Résultats pour : "génie génétique"

Pyricularia oryzae: Lab star and field scourge. Baudin Maël, Le Naour-Vernet Marie, Gladieux Pierre, Tharreau Didier, Lebrun Marc-Henri, Lambou Karine, Leys Marie, Fournier Elisabeth, Cesari Stella, Kroj Thomas. 2024. Molecular Plant Pathology, 25 (4):e13449, 16 p.

The bZIP transcription factor BIP1 of the rice blast fungus is essential for infection and regulates a specific set of appressorium genes. Lambou Karine, Tag Andrew, Lassagne Alexandre, Collemare Jérôme, Clergeot Pierre-Henri, Barbisan Crystel, Perret Phillippe, Tharreau Didier, Millazo Joelle, Chartier Elia, De Vries Ronald P., Hirsch Judith, Morel Jean-Benoit, Beffa Roland, Kroj Thomas, Thomas Terry, Lebrun Marc-Henri. 2024. PLoS Pathogens, 20 (1):e1011945, 30 p.

A toolbox for manipulating the genome of the major goat pathogen, Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae. Gourgues Géraldine, Manso-Silvan Lucia, Chamberland Catherine, Sirand-Pugnet Pascal, Thiaucourt François, Blanchard Alain, Baby Vincent, Lartigue Carole. 2024. Microbiology, 170 (1), 17 p.

Combining fusion of cells with CRISPR-Cas9 editing for the cloning of large DNA fragments or complete bacterial genomes in yeast. Guesdon Gabrielle, Gourgues Géraldine, Rideau Fabien, Ipoutcha Thomas, Manso-Silvan Lucia, Jules Matthieu, Sirand-Pugnet Pascal, Blanchard Alain, Lartigue Carole. 2023. ACS Synthetic Biology, 12 (11) : 3252-3266.

Multiple gene co-options underlie the rapid evolution of sexually deceptive flowers in Gorteria diffusa. Kellenberger Roman T., Ponraj Udhaya, Delahaie Boris, Fattorini Róisín, Balk Janneke, Lopez-Gomollon Sara, Müller Karin H., Ellis Allan G., Glover Beverley J.. 2023. Current Biology, 33 (8) : 1502-1512.

Targeted high-throughput sequencing enables the detection of single nucleotide variations in CRISPR/Cas9 gene-edited organisms. Fraiture Marie-Alice, D’aes Jolien, Guiderdoni Emmanuel, Meunier Anne Cecile, Delcourt Thomas, Hoffman Stefan, Vandermassen Els, De Keersmaecker Sigrid C. J., Vanneste Kevin, Roosens Nancy. 2023. Foods, 12 (3) : 1-14.

Manipulation of meiotic recombination to hasten crop improvement. Fayos Ian, Frouin Julien, Meynard Donaldo, Vernet Aurore, Herbert Leo, Guiderdoni Emmanuel. 2022. Biology, 11 (3), n.spéc. Crop Improvement Now and Beyond:369, 15 p.

Origin of COVID-19: dismissing the Mojiang mine theory and the laboratory accident narrative. Frutos Roger, Javelle Emilie, Barberot Celine, Gavotte Laurent, Tissot-Dupont Herve, Devaux Christian. 2022. Environmental Research, 204 (Part B):112141, 5 p.

ddPCR strategy to detect a gene-edited plant carrying a single variation point: Technical feasibility and interpretation issues. Fraiture Marie-Alice, Guiderdoni Emmanuel, Meunier Anne Cecile, Papazova Nina, Roosens Nancy. 2022. Food Control, 137:108904, 10 p.

Defining the combined stress response in wild Arachis. Zotta Mota Ana, Brasileiro Ana Christina Miranda, Vidigal Bruna S., Oliveira Thais Nicolini, Andressa da Cunha Quintana Martins, Passos Saraiva Mario A., Guerra de Araújo Ana Claudia, Togawa Roberto Coiti, Grossi-de-Sa Maria Fatima, Guimarães Patricia M.. 2021. Scientific Reports, 11 (1), 12 p.

Free-living, psychrotrophic bacteria of the Genus Psychrobacter are descendants of pathobionts. Welter Daphne K., Ruaud Albane, Henseler Zachariah M., De Jong Hannah N., Van Coeverden de Groot Peter, Michaux Johan, Gormezano Linda, Waters Jillian L., Youngblut Nicholas D., Ley Ruth E.. 2021. mSystems, 6 (2), 20 p.

GreenPhylDB v5: A comparative pangenomic database for plant genomes. Guignon Valentin, Toure Abdel, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, Conte Matthieu, Rouard Mathieu. 2021. Nucleic Acids Research, 49 (D1) : D1464-D1471.

High-resolution temporal transcriptome sequencing unravels ERF and WRKY as the master players in the regulatory networks underlying sesame responses to waterlogging and recovery. Wang Linhai, Dossa Komivi, You Jun, Zhang Yanxin, Li Donghua, Zhou Rong, Yu Jingyin, Wei Xin, Zhu Xiaodong, Jiang Shiyang, Gao Yuan, Mmadi Marie Ali, Zhang Xiurong. 2021. Genomics, 113 (1) : 276-290.

Integration of genomics with crop modeling for predicting rice days to flowering: A multi-model analysis. Yang Yubin, Wilson Lloyd Ted, Li Tao, Paleari Livia, Confalonieri Roberto, Zhu Yan, Tang Liang, Qiu Xiaolei, Tao Fulu, Chen Yi, Hoogenboom Gerrit, Boote Ken, Gao Yujing, Onogi Akio, Nakagawa Hiroshi, Yoshida Hiroe, Yabe Shiori, Dingkuhn Michael, Lafarge Tanguy, Wang Jing, Hasegawa Toshihiro. 2021. Field Crops Research, 276:108394, 15 p.

Intended consequences statement. Phelan Ryan, Baumgartner Bridget, Brand Stewart, Brister Evelyn, Burgiel Stanley W., Charo R. Alta, Coche Isabelle, Cofrancesco Al, Delborne Jason A., Edwards Owain, Fisher Joshua B., Gaywood Martin, Gordon Doria, Howald Gregg, Hunter Margaret E., Kareiva Peter, Mankad Aditi, Marvier Michelle, Moseby Katherine, Newhouse Andrew E., Novak Ben J., Ohrstrom Gerry, Olson Steven, Palmer Megan J., Palumbi Stephen, Patterson Neil J.R., Pedrono Miguel, et al.. 2021. Conservation Science and Practice, 3 (4), n.spéc. Intended Consequences:e371, 3 p.

Mobilizing sorghum genetic diversity: Biochemical and histological-assisted design of a stem ideotype for biomethane production. Thomas Hélène Laurence, Pot David, Jaffuel Sylvie, Verdeil Jean-Luc, Baptiste Christelle, Bonnal Laurent, Trouche Gilles, Bastianelli Denis, Latrille Eric, Berger Angélique, Calatayud Caroline, Chauvergne Céline, Rossard Virginie, Jeanson Patrice, Alcouffe Joël, Carrere Hélène. 2021. Global Change Biology. Bioenergy, 13 (12) : 1874-1893.

La petite histoire des OGM. Montet Didier. 2020. Toulouse : EchoSciences Occitanie, 3 p.

Moving beyond the opposition of diverse knowledge systems for food security and nutrition. Pingault Nathanaël, Caron Patrick, Kolmans Alicia, Lemke Stefanie, Kalafatic Carol, Zikeli Sabine, Waters-Bayer Ann, Callenius Carolin, Qin Yong-jun. 2020. Journal of Integrative Agriculture, 19 (1) : 291-293.

Thirty years of genome engineering in rice: from gene addition to gene editing. Meynard Donaldo, Vernet Aurore, Meunier Anne Cecile, Mieulet Delphine, Bes Martine, Portefaix Murielle, Breitler Jean-Christophe, Périn Christophe, Guiderdoni Emmanuel. 2020. In : Annual plant reviews online. Roberts Jeremy (ed.). Chichester : John Wiley & Sons, 1-76. (Annual plant reviews, 3) ISBN 9781119312994

The case for improving crop carbon sink strength or plasticity for a CO2-rich future. Dingkuhn Michael, Luquet Delphine, Fabre Denis, Muller Bertrand, Yin Xinyou, Paul Matthew J.. 2020. Current Opinion in Plant Biology, 56, n.spéc. Biotic interactions AGRI 2019 : 259-272.

Depicting the core transcriptome modulating multiple abiotic stresses responses in sesame (Sesamum indicum L.). Dossa Komivi, Mmadi Marie Ali, Zhou Rong, Zhang Tianyuan, Su Ruqi, Zhang Yujuan, Wang Linhai, You Jun, Zhang Xiurong. 2019. International Journal of Molecular Sciences, 20 (16), n.spéc. Plant Genomics 2019:3930, 19 p.

