 2016. Molecular Breeding, 36 (6):e74, 11 p.

Members of BTB Gene Family of Scaffold Proteins Suppress Nitrate Uptake and Nitrogen Use Efficiency. Araus Viviana, Vidal Elena A., Puelma Tomas, Alamos Simón, Mieulet Delphine, Guiderdoni Emmanuel, Gutiérrez Rodrigo A.. 2016. Plant Physiology, 171 (2) : 1523-1532.

Placental genetic variations in circadian clock-related genes increase the risk of placental abruption. Qiu Chunfang, Gelaye Bizu, Denis Marie, Tadesse Mahlet G., Enquobahrie Daniel A., Ananth Cande V., Pacora Percy N., Salazar Manuel, Sanchez Sixto E., Williams Michelle A.. 2016. International Journal of Molecular Epidemiology and Genetics, 7 (1) : 32-40.

Plasticité phénotypique du palmier à huile: adaptation au stress et incidence sur le développement reproducteur. Jaligot Estelle. 2016. Montpellier : Université de Montpellier, 145 p. Habilitation à diriger des recherches : Biodiversité, agriculture, alimentation, environnement : Université de Montpellier

Selection of reference genes for expression Study in pulp and seeds of Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum. Ferraz dos Santos Lucas, Santana Silva Raner José, Do Amaral Daniel Oliveira Jordão, Barbosa de Paula Márcia Fabiana, Ludke Falcão Loeni, Legavre Thierry, Alves Rafael Moyses, Marcellino Lucilia Helena, Micheli Fabienne. 2016. PloS One, 11 (8):e0160646, 12 p.

The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

Surface polysaccharides and quorum sensing are involved in the attachment and survival of Xanthomonas albilineans on sugarcane leaves. Mensi Imène, Daugrois Jean-Heinrich, Pieretti Isabelle, Gargani Daniel, Fleites Laura, Noëll Julie, Bonnot François, Gabriel Dean W., Rott Philippe. 2016. Molecular Plant Pathology, 17 (2) : 236-246.

A genome-wide association study on the seedless phenotype in banana (Musa spp.) reveals the potential of a selected panel to detect candidate genes in a vegetatively propagated crop. Sardos Julie, Rouard Mathieu, Hueber Yann, Cenci Alberto, Hyma Katie E., Van Den Houwe Ines, Hribova Eva, Courtois Brigitte, Roux Nicolas. 2016. PloS One, 11 (5):e0154448, 25 p.

The phenome analysis of mutant alleles in Leucine-Rich Repeat Receptor-Like Kinase genes in rice reveals new potential targets for stress tolerant cereals. Diévart Anne, Périn Christophe, Hirsch Judith, Bettembourg Mathilde, Lanau Nadège, Artus Florence, Bureau Charlotte, Noel Nicolas, Droc Gaëtan, Peyramard Mathieu, Pereira Serge, Courtois Brigitte, Morel Jean-Benoit, Guiderdoni Emmanuel. 2016. Plant Science, 242 : 240-249.

A physical map of important QTLs, functional markers and genes available for sesame breeding programs. Dossa Komivi. 2016. Physiology and Molecular Biology of Plants, 22 : 613-619.

The wheat durable, multipathogen resistance gene Lr34 confers partial blast resistance in rice. Krattinger Simon G., Sucher Justine, Selter Liselotte, Chauhan Harsh, Zhou Bo, Tang Mingzhi, Upadhyaya Narayana, Mieulet Delphine, Guiderdoni Emmanuel, Weidenbach Denise, Schaffrath Ulrich, Lagudah Evans S., Keller Beat. 2016. Plant Biotechnology Journal, 14 (5) : 1261-1268.

Applying Epigenetics in Plant Breeding: Balancing Genome Stability and Phenotypic Plasticity. Jaligot Estelle, Rival Alain. 2015. In : Advances in Plant Breeding Strategies: Breeding, Biotechnology and Molecular Tools. Al-Khayri Jameel M. (ed.), Jain Shri Mohan (ed.), Johnson Dennis V.(ed.). Cham : Springer International Publishing, 159-192. ISBN 978-3-319-22520-3

Cassiicolin genes among Corynespora cassiicola isolates from Rubber plantations in Malaysia. Shuib Siti Shuhada, Déon Marine, Mahyuddin Murnita Mohamad, Izhar Azimah, Fumanal Boris, Sunderasan E., Pujade-Renaud Valérie. 2015. Journal of Rubber Research, 18 (2) : 109-126.

Characterization of a candidate gene for drought tolerance in Coffea: the CcDREB1D gene, in contrasting genotypes of Coffea canephora and related species. Costa Alves Gabriel. 2015. Montpellier : Montpellier SupAgro, 190 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Colonization of the Mediterranean Basin by the vector biting midge species Culicoides imicola: an old story. Jacquet Stéphan, Garros Claire, Lombaert E., Walton E., Restrepo J., Allene Xavier, Baldet Thierry, Cetre-Sossah Catherine, Chaskopoulou A., Delecolle Jean Claude, Desvars Amélie, Djerbal Mouloud, Fall Moussa, Gardes Laëtitia, De Garine-Wichatitsky Michel, Goffredo Maria, Gottlieb Yuval, Gueye Fall Assane, Kasina M., Labuschagne Karien, Lhor Youssef, Lucientes Javier, Martin Thibaud, Mathieu Bertrand, Miranda Miguel Angel, Pages Nitu, Pereira da Fonseca Isabel, Ramilo David, Segard Adeline, Setier-Rio Marie-Laure, Stachurski Frédéric, Tabbabi A., Talla Seck Monar, Venter Gert J., Zimba Moses, Balenghien Thomas, Guis Hélène, Chevillon Christine, Bouyer Jérémy, Huber Karine. 2015. Molecular Ecology, 24 (22) : 5707-5725.

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

Diversity of ACE1 genotypes of the rice blast fungus (Magnaporthe oryzae B.C. Couch) in the Philippines. Lopez Ana Liza C., Cumagun Christian Joseph R., Tharreau Didier. 2015. IAMURE International Journal of Ecology and Conservation, 16 (1) : 80-92.

Dynamique évolutive de Ralstonia solanacearum en réponse aux pressions de sélection de l'aubergine résistante : approche populationnelle, de génétique évolutive et fonctionnelle de la durabilité de la résistance. Guinard Jérémy. 2015. Saint-Denis : Université de la Réunion, 415 p. Thèse de doctorat : Sciences. Génétique des populations, phytopathologie, bactériologie, épidémiologie moléculaire : Université de la Réunion

Etude de la fonction de deux facteurs de transcription SHORT-ROOT 1 et SHORTROOT 2 dans la mise en place du cortex chez le riz. Henry Sophia. 2015. Montpellier : Université de Montpellier, 273 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université de Montpellier

EucaMaps: linking genetic maps and associated QTLs to the Eucalyptus grandis genome. Gion Jean-Marc, Chaumeil Philippe, Plomion Christophe. 2015. Tree Genetics and Genomes, 11 (795), 7 p.

Evaluation of eleven reference genes for Reverse Transcriptase Quantitative PCR of rubber tree under water deficit. Putranto Riza Arief, Leclercq Julie, Montoro Pascal. 2015. Menara Perkebunan, 83 (2) : 86-94.

Evidence of intense chromosomal shuffling during conifer evolution. de Miguel Marina, Bartholomé Jérôme, Ehrenmann François, Murat Florent, Moriguchi Yoshinari, Uchiyama Kentaro, Ueno Saneyoshi, Tsumura Yoshihiko, Lagraulet Hélène, de Maria Nuria, Cabezas José-Antonio, Cervera María-Teresa, Gion Jean-Marc, Salse Jérôme, Plomion Christophe. 2015. Genome Biology and Evolution, 7 (1) : 2799-2809.

Genome-enabled phylogeographic investigation of the quarantine pathogen Ralstonia solanacearum race 3 biovar 2 and screening for sources of resistance against its Core effectors. Clarke Christopher R., Studholme David J., Hayes Byron W., Runde Brendan J., Weisberg Alexandra, Cai Rongman, Wroblewski Tadeusz, Daunay Marie-Christine, Wicker Emmanuel, Castillo Jose A., Vinatzer Boris A.. 2015. Phytopathology, 105 (5) : 597-607.

Identification and mapping of a novel blast resistance gene Pi57 (t) in Oryza longistaminata. Xu Jianlong, Dong Liying, Zhou Jiawu, Li Jing, Zhang Y., Hu F.Y., Liu S.F., Wang Qun, Deng Wei, Deng X.N., Tharreau Didier, Yang Qinzhong, Tao Dayun. 2015. Euphytica, 205 (1) : 95-102.

Identification of Theobroma cacao genes differentially expressed during Phytophthora megakarya infection. Legavre Thierry, Ducamp Michel, Sabau Xavier, Argout Xavier, Fouet Olivier, Dedieu Frédéric, Surujdeo-Maharaj Surendra, Garcia Dominique, Paulin Didier, Lanaud Claire. 2015. Physiological and Molecular Plant Pathology, 92 : 1-13.

In Silico analysis of usher encoding genes in Klebsiella pneumoniae and characterization of their role in adhesion and colonization. Khater Fida, Balestrino Damien, Charbonnel Nicolas, Dufayard Jean-François, Brisse Sylvain, Forestier Christianne. 2015. PloS One, 10 (3):e0116215, 24 p.

L'amélioration génétique des arbres forestiers. Louppe Dominique. 2015. In : Mémento du forestier tropical. Mille Gilles (ed.), Louppe Dominique (ed.). Versailles : Ed. Quae, 563-584. ISBN 978-2-7592-2340-4

La bonne santé des plantes tropicales pour atténuer les effets du changement climatique: l'exemple du caféier. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2015. In : Changement climatique et agricultures du monde. Torquebiau Emmanuel (ed.). Versailles : Ed. Quae, 84-95. (Agricultures et défis du monde)

Loss of floral repressor function adapts rice to higher latitudes in Europe. Gomez-Ariza Jorge, Galbiati Francesca, Goretti Daniela, Brambilla Vittoria, Shrestha Roshi, Pappolla Andrea, Courtois Brigitte, Fornara Fabio. 2015. Journal of Experimental Botany, 66 (7) : 2027-2039.

Mapping genetic determinants of viral traits with FST and quantitative trait locus (QTL) approaches. Doumayrou Juliette, Thébaud Gaël, Vuillaume Florence, Peterschmitt Michel, Urbino Cica. 2015. Virology, 484 : 346-353.

Mitochondrial, nuclear, and endosymbiotic diversity of two recently introduced populations of the invasive Bemisia tabaci MED species in La Réunion. Thierry Magalie, Bile Audrey, Grondin Martial, Reynaud Bernard, Becker Nathalie, Delatte Hélène. 2015. Insect Conservation and Diversity, 8 (1) : 71-80.

OsMADS26 negatively regulates resistance to pathogens and drought tolerance in rice. Khong Ngan Giang, Pati Pratap K., Richaud Frédérique, Parizot Boris, Bidzinski Przemyslaw, Mai Chung Duc, Bes Martine, Bourrié Isabelle, Meynard Donaldo, Beeckman Tom, Selvaraj Michael Gomez, Manabu Ishitani, Genga Anna-Maria, Brugidou Christophe, Do Vinh Nang, Guiderdoni Emmanuel, Morel Jean-Benoit, Gantet Pascal. 2015. Plant Physiology, 169 (4) : 2935-2949.

QueTAL: A suite of tools to classify and compare TAL effectors functionally and phylogenetically. Pérez-Quintero Alvaro L., Lamy Léo, Gordon Jonathan, Escalon Aline, Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Gagnevin Lionel. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (545), 16 p.

Towards the identification of Type III effectors associated to Ralstonia solanacearum virulence on tomato and eggplant. Pensec Flora, Lebeau Aurore, Daunay Marie-Christine, Chiroleu Frédéric, Guidot Alice, Wicker Emmanuel. 2015. Phytopathology, 105 (12) : 1529-1544.

The coffee genome hub: a resource for coffee genomes. Dereeper Alexis, Bocs Stéphanie, Rouard Mathieu, Guignon Valentin, Ravel Sébastien, Tranchant-Dubreuil Christine, Poncet Valérie, Garsmeur Olivier, Lashermes Philippe, Droc Gaëtan. 2015. Nucleic Acids Research, 43 (D1), D1028-D1035

The genome sequence of the orchid Phalaenopsis equestris. Cai Jing, Vanneste Kevin, Proost Sebastian, Tsai Wen-Chieh, Liu Ke-Wei, Chen Li-Jun, He Ying, Xu Qing, Bian Chao, Zheng Zhijun, Sun Fengming, Liu Weiqing, Hsiao Yu-Yun, Pan Zhao-Jun, Hsu Chia-Chi, Yang Ya-Ping, Hsu Yi-Chin, Chuang Yu-Chen, Diévart Anne, Dufayard Jean-François, Xu Xun, Wang Juhui, Wang Jung, Xiao Xin-Ju, Zhao Xue-Min, Du Rong, Zhang Guo-Qiang, Wang Meina, Su Yong-Yu, Xie Gao-Chang, Liu Guo-Hui, Li Li-Qiang, Huang Lai-Qiang, Luo Yi-Bo, Chen Hong-Hwa, Van de Peer Yves, Liu Zhong-Jian. 2015. Nature Genetics, 47 (1) : 65-74.

The greater phenotypic homeostasis of the allopolyploid Coffea arabica improved the transcriptional homeostasis over that of both diploid parents. Bertrand Benoît, Bardil Amélie, Baraille Hélène, Dussert Stéphane, Doulbeau Sylvie, Dubois Emeric, Severac Dany, Dereeper Alexis, Etienne Hervé. 2015. Plant and Cell Physiology, 56 (10) : 2035-2051.

Caractérisation de la superfamille AP2/ERF en réponse aux stress abiotiques et étude de leur spécificité lors de l'apparition de l'encoche sèche chez Hevea brasiliensis. Putranto Riza Arief. 2014. Montpellier : UM2, 234 p. Thèse de doctorat : Système intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hyddrosciences et environnement. Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Evidence of nickel (Ni) efflux in Ni-tolerant ectomycorhizal Pisolithus albus isolated from ultramafic soil. Majorel Clarisse, Hannibal Laure, Ducousso Marc, Lebrun Michel, Jourand Philippe. 2014. Environmental Microbiology Reports, 6 (5) : 510-518.

Expansion of banana (Musa acuminata) gene families involved in ethylene biosynthesis and signalling after lineage-specific whole-genome duplications. Jourda Cyril, Cardi Céline, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Bocs Stéphanie, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2014. New Phytologist, 202 (3) : 986-1000.

Functional analysis of the durum wheat gene TdPIP2;1 and itspromoter region in response to abiotic stress in rice. Ayadi Malika, Mieulet Delphine, Fabre Denis, Verdeil Jean-Luc, Vernet Aurore, Guiderdoni Emmanuel, Masmoudi Khaled. 2014. Plant Physiology and Biochemistry, 79 : 98-108.

Genes controlling root development in rice. Mai Chung Duc, Phung Nhung Thi Phuong, To Huong T.M., Gonin Mathieu, Hoang Giang Thi, Nguyen Khanh L., Do Vinh Nang, Courtois Brigitte, Gantet Pascal. 2014. Rice, 7 (30), 11 p.

Impact of natural selection on lignin and cellulose candidate genes in a natural population of Eucalyptus urophylla. Camus-Kulandaivelu Létizia, Favreau Bénédicte, Ueno Saneyoshi, Przybyla Jonathan, Bouvet Jean-Marc. 2014. Open Journal of Ecology, 4 (17) : 1128-1150.

Impact of recurrent gene duplication on adaptation of plant genomes. Fischer Iris, Dainat Jacques, Ranwez Vincent, Glemin Sylvain, Dufayard Jean-François, Chantret Nathalie. 2014. BMC Plant Biology, 14 (151), 15 p.

Placental genome and maternal-placental genetic interactions: A genome-wide and candidate gene association study of placental abruption. Denis Marie, Salazar M., Williams M.A., Enquobahrie Daniel A., Tadesse Mahlet G., Sanchez Sixto E., Ananth Cande V.. 2014. PloS One, 9 (12):e116346, 24 p.

Plant root transcriptome profiling reveals a strain-dependent response during Azospirillum-rice cooperation. Drogue Benoit, Sanguin Hervé, Chamam Amel, Mozar Michael, Llauro Christel, Panaud Olivier, Prigent-Combaret Claire, Picault Nathalie, Wisniewski-Dyé Florence. 2014. Frontiers in Plant Science, 5 (607), 14 p.

Positional cloning of the rice male sterility gene ms-IR36, widely used in the inter-crossing phase of recurrent selection schemes. Frouin Julien, Filloux Denis, Taillebois James E., Grenier Cécile, Montes Fabienne, De Lamotte Frédéric, Verdeil Jean-Luc, Courtois Brigitte, Ahmadi Nourollah. 2014. Molecular Breeding, 33 (3) : 555-567.

Sequence and expression analyses of ethylene response factors highly expressed in latex cells from Hevea brasiliensis. Piyatrakul Piyanuch, Yang Meng, Putranto Riza Arief, Pirrello Julien, Dessailly Florence, Hu Songnian, Summo Marilyne, Theeravatanasuk Kannikar, Leclercq Julie, Kuswanhadi, Montoro Pascal. 2014. PloS One, 9 (6):e99367, 20 p.

Sequence variation and recognition specificity of the avirulence gene AvrPiz-T in Magnaporthe Oryzae field populations. Chen Chenx, Chen Meilian, Hu Jinnan, Zhang Wenjing, Zhong Zhenhui, Jia Yulin, Allaux Ludovic, Fournier Elisabeth, Tharreau Didier, Wang Guo-Liang, Wang Zonghua, Shen Wei-Chiang, Lu Guodong, Wang Baohua, Mitchell Thomas K.. 2014. Fungal Genomics and Biology, 4 (1), 8 p.

Transcriptional and post-transcriptional regulation of the jasmonate signalling pathway in response to abiotic and harvesting stress in Hevea brasiliensis. Pirrello Julien, Leclercq Julie, Dessailly Florence, Rio Maryannick, Piyatrakul Piyanuch, Kuswanhadi, Tang Chaorong, Montoro Pascal. 2014. BMC Plant Biology, 14 (341), 17 p.

Understanding Anaplasmataceae pathogenesis using "Omics" approaches. Pruneau Ludovic, Moumène Amal, Meyer Damien, Marcelino Isabel, Lefrançois Thierry, Vachiery Nathalie. 2014. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 4 (96), 7 p.

The polycomb group gene EMF2B is essential for maintenance of floral meristem determinacy in rice. Conrad Liza J., Khanday Imtiyaz, Johnson Cameron, Guiderdoni Emmanuel, An Gynheung, Vijayraghavan Usha, Sundaresan Venkatesan. 2014. Plant Journal, 80 (5) : 883-894.

Analise da expressão do gene manose 6 fosfato redutase em cafeeiros submetidos ao déficit hídrico. Pereira Freire Luciana, Marraccini Pierre, Costa Rodrigues Gustavo, Carvalho Andrade Alan. 2013. Coffee Science, 8 (1) : 17-23.

Bru1 gene and potential alternative sources of resistance to sugarcane brown rust disease. Racedo Josefina, Perera María Francisca, Bertani Romina, Funes Claudia, González Victoria, Cuenya María I., D'Hont Angélique, Welin Björn, Castagnaro Atilio P.. 2013. Euphytica, 191 (3) : 429-436.

Caractérisation des gènes AP2/ERF impliqués dans le développement chez Hevea brasiliensis. Piyatrakul Piyanuch. 2013. Montpellier : Montpellier SupAgro, 134 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement. Biologie intégrative des plantes : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Different molecular mechanisms account for drought tolerance in Coffea canephora var. Conilon. Vieira Natalia Gomes, Carneiro Fernanda A, Sujii Patricia. S, Alekcevetch Jean Carlos, Freire Luciana Pereira, Vinecky Felipe, Elbelt Sonia, Silva Vânia Aparecida, Damatta Fabio M., Ferrão Maria Amélia G., Marraccini Pierre, Andrade Alan Carvalho. 2013. Tropical Plant Biology, 6 (4) : 181-190.

Genetic and phenetic approaches to Anopheles systematics. Garros Claire, Dujardin Jean Pierre. 2013. In : Anopheles mosquitoes - New insights into malaria vectors. Sylvie Manguin (ed.). Rijeka : InTech, 81-105. ISBN 978-953-51-1188-7

Genetic variation of wood chemical traits and association with underlying genes in Eucalyptus urophylla. Denis Marie, Favreau Bénédicte, Ueno Saneyoshi, Camus-Kulandaivelu Létizia, Chaix Gilles, Gion Jean-Marc, Nourrisier-Mountou S., Polidori Joel, Bouvet Jean-Marc. 2013. Tree Genetics and Genomes, 9 (4) : 927-942.

Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain CIO151. Arrieta-Ortiz Mario L., Rodríguez-R Luis Miguel, Pérez-Quintero Alvaro L., Poulin Lucie, Díaz Ana C., Arias Rojas Nathalia, Trujillo Cesar, Restrepo Benavides Mariana, Bart Rebecca, Boch Jen, Boureau Tristan, Darrasse Armelle, David Perrine, Dugé de Bernonville Thomas, Fontanilla Paula, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Lefeuvre Pierre, Medina Cesar, Medina Edgar, Montenegro Nathaly, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Ortiz Quiñoes Juan F., Osorio Daniela, Pardo Carolina, Patil Prabhu B., Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ryan Robert P., Tabima Javier, Urrego Morales Osacar G., Vernière Christian, Carrère Sébastien, Verdier Valérie, Szurek Boris, Restrepo Silvia, López Camilo, Koebnik Ralf, Bernal Adriana Jimena. 2013. PloS One, 8 (11):e79704, 18 p.

Influence of micropropagation through somatic embryogenesis on somaclonal variation in coffee (Coffea arabica): assessment of variations at the phenotypical, cytological, genetic and epigenetic level. Bodadilla Landey Roberto. 2013. Montpellier : UM2, 186 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

MULTIPASS, a rice R2R3-type MYB transcription factor, regulates adaptive growth by integrating multiple hormonal pathways. Schmidt Romy, Schippers Jos H.M., Mieulet Delphine, Obata Toshihiro, Fernie Alisdair R., Guiderdoni Emmanuel, Mueller-Roeber Bernd. 2013. Plant Journal, 76 (2) : 258-273.

Molecular characterization of Cryptosporidium species at the wildlife/livestock interface of the Kruger National Park, South Africa. Samra Nada Abu, Jori Ferran, Xiao Lihua, Rikhotso Oupa, Thompson Peter. 2013. Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases, 36 (3), spec. : 295-302.

New allelic variants found in key rice salt-tolerance genes: an association study. Negrão Sonia, Almadanim M. Cecilia, Pires Ines, Abreu Isabel, Maroco João. P, Courtois Brigitte, Gregorio Glenn, McNally Kenneth L., Oliveira Margarida. 2013. Plant Biotechnology Journal, 11 (1) : 87-100.

New rice resistance genes via targeted genome editing. Baufumé Servane, Meynard Donaldo, Reschke Maik, Solé Montserrat, Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Guiderdoni Emmanuel, Boch Jen, Koebnik Ralf. 2013. Phytopathology, 103 (6), suppl. S2 : S2.13. APS-MSA Conference, Austin, États-Unis, 10 Août 2013/14 Août 2013.

Organisation et évolution de familles de gènes impliqués dans la maturation du fruit chez le bananier. Jourda Cyril. 2013. Montpellier : UM2, 353 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Permanent genetic resources added to molecular ecology resources database 1 february 2013-31 march 2013. Arias M.C., Attéké Christiane, Augusto Sebastião Geraldo, Bailey J., Bazaga Pilar, Beheregaray Luciano B., Benoit Laure, Blatrix Rumsaïs, Born Céline, Brito R.M., Chen Hai-Kui, Covarrubias Sara, De Vaga Clara, Djiéto-Lordon Champlain, Dubois Marie-Pierre, Francisco Felipe O., Garcia Cristina, Gonçalves P.H.P., Gonzalez Clementina, Gutierrez-Rodriguez Carla, Hammer Michael P., Herrera Carlos M., Itoh H., Karaoglu H., Kojima S., Li Shou-Li, Ling Hannah J., Matos-Maravi Pavel F., McKey Doyle B., Mezui-M'Eko Judicaël, Ornelas Juan Francisco, Park R.F., Pozo Maria I., Ramula Satu, Rigueiro Cristina, Sandoval-Castillo Jonathan, Santiago L.R., Seino Miyuki M., Song Chang-Bing, Takeshima H., Vasemägi Anti, Wellings C.R., Yan Ji, Yu-Zhou Du, Zhang Chang-Rong, Zhang Tian-Yun. 2013. Molecular Ecology Resources, 13 (4) : 760-762.

Physiologie de la maturation du fruit et elaboration de la qualité. Mbéguié-A-Mbéguié Didier. 2013. Toulouse : INPT, 43 p. Habilitation à diriger des recherches : Institut national polytechnique de Toulouse

Polygalacturonases from Moniliophthora perniciosa are regulated by fermentable carbon sources and possible post-translational modifications. Santos Carvalho Heliana Argôlo, De Andrade Silva Edson Mario, Carvalho Santos Stênio, Micheli Fabienne. 2013. Fungal Genetics and Biology, 60 : 110-121.

Promoter analysis of the WRKY transcription factors CaWRKY1a and CaWRKY1b homoeologous genes in coffee (Coffea arabica). Petitot Anne-Sophie, Barsalobres-Cavallari Carla, Ramiro Daniel, Albuquerque Erika, Etienne Hervé, Fernandez Diana. 2013. Plant Cell Reports, 32 (8) : 1263-1276.

Quantitative trait loci for partial resistance to Pseudomonas syringae pv. maculicola in Arabidopsis thaliana. Rant Jenni C., Arraiano Lia S., Chabannes Matthieu, Brown James K.M.. 2013. Molecular Plant Pathology, 14 (8) : 828-837.

Recombinant [bêta]-1,3-1,4-glucanase from Theobroma cacao impairs Moniliophthora perniciosa mycelial growth. Britto Dahayna Santos, Pirovani Carlos Priminho, Andrade Bruno Silva, Pereira dos Santos Tassiara, Pungartnik Cristina, Cascardo Julio Cezar M., Micheli Fabienne, Gesteira Abelmon. 2013. Molecular Biology Reports, 40 (9) : 5417-5427.

Using plant growth modeling to analyse C source-sink relations under drought: inter and intra specific comparison. Pallas Benoît, Clément-Vidal Anne, Rebolledo Maria Camila, Soulie Jean-Christophe, Luquet Delphine. 2013. Frontiers in Plant Science, 4 (437), 13 p.

Utilization of a major brown rust resistance gene in sugarcane breeding. Glynn Neil C., Laborde Chris, Davidson R. Wayne, Irey Mike S., Glaz Barry, D'Hont Angélique, Comstock Jack C.. 2013. Molecular Breeding, 31 (2) : 323-331.

Analyse du transcriptome d'Ehrlichia ruminantium agent causal de la cowdriose : mise en évidence des gènes impliqués dans la virulence et les mécanismes d'atténuation et application à l'élaboration d'un vaccin recombinant. Pruneau Ludovic. 2012. Pointe-à-Pitre : UAG, 178 p. Thèse de doctorat : Sciences de la vie. Aspect moléculaires et cellulaires de la biologie : Université des Antilles et de la Guyane

Characterization of a cassiicolin-encoding gene from Corynespora cassiicola, pathogen of rubber tree (Hevea brasiliensis). Déon Marine, Bourre Yanice, Gimenez Stéphanie, Berger Angélique, Bieysse Daniel, De Lamotte Frédéric, Poncet Joël, Roussel Véronique, Bonnot François, Oliver Gérald, Franchel Jérôme, Seguin Marc, Leroy Thierry, Roeckel-Drevet Patricia, Pujade-Renaud Valérie. 2012. Plant Science, 185-186 : 227-237.

Comparative expression of cell wall related genes in four maize RILs and one parental line of variable lignin content and cell wall degradability. Courtial Audrey, Jourda Cyril, Arribat Sandrine, Balzergue Sandrine, Huguet Annie, Reymond Matthieu, Grima Pettenati Jacqueline, Barrière Yves. 2012. Maydica, 57 (1-4) : 56-74.

Comparison of the genetic determinism of two key phenological traits, flowering and maturity dates, in three Prunus species: Peach, apricot and sweet cherry. Dirlewanger Elisabeth, Quero-Garcia José, Le Dantec L., Lambert P., Ruiz David, Dondini L., Illa E., Quilot-Turion Bénédicte, Audergon Jean-Marc, Tartarini S., Letourmy Philippe, Arus P.. 2012. Heredity, 109 : 280-292.

Deep sequencing reveals differences in the transcriptional landscapes of fibers from two cultivated species of cotton. Lacape Jean-Marc, Claverie Michel, Vidal Ramon Oliveira, Carazzolle Marcelo Falsarella, Guimarães Pereira Gonçalo Amarante, Ruiz Manuel, Pré Martial, Llewellyn Danny, Al-Ghazi Yves, Jacobs John, Dereeper Alexis, Huguet Stéphanie, Giband Marc, Lanaud Claire. 2012. PloS One, 7 (11):e48855, 16 p.

Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. Marraccini Pierre, Vinecky Felipe, Alves Gabriel Sergio Costa, Ramos Humberto J.O., Elbelt Sonia, Vieira Natalia Gomes, Carneiro Fernanda A, Sujii Patricia. S, Alekcevetch Jean Carlos, Silva Vânia Aparecida, Damatta Fabio M., Ferrão Maria Amélia G., Leroy Thierry, Pot David, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Da Silva Felipe, Andrade Alan Carvalho. 2012. Journal of Experimental Botany, 63 (11) : 4191-4212.

First characterization of endophytic Corynespora cassiicola isolates with variant cassiicolin genes recovered from rubber trees in Brazil. Déon Marine, Scomparin Ana, Tixier Aude, Mattos Carlos Raimunto Reis, Leroy Thierry, Seguin Marc, Roeckel-Drevet Patricia, Pujade-Renaud Valérie. 2012. Fungal Diversity, 54 (1) : 87-99.

Haplotype structure around Bru 1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars. Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique. 2012. Theoretical and Applied Genetics, 125 (5) : 825-836.

Importance de la cassiicoline en tant qu'effectuer de la Corynespora Leaf Fall (CLF) chez l'hévéa. Développement d'outils pour le contrôle de la maladie. Déon Marine. 2012. Clermont-Ferrand : Université Blaise Pascal, 179 p. Thèse d'université : Science de la la vie, agronomie, environnement. Spécialité Physiologie et génétique moléculaire : Université Blaise Pascal

Isolamento e caracterização do gene CaLTP EM Coffea spp. Guitton Cotta Michelle. 2012. Lavras : UFLA, 161 p. Mémoire de master : Biotecnologia Vegetal : Universidade Federal de Lavras

OsWRKY22, a monocot WRKY gene, plays a role in the resistance response to blast. Abbruscato Pamela, Nepusz Tamas, Mizzi Luca, Del Corvo Marcello, Morandini Piero, Fumasoni Irene, Michel Corinne, Paccanaro Alberto, Guiderdoni Emmanuel, Schaffrath Ulrich, Morel Jean-Benoit, Piffanelli Pietro, Faivre-Rampant Odile. 2012. Molecular Plant Pathology, 13 (8) : 828-841.

Reversible oxygen-tolerant hydrogenase carried by free-living N2-fixing bacteria isolated from the rhizospheres of rice, maize, and wheat. Roumagnac Philippe, Richaud Pierre, Barakat Mohamed, Ortet Philippe, Roncato Marie-Anne, Heulin Thierry, Peltier Gilles, Achouak Wafa, Cournac Laurent. 2012. MicrobiologyOpen, 1 (4) : 349-361.

Specific patterns of genetic diversity among aromatic rice varieties in Myanmar. Myint Khin M., Courtois Brigitte, Risterucci Ange-Marie, Frouin Julien, Soe Khin, Thet Khin M., Vanavichit Apichart, Glaszmann Jean-Christophe. 2012. Rice, 5 (20), 13 p.

Wide genetic diversity of Ralstonia solanacearum strains affecting tomato in Trinidad, West Indies. Ramsubhag A., Lawrence D., Cassie D., Fraser R., Umaharan Pathmanathan, Prior Philippe, Wicker Emmanuel. 2012. Plant Pathology, 61 (5) : 844-857.

A candidate gene for lignin composition in Eucalyptus: Cinnamoyl-CoA reductase (CCR). Mandrou Eric, Hein Paulo Ricardo Gherardi, Villar Emilie, Vigneron Philippe, Plomion Christophe, Gion Jean-Marc. 2012. Tree Genetics and Genomes, 8 (2) : 353-364.

The half-size ABC transporters STR1 and STR2 are indispensable for mycorrhizal arbuscule formation in rice. Gutjahr Caroline, Radovanovic Dragica, Geoffroy Jessika, Zhang Quan, Siegler Heike, Chiapello Marco, Casieri Leonardo, An Kyungsook, An Gynheung, Guiderdoni Emmanuel, Kumar Chellian Santhosh, Sundaresan Venkatesan, Harrison Maria J., Paszkowski Uta. 2012. Plant Journal, 69 (5) : 906-920.

An in planta, Agrobacterium-mediated transient gene expression method for inducing gene silencing in rice (Oryza sativa L.) leaves. Andrieu Aurélie, Breitler Jean-Christophe, Sire Christelle, Meynard Donaldo, Gantet Pascal, Guiderdoni Emmanuel. 2012. Rice, 5 (23), 12 p.

Adaptation to drought in two wild tomato species: The evolution of the Asr gene family. Fischer Iris, Camus-Kulandaivelu Létizia, Allal François, Wolfgang Stephan. 2011. New Phytologist, 190 (4) : 1032-1044.

Cell separation processes that underlie fruit abscission and shedding in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Roongsattham Peerapat. 2011. Montpellier : UM2, 158 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Characterization of a resistance locus to coffee leaf rust (Hemileia vastratrix) in coffee trees: genomic organization, diversity and development of tools for functional gene validation. Ribas Alessandra. 2011. Montpellier : UM2, 227 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Divergent expression patterns of miR164 and CUP-SHAPED COTYLEDON genes in palms and other monocots : Implication for the evolution of meristem function in angiosperms. Adam Hélène, Marguerettaz Mélanie, Qadri Rashad, Adroher Bernard, Richaud Frédérique, Collin Myriam, Thuillet Anne-Céline, Vigouroux Yves, Laufs Patrick, Tregear James, Jouannic Stefan. 2011. Molecular Biology and Evolution, 28 (4) : 1439-1454.

Evaluation of potential reference genes for reverse transcription-qPCR studies of physiological responses in Drosophila melanogaster. Ponton Fleur, Chapuis Marie-Pierre, Pernice Mathieu, Sword Gregory A., Simpson Stephen J.. 2011. Journal of Insect Physiology, 57 (6) : 840-850.

High genetic diversity in field isolates of Trypanosoma theileri assessed by analysis of cathepsin L-like sequences disclosed multiple and new genotypes infecting cattle in Thailand. Garcia Herakles A., Kamyingkird Ketsarin, Rodrigues Adriana C., Jittapalapong Sathaporn, Teixeira Marta M.G., Desquesnes Marc. 2011. Veterinary Parasitology, 180 (3-4) : 363-367.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Bocs Stéphanie, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Zini Cyrille, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2011. New Phytologist, 189 (2) : 629-642.

Identification of genes involved in the response of banana to crown rot disease. Lassois Ludivine, Frettinger Patrick, De Lapeyre de Bellaire Luc, Lepoivre Philippe, Jijakli M. Haïssam. 2011. Molecular Plant-Microbe Interactions, 24 (1) : 143-153.

Importance of the rpf gene cluster in phyllosphere colonization and pathogenicity of Xanthomonas albilineans. Mensi Imène, Fleites Laura, Daugrois Jean-Heinrich, Gabriel Dean W., Rott Philippe. 2011. In : The impact of bioactive small molecules in plant pathology. Salmond Georges (ed.), Dudler Robert (ed.), Loper Joyce (ed.), Grant Murray (ed.), Hofte Monica (ed.), Eberl Leo (ed.), Turgeon Gillian (ed.), Chichewicz Robert (ed.), Ferrand Stephen (ed.), Strobel Gary (ed.), Slusarenko Alan (ed.), Dow Max (ed.). BSPP. Cambridge : BSPP, Résumé, 53-54. British Society for Plant Pathology Presidential Meeting, Cambridge, Royaume-Uni, 15 Décembre 2011/16 Décembre 2011.

In silico analysis of cytochrome p450 genes involved in the metabolism of diterpenes in Coffea. Ivamoto Suzana Tiemi, Pot David, Kitzberger Cíntia S.G., Scholz Maria Brigida dos Santos, Andrade D.S., Alves L.C., Domingues Douglas S., Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Pereira Luiz Filipe P.. 2011. In : III Symposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 10 a 15 de abril de 2011, Ilhéus, BA. SBG. Ribeirão Preto : SBG, Résumé, 43. Simposio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 3, Ilheus, Brésil, 10 Avril 2011/15 Avril 2011.

Superexpressão em sistema heterólogo de pectinases de Moniliophthora perniciosa : [Abstract Codigo : 2011236]. Figueredo Ribeiro Lidiane, Micheli Fabienne, Santos Carvalho Heliana Argôlo. 2011. In : 17° Seminario de Iniciação Cientifica e 11° Semana de Pesquisa e Pós-Graduação, 08 a 10 de Novembro de 2011, Ilhéus-Bahia, Brasil. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Seminario de Iniciação Cientifica. 17, Ilhéus-Bahia, Brésil, 8 Novembre 2011/10 Novembre 2011.

Application of an evolutionary algorithm to the inverse parameter estimation of an individual-based model. Duboz Raphaël, Versmisse David, Travers Morgane, Ramat Eric, Shin Yunne-Jai. 2010. Ecological Modelling, 221 (5) : 840-849.

Fine mapping of a gene for low-tiller number, Ltn, in japonica rice (Oryza sativa L.) variety Aikawa 1. Fujita Daisuke, Ebron Leodegario A., Araki Etsuko, Kato Hiroshi, Khush Gurdev S., Sheehy John E., Lafarge Tanguy, Fukuta Yoshimichi, Kobayashi Nobuya. 2010. Theoretical and Applied Genetics, 120 (6) : 1233-1240.

Folate polyglutamylation is required for rice seed development. Anukul Nampeung, Ramos Riza Abilgos, Mehrshahi Payam, Castelazo Anahi Santoyo, Parker Hélène, Dievart Anne, Lanau Nadège, Mieulet Delphine, Tucker Grégory, Guiderdoni Emmanuel, Barret David A, Bennett Malcolm J.. 2010. Rice, 3 : 181-193. International Rice Genetics Symposium. 6, Manille, Philippines, 6 Novembre 2009/19 Novembre 2009.

Identification of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides small colony genes coding for T-cell antigens. Totté Philippe, Mather Arshad, Reslan Lina, Boublik Yan, Niang Mamadou, Du Plessis Dion H., Dedieu Laurence. 2010. Clinical and Vaccine Immunology, 17 (8) : 1211-1216.

Improved drought and salt stress tolerance in transgenic tobacco overexpressing a novel A20/AN1 zinc-finger "AlSAP" gene isolated from the halophyte grass Aeluropus littoralis. Ben Saad Rania, Zouari Nabil, Ben Ramdhan Walid, Azaza Jalel, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, Hassairi Afif. 2010. Plant Molecular Biology, 72 (1-2) : 171-190.

Intertwining threshold settings, biological data and database knowledge to optimize the selection of differentially expressed genes from microarray. Chuchana Paul, Holzmuller Philippe, Vezilier Frédéric, Berthier David, Chantal Isabelle, Severac Dany, Lemesre Jean-Loup, Cuny Gérard, Nirdé Philippe, Bucheton Bruno. 2010. PloS One, 5 (10):e13518, 12 p.

Mechanisms of haplotype divergence at the RGA08 nucleotide-binding leucine-rich repeat gene locus in wild banana (Musa balbisiana). Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Rouard Mathieu, Matsumoto Takashi, Miller Roberto Neil Gerard, Rodier-Goud Marguerite, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Yahiaoui Nabila. 2010. BMC Plant Biology, 10 (149), 16 p.

Obtenção de produtos de PCR dos principais fungos causadores de doenças no cacaueiro visando estudos filogeneticos e taxonômicos : [Resumo]. Santos Rogério M.F., Lemos L.S.L., Juca F.F., Dos Santos M.V.O., Kruschewsky M.C., Ganem Rodrigo Sousa, Clément Didier, Micheli Fabienne, Gramacho Karina Peres. 2010. In : Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., 127. Congresso Brasileiro de Genética. 56, Guaruja, Brésil, 14 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

Patrons de variabilité chez Vitellaria paradoxa (karité) : étude phylogéographique et analyse combinée de la variation des acides gras, des tocophérols et de gènes candidats. Allal François. 2010. Montpellier : UM2, 310 p. Thèse de doctorat : Évolution, écologie, ressources génétiques, paléontologie : Université Montpellier 2

Seawater and freshwater challenges affect the insulin-like growth factors IGF-I and IGF-II in liver and osmoregulatory organs of the tilapia. Link Karl, Berishvili Giorgi, Shved Natallia, D'Cotta Helena, Baroiller Jean-François, Reinecke Manfred, Eppler Elisabeth. 2010. Molecular and Cellular Endocrinology, 327 (1-2) : 40-46.

The green fluorescent protein as an efficient selection marker for Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation in Hevea brasiliensis (Müll. Arg). Leclercq Julie, Lardet Ludovic, Martin Florence, Chapuset Thierry, Oliver Gérald, Montoro Pascal. 2010. Plant Cell Reports, 29 (5) : 513-522.

A high-throughput data mining of single nucleotide polymorphisms in Coffea species expressed sequence tags suggests differential homeologous gene expression in the allotetraploid Coffea arabica 1[W]. Vidal Ramon Oliveira, Mondego Jorge M.C., Pot David, Batista Ambrosio Alinne, Carvalho Andrade Alan, Protasio Pereira Luiz Filipe, Colombo Carlos Augusto, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Carazzolle Marcelo Falsarella, Guimarães Pereira Gonçalo Amarante. 2010. Plant Physiology, 154 (3) : 1053-1066.

Distribution of insensitive acetylcholinesterase (ace-1R) in Anopheles gambiae s.l. populations from Burkina Faso (West Africa). Dabiré K.R., Diabaté Abdoulaye, Namountougou Moussa, Djogbenou Luc, Kengne Pierre, Simard Frédéric, Bass Chris, Baldet Thierry. 2009. Tropical Medicine and International Health, 14 (4) : 396-403.

Evolution de différents effecteurs de la virulence dans les populations du champignon pathogène Magnaporthe oryzae issues du riz et d'autres plantes hôtes. Mississipi Stelly, Tharreau Didier, Kroj Thomas, Lebrun Marc-Henri, Fournier Elisabeth. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 41. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

Genetic diversity of Xanthomonas species pathogenic to citrus based on avr and leucine rich protein genes. Fabricio José J., Martins E. Cristina, Ferro M.Inês T., Vernière Christian, Pruvost Olivier, Belasque José. 2009. In : Abstracts of the XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, July 19-23, 2009, Quebec City, Canada. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 14, Québec, Canada, 19 Juillet 2009/23 Juillet 2009.

Genetic diversity of candidate genes for root development in rice. Plassé Caroline, Gensous Simon, Gantet Pascal, Courtois Brigitte. 2009. In : 6th International Rice Genetics Symposium, Manila, Philippines, 06-19 November 2009. s.l. : s.n., 1 p. International Rice Genetics Symposium. 6, Manille, Philippines, 6 Novembre 2009/19 Novembre 2009.

High-affinity copper transport and Snq2 export permease of Saccharomyces cerevisiae modulate cytotoxicity of PR-10 from Theobroma cacao. Pungartnik Cristina, Da Silva Aline Clara, Alves de Melo Sarah, Peres Gramacho Karina, De Mattos Cascardo Julio Cézar, Brendel Martin, Micheli Fabienne, Da Silva Gesteira Abelmon. 2009. Molecular Plant-Microbe Interactions, 22 (1) : 39-51.

New karyotypic data for Asian rodents (Rodentia, Muridae) with the first report of B-chromosomes in the genus Mus. Badenhorst D., Herbreteau Vincent, Chaval Yannick, Pagès Michel, Robinson T.J., Rerkamnuaychoke W., Morand Serge, Hugot J.P., Dobigny Gauthier. 2009. Journal of Zoology, 279 (1) : 44-56.

Agrobacterium rhizogenes-transformed roots of Coffee (Coffea arabica): Conditions for long-term proliferation, and morphological and molecular characterization. Alpizar Edgardo, Dechamp Eveline, Lapeyre-Montes Fabienne, Guilhaumon Claire, Bertrand Benoît, Jourdan Christophe, Lashermes Philippe, Etienne Hervé. 2008. Annals of Botany, 101 (7) : 929-940.

Analysis of genome-wide linkage disequilibrium in the highly polyploid sugarcane. Raboin Louis-Marie, Pauquet Jérôme, Butterfield Mike, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe. 2008. Theoretical and Applied Genetics, 116 (5) : 701-714.

Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: Isolation, RFLP marker development, and physical mapping. Miller Roberto Neil Gerard, Bertioli David J., Baurens Franc-Christophe, Santos Candice M.R., Alves P.C., Martins Natalia, Togawa Roberto Coiti, Souza Manoel, Pappas Junior Georgios. 2008. BMC Plant Biology, 8 (15), 15 p.

Characterization of leafy cotyledon1-like during embryogenesis in Theobroma cacao L. Alemanno Laurence, Devic M., Niemenak Nicolas, Sanier Christine, Guilleminot J., Rio Maryannick, Verdeil Jean-Luc, Montoro Pascal. 2008. Planta, 227 (4) : 853-866.

Characterization of the Bru1 (brown rust resistance) locus; distribution in sugarcane cultivars. Royaert Stefan, Le Cunff Loïc, Costet Laurent, Raboin Louis-Marie, Hoarau Jean-Yves, Telismart Hugues, Hervouet Catherine, Garsmeur Olivier, Nibouche Samuel, D'Hont Angélique. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT ; CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

Diploid/polyploid syntenic shuttle mapping and haplotype-specific chromosome walking toward a rust resistance gene (Bru1) in highly polyploid sugarcane (2n ~ 12x ~ 115). Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Pauquet Jérôme, Telismart Hugues, Selvi Athiappan, Grivet Laurent, Philippe Romain, Begum Dilara, Deu Monique, Costet Laurent, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique. 2008. Genetics, 180 (1) : 649-660.

Distribution of the members of Anopheles gambiae and pyrethroid knock-down resistance gene (kdr) in Guinea-Bissau, West Africa. Dabiré K.R., Diabaté Abdoulaye, Agostinho F., Alves F., Manga L., Faye Ousmane, Baldet Thierry. 2008. Bulletin de la Société de Pathologie Exotique, 101 (2) : 119-123.

ESKIMO1 is a gene involved in water economy as well as cold acclimatation and salt tolerance. Bouchabke-Coussa Oumaya, Quashie Marie-Luce, Seoane-Redondo Jose, Fortabat Marie-Noelle, Gery Carine, Yu Agnès, Linderme Daphné, Trouverie Jacques, Granier Fabienne, Téoulé Evelyne, Durand-Tardif Mylène. 2008. BMC Plant Biology, 8 (125), 35 p.

Exploiter les ressources génétiques de la canne à sucre : l'apport du marquage moléculaire. D'Hont Angélique. 2008. In : Canne à sucre = Sugarcane. CIRAD-PERSYST-UPR Systèmes canniers. Montpellier : CIRAD, 2 p.

Exploiting sugarcane genetic resources : The contribution of molecular markers. D'Hont Angélique. 2008. In : Sugarcane = Canne à sucre. CIRAD-PERSYST-UPR Systèmes canniers. Montpellier : CIRAD, 2 p.

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Expression des gènes codant pour les invertases acides et les ASRs chez six génotypes de riz soumis à un stress hydrique : implication potentielle dans la régulation du métabolisme carboné. Fabre Denis. 2008. Montpellier : UM2, 21 p. Mémoire de master : Biologie, géoscience, agronomie, environnement. Biologie et évolution des plantes. Biologie fonctionnelle des plantes : Université Montpellier 2

Facteurs limitant l'efficacité des cotonniers GM : implications pour la culture paysanne en Afrique. Hofs Jean-Luc. 2008. In : Séminaire sur les cotonniers génétiquement modifiés, Ouagadougou, du 16 au 18 septembre 2008 = Seminar on Genetically Modified Cotton, Ouagadougou, from 16th to 18th September. COS-Coton. Ouagadougou : COS-Coton, Diaporama, (16 vues) Conférence sur les enjeux du coton génétiquement modifié en Afrique, Ouagadougou, Burkina Faso, 16 Septembre 2008/18 Septembre 2008.

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Phylogenomics of plant genomes : A methodology for genome-wide searches for orthologs in plants. Conte Matthieu, Gaillard Sylvain, Droc Gaëtan, Perin Christophe. 2008. BMC Genomics, 9 (183), 16 p.

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Régionalisation des OGM et évolution de l'offre en transgènes de nouvelle génération. Frutos Roger. 2008. In : Séminaire sur les cotonniers génétiquement modifiés, Ouagadougou, du 16 au 18 septembre 2008 = Seminar on Genetically Modified Cotton, Ouagadougou, from 16th to 18th September. COS-Coton. Ouagadougou : COS-Coton, Diaporama, (13 vues) Conférence sur les enjeux du coton génétiquement modifié en Afrique, Ouagadougou, Burkina Faso, 16 Septembre 2008/18 Septembre 2008.

The crucial role of the Pls1 tetraspanin during ascospore germination in Podospora anserina provides an example of the convergent evolution of morphogenetic processes in fungal plant pathogens and saprobes. Lambou Karine, Malagnac Fabienne, Barbisan Crystel, Tharreau Didier, Lebrun Marc-Henri, Silar Philippe. 2008. Eukaryotic Cell, 7 (10) : 1809-1818.

The rice defensome database: Centralizing and unifying R-genes, resistance QTL mapping and defence gene expression for rice blast. Ballini Elsa, Vergne Emilie, Droc Gaëtan, Courtois Brigitte, Price Adam H., Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier, Morel Jean-Benoit. 2008. In : Journées Jean Chevaugeon, VIIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie, du 20 au 24 janvier 2008 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.). CIRAD, INRA, CNRS, SFP, Bayer cropscience. Montpellier : CIRAD, 109. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 7, Aussois, France, 20 Janvier 2008/24 Janvier 2008.

Analyse fonctionnelle de la diversité agronomique chez le sorgho (Sorghum bicolor ssp. bicolor) : sequence diversity and variability of key genes implied in grain quality. De Alencar Figueiredo Lucio Flavio. 2007. Montpellier : UM2, 200 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Analysis of 13000 unique Citrus clusters associated with fruit quality, production and salinity tolerance. Terol Javier F., Conesa Ana, Colmenero Jose M., Cercos Manuel, Tadeo Francisco, Agusti Javier, Alos Enriqueta, Andres Fernando, Soler Guillermo, Brumos Javier, Iglesias Domingo, Götz Stefan, Legaz Francisco, Argout Xavier, Courtois Brigitte, Ollitrault Patrick, Dossat Carole, Wincker Patrick, Morillon Raphaël, Talon Manuel. 2007. BMC Genomics, 8 (31)

Carotenoid biosynthetic pathway in the Citrus Genus : Number of copies and phylogenetic diversity of seven genes. Fanciullino Anne Laure, Dhuique-Mayer Claudie, Luro François, Morillon Raphaël, Ollitrault Patrick. 2007. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 55 (18) : 7405-7417.

Early and specific gene expression triggered by rice resistance gene Pi33 in response to infection by ACE1 avirulent blast fungus. Vergne Emilie, Ballini Elsa, Marques S., Sidi Mammar B., Droc Gaëtan, Gaillard Sylvain, Bourot S., De Rose Richard, Tharreau Didier, Nottéghem Jean-Loup, Lebrun Marc-Henri, Morel Jean-Benoit. 2007. New Phytologist, 174 (1) : 159-171.

Etude des interactions riz-Magnaporthe oryzae. Diversité, origine et évolution du locus du gène de résistance Pi33. Ballini Elsa. 2007. Montpellier : Montpellier SupAgro, 308 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative des plantes : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Evidence that Cymbidium mosaic virus (CymMV) isolates divide into two subgroups based on nucleotide diversity of coat protein and replicase genes. Moles Marion, Delatte Hélène, Farreyrol Karin, Grisoni Michel. 2007. Archives of Virology, 152 (4) : 705-715.

In silico and in vitro analysis of the isoprenoid pathway in coffee. Tiski Iris, Perreira Luiz Filipe Protasio, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Takahashi E.K., Ferreira Lucia Pires, Marraccini Pierre, Pot David, Leroy Thierry, Benassi Marta T., Dias Rafael Carlos Eloy. 2007. In : 21st International Conference on Coffee Science, Montpellier (France), 11th - 15th September 2006 = 21ème Colloque scientifique international sur le café ; 21. Internationales Wissenshaftliches Kolloquium über Kaffee ; 21e Coloquio Cientifico Internacional sobre el Café. ASIC. Montpellier : ASIC, 745-748. ISBN 2-900212-20-0 Colloque Scientifique International sur le Café. 21, Montpellier, France, 11 Septembre 2006/15 Septembre 2006.

Intermediate resistance to Meloidogyne exigua root-knot nematode in Coffea arabica. Alpizar Edgardo, Etienne Hervé, Bertrand Benoît. 2007. Crop Protection, 26 (7) : 903-910.

Microsatellite null alleles and estimation of population differentiation. Chapuis Marie-Pierre, Estoup Arnaud. 2007. Molecular Biology and Evolution, 24 (3) : 621-631.

Modern elite rice varieties of the 'Green Revolution' have retained a large introgression from wild rice around the Pi33 rice blast resistance locus. Ballini Elsa, Berruyer Romain, Morel Jean-Benoit, Lebrun Marc-Henri, Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier. 2007. New Phytologist, 175 (1) : 340-350.

Molecular characterization of an ethylene receptor gene (CcETR1) in coffee trees, its relationship with fruit development and caffeine content. Bustamante-Porras José, Campa Claudine, Poncet Valérie, Noirot Michel, Leroy Thierry, Hamon Serge, De Kochko Alexandre. 2007. Molecular Genetics and Genomics, 277 : 701-712.

The Triticum aestivum non-specific lipid transfer protein (TaLtp) gene family : Comparative promoter activity of six TaLtp genes in transgenic rice. Boutrot Freddy, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, Joudrier Philippe, Gautier Marie-Françoise. 2007. Planta, 225 (4) : 843-862.

A potato carboxypeptidase inhibitor gene provides pathogen resistance in transgenic rice. Quilis Jordi, Meynard Donaldo, Vila Laura, Avilés Francesc X., Guiderdoni Emmanuel. 2007. Plant Biotechnology Journal, 5 (4) : 537-553.

The promoter of the wheat puroindoline-a gene (PinA) exhibits a more complex pattern of activity than that of the PinB gene and is induced by wounding and pathogen attack in rice. Evrard Alexandre, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, Joudrier Philippe, Gautier Marie-Françoise. 2007. Planta, 225 : 287-300.

Abscence de gènes nod chez certaines souches de Bradyrhizobium photosynthétiques révélée par l'analyse de la séquence de leurs génomes. Moulin Lionel, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Barbe Valérie, Béna Gilles, Cartiaux F., Delajudie P., Dreyfus Bernard, Elmerich D., Fardoux Joël, Hannibal L., Kojadinovic Mila, Lajus Aurélie, Mangenot S.G., Medigue Claudine, Pignol David, Prin Yves, Rouy Zoe, Stacey Gary, Sadowsky Michael, Vallenet D., Vermeglio André, Vuillet Laurie, Giraud E.. 2006. In : 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. SFP. Angers : INRA, Résumé, 39. Rencontres plantes-bactéries. 7, Aussois, France, 20 Mars 2006/24 Mars 2006.

Améliorer le riz pour l'Afrique : resistance to rice yellow mottle virus and the breeding potential of O. glaberrima. Ghesquière Alain, Ahmadi Nourollah, Albar Laurence, Fargette Denis, Jones Monty P., Lorieux Mathias, Ndjiondjop Marie-Noëlle, Sohro F.. 2006. In : La France et le CGIAR : delivering scientific results for agricultural development = France and the CGIAR : delivering scientific results for agricultural development. Rocchi Daniel (ed.), Despréaux Denis (ed.), Frison Emile A. (ed.), Hubert Bernard (ed.), Lantin Manuel M. (ed.). Washington : CGIAR, 30-33.

Cloning and characterization of ripening-related cDNAs from banana fruit : Functional genomic tools for molecular mechanism studies of fruit-quality elaboration. Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Hubert Olivier, Chillet Marc, Fils-Lycaon Bernard, Gomez Rose-Marie, Rinaldo Dominique, Baurens Franc-Christophe. 2006. In : Gordon Research Conference on Postharvest Physiology, 09-14 juillet 2006, New London, USA. s.l. : s.n., 1 p. Gordon Research Conference on Postharvest Physiology, New London, États-Unis, 9 Juillet 2006/14 Juillet 2006.

Cloning of Pi33, the rice resistance gene corresponding to the cloned avirulence gene ACE1 of Magnaporthe grisea. Ballini Elsa, Bordat Amandine, Vergne Emilie, Morel Jean-Benoit, Lebrun Marc-Henri, Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier. 2006. In : Journées Jean Chevaugeon : VIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie du 15 au 19 janvier 2006 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.), Tharreau Didier (ed.). CIRAD, INRA, IRD, Bayer cropscience, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 92. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 6, Aussois, France, 15 Janvier 2006/19 Janvier 2006.

Distribution and origin of the rice blast resistance gene Pi33. Ballini Elsa, Berruyer Romain, Bordat Amandine, Lebrun Marc-Henri, Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier. 2006. In : Journées Jean Chevaugeon : VIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie du 15 au 19 janvier 2006 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.), Tharreau Didier (ed.). CIRAD, INRA, IRD, Bayer cropscience, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 91. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 6, Aussois, France, 15 Janvier 2006/19 Janvier 2006.

Diversité génétique d'Elaeis guineensis par marqueurs microsatellites et étude préliminaire du déséquilibre de liaison local. Rekima Samah. 2006. Montpellier : CIRAD, 47 p. Mémoire de master : Génétiques et gestion de la biodiversité : Université Pierre et Marie Curie

Genetic mapping in sugarcane, a high polyploid, using bi-parental progeny : identification of a gene controlling stalk colour and a new rust resistance gene. Raboin Louis-Marie, Oliveira Karine Miranda, Le Cunff Loïc, Telismart Hugues, Roques Danièle, Butterfield M.K., Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique. 2006. Theoretical and Applied Genetics, 112 (7) : 1382-1391.

Identification of new gene expression regulators specifically expressed during plant seed maturation. Gutierrez Laurent, Conejero Geneviève, Castelain Mathieu, Guénin Stéphanie, Verdeil Jean-Luc, Thomasset Brigitte, Van Wuytswinkel Olivier. 2006. Journal of Experimental Botany, 57 (9) : 1919-1932.

Isolement et caractérisation des gènes ACS et ACO impliqués dans la biosynthèse de l'éthylène chez Hevea brasiliensis. Kuswanhadi. 2006. Montpellier : UM2, 166 p. Thèse de doctorat : Amélioration des plantes : Université Montpellier 2

La cartographie de la population de IR64/ Azucena. Guiderdoni Emmanuel, Courtois Brigitte, Huang Ning, Mc Couch Susan R., Ghesquière Alain, Lorieux Mathias, Filloux Denis, Albar Laurence, Ahmadi Nourollah, Tharreau Didier, Nottéghem Jean-Loup. 2006. In : La France et le CGIAR : delivering scientific results for agricultural development = France and the CGIAR : delivering scientific results for agricultural development. Rocchi Daniel (ed.), Despréaux Denis (ed.), Frison Emile A. (ed.), Hubert Bernard (ed.), Lantin Manuel M. (ed.). Washington : CGIAR, 34-38.

MADS Box Genes in Oil Palm (Elaeis guineensis) : Patterns in the Evolution of the SQUAMOSA, DEFICIENS, GLOBOSA, AGAMOUS, and SEPALLATA Subfamilies. Adam Hélène, Jouannic Stefan, Morcillo Fabienne, Richaud Frédérique, Duval Yves, Tregear James. 2006. Journal of Molecular Evolution, 62 (1) : 15-31.

SPODOBASE: An EST database for the lepidopteran crop pest Spodoptera. Nègre Vincent, Hôtelier Thierry, Volkoff Anne-Nathalie, Gimenez Sylvie, Cousserans François, Mita Kazuei, Sabau Xavier, Rocher Janick, Lopez-Ferber Miguel, D'Alençon Emmanuelle, Audant Pascaline, Sabourault Cécile, Bidegainberry Vincent, Hilliou Frédérique, Fournier Philippe. 2006. BMC Bioinformatics, 7 (322), 10 p.

Somaclonal variation in micropropagated oil palm. Characterization of two novel genes with enhanced expression in epigenetically abnormal cell lines and in response to auxin. Morcillo Fabienne, Gagneur Cyril, Adam Hélène, Richaud Frédérique, Singh Rajinder, Cheah Suan-Choo, Rival Alain, Duval Yves, Tregear James. 2006. Tree Physiology, 26 (5) : 585-594.

Variation in albicidin biosynthesis genes and in pathogenicity of Xanthomonas albilineans, the sugarcane leaf scald pathogen. Champoiseau Patrice, Daugrois Jean-Heinrich, Girard Jean-Claude, Royer Monique, Rott Philippe. 2006. Phytopathology, 96 (1) : 33-45.

Vers l'identification des gènes impliqués dans la pathogénie de Xanthomonas albilineans, l'agent causal de l'échaudure des feuilles de canne à sucre. Champoiseau Patrice, Daugrois Jean-Heinrich, Royer Monique, Rott Philippe. 2006. In : 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. SFP. Angers : INRA, Résumé, 46. Rencontres plantes-bactéries. 7, Aussois, France, 20 Mars 2006/24 Mars 2006.

Xanthomonas albilineans, l'agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre : caractérisation et variabilité des bases génétiques du pouvoir pathogène, en Guadeloupe et dans le monde. Champoiseau Patrice. 2006. Pointe-à-Pitre : UAG, 187 p. Thèse de doctorat : Science de la vie. Phytopathologie : Université des Antilles et de la Guyane

A secondary metabolite is involved in recognition of the rice blast fungus. Collemare J., Böhnert Heidi U., Pianfetti M., Fudal Isabelle, Tharreau Didier, Lebrun Marc-Henri. 2006. In : Journées Jean Chevaugeon : VIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie du 15 au 19 janvier 2006 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.), Tharreau Didier (ed.). CIRAD, INRA, IRD, Bayer cropscience, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 42. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 6, Aussois, France, 15 Janvier 2006/19 Janvier 2006.

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Biosynthèse de l'albicidine, une molécule antibiotique et une pathotoxine de Xanthomonas albilineans. Vivien Eric. 2005. Montpellier : UM2, 188 p. Thèse de doctorat : Microbiologie moléculaire : Université Montpellier 2

Caractérisation de l'expression des gènes de biosynthèse de l'éthylène par hybridation in situ chez l'hévéa. Développement de techniques de localisation cellulaire de gènes faiblement exprimés. Guilhaumon Claire. 2005. Montpellier : UM2, 23 p. Mémoire DESS : Génétique, génomique et technologies avancées des végétaux : Université Montpellier 2

Construction of a reference microsatelliete genetic map of Magnaporthe grisea and its use for mapping avirulence genes. Kaye Claudia, Bordat Amandine, Wang Yanli, Li Chengyun, Sreewongchai Tanee, Rosenfeld Sophie, Sirithunya Pattama, Shen Ying, Lebrun Marc-Henri, Tharreau Didier. 2005. In : Société française de phytopathologie, VIème congrés, 23-24-25 février 2005, Toulouse : programme et résumés des communications. SFP, INRA, CNRS, ENSAT-INP, UPS, IFR FR40. Paris : Société française de phytopathologie, Résumé, 1 p. Congrès de la Société française de phytopathologie. 6, Toulouse, France, 23 Février 2005/25 Février 2005.

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Diversité nucléotidique et évolution moléculaire de cinq gènes impliqués dans la voie de biosynthèse du saccharose au sein du genre Coffea. Bouchet Sophie. 2005. Rennes : Université de Rennes I, 64 p. Mémoire de master : Biologie. Spécialité Génétique, adaptation et productions végétales : Université de Rennes I

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Préparation de vecteurs binaires permettant la surexpression de gènes afin d'améliorer la tolérance au stress oxydatif chez Hevea brasiliensis. Peyramard Mathieu. 2005. Montpellier : UM2, 20 p. Mémoire de master : Biologie fonctionnelle des plantes : Université Montpellier 2

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Caractérisation de gènes appartenant à la famille MADS box chez le palmier à huile et étude de leur rôle dans la mise en place de la structure florale. Adam Hélène. 2004. Montpellier : UM2, 168 p. Thèse de doctorat : Physiologie végétale : Université Montpellier 2

Caractérisation fonctionnelle de l'expression du gène rapporteur uidA sous le contrôle du promoteur du gène hev2.1 dans des cals friables et des plantules in vitro transgéniques chez Hevea brasiliensis. Lagier Sébastien. 2004. Montpellier : UM2, 44 p. Mémoire DESS : Génétique, génomique et technologies avancées des végétaux : Université Montpellier 2

Construction of a sugarcane BAC contig the target resistance gene Bru1 through exploitation of synteny with sorghum and rice [Workshop : ICSB. W120]. Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique. 2004. . s.l. : s.n. Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.

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Evaluation of resistance of some hybrid rices, conventional early indica and late japonica rice to Magnaporthe grisea in China. Shen Ying, Adreit Henri, Zhu Xu-Dong, Milazzo Joëlle, Chen Hong-Qi, Tharreau Didier. 2004. Scientia Agricultura Sinica, 37 (3) : 362-369.

From genes to morphogenesis. Coen Enrico. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 359. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

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Génétique d'une graminée hautement polyploïde : apports de la génomique. Glaszmann Jean-Christophe. 2004. Comptes Rendus des Séances de l'Académie d'Agriculture de France, 90 (3) : 24. Séance de l'Académie d'Agriculture de France "La canne à sucre : origine, génétique et amélioration variétale", Paris, France, 24 Mars 2004.

High throughput T-DNA insertion mutagenesis in rice : A first step towards in silico reverse genetics. Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Piegu Benoît, Droc Gaëtan, Regad Farid, Bourgeois Emmanuelle, Meynard Donaldo, Perin Christophe, Sabau Xavier, Ghesquière Alain, Glaszmann Jean-Christophe, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2004. Plant Journal, 39 (3) : 450-464.

Linkage disequilibrium in sorghum [Workshop : allele mining. W10]. Deu Monique, Glaszmann Jean-Christophe. 2004. . s.l. : s.n. Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.

Mating type alleles, female fertility and genetic diversity of Magnaporthe grisea populations pathogenic to rice from five Asian countries. Shen Ying, Milazzo Joëlle, Yuan Xiao Ping, Adreit Henri, Wang Y., Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier. 2004. In : Rice blast: Interaction with rice and control : Proceedings of the 3rd International Rice Blast Conference. Kawasaki Shinji (ed.). Dordrecht : Kluwer Academic Publishers, 271-279. ISBN 1-4020-1228-4 International Rice Blast Conference. 3, Tsukuba, Japon, 11 Septembre 2002/14 Septembre 2002.

Molecular monitoring of the introgression in Gossypium hirsutum L. of G. sturtianum Willis genes controlling the "glanded-plant and glandless-seed" trait. Benbouza Halima, Lacape Jean-Marc, Jacquemin Jean-Marie, Baudoin Jean-Pierre, Mergeai Guy. 2004. In : Proceedings of the world cotton research conferences - 3. Cotton production for the new millennium. Swanepoel A. (ed.). ARC-IIC, FAO. Rustenburg : ARC-IIC, 333-341. World Cotton Research Conference. 3, Cape Town, Afrique du Sud, 9 Mars 2003/13 Mars 2003.

Recombinaison homologue chez le riz (Oryza sativa L.) : développement d'un modèle d'étude de ciblage génique et caractérisation moléculaire du gène rad50. Cotsaftis Olivier. 2004. Montpellier : UM2, 95 p. Thèse de doctorat : Biochimie et Biologie moléculaire : Université Montpellier 2

Resistance of some chinese hybrid rice, conventional early Indica and late Japonica rice to Magnaporthe grisea. Shen Ying, Adreit Henri, Zhu Xu-Dong, Milazzo Joëlle, Chen Hong-Qi, Tharreau Didier. 2004. In : Rice blast: Interaction with rice and control : Proceedings of the 3rd International Rice Blast Conference. Kawasaki Shinji (ed.). Dordrecht : Kluwer Academic Publishers, 241-250. ISBN 1-4020-1228-4 International Rice Blast Conference. 3, Tsukuba, Japon, 11 Septembre 2002/14 Septembre 2002.

Rice mutant resources for gene discovery. Hirochika Hirohiko, Guiderdoni Emmanuel, An Gynheung, Hsing Yue-ie C., Young Eun Moo, Han Chang-deok, Upadhyaya Narayana, Ramachandran Srinivasan, Zhang Qifa, Pereira Andy, Sundaresan Venkatesan, Leung Hei. 2004. Plant Molecular Biology, 54 (3) : 325-334.

Studies on the rice blast pathogen, resistance genes, and implication for breeding for durable blast resistance in Colombia. Correa-Victoria F.J., Tharreau Didier, Martinez C., Vales Michel, Escobar F., Prado G., Aricapa G.. 2004. In : Rice blast: Interaction with rice and control : Proceedings of the 3rd International Rice Blast Conference. Kawasaki Shinji (ed.). Dordrecht : Kluwer Academic Publishers, 215-227. ISBN 1-4020-1228-4 International Rice Blast Conference. 3, Tsukuba, Japon, 11 Septembre 2002/14 Septembre 2002.

Targeted mapping of a sugarcane rust resistance gene (Bru1) using bulked segregant analysis and AFLP markers. Asnaghi Carole, Roques Danièle, Ruffel Sandrine, Kaye Claudia, Hoarau Jean-Yves, Telismart Hugues, Girard Jean-Claude, Raboin Louis-Marie, Risterucci Ange-Marie, Grivet Laurent, D'Hont Angélique. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (4) : 759-764.

Yield response to water deficit in an upland rice mapping population : associations among traits and genetic markers. Lafitte Renée Honor, Price Adam H., Courtois Brigitte. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 109 (6) : 1237-1246.

A barley cultivation-associated polymorphism conveys resistance to powdery mildew. Piffanelli Pietro, Ramsay Luke, Waugh Robbe, Benabdelmouna Abdellah, D'Hont Angélique, Hollricher Karin, Jorgensen Jorgen Helms, Schuize-Lefert Paul, Panstruga Ralph. 2004. Nature, 430 (7002) : 887-891.

A novel two T-DNA binary vector allows efficient generation of marker-free transgenic plants in three elite cultivars of rice (Oryza sativa L.). Breitler Jean-Christophe, Meynard Donaldo, Van Boxtel Jos, Royer Monique, Bonnot François, Cambillau Laurence, Guiderdoni Emmanuel. 2004. Transgenic Research, 13 (3) : 271-287.

A putative polyketide synthase/peptide synthetase from Magnaporthe grisea signals pathogen attack to resistant rice. Böhnert Heidi U., Fudal Isabelle, Dioh Waly, Tharreau Didier, Nottéghem Jean-Loup, Lebrun Marc-Henri. 2004. Plant Cell, 16 (9) : 2499-2513.

Analysing the genomic distribution of sequence diversity, the new challenge for germplasm characterisation [B-47]. Glaszmann Jean-Christophe, Deu Monique. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 22. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Characterization of the phosphoenolpyruvate carboxylase gene family in grasses (Poaceae). Besnard G., Pinçon G., D'Hont Angélique, Robert C., Rondeau Philippe, Hoarau Jean-Yves, Offmann Bernard Gilles, Rouch Claude, Cadet Fréderic. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 2. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Detection of QTAs for agronomic traits across crop-cycles and seasons in two segregating populations. Forget L., Hoarau Jean-Yves, Mungur H., Payet Jacques, Badaloo G., Hellmann Michel, Ramdoyal K., Wong Sak Hoi L., Raboin Louis-Marie, Dookun-Saumtally Asha, Offmann Bernard Gilles. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 23. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

ESTs as a source for sequence polymorphism discovery in sugarcarne : example of the Adh genes. Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, Vincentz Michel, Da Silva F., Arruda Paulo. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 190-197.

Etude des facteurs génétiques contrôlant le rendement en sucre et la teneur en fibre dans deux populations de canne à sucre (Saccharum spp.) de l'île de la Réunion et d'Australie. Reffay Nathalie. 2003. Saint-Denis : Université de la Réunion, 158 p. Thèse de doctorat : Connaissance et amélioration des plantes : Université de la Réunion

Etude des interactions riz-Magnaporthe grisea : caractérisation et clonage du gène de résistance Pi33. Berruyer Romain. 2003. Montpellier : ENSAM, 340 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative. Spécialité Ressources phytogénétiques et interactions biologiques : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

Exploration du génome de la canne à sucre par séquençage EST : [2001-02]. Grivet Laurent, D'Hont Angélique. 2003. In : Le Cirad au Brésil : rapport d'activités 2001-2002. Hainzelin Etienne (ed.). CIRAD. Brasilia : CIRAD, 16-17.

Exploração do genoma da cana-de-açucar por seqüenciamento EST : [2001-02]. Grivet Laurent, D'Hont Angélique. 2003. In : O Cirad no Brasil : relatorio de atividades 2001-2002. Hainzelin Etienne (ed.). CIRAD. Brasilia : CIRAD, 16-17.

Functional genomics in Magnaporthe grisea:A strategic evolution for fungicide discovery. Lebrun Marc-Henri, Villalba François, Perret Phillippe, Fargeix Christophe, Tag Andy, Thomas Terry, Lappartient Anne, Kaye Claudia, Tharreau Didier, Beffa Roland. 2003. . s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 11, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2003/15 Janvier 2003.

Genetic transformation of pigeonpea to evaluate insecticidal genes for resistance to the legume pod borer Helicoverpa armigera [SS1-12]. Lavanya M., Uraichuen Sopon, Pieretti Isabelle, Vassal Jean-Michel, Sharma Kiran, Royer Monique. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 448. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Genome distribution and characterization of EST derived sugarcane resistance gene analogs. Rossi Magdalena, Araujo Paula G., Paulet Florence, Garsmeur Olivier, Dias Viviane M., Chen Hui, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 9. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Genome distribution and characterization of sugarcane resistance gene analogs. Rossi Magdalena, Araujo Paula G., Garsmeur Olivier, Dias Viviane M., Paulet Florence, Chen Hui, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2003. . s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 11, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2003/15 Janvier 2003.

Highly efficient production and characterization of T-DNA plants for rice (Oryza sativa L.) functional genomics. Sallaud Christophe, Meynard Donaldo, Van Boxtel Jos, Gay Céline, Bes Martine, Brizard Jean-Paul, Larmande Pierre, Ortega D., Raynal Monique, Portefaix Murielle, Ouwerkerk Pieter B.F., Rueb S., Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 1396-1408.

Identification and fine mapping of Pi33, the rice resistance gene corresponding to the magnaporthe grisea avirulence gene ACE1. Berruyer Romain, Adreit Henri, Milazzo Joëlle, Gaillard Sylvain, Berger Angélique, Dioh Waly, Lebrun Marc-Henri, Tharreau Didier. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 107 : 1139-1147.

Identification of five new blast resistance genes in the highly blast-resistant rice variety IR64 using a QTL mapping strategy. Sallaud Christophe, Lorieux Mathias, Roumen E., Tharreau Didier, Berruyer Romain, Svestasrani P., Garsmeur Olivier, Ghesquière Alain, Nottéghem Jean-Loup. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 794-803.

Identification of genetic markers linked to banana streak disease expression in inter-specific Musa hybrids. Lheureux Fabrice, Carreel Françoise, Jenny Christophe, Lockhart Benham E.L., Iskra Caruana Marie-Line. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 (4) : 594-598.

Map based cloning of a rust resistance gene in cultivar R570 exploiting the colinearity with sorghum and rice. Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Grivet Laurent, D'Hont Angélique. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 16. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Molecular characterisation of the Rad50 gene in rice [W03-15]. Cotsaftis Olivier, Heijde Marc, Guiderdoni Emmanuel. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 460. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Molecular phylogeny and evolution of the plant-specific seven-transmembrane MLO family. Devoto Alessandra, Hartmann Henrik Andreas, Piffanelli Pietro, Elliott Candace, Simmons Carl, Taramino Graziana, Goh Chern-Sing, Cohen Fred E., Emerson Brent C., Schulze-Lefert Paul, Panstruga Ralph. 2003. Journal of Molecular Evolution, 56 : 77-88.

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Resistance evaluation of some hybrid rice, conventional early Indica and late Japonica rice to Magnaporthe grisea. Shen Ying, Adreit Henri, Zhu Xu-Dong, Milazzo Joëlle, Chen Hong-Qi, Tharreau Didier. 2003. Agricultural Sciences in China, 2 (12) : 1351-1356.

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Strategies for identification of genes of agricultural importance in Musa acuminata 'Calcutta 4' [S22-33]. Miller Robert, Ciampi Ana, Alves Paulo, Hörberg Helena, Bertolio David, Pappas Junior Georgios, Da Silva Felipe, Martins Natalia, Collevatti Rosane, Piffanelli Pietro, Souza Manoel. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 323. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Tropgene DB sugarcane. Raboin Louis-Marie. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 13. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Variability of the gene NhxI (a potential Na+/H+ antiport) in citrus [S24-16]. Saleh Basel, Legavre Thierry, Baurens Franc-Christophe, Curk Franck, Ollitrault Patrick. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 351. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

The ceratotoxin gene family in the medfly Ceratitis capitata and the Natal fruit fly Ceratitis rosa (Dipera : Tephritidae). Rosetto M., Marchini D., De Filippis T., Ciolfi S., Frati F., Quilici Serge, Dallai R.. 2003. Heredity, 90 (5) : 382-389.

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Characterization of Pi33, a resistance gene in rice interacting with Magnaporthe grisea avirulence gene ACE1. Berruyer Romain, Adreit Henri, Milazzo Joëlle, Tharreau Didier, Dioh Waly, Böhnert Heidi U., Fudal Isabelle, Lebrun Marc-Henri, Zhu L., Price Adam H., Nottéghem Jean-Loup. 2002. International Rice Research Newsletter, 27 (2) : 11-12.

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Different hematological phenotypes caused by extranumerary alpha-Globin genes in sheep native of an endemic TBD region. Pieragostini E., Rubino G., Sassanelli M.T., Petazzi F.. 2002. In : Second international symposium on Candidate Genes for Animal Health (C.G.A.H), Montpellier, France, August 16-18th 2002 : abstracts. CIRAD, INRA. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. International Symposium on Candidate Genes for Animal Health. 2, Montpellier, France, 16 Août 2002/18 Août 2002.

Diversité génétique et capacité colonisatrice de Xanthomonas albilineans, agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre (Saccharum spp.). Champoiseau Patrice. 2002. Montpellier : ENSAM, 26 p. Mémoire DEA : Biologie intégrative : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

Détection moléculaire de la résistance aux insecticides organo-phosphorés et carbamates chez Bemisia tabaci (Gennadius), Hemiptera, Aleyrodidae et Aphis gossypii Glover, Hemiptera, Aphididae : compte-rendu final d'ATP/CIRAD. Menozzi Philippe, Vaissayre Maurice. 2002. Montpellier : CIRAD, 20 p. N° de rapport : APT N° 30/98

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Etude des mécanismes génétiques impliqués dans l'expression des séquences EPRVs pathogènes des bananiers au cours de croisements génétiques interspécifiques. Lheureux Fabrice. 2002. Montpellier : ENSAM, 166 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

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Etudes génétique et moléculaire de la rhuzogenèse adventive : possibilités de modifier le développement des racines via la transformation génétique ; enjeux scientifiques et agronomiques. Jay Allemand Christian, Breton Catherine, Cornu D.. 2002. In : Multiplication végétative des ligneux forestiers, fruitiers et ornementaux : troisième rencontre du groupe de la Sainte Catherine, Orléans du 22 au 24 novembre 2000. Verger M. (ed.). Loiret-Conseil général, Ville d'Orléans, INRA, CTA, CIRAD. Montpellier : CIRAD ISBN 2-87614-498-0 Rencontre du groupe de la Sainte Catherine. 3, Orléans, France, 22 Novembre 2000/24 Novembre 2000.

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Exploitation of sorghum molecular for map-based cloning of a major rust resistance gene in sugarcane. D'Hont Angélique, Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Paulet Florence, Begum Dilara, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

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Genes expressed during the saprotrophic and the symbiotic phases in the ectomycorrhizal fungus Tuber borchii Vittal. Miozzi Laura, Balestrini Raffaella. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Genetic dissection of a modern sugarcane cultivar (Saccharum spp.). II. Detection of QTLs for yield components. Hoarau Jean-Yves, Grivet Laurent, Offmann Bernard Gilles, Raboin Louis-Marie, Diorflar J.P., Payet Jacques, Hellmann Michel, D'Hont Angélique, Glaszmann Jean-Christophe. 2002. Theoretical and Applied Genetics, 105 : 1027-1037.

Genetic improvment of rice in aerobic systems : Progress from yield to genes. Lafitte Renée Honor, Courtois Brigitte, Arraudeau Michel. 2002. Field Crops Research, 75 : 171-190.

Global analyses of the symbiotic cell programme in arbuscular mycorrhiza. Gianinazzi Pearson Vivienne, Van Tuinen Diederik, Brechenmacher Laurent, Gianinazzi Silvo. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Identification d'un cluster de gènes potentiellement impliqués dans le pouvoir pathogène d'Alternaria brassicae, l'agent du black spot des crucifères. Guillemette Thomas, Simoneau Philippe. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

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Le gène d'avirulence Ace1 (Avr1-Irat7) du champignon pathogène du riz Magnaporthe grisea codé pour une enzyme de biosynthèse de métabolites secondaires. Böhnert Heidi U., Fudal Isabelle, Dioh Waly, Tharreau Didier, Nottéghem Jean-Loup. 2001. In : 5e Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Angers (France), 26 - 29 mars 2001. Programme et résumés des communications. SFP. Angers : INRA, Résumé, 79. Congrès de la Société Française de Phytopathologie. 5, Angers, France, 26 Mars 2001/29 Mars 2001.

Le gène d'avirulence Ace1 (Avr1-Irat7) du champignon pathogène du riz Magnaporthe grisea codé pour une polycetide synthase : session E - Résistance et réponses de la plante aux microorganismes. Böhnert Heidi U., Fudal Isabelle, Dioh Waly, Tharreau Didier, Nottéghem Jean-Loup. 2001. In : 5e Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Angers (France), 26 - 29 mars 2001. Programme et résumés des communications. SFP. Angers : INRA, Résumé, 160. Congrès de la Société Française de Phytopathologie. 5, Angers, France, 26 Mars 2001/29 Mars 2001.

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Implication du gène ltp1 de protéine de transfert des lipides du riz (Oryza sativa L.) dans des réactions de défense vis-à-vis d'une attaque par l'agent de la pyriculariose (Magnaporthe grisea) : étude de l'inductibilité du promoteur et de la dérégulation de ce gène dans des riz transgéniques. Lescot Magali. 1997. Vandoeuvre-les-Nancy : ENSAIA, 57 p. Mémoire DAA : Production Végétale, Biotechnologies et Amélioration du Végétal : Ecole nationale supérieure d'agronomie et des industries alimentaires

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Lutte génétique contre la maladie sud-américaine de l'hévéa due à Microcyclus ulei (SALB). Troispoux Valérie, Juliot Eric, Mattos Carlos Raimunto Reis, Pinard Fabrice, Rodier-Goud Marguerite, Seguin Marc, Lespinasse Denis, Le Guen Vincent. 1997. In : Séminaire gestion raisonnée des résistances des plantes aux pathogènes, ATP 96/21, Montpellier, 11-12 septembre 1997. CIRAD. Montpellier : CIRAD, Diaporama, (24 vues) Séminaire gestion raisonnée des résistances des plantes aux pathogènes, Montpellier, France, 11 Septembre 1997/12 Septembre 1997.

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