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Etude du déséquilibre de liaison entre locus trés liés chez le sorgho. Utilisation de sondes moléculaires identifiées grâce à la microsynténie avec la canne à sucre

Bellec Arnaud. 2000. Etude du déséquilibre de liaison entre locus trés liés chez le sorgho. Utilisation de sondes moléculaires identifiées grâce à la microsynténie avec la canne à sucre. Paris : Université de Paris VII, 43 p. Mémoire DESS : Productivité végétale (Biotechnologie, Génome) : Université de Paris VII

Mémoire
Texte intégral non disponible.

Résumé : Nous avons entrepris d'étudier le déséquilibre de liaison chez le sorgho en utilisant la technique RFLP. Pour ce faire nous nous sommes appuyés sur deux contigs de BAC de canne à sucre et une collection de 211 variétés de sorgho représentatives de la diversité de cette graminée. Les extrémités et des fragments (sous-clones) de BAC nous ont fourni deux lots de sondes très liées chez la canne à sucre. Les étroites relations de synténie entre la canne à sucre et le sorgho nous autorisaient à penser que ces sondes de canne à sucre devraient s'hybrider chez le sorgho et être également très liées chez cette espèce. La collection initiale de sorgho a permis de dégager un échantillon de 105 variétés représentatif des 5 races principales et de leurs origines géographiques ; les données RFLP des variétés de sorgho constituant la collection nous ont permis de vérifier la représentativité de cet échantillon. Parmi les 35 sondes testées, 19 se sont hybridées sur l'ADN de sorgho et 12 d'entre-elles ont été retenues pour étudier le déséquilibre de liaison. Ce lot de sondes a été complété par 3 marqueurs RFLP cartographiés dans la même zone génomique chez la canne à sucre. Les hybridations de ces sondes sur la collection de sorgho ont permis de mettre en évidence trois situations de déséquilibre de liaison. A chaque fois le déséquilibre de liaison concerne des sondes extrêmement liées chez la canne à sucre qui ont probablement révélé des locus physiquement très proches chez le sorgho.

Mots-clés Agrovoc : Sorghum, variation génétique, carte génétique, technique analytique, biotechnologie végétale, génie génétique, Saccharum, liaison génétique

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

  • Bellec Arnaud, Université de Paris VII (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/477007/)

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