Effector profiles of Xanthomonas perforans and X. euvesicatoria provide insights into the evolution of host range and virulence in BLS pathogens. Iruegas-Bocardo Fernanda, Timilsina Sujan, Jibrin Mustafa O., Minsavage Gerald V., Abrahamian Peter, Egel Daniel S., Creswell Tom, Miller Sydney, Rotondo Francesca, Louws Frank John, Adhikari Tushar, Trueman Cheryl L., Roach Rebecca, Coutinho Teresa A., Pruvost Olivier, Nga Nguyen Thi Thu, Luo Laixin, Kebede Misrak, Potnis Neha, Vallad Gary E., Jones Jeffrey B., Goss Erica. 2019. Phytopathology, 109 (10S), suppl. Plant Health 2019, Résumé : 21-22. American Phytopathological Society 2019 Annual Meeting, Cleveland, États-Unis, 3 Août 2019/7 Août 2019.

Genetic control of vectors. Bouyer Jérémy, Marois Eric. 2018. In : Pests and vector-borne diseases in the livestock industry. Garros Claire (ed.), Bouyer Jérémy (ed.), Takken Willem (ed.), Smallegange Renate C. (ed.). Wageningen : Wageningen Academic Publishers, 435-451. (Ecology and Control of Vector-Borne Diseases, 5, 5) ISBN 978-90-8686-315-0

Genome-wide association studies of 39 seed yield-related traits in sesame (Sesamum indicum L.). Zhou Rong, Dossa Komivi, Li Donghua, Yu Jingyin, You Jun, Wei Xin, Zhang Xiurong. 2018. International Journal of Molecular Sciences, 19 (9), n.spéc. Plant Genetics and Molecular Breeding:2794, 18 p.

Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. Chen Nicolas W.G., Serres-Giardi Laurana, Ruh Mylène, Briand Martial, Bonneau Sophie, Darrasse Armelle, Barbe Valérie, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Jacques Marie Agnès. 2018. BMC Genomics, 19:606, 20 p.

Rice diversity panel provides accurate genomic predictions for complex traits in the progenies of biparental crosses involving members of the panel. Ben Hassen Manel, Cao Tuong-Vi, Bartholome Jérôme, Orasen Gabriele, Colombi C., Rakotomalala J., Razafinimpiasa Lisy, Bertone C., Biselli Chiara, Volante Andrea, Desiderio Francesca, Jacquin Laval, Valè Giampiero, Ahmadi Nourollah. 2018. Theoretical and Applied Genetics, 131 (2) : 417-435.

Viral metagenomic-based screening of sugarcane from florida reveals occurrence of six sugarcane-infecting viruses and high prevalence of Sugarcane yellow leaf virus. Filloux Denis, Fernandez Emmanuel, Comstock Jack C., Mollov Dimitre S., Roumagnac Philippe, Rott Philippe. 2018. Plant Disease, 102 (11) : 2317-2323.

An overview of genetically modified crop governance, issues and challenges in Malaysia. Andrew Johnny, Ismail Normaz Wana, Djama Marcel. 2018. Journal of the Science of Food and Agriculture, 98 (1) : 12-17.

Comparative genomics of the zoonotic pathogen Ehrlichia chaffeensis reveals candidate type IV effectors and putative host cell targets. Noroy Christophe, Meyer Damien. 2017. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 6 (204), 15 p.

Complete genome sequences of six copper-resistant Xanthomonas strains causing bacterial spot of solaneous plants, Bblonging to X. gardneri, X. euvesicatoria, and X. vesicatoria, using long-read technology. Richard Damien, Boyer Claudine, Lefeuvre Pierre, Canteros B.I., Beni-Madhu Shyam, Portier Perrine, Pruvost Olivier. 2017. Genome Announcements, 5 (8):e01693-16, 2 p.

Concepts et méthodes d'identification des espèces d'arthropodes. Fontenille Didier, Almeras Lionel, Garros Claire. 2017. In : Entomologie médicale et vétérinaire. Duvallet Gérard (ed.), Fontenille Didier (ed.), Robert Vincent (ed.). Marseille : IRD-Ed. Quae, 61-78. ISBN 978-2-7099-2376-7

Development of highly informative genome-wide single sequence repeat markers for breeding applications in sesame and construction of a web resource: SisatBase. Dossa Komivi, Yu Jingyin, Liao Boshou, Cissé Ndiaga, Zhang Xiurong. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:1470, 10 p.

Differential fine-tuning of gene expression regulation in coffee leaves by CcDREB1D promoter haplotypes under water deficit. Costa Alves Gabriel Sergio, Ferreira Torres Luana, Dechamp Eveline, Breitler Jean-Christophe, Joët Thierry, Gatineau Frédéric, Carvalho Andrade Alan, Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Etienne Hervé. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (11) : 3017-3031.

Do changes in gene expression contribute to sexual isolation and reinforcement in the house mouse? Loire Etienne, Tusso Sergio, Caminade Pierre, Severac Dany, Boursot Pierre, Ganem Guila, Smadja Carole. 2017. Molecular Ecology, 26 (19) : 5189-5202.

Domestication rewired gene expression and nucleotide diversity patterns in tomato. Sauvage Christopher, Rau Andrea, Aichholz Charlotte, Chadoeuf Joël, Sarah Gautier, Ruiz Manuel, Santoni Sylvain, Causse Mathilde, David Jacques, Glemin Sylvain. 2017. Plant Journal, 91 (4) : 631-645.

Dynamic transcriptome landscape of sesame (Sesamum indicum L.) under progressive drought and after rewatering. Dossa Komivi, Li Donghua, Wang Linhai, Zheng Xiaomin, Yu Jingyin, Wei Xin, Fonceka Daniel, Diouf Diaga, Liao Boshou, Cissé Ndiaga, Zhang Xiurong. 2017. Genomics Data, 11 : 122-124.

Evolution of the banana genome (Musa acuminata) is impacted by large chromosomal translocations. Martin Guillaume, Carreel Françoise, Coriton Olivier, Hervouet Catherine, Cardi Céline, Derouault Paco, Roques Danièle, Salmon Frédéric, Rouard Mathieu, Sardos Julie, Labadie Karine, Baurens Franc-Christophe, D'Hont Angélique. 2017. Molecular Biology and Evolution, 34 (9), 28 p.

Future prospects. Soh Aik Chin, Mayes Sean, Roberts Jeremy, Mahamooth Tasren, Murphy Denis J., Walker Sue, Karunaratne Asha S., Murchie Erik, Foulkes John, De Raïssac Marcel, Perez Raphaël, Fabre Denis, Goh Kah Joo, Ong Chin Kooi, Corley Hereward. 2017. In : Oil palm breeding : genetics and genomics. Soh Aik Chin (ed.), Mayes Sean (ed.) , Roberts Jeremy A. (ed.). Boca Raton : CRC Press, 353-424. ISBN 978-1-4987-1544-7

A G-protein-coupled chemokine receptor: A putative insertion site for a multi-pathogen recombinant capripoxvirus vaccine strategy. Cetre-Sossah Catherine, Dickmu Simon, Kwiatek Olivier, Albina Emmanuel. 2017. Journal of Immunological Methods, 448 : 112-115.

Genome sequencing of the sweetpotato whitefly Bemisia tabaci MED/Q. Xie Wen, Chen Chunhai, Yang Zezhong, Guo Litao, Yang Xin, Wang Dan, Chen Ming, Huang Jinqun, Wen Yanan, Zeng Yang, Liu Yating, Xia Jixing, Tian Lixia, Cui Hongying, Wu Qingjun, Wang Shaoli, Wu Baoyun, Li Xianchiun, Tan Xinqiu, Ghanim Murad, Qiu Baoli, Pan Huipeng, Chu Dong, Delatte Hélène, Maruthi M.N., Ge Feng, Zhou Xueping, Wang Xiaowei, Wan Fang-Hao, Du Yuzhou, Luo Chen, Yan Fengming, Preisser Evan L., Jiao Xiaoguo, Coates Brad S., Zhao Jinyang, Gao Qiang, Xia Jinquan, Yin Ye, Liu Yong, Brown Judith, Zhou Xuguo-Joe, Zhang Youjun. 2017. GigaScience, 6 (5), 7 p.

Genomic preselection with genotyping-bysequencing increases performance of commercial oil palm hybrid crosses. Cros David, Bocs Stéphanie, Riou Virginie, Ortega Abboud Enrique, Tisne Sébastien, Argout Xavier, Pomies Virginie, Nodichao Leifi, Lubis Zulkifli, Cochard Benoît, Durand-Gasselin Tristan. 2017. BMC Genomics, 18:839, 17 p.

Improving transcriptome de novo assembly by using a reference genome of a related species: Translational genomics from oil palm to coconut. Armero Villanueva Alix Augusto, Baudouin Luc, Bocs Stéphanie, This Dominique. 2017. PloS One, 12 (3):e0173300, 22 p.

Le génome du cacaoyer : du décodage de sa séquence jusqu'à l'étude de gènes impliqués dans des caractères agronomiques d'intérêt. Argout Xavier. 2017. Montpellier : Montpellier SupAgro, 238 p. Thèse de doctorat : Biologie, interactions, diversité adaptative des plantes : Montpellier SupAgro

MGIS: Managing banana (Musa spp.) genetic resources information and high-throughput genotyping data. Ruas Max, Guignon Valentin, Sempere Guilhem, Sardos Julie, Hueber Yann, Duvergey H., Andrieu A., Chase Rachel, Jenny Christophe, Hazekamp T., Irish B., Jelali K., Adeka J., Ayala-Silva T., Chao C.P., Daniells J., Dowiya B., Effa Effa B., Gueco L., Herradura L., Ibobondji L., Kempenaers E., Kilangi J., Muhangi S., Ngo Xuan P., Paofa Janet, Pavis Claude, Thiemele D., Tossou Christophe, Sandoval Jorge A., Sutanto A., Vangu Paka G., Yi G., Van Den Houwe Ines, Roux Nicolas, Rouard Mathieu. 2017. Database, 2017:bax046, 12 p.

Molecular genetics and breeding. Soh Aik Chin, Mayes Sean, Roberts Jeremy, Zaki Noorhariza Mohd, Madon Maria, Schwarzacher Trude, Heslop-Harrison Pat, Ithnin Maizura Bint, Din Amiruddin Mohd, Ramli Umi Salamah, Othman Abrizah, Zulkifli Yaakub, Low Eng Ti Leslie, Ong-Abdullah Meilina, Singh Rajinder, Teh Chee Keng, Kwong Qi Bin, Ong Ail Ling, Mohamed Mohaimi, Apparow Sukganah, Chew Fook Tim, Appleton David Ross, Kulaveerasingam Harikrishna, Teh Huey Fang, Mebus Katharina, Neoh Bee Keat, Ooi Tony Eng Keong, Wong Yick Ching, Cros David. 2017. In : Oil palm breeding : genetics and genomics. Soh Aik Chin (ed.), Mayes Sean (ed.) , Roberts Jeremy A. (ed.). Boca Raton : CRC Press, 225-281. ISBN 978-1-4987-1544-7

Post genomics era for orchid research. Tsai Wen-Chieh, Diévart Anne, Hsu Chia-Chi, Hsiao Yu-Yun, Chiou Shang-Yi, Huang Hsin, Chen Hong-Hwa. 2017. Botanical Studies, 58:e61, 22 p.

Root cone angle is enlarged in docs1 LRR- RLK mutants in rice. Bettembourg Mathilde, Dal-Soglio M., Bureau Charlotte, Vernet Aurore, Dardou Audrey, Portefaix Murielle, Bes Martine, Meynard Donaldo, Mieulet Delphine, Cayrol Bastien, Périn Christophe, Courtois Brigitte, Ma J.F., Diévart Anne. 2017. Rice, 10:50, 8 p.

Targeted promoter editing for rice resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae reveals differential activities for SWEET14-inducing TAL effectors. Blanvillain-Baufumé Servane, Reschke Maik, Solé Montserrat, Auguy Florence, Doucoure Hinda, Szurek Boris, Meynard Donaldo, Portefaix Murielle, Cunnac Sébastien, Guiderdoni Emmanuel, Boch Jen, Koebnik Ralf. 2017. Plant Biotechnology Journal, 15 (3) : 306-317.

Transcriptome analysis of leaves, flowers and fruits perisperm of Coffea arabica L. reveals the differential expression of genes involved in raffinose biosynthesis. Ivamoto Suzana Tiemi, Reis Júnior Osvaldo, Silva Domingues Douglas, Dos Santos Tiago Benedito, Freitas de Oliveira Fernanda, Pot David, Leroy Thierry, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Falsarella Carazzolle Marcelo, Guimarães Pereira Gonçalo Amarante, Protasio Pereira Luiz Filipe. 2017. PloS One, 12 (1):e0169595, 17 p.

A comparative test of ixodid tick identification by a network of European researchers. Estrada-Pena Agustin, D'Amico G., Palomar A.M., Dupraz Marlene, Fonville M., Heylen D., Habela M.A., Hornok S., Lempereur Laetitia, Madder M., Núncio M.S., Otranto Domenico, Pfaffle M., Plantard Olivier, Santos-Silva Maria Margarida, Sprong Hein, Vatansever Z., Vial Laurence, Mihalca Andrei Daniel. 2017. Ticks and Tick-borne Diseases, 8 (4) : 540-546.

The emerging oilseed crop Sesamum indicum enters the “Omics” era. Dossa Komivi, Diouf Diaga, Wang Linhai, Wei Xin, Zhang Yanxin, Niang Mareme, Fonceka Daniel, Yu Jingyin, Mmadi Marie Ali, Yehouessi Louis W., Liao Boshou, Zhang Xiurong, Cissé Ndiaga. 2017. Frontiers in Plant Science, 8:1154, 16 p.

The genome draft of coconut (Cocos nucifera). Xiao Yong, Xu Pengwei, Fan Haikuo, Baudouin Luc, Xia Wei, Bocs Stéphanie, Xu Junyang, Li Qiong, Guo Anping, Zhou Lixia, Li Jing, Wu Yi, Ma Zilong, Armero Villanueva Alix Augusto, Issali Auguste Emmanuel, Liu Na, Peng Ming, Yang Yaodong. 2017. GigaScience, 6 (11), 11 p.

Cloning, expression, molecular characterization and preliminary studies on immunomodulating properties of recombinant Trypanosoma congolense calreticulin. Bossard Géraldine, Grébaut Pascal, Thevenon Sophie, Seveno Martial, Berthier David, Holzmuller Philippe. 2016. Infection, Genetics and Evolution, 45 : 320-331.

Combating a global threat to a clonal crop: Banana black sigatoka pathogen Pseudocercospora fijiensis (Synonym Mycosphaerella fijiensis) genomes reveal clues for disease control. Arango Isaza Rafael E., Diaz-Trujillo Caucasella, Dhillon Braham, Aerts Andrea, Carlier Jean, Crane Charles F., de Jong Tristan V., De Vries Ineke, Dietrich Robert, Farmer Andrew, Fortes Fereira Claudia, Garcia Suzana, Guzman Mauricio, Hamelin Richard C., Lindquist Erika, Mehrabi Rahim, Quiros Madrigal Olman, Schmutz Jeremy, Shapiro Harris, Reynolds Elizabeth, Scalliet Gabriel, Souza Manoel, Stergiopoulos Ioannis, Van der Lee Theo A.J., De Wit Pierre J. G. M., Zapater Marie-Françoise, Zwiers Lute-Harm, Grigoriev Igor, Goodwin Stephen B., Kema Gert H.J.. 2016. PLoS Genetics, 12 (8):e1005876, 36 p.

Degradation of the plant defense signal salicylic acid protects Ralstonia solanacearum from toxicity and enhances virulence on tobacco. Lowe-Power Tiffany M., Jacobs Jonathan M., Ailloud Florent, Fochs Brianna, Prior Philippe, Allen Caitilyn. 2016. Mbio, 7 (3):e00656-16, 12 p.

Draft genome sequences of nine strains of Ralstonia solanacearum differing in virulence to eggplant (Solanum melongena). Guinard Jérémy, Vinatzer Boris A., Poussier Stéphane, Lefeuvre Pierre, Wicker Emmanuel. 2016. Genome Announcements, 4 (1):e01415, 15 p.

Evaluation of hierarchical models for integrative genomic analyses. Denis Marie, Tadesse Mahlet. 2016. Bioinformatics, 32 (5) : 738-746.

Genome-wide association mapping of sexual incompatibility genes in cacao (Theobroma cacao L.). da Silva Marcos Ramos, Clément Didier, Gramacho Karina Peres, Monteiro Wilson Reis, Argout Xavier, Lanaud Claire, Lopes Uilson Vanderlei. 2016. Tree Genetics and Genomes, 12 (3):62, 13 p.

Geographic differentiation and population genetic structure of Moniliophthora roreri in the principal cocoa production areas in Colombia. Jaimes Yeirme, Gonzalez Carolina, Rojas Jairo, Cornejo Omar E., Mideros Maria F., Restrepo Silvia, Cilas Christian, Furtado Edson L.. 2016. Plant Disease, 100 (8) : 1548-1558.

Gigwa—Genotype investigator for genome-wide analyses. Sempere Guilhem, Philippe Florian, Dereeper Alexis, Ruiz Manuel, Sarah Gautier, Larmande Pierre. 2016. GigaScience, 5 (25), 9 p.

Healthy tropical plants to mitigate the impact of climate change - as exemplified in coffee. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2016. In : Climate change and agriculture worldwide. Torquebiau Emmanuel (ed.), Manley David (trad.), Cowan Paul (trad.). Heidelberg : Springer, 83-95. ISBN 978-94-017-7460-4

High-quality draft genome sequences of two Xanthomonas pathotype strains infecting aroid plants. Robène Isabelle, Bolot Stéphanie, Pruvost Olivier, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès, Koebnik Ralf, Gagnevin Lionel. 2016. Genome Announcements, 4 (5):e00902-16, 2 p.

Identification of successive flowering phases highlights a new genetic control of the flowering pattern in strawberry. Perrotte Justine, Guédon Yann, Gaston Amèlia, Denoyes Béatrice. 2016. Journal of Experimental Botany, 67 (19) : 5643-5655.

Improvement of the banana Musa acuminata reference sequence using NGS data and semi-automated bioinformatics methods. Martin Guillaume, Baurens Franc-Christophe, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Cenci Alberto, Kilian Andrzej, Hastie Alex, Dolezelova M., Aury Jean-Marc, Alberti Adriana, Carreel Françoise, D'Hont Angélique. 2016. BMC Genomics, 17 (243), 12 p.

In planta comparative transcriptomics of host-adapted strains of Ralstonia solanacearum. Ailloud Florent, Lowe Tiffany, Robène Isabelle, Cruveiller Stéphane, Allen Caitilyn, Prior Philippe. 2016. PeerJ, 4:e1549, 18 p.

Insight into the AP2/ERF transcription factor superfamily in sesame and expression profiling of DREB subfamily under drought stress. Dossa Komivi, Wei Xin, Li Donghua, Foncéka Daniel, Zhang Yanxin, Wang Linhai, Yu Jingyin, Liao Boshou, Diouf Diaga, Cissé Ndiaga, Zhang Xiurong. 2016. BMC Plant Biology, 16 (171), 16 p.

Le riz, une plante modèle à croquer. Cunnac Sébastien, Gantet Pascal, Ghesquière Alain, Guiderdoni Emmanuel, Trung Luu Doan. 2016. Biofutur (380) : 30-34.

Lineage-specific evolutionary histories and regulation of major starch metabolism genes during banana ripening. Jourda Cyril, Cardi Céline, Gibert Olivier, Giraldo Toro Andres, Ricci Julien, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Yahiaoui Nabila. 2016. Frontiers in Plant Science, 7 (1778), 21 p.

Metagenomic-based screening and molecular characterization of cowpea-infecting viruses in Burkina Faso. Palanga Essowé, Filloux Denis, Martin Darren Patrick, Fernandez Emmanuel, Gargani Daniel, Ferdinand Romain, Zabré Jean, Bouda Zakaria, Neya Bouma, Sawadogo Mahamadou, Traoré Oumar, Peterschmitt Michel, Roumagnac Philippe. 2016. PloS One, 11 (10):e0165188, 21 p.

Ongoing geographical spread of Tomato yellow leaf curl virus. Mabvakure Batsirai, Martin Darren Patrick, Kraberger Simona, Cloete Leendert, van Brunschot Sharon, Geering Andrew D., Thomas John, Bananej Kaveh, Lett Jean-Michel, Lefeuvre Pierre, Varsani Arvind, Harkins Gordon William. 2016. Virology, 498 : 257-264.

Patterns of genetic structure and phenotypic diversity in sorghum landraces in relation to farmers' management in Burkina Faso. Kondombo Clarisse Pulchérie, Deu Monique, Chantereau Jacques, Martin Guillaume, Chapuis Elodie, Letourmy Philippe, Zongo Jean-Didier, Sagnard Fabrice, Vom Brocke Kirsten. 2016. International Journal of Biological and Chemical Sciences, 10 (4) : 1747-1764.

Phylogenetic origin of limes and lemons revealed by cytoplasmic and nuclear markers. Curk Franck, Ollitrault Frédérique, Garcia-Lor Andrés, Luro François, Navarro Luis, Ollitrault Patrick. 2016. Annals of Botany, 117 (4) : 565-583.

Phylogeographic reconstructions of a rift valley fever virus strain reveals transboundary animal movements from Eastern Continental Africa to the Union of the Comoros. Maquart Marianne, Pascalis Hervé, Abdouroihamane F., Roger Matthieu, Abdourahime F., Cardinale Eric, Cetre-Sossah Catherine. 2016. Transboundary and Emerging Diseases, 63 (2) : e281-e285.

Several wall-associated kinases participate positively and negatively in basal defense against rice blast fungus. Delteil Amandine, Gobbato Enrico, Cayrol Bastien, Estevan Joan, Michel-Romiti Corinne, Diévart Anne, Kroj Thomas, Morel Jean-Benoit. 2016. BMC Plant Biology, 16 (17), 10 p.

Transcriptome analysis in Coffea eugenioides, an Arabica coffee ancestor, reveals differentially expressed genes in leaves and fruits. Yuyama Priscilla Mary, Reis Júnior Osvaldo, Ivamoto Suzana Tiemi, Domingues Douglas S., Carazzolle Marcelo Falsarella, Pereira Gonçalo Amarante Guimarães, Charmetant Pierre, Leroy Thierry, Pereira Luiz Filipe P.. 2016. Molecular Genetics and Genomics, 291 (1) : 323-336.

Turning rice meiosis into mitosis. Mieulet Delphine, Jolivet Sylvie, Rivard Maud, Cromer Laurence, Vernet Aurore, Mayonove Pauline, Pereira Lucie, Droc Gaëtan, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel, Mercier Raphael. 2016. Cell Research, 26 (11) : 1242-1254.

A genome-wide association study on the seedless phenotype in banana (Musa spp.) reveals the potential of a selected panel to detect candidate genes in a vegetatively propagated crop. Sardos Julie, Rouard Mathieu, Hueber Yann, Cenci Alberto, Hyma Katie E., Van Den Houwe Ines, Hribova Eva, Courtois Brigitte, Roux Nicolas. 2016. PloS One, 11 (5):e0154448, 25 p.

A physical map of important QTLs, functional markers and genes available for sesame breeding programs. Dossa Komivi. 2016. Physiology and Molecular Biology of Plants, 22 : 613-619.

The qTSN positive effect on panicle and flag leaf Size of rice is associated with an early down-regulation of tillering. Adriani Dewi Erika, Lafarge Tanguy, Dardou Audrey, Fabro Aubrey, Clément-Vidal Anne, Yahya Sudirman, Dingkuhn Michaël, Luquet Delphine. 2016. Frontiers in Plant Science, 6 (1197), 17 p.

Accuracy of genomic selection in a rice synthetic population developed for recurrent selection breeding. Grenier Cécile, Cao Tuong-Vi, Ospina Yolima, Quintero Constanza, Châtel Marc, Tohmé Joe, Courtois Brigitte, Ahmadi Nourollah. 2015. PloS One, 10 (8):e0136594, 25 p.

Characterization of a candidate gene for drought tolerance in Coffea: the CcDREB1D gene, in contrasting genotypes of Coffea canephora and related species. Costa Alves Gabriel. 2015. Montpellier : Montpellier SupAgro, 190 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Clade- and species-specific features of genome evolution in the Saccharomycetaceae. Wolfe Kenneth H., Armisén David, Proux-Wera Estelle, ÓhÉigeartaigh Seán S., Azam Haleema, Gordon Jonathan, Byrne Kevin P.. 2015. FEMS Yeast Research, 15 (5), 12 p.

Coffee (Coffea arabica L.). Dechamp Eveline, Breitler Jean-Christophe, Leroy Thierry, Etienne Hervé. 2015. In : Agrobacterium Protocols: Volume 2. Wang Kan (ed.). s.l. : Springer, 275-291. (Methods in Molecular Biology, 1224) ISBN 978-1-4939-1658-0

Comparative genomic analysis of Ralstonia solanacearum reveals candidate genes for host specificity. Ailloud Florent, Lowe Tiffany, Cellier Gilles, Roche David, Allen Caitilyn, Prior Philippe. 2015. BMC Genomics, 16 (270), 11 p.

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

Comparative genomics of a cannabis pathogen reveals insight into the evolution of pathogenicity in Xanthomonas. Jacobs Jonathan M., Pesce Céline, Lefeuvre Pierre, Koebnik Ralf. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (431), 13 p.

Comparative proteomic profiling of Ehrlichia ruminantium pathogenic strain and its high-passaged attenuated strain reveals virulence and attenuation-associated proteins. Marcelino Isabel, Ventosa Miguel, Pires Elisabete, Müller Markus, Lisacek Frédérique, Lefrançois Thierry, Vachiery Nathalie, Coelho Ana Varela. 2015. PloS One, 10 (12):e0145328, 23 p.

Culicoides Latreille (Diptera: Ceratopogonidae) taxonomy: Current challenges and future directions. Harrup Lara E., Bellis Glenn A., Balenghien Thomas, Garros Claire. 2015. Infection, Genetics and Evolution, 30 : 249-266.

Deciphering genome content and evolutionary relationships of isolates from the fungus Magnaporthe oryzae attacking different host plants. Chiapello Hélène, Mallet Ludovic, Guerin Cyprien, Aguileta Gabriela, Amselem Joelle, Kroj Thomas, Ortega-Abboud Enrique, Lebrun Marc-Henri, Henrissat Bernard, Gendrault Annie, Rodolphe François, Tharreau Didier, Fournier Elisabeth. 2015. Genome Biology and Evolution, 7 (10) : 2896-2912.

Development of a new pCAMBIA binary vector using Gateway® technology. Leclercq Julie, Szabolcs Toth, Martin Florence, Montoro Pascal. 2015. Plasmid, 81 : 50-54.

Diversité, évolution et contrôle des virus des plantes tropicales : l'ennemi peut aussi venir de l'intérieur. Caruana Marie-Line. 2015. Montpellier : Université de Montpellier 2, 73 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2

Draft genome sequences of two Xanthomonas euvesicatoria strains from the Balkan Peninsula. Vancheva Taca, Lefeuvre Pierre, Bogatzevska Nevena, Moncheva Penka, Koebnik Ralf. 2015. Genome Announcements, 3 (1):e01528, 2 p.

Draft genome sequences of two Xanthomonas vesicatoria strains from the Balkan peninsula. Vancheva Taca, Bogatzevska Nevena, Moncheva Penka, Lefeuvre Pierre, Koebnik Ralf. 2015. Genome Announcements, 3 (1):e01558-14, 2 p.

Endogenous murine leukemia retroviral variation across wild European and inbred strains of house mouse. Hartmann Stefanie, Hasenkamp Natascha, Mayer Jens, Michaux Johan, Morand Serge, Mazzoni Camila J., Roca Alfred L., Greenwood Alex. 2015. BMC Genomics, 16 (613), 13 p.

Extending DNA fibers and Fiber-FISH. Ozouf-Costaz Catherine, Coutanceau Jean-Pierre, D'Hont Angélique, Chassoux D., Lecointre G.. 2015. In : Fish cytogenetic techniques : Ray-fin fishes and chondrichthyans. Ozouf-Coastaz Catherine (ed.), Pisano Eva (ed.), Fausto Foresti (ed.), Foresti de Almeida Toledo Lurdes (ed.). New-York : CRC Press, 166-174. ISBN 978-1-4822-1199-3

Genomic selection prediction accuracy in a perennial crop: case study of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Cros David, Denis Marie, Sanchez Leopoldo, Cochard Benoît, Flori Albert, Durand-Gasselin Tristan, Nouy Bruno, Omoré Alphonse, Pomies Virginie, Riou Virginie, Suryana Edyana, Bouvet Jean-Marc. 2015. Theoretical and Applied Genetics, 128 (3) : 397-410.

La bonne santé des plantes tropicales pour atténuer les effets du changement climatique: l'exemple du caféier. Bertrand Benoît, Marraccini Pierre, Villain Luc, Breitler Jean-Christophe, Etienne Hervé. 2015. In : Changement climatique et agricultures du monde. Torquebiau Emmanuel (ed.). Versailles : Ed. Quae, 84-95. (Agricultures et défis du monde)

Le pouvoir pathogène chez Ralstonia solanacearum phylotype II : génomique intégrative et paysages transcriptomiques en relation avec l'adaptation à l'hôte. Ailloud Florent. 2015. Saint-Denis : Université de la Réunion, 222 p. Thèse de doctorat : Microbiologie. Phytopathologie : Université de la Réunion

Long-term genomic selection for heterosis without dominance in multiplicative traits: Case study of bunch production in oil palm. Cros David, Denis Marie, Bouvet Jean-Marc, Sanchez Leopoldo. 2015. BMC Genomics, 16 (651), 16 p.

Mapping genetic determinants of viral traits with FST and quantitative trait locus (QTL) approaches. Doumayrou Juliette, Thébaud Gaël, Vuillaume Florence, Peterschmitt Michel, Urbino Cica. 2015. Virology, 484 : 346-353.

New multilocus variable-number tandem-repeat analysis tool for surveillance and local epidemiology of bacterial leaf blight and bacterial leaf streak of rice caused by Xanthomonas oryzae. Poulin Lucie, Grygiel Pierre, Magne Maxime, Gagnevin Lionel, Rodríguez-R Luis Miguel, Forero Serna Natalia, Zhao Shuai, El Rafil M., Dao S., Tekete C., Wonni Issa, Kolta O., Pruvost Olivier, Verdier Valérie, Vernière Christian, Koebnik Ralf. 2015. Applied and Environmental Microbiology, 81 (2) : 688-698.

OsMADS26 negatively regulates resistance to pathogens and drought tolerance in rice. Khong Ngan Giang, Pati Pratap K., Richaud Frédérique, Parizot Boris, Bidzinski Przemyslaw, Mai Chung Duc, Bes Martine, Bourrié Isabelle, Meynard Donaldo, Beeckman Tom, Selvaraj Michael Gomez, Manabu Ishitani, Genga Anna-Maria, Brugidou Christophe, Do Vinh Nang, Guiderdoni Emmanuel, Morel Jean-Benoit, Gantet Pascal. 2015. Plant Physiology, 169 (4) : 2935-2949.

Phenotypic and genetic dissection of component traits for early vigour in rice using plant growth modelling, sugar content analyses and association mapping. Rebolledo Maria Camila, Dingkuhn Michaël, Courtois Brigitte, Gibon Yves, Clément-Vidal Anne, Cruz Daniel F., Duitama Jorge, Lorieux Mathias, Luquet Delphine. 2015. Journal of Experimental Botany, 66 (18), n.spéc. Phenotyping in Plants : 5555-5566.

QueTAL: A suite of tools to classify and compare TAL effectors functionally and phylogenetically. Pérez-Quintero Alvaro L., Lamy Léo, Gordon Jonathan, Escalon Aline, Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Gagnevin Lionel. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (545), 16 p.

Sequence and polymorphism analysis of the camel (Camelus dromedarius) myostatin gene. Muzzachi S., Oulmouden A., Cherifi Y., Yahyaoui H., Zayed M.A., Burger P., Lacalandra G.M., Faye Bernard, Ciani Elena. 2015. Emirates Journal of Food and Agriculture, 27 (4) : 367-373.

Tomato chlorotic mottle Guyane virus: A novel tomato-infecting bipartite begomovirus from French Guiana. Lett Jean-Michel, De Bruyn Alexandre, Hoareau Murielle, Ouattara Alassane, Claverie Sohini, Dalmon Anne, Laplace Damien, Lefeuvre Pierre, Hostachy Bruno. 2015. Archives of Virology, 160 (11) : 2887-2890.

Visacane: An innovative quarantine tool for the exchange of pest and disease-free sugarcane germplasm. Guinet-Brial Isabelle, Girard Jean-Claude, Roumagnac Philippe, Daugrois Jean-Heinrich, Fernandez Emmanuel, Rott Philippe. 2015. International Sugar Journal : 890-896.

The decoy substrate of a pathogen effector and a pseudokinase specify pathogen-induced modified-self recognition and immunity in plants. Wang Guoxun, Roux Brice, Feng Feng, Guy Endrick, Li Lin, Li Nannan, Zhang Xiaojuan, Lautier Martine, Jardinaud Marie-Françoise, Chabannes Matthieu, Arlat Mathieu, Chen She, He Chaozu, Noel Laurent D., Zhou Jian-Min. 2015. Cell Host and Microbe, 18 (3) : 285-295.

The dynamic world of the genus Xanthomonas. Pruvost Olivier, Robene Isabelle, Escalon Aline, Leduc Alice, Gagnevin Lionel, Vernière Christian, Wang Nian, Schwartz Howard F., Gent David H., Rott Philippe, Royer Monique, Alvarez Anne M., Vowell Tomie S., Toves Peter J., White Frank F., Potnis Neha, Jones Jeffrey B.. 2015. In : Virulence mechanisms of plant pathogenic bacteria. Wang Nian (ed.), Jones Jeffrey B. (ed.), Sundin George W. (ed.), White Frank F. (ed.), Hogenhout Saskia A. (ed.), Roper Caroline (ed.), De La Fuente Leonardo (ed.), Ham Jong Hyun (ed.). Saint Paul : The American Phytopathological Society, 381-385. ISBN 978-0-89054-444-0

The promoter of the AlSAP gene from the halophyte grass Aeluropus littoralis directs a stress-inducible expression pattern in transgenic rice plants. Ben-Saad Rania, Meynard Donaldo, Ben Romdhane Walid, Mieulet Delphine, Verdeil Jean-Luc, Al-Doss Abdullah, Guiderdoni Emmanuel, Hassairi Afif. 2015. Plant Cell Reports, 34 (10) : 1791-1806.

Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. de Setta Nathalia, Monteiro-Vitorello Cláudia, Metcalfe Cushla Jane, Cruz Guilherme Marcelo Queiroga, Del Bem Luiz Eduardo, Vicentini Renato, Tebaldi Silveira Nogueira Fábio, Alvares Campos Roberta, Lima Nunes Sideny, Gasperazzo Turrini Paula Crisina, Prata Vieira Andreia, Ochoa Cruz Edgar Andrés, Silveira Corrêa Tatiana Caroline, Takeshi Hotta Carlos, de Mello Varani Alessandro, Vautrin Sonia, Silva da Trindade Adilson, de Mendonça Vilela Marianne, Gimiliani Lembke Carolina, Mieko Sato Paloma, Fandino de Andrade Rodrigo, Yutaka Nishiyama Milton, Cardoso-Silva Claudio Benicio, Castanho Scortecci Katia, Garcia Antonio Augusto Franco, Sampaio Carneiro Monalisa, Kim Changsoo, Paterson Andrew H., Berges Hélène, D'Hont Angélique, Pereira de Souza Anete, Mendes Souza Glaucia, Vincentz Michel, Kitajima João Paulo, Van Sluys Marie-Anne. 2014. BMC Genomics, 15 (540), 18 p.

Caractérisation des différences de structures chromosomiques dans l'espèce Musa acuminata par re-séquençage ; le cas de l'accession Pahang. Martin Guillaume. 2014. Montpellier : Montpellier SupAgro, 299 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Cost-effective enrichment hybridization capture of chloroplast genomes at deep multiplexing levels for population genetics and phylogeography studies. Mariac Cédric, Scarcelli Nora, Pouzadou Juliette, Barnaud Adeline, Billot Claire, Faye Adama, Kougbeadjo Ayite, Maillol Vincent, Martin Guillaume, Sabot François, Santoni Sylvain, Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. 2014. Molecular Ecology Resources, 14 (6) : 1103-1113.

Development and characterization of a new set of 164 polymorphic EST-SSR markers for diversity and breeding studies in rubber tree (Hevea brasiliensis Müll. Arg.). Cubry Philippe, Pujade-Renaud Valérie, Garcia Dominique, Espeout Sandra, Le Guen Vincent, Granet Françoise, Seguin Marc. 2014. Plant Breeding, 133 (3) : 419-426.

Distribution and differentiation of wild, feral, and cultivated populations of perennial upland cotton (Gossypium hirsutum L.) in mesoamerica and the Caribbean. Coppens D'Eeckenbrugge Géo, Lacape Jean-Marc. 2014. PloS One, 9 (9):e107458, 19 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas axonopodis pv. allii strain CFBP 6369. Gagnevin Lionel, Bolot Stéphanie, Gordon Jonathan, Pruvost Olivier, Vernière Christian, Robène Isabelle, Arlat Mathieu, Noel Laurent D., Carrère Sébastien, Jacques Marie Agnès, Koebnik Ralf. 2014. Genome Announcements, 2 (4):e00727, 2 p.

Ecologie, diversité, et découverte de phytovirus à l'échelle de deux agro-écosystèmes dans un cadre spatio-temporel à l'aide de la géo-métagénomique. Bernardo Pauline. 2014. Montpellier : UM2, 278 p. Thèse de doctorat : Microbiologie parasitologie : Université Montpellier 2

Etude des facteurs contrôlant l'efficacité de la sélection génomique chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.). Cros David. 2014. Montpellier : Montpellier SupAgro, 204 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes (BIP) : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Inducible expression of a fusion gene encoding two proteinase inhibitors leads to insect and pathogen resistance in transgenic rice. Quilis Jordi, López-García Belén, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, San Segundo Blanca. 2014. Plant Biotechnology Journal, 12 (3) : 367-377.

Lipid transfer proteins in coffee: isolation of Coffea orthologs, Coffea arabica homeologs, expression during coffee fruit development and promoter analysis in transgenic tobacco plants. Cotta Michelle G., Barros Leila M.G., De Almeida Juliana D., De Lamotte Frédéric, Barbosa Eder A., Vieira Natalia Gomes, Alves Gabriel Sergio Costa, Vinecky Felipe, Andrade Alan Carvalho, Marraccini Pierre. 2014. Plant Molecular Biology, 85 (1-2) : 11-31.

A MLVA genotyping scheme for global surveillance of the citrus pathogen Xanthomonas citri pv. citri suggests a worldwide geographical expansion of a single genetic lineage. Pruvost Olivier, Magne Maxime, Boyer Karine, Leduc Alice, Tourterel Christophe, Drevet Christine, Ravigné Virginie, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Chiroleu Frédéric, Koebnik Ralf, Verdier Valérie, Vernière Christian. 2014. PloS One, 9 (6):e98129, 11 p.

Phylogenetic reconstruction methods: An overview. De Bruyn Alexandre, Martin Darren Patrick, Lefeuvre Pierre. 2014. In : Molecular Plant Taxonomy. by Pascale Besse (ed.). New York : Humana Press, 257-277. (Mehtods in Molecular Biology, 1115) ISBN 978-1-62703-766-2

Prospecting sugarcane resistance to Sugarcane yellow leaf virus by genome-wide association. Débibakas Sarah, Rocher Solen, Garsmeur Olivier, Toubi Lyonel, Roques Danièle, D'Hont Angélique, Hoarau Jean-Yves, Daugrois Jean-Heinrich. 2014. Theoretical and Applied Genetics, 127 (8) : 1719-1732.

Resolving the polyphyletic nature of Pyricularia (Pyriculariaceae). Klaubauf S., Tharreau Didier, Fournier Elisabeth, Crous Pedro W., De Vries Ronald P., Lebrun Marc-Henri. 2014. Studies in Mycology, 79 : 85-120.

Sequence variation and recognition specificity of the avirulence gene AvrPiz-T in Magnaporthe Oryzae field populations. Chen Chenx, Chen Meilian, Hu Jinnan, Zhang Wenjing, Zhong Zhenhui, Jia Yulin, Allaux Ludovic, Fournier Elisabeth, Tharreau Didier, Wang Guo-Liang, Wang Zonghua, Shen Wei-Chiang, Lu Guodong, Wang Baohua, Mitchell Thomas K.. 2014. Fungal Genomics and Biology, 4 (1), 8 p.

Sequencing of diverse mandarin, pummelo and orange genomes reveals complex history of admixture during citrus domestication. Wu Guohong Albert, Prochnik Simon, Jenkins Jerry, Salse Jérôme, Hellsten Uffe, Murat Florent, Perrier Xavier, Ruiz Manuel, Scalabrin Simone, Terol Javier F., Takita Marco Aurélio, Labadie Karine, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Jabbari Kamel, Cattonaro Frederica, Del Fabbro Cristian, Pinosio Sara, Zuccolo Andrea, Chapman Jarrod, Grimwood Jane, Tadeo Francisco, Estornell Leandro H., Muñoz-Sanz Juan V., Ibáñez Victoria, Herrero-Ortega Amparo, Aleza Pablo, Pérez-Pérez Júlian, Ramón Daniel, Brunel Dominique, Luro François, Chen Chunxian, Farmerie William G., Desany Brian, Kodira Chinnappa, Mohiuddin Mohammed, Harkins Tim, Fredrikson Karin, Burns Paul, Lomsadze Alexandre, Borodovsky Mark, Reforgiato Giuseppe, Freitas-Astúa Juliana, Quetier Francis, Navarro Luis, Roose Mikeal L., Wincker Patrick, Schmutz Jeremy, Morgante Michele, Machado Marcos Antonio, Talon Manuel, Ollitrault Patrick, Gmitter Frederick G. Jr., Rokhsar Daniel S.. 2014. Nature Biotechnology, 32 : 656-662.

The genome of African yam (Dioscorea cayenensis-rotundata complex) hosts endogenous sequences from four distinct badnavirus species. Umber Marie, Filloux Denis, Muller Emmanuelle, Laboureau Nathalie, Galzi Serge, Roumagnac Philippe, Iskra Caruana Marie-Line, Pavis Claudie, Teycheney Pierre-Yves, Seal Susan. 2014. Molecular Plant Pathology, 15 (8) : 790-801.

The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish. Brawand David, Wagner Catherine E., Li Yang I., Malinsky Milan, Keller Irène, Fan Shaohua, Simakov Oleg, Ng Alvin Y., Lim Zhi Wei, Bezault Etienne, Turner-Maier Jason, Johnson Jeremy, Alcazar Rosa, Noh Hyun Ji, Russell Pamela, Aken Bronwen, Alföldi Jessica, Amemiya Chris, Azzouzi Naoual, Baroiller Jean-François, Barloy-Hubler Frédérique, Berlin Aaron, Bloomquist Ryan, Carleton Karen L., Conte Matthew A., D'Cotta Helena, Eshel Orly, Gaffney Leslie, Galibert Francis, Gante Hugo F., Gnerre Sante, Greuter Lucie, Guyon Richard, Haddad Nathalie S., Haerty Wilfried, Harris Rayna M., Hofmann Hans A., Hourlier Thibaut, Hulata Gideon, Jaffe David B., Lara Marcia, Lee Alison P., MacCallum Iain, Mwaiko Salome, Nikaido Masato, Nishihara Hidenori, Ozouf-Costaz Catherine, Penman David J., Przybylski Darius, Rakotomanga Michelle, Renn Suzy C. P., Ribeiro Filipe J., Ron Micha, Salzburger Walter, Sanchez-Pulido Luis, Santos Emilia, Searle Steve, Sharpe Ted, Swofford Ross, Tan Frederick J., Williams Louise, Young Sarah, Yin Shuangye, Okada Norihiro, Kocher Thomas D., Miska Eric A., Lander Eric S., Venkatesh Byrappa, Fernald Russell D., Meyer Axel, Ponting Chris P., Streelman J. Todd, Lindblad-Toh Kerstin, Seehausen Ole, Di Palma Frederica. 2014. Nature, 513 (7518) : 375-381.

An integrative approach to species discrimination in the Eupelmus urozonus complex (Hymenoptera, Eupelmidae), with the description of 11 new species from the Western Palaearctic. Al Khatib Fadel, Fusu Lucian, Cruaud Astrid, Borowiec Nicolas, Rasplus Jean-Yves, Ris Nicolas, Delvare Gérard. 2014. Systematic Entomology, 39 (4) : 806-862.

The pathogenesis-related protein PR-4b from Theobroma cacao presents RNase activity, Ca2+ and Mg2+ dependent-DNase activity and antifungal action on Moniliophthora perniciosa. Menezes Sara Pereira, De Andrade Silva Edson Mario, Lima Eline Matos, Oliveira de Sousa Aurizângela, Andrade Bruno Silva, Santos Lima Livia, Gramacho Karina Peres, Da Silva Gesteira Abelmon, Priminho Pirovani Carlos, Micheli Fabienne. 2014. BMC Plant Biology, 14 (161), 21 p.

Analysis of the expression of the AGL17-like clade of MADS-box transcription factors in rice. Puig Jérôme, Meynard Donaldo, Khong Ngan Giang, Pauluzzi Germain, Guiderdoni Emmanuel, Gantet Pascal. 2013. Gene Expression Patterns, 13 (5-6) : 160-170.

Applications de la transgenèse à l'amélioration variétale du riz. Meynard Donaldo, Mieulet Delphine, Ben Saad Rania, Breitler Jean-Christophe, Petit Julie, Gantet Pascal, Hassairi Afif, Guiderdoni Emmanuel. 2013. Cahiers Agricultures, 22 (5) : 494-505.

BAC-end sequences analysis provides first insights into coffee (Coffea canephora P.) genome composition and evolution. Dereeper Alexis, Guyot Romain, Tranchant-Dubreuil Christine, Anthony François, Argout Xavier, De Bellis Fabien, Combes Marie-Christine, Gavory Fréderick, De Kochko Alexandre, Kudrna Dave, Leroy Thierry, Poulain Julie, Rondeau Myriam, Song Xiang, Wing Rod A., Lashermes Philippe. 2013. Plant Molecular Biology, 83 (3) : 177-189.

Caractérisation des gènes AP2/ERF impliqués dans le développement chez Hevea brasiliensis. Piyatrakul Piyanuch. 2013. Montpellier : Montpellier SupAgro, 134 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement. Biologie intégrative des plantes : Montpellier SupAgro Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques

Characterization and comparison of microsatellite markers derived from genomic and expressed libraries for the desert locust. Blondin Laurence, Badisco L., Pagès Christine, Foucart Antoine, Risterucci Ange-Marie, Bazelet Corinna S., Vanden Broeck Jozef, Song H., Ould Ely Sidi, Chapuis Marie-Pierre. 2013. Journal of Applied Entomology, 137 (9) : 673-683.

Efficiency of genomic selection with models including dominance effect in the context of Eucalyptus breeding. Denis Marie, Bouvet Jean-Marc. 2013. Tree Genetics and Genomes, 9 (1) : 37-51.

Evidence for novel hepaciviruses in rodents. Drexler Jan Felix, Corman Victor Max, Müller Marcel Alexander, Lukashev Alexander N., Gmyl Anatoly, Coutard Bruno, Adam Alexander, Ritz Daniel, Leijten Lonneke M., Van Riel Debby, Kallies Rene, Klose Stefan M., Gloza-Rausch Florian, Binger Tabea, Annan Augustina, Adu-Sarkodie Yaw, Oppong Samuel, Bourgarel Mathieu, Rupp Daniel, Hoffmann Bernd, Schlegel Mathias, Kümmerer Beate M., Krüger Detlev H., Schmidt-chanasit Jonas, Aguilar Setién Alvaro, Cottontail Veronika M., Hemachudha Thiravat, Wacharapluesadee Supaporn, Osterrieder Klaus, Bartenschlager Ralf, Matthee Sonja, Beer Martin, Kuilen Thijs, Reusken Chantal, Leroy Eric M., Ulrich Rainer G., Drosten Christian. 2013. PLoS Pathogens, 9 (6):e1003438, 17 p.

Evolution et spécialisation du pouvoir pathogène de Xanthomonas citri pv. citri : rôle des effecteurs de type 3. Escalon Aline. 2013. Saint-Denis : Université de la Réunion, 258 p. Thèse de doctorat : Sciences : Université de la Réunion

Experimental assessment of the accuracy of genomic selection in sugarcane. Gouy Matthieu, Rousselle Yves, Bastianelli Denis, Lecomte Philippe, Bonnal Laurent, Roques Danièle, Efile Jean-Claude, Rocher Solen, Daugrois Jean-Heinrich, Toubi Lyonel, Nabeneza Serge, Hervouet Catherine, Telismart Hugues, Denis Marie, Thong-Chane Audrey, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, Nibouche Samuel, Costet Laurent. 2013. Theoretical and Applied Genetics, 126 (10) : 2575-2586.

Genetic data provide evidence for wind-mediated transmission of highly pathogenic avian influenza. Ypma Rolf J.F., Jonges Marcel, Bataille Arnaud, Stegeman Arjan, Koch Guus, Van Boven Michiel, Koopmans Marion, Van Ballegooijen W. Marijn, Wallinga Jacco. 2013. Journal of Infectious Diseases, 207 (5) : 730-735.

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Boureau Tristan, Arrieta-Ortiz Mario L., Bonneau Sophie, Briand Martial, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Serres-Giardi Laurana, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2013. BMC Genomics, 14 (761), 30 p.

Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain CIO151. Arrieta-Ortiz Mario L., Rodríguez-R Luis Miguel, Pérez-Quintero Alvaro L., Poulin Lucie, Díaz Ana C., Arias Rojas Nathalia, Trujillo Cesar, Restrepo Benavides Mariana, Bart Rebecca, Boch Jen, Boureau Tristan, Darrasse Armelle, David Perrine, Dugé de Bernonville Thomas, Fontanilla Paula, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Lefeuvre Pierre, Medina Cesar, Medina Edgar, Montenegro Nathaly, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Ortiz Quiñoes Juan F., Osorio Daniela, Pardo Carolina, Patil Prabhu B., Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Ryan Robert P., Tabima Javier, Urrego Morales Osacar G., Vernière Christian, Carrère Sébastien, Verdier Valérie, Szurek Boris, Restrepo Silvia, López Camilo, Koebnik Ralf, Bernal Adriana Jimena. 2013. PloS One, 8 (11):e79704, 18 p.

High-Quality Draft Genome Sequences of Two Xanthomonas citri pv. malvacearum Strains. Cunnac Sébastien, Bolot Stéphanie, Forero Serna Natalia, Ortiz Erika, Szurek Boris, Noel Laurent D., Arlat Mathieu, Jacques Marie Agnès, Gagnevin Lionel, Carrère Sébastien, Nicole Michel, Koebnik Ralf. 2013. Genome Announcements, 1 (4):e00674, 2 p.

Improvement of yield per se in sugarcane. Gouy Matthieu, Nibouche Samuel, Hoarau Jean-Yves, Costet Laurent. 2013. In : Translational genomics for crop breeding. Abiotic stress, yield and quality. Varshney Rajeev K. (ed.), Tuberosa Roberto (ed.). Hoboken : Wiley-Blackwell, 211-237. ISBN 978-0-4709-6291-6

La transformation génétique, un outil pour l'analyse fonctionnelle du génome du riz. Mieulet Delphine, Meynard Donaldo, Sire Christelle, Petit Julie, Breitler Jean-Christophe, Perin Christophe, Diévart Anne, Divol Malgoire Fanchon, Courtois Brigitte, Verdeil Jean-Luc, Gantet Pascal, Guiderdoni Emmanuel. 2013. Cahiers Agricultures, 22 (5) : 484-493.

Mutant resources for functional analysis of the rice genome. Droc Gaëtan, An Gynheung, Wu Changyin, Hsing Yue-ie C., Hirochika Hirohiko, Pereira Andy, Sundaresan Venkatesan, Han Chang-deok, Upadhyaya Narayana, Ramachandran Srinivasan, Comai Luca, Leung Hei, Guiderdoni Emmanuel. 2013. In : Genetics and genomics of rice. Zhang Qifa (ed.), Wing Rod (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 81-115. (Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, 5) ISBN 978-1-4614-7902-4

Métagénomique virale et pathologie Une histoire récente. Bernardo Pauline, Albina Emmanuel, Eloit Marc, Roumagnac Philippe. 2013. MS - Médecine Sciences, 29 (5) : 501-508.

New rice resistance genes via targeted genome editing. Baufumé Servane, Meynard Donaldo, Reschke Maik, Solé Montserrat, Cunnac Sébastien, Szurek Boris, Guiderdoni Emmanuel, Boch Jen, Koebnik Ralf. 2013. Phytopathology, 103 (6), suppl. S2 : S2.13. APS-MSA Conference, Austin, États-Unis, 10 Août 2013/14 Août 2013.

Organisation et évolution de familles de gènes impliqués dans la maturation du fruit chez le bananier. Jourda Cyril. 2013. Montpellier : UM2, 353 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Organización de la diversidad genética de los cítricos. Garcia Lor Andrés. 2013. Valence : Universidad Politecnica de Valencia, 259 p. Tesis doctoral : Universidad Politecnica de Valencia

Physiologie de la maturation du fruit et elaboration de la qualité. Mbéguié-A-Mbéguié Didier. 2013. Toulouse : INPT, 43 p. Habilitation à diriger des recherches : Institut national polytechnique de Toulouse

Population dynamics of Glossina palpalis gambiensis symbionts, Sodalis glossinidius, and Wigglesworthia glossinidia, throughout host-fly development. Soumana Illiassou Hamidou, Berthier David, Tchicaya Bernadette, Thevenon Sophie, Njiokou Flobert, Cuny Gérard, Geiger Anne. 2013. Infection, Genetics and Evolution, 13 (1) : 41-48.

Potential shortfall of pyramided transgenic cotton for insect resistance management. Brévault Thierry, Heuberger Shannon, Zhang Min, Ellers-Kirk Christa, Ni Xinzhi, Masson Luke, Li Xianchiun, Tabashnik Bruce E., Carrière Yves. 2013. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110 (15) : 5806-5811.

Promoter analysis of the WRKY transcription factors CaWRKY1a and CaWRKY1b homoeologous genes in coffee (Coffea arabica). Petitot Anne-Sophie, Barsalobres-Cavallari Carla, Ramiro Daniel, Albuquerque Erika, Etienne Hervé, Fernandez Diana. 2013. Plant Cell Reports, 32 (8) : 1263-1276.

Reference-free population genomics from next-generation transcriptome data and the vertebrate–invertebrate gap. Gayral Philippe, Melo-Ferreira José, Glemin Sylvain, Bierne Nicolas, Carneiro Miguel, Nabholz Benoit, Lourenco Joao M., Alves Paulo, Ballenghien Marion, Faivre Nicolas, Belkhir Khalid, Cahais Vincent, Loire Etienne, Bernard Aurélien, Galtier Nicolas. 2013. PLoS Genetics, 9 (4):e1003457, 15 p.

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Riz et rizicultures, enjeux économiques, écologiques et scientifiques : [Editorial]. Ahmadi Nourollah, Bouman Bas. 2013. Cahiers Agricultures, 22 (5) : 333-335.

Transcriptional activity, chromosomal distribution and expression effects of transposable elements in Coffea genomes. Lopes Fabrício R., Jjingo Daudi, Da Silva Carlos R.M., Andrade Alan Carvalho, Marraccini Pierre, Teixeira João B., Carazzolle Marcelo Falsarella, Pereira Gonçalo Amarante Guimarães, Pereira Luiz Filipe P., Vanzela André L.L., Wang Lu, Jordan King, Carareto Claudia M.A.. 2013. PloS One, 8 (11):e78931, 16 p.

Variations in genomic DNA methylation during the long-term in vitro proliferation of oil palm embryogenic suspension cultures. Rival Alain, Ilbert Pascal, Labeyrie Axel, Torres Esperanza, Doulbeau Sylvie, Personne Aline, Dussert Stéphane, Beulé Thierry, Durand-Gasselin Tristan, Tregear James, Jaligot Estelle. 2013. Plant Cell Reports, 32 (3) : 359-368.

Variétés et porte-greffes : création, description et sélection. Jacquemond Camille, Curk Franck, Froelicher Yann, Luro François. 2013. In : Les clémentiniers et autres petits agrumes. Jacquemond Camille (ed.), Curk Franck (ed.), Heuezt Marion (ed.). Versailles : Ed. Quae, 37-107. (Savoir-faire) ISBN 978-2-7592-2067-0

Xanthomonas albilineans OmpA1 appears to be functionally modular and both the OMC and C-like domains are necessary for leaf scald disease of sugarcane. Fleites Laura, Mensi Imène, Gargani Daniel, Zhang Shujian, Rott Philippe, Gabriel Dean W.. 2013. Molecular Plant-Microbe Interactions, 26 (10) : 1200-1210.

The banana genome hub. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2013. Database, 2013 (bat035), 14 p.

A nuclear phylogenetic analysis: SNPs, indels and SSRs deliver new insights into the relationships in the "true citrus fruit trees" group (Citrinae, Rutaceae) and the origin of cultivated species. Garcia-Lor Andrés, Curk Franck, Snoussi Trifa Hager, Morillon Raphaël, Ancillo Gema, Luro François, Navarro Luis, Ollitrault Patrick. 2013. Annals of Botany, 111 (1) : 1-19.

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Analysis of the Meiotic Segregation in Intergeneric Hybrids of Tilapias. Bezault Etienne, Rognon François, Clota Frédéric, Gharbi Karim, Baroiller Jean-François, Chevassus Bernard. 2012. International Journal of Evolutionary Biology, 2012 (ID 817562), 10 p.

Building a mutant resource for the study of disease resistance in rice reveals the pivotal role of several genes involved in defence. Delteil Amandine, Blein Mélisande, Faivre-Rampant Odile, Guellim Amira, Estevan Joan, Hirsch Judith, Bevitori Rosangela, Michel Corinne, Morel Jean-Benoit. 2012. Molecular Plant Pathology, 13 (1) : 72-82.

Citrus. Ollitrault Patrick, Navarro Luis. 2012. In : Fruit breeding. Badenes Marisa Luisa (ed.), Byrne David H. (ed.). New York : Springer [Etats-Unis], 623-662. (Handbook of plant breeding, 8) ISBN 978-1-4419-0762-2

Detection of Trypanosoma lewisi from wild rats in Southern China and its genetic diversity based on the ITS1 and ITS2 sequences. Tang Hai-Jun, Lan You-Gen, Wen Yan-Zi, Zhang Xi-Chen, Desquesnes Marc, Yang Ting-Bao, Hide Geoff, Lun Zhao-Rong. 2012. Infection, Genetics and Evolution, 12 (5) : 1046-1051.

Dossier de candidature au diplôme d'habilitation à diriger des recherches. Perin Christophe. 2012. Montpellier : UM2, 61 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2

Epidémiologie et contrôle durable des Begomovirus chez la tomate. Péréfarres Frédéric. 2012. Saint-Denis : Université de la Réunion, 158 p. Thèse de doctorat : Sciences : Université de la Réunion

Evaluation of the allergenicity potential of TcPR-10 protein from Theobroma cacao. Menezes Sara Pereira, Dos Santos Jane Lima, Cardoso Thyago Hermylly Santana, Pirovani Carlos Priminho, Micheli Fabienne, Noronha Fátima Soares Noronha, Alves Andréa Catão, Faria Ana Maria Caetano, Da Silva Gesteira Abelmon. 2012. PloS One, 7 (6):e37969, 12 p.

Evolutionary history of contagious bovine pleuropneumonia using next generation sequencing of mycoplasma mycoides subsp. mycoides "small colony". Dupuy Virginie, Manso-Silvan Lucia, Barbe Valérie, Thebault Patricia, Dordet-Frisoni Emilie, Citti Christine, Poumarat François, Blanchard Alain, Breton Marc, Sirand-Pugnet Pascal, Thiaucourt François. 2012. PloS One, 7 (10):e46821, 13 p.

Genomics of an ancient sex chromosome in Tilapia. W633. Baroiller Jean-François, Soler Lucile, Bocs Stéphanie, Conte Matthew A., D'Hont Angélique, Kocher Thomas D., Ozouf-Costaz Catherine, D'Cotta Helena. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San Diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 20, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2012/18 Janvier 2012.

Identification des déterminants moléculaires de la qualité du café par des approches de génomique fonctionnelle. Une revue. Joët Thierry, Pot David, Pires Ferreira Lucia, Dussert Stéphane, Marraccini Pierre. 2012. Cahiers Agricultures, 21 (2-3) : 125-133.

Intégration des données et des connaissances appliquée à la génomique des plantes tropicales et méditerranéennes. Ruiz Manuel. 2012. Montpellier : UM2, 35 p. Habilitation à diriger des recherches : Systèmes intègres en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement (SIBAGHE) : Université Montpellier 2

Isolamento e caracterização do gene CaLTP EM Coffea spp. Guitton Cotta Michelle. 2012. Lavras : UFLA, 161 p. Mémoire de master : Biotecnologia Vegetal : Universidade Federal de Lavras

Marker-free transgenic durum wheat cv. Karim expressing the AlSAP gene exhibits a high level of tolerance to salinity and dehydration stresses. Ben-Saad Rania, Ben-Ramdhan Walid, Zouari Nabil, Azaza Jalel, Mieulet Delphine, Guiderdoni Emmanