Lagoda Pierre, Regad Farid, Frisch David, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe.
2001. Réalisation d'une banque BAC sur la variété de riz Azucena.
In : Des modèles biologiques à l'amélioration des plantes. Hamon Serge (ed.). AUF
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Version publiée
- Français
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Résumé : Les banques d'ADN génomique à larges inserts sont un outil essentiel pour aborder des problèmes de génomique moderne. La fabrication d'une banque BAC de riz (variété japonica tropicale Azucena) et la préparation de filtres haute densité pour un début d'exploitation ont été réalisés en collaboration avec le Clemson University Genomics Institute. La banque BAC a été construite en utilisant le vecteur pBAC Indigo 536. Elle est constituée de 36 864 clones et représente 6X équivalents du génome haploïde du riz. 2X équivalents sont représentés par des inserts d'une taille supérieure à 100 kb. La taille moyenne des inserts de la banque totale est estimée à 70 kb. Nous présentons la réalisation et la caractérisation de cette banque BAC. De plus, nous décrirons la mise en place d'un laboratoire équipé en robotique pour permettre la construction de banques BAC et leur gestion rationnelle, la production de filtres à haute densité de dépôts et de microarrays dans le contexte de la Génopole de Montpellier.
Mots-clés Agrovoc : Oryza sativa, banque de gènes, adn
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
Auteurs et affiliations
- Lagoda Pierre, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
- Regad Farid, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
- Frisch David, Clemson University (USA)
- Wing Rod A., Clemson University (USA)
-
Glaszmann Jean-Christophe, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
ORCID: 0000-0001-9918-875X
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/475637/)
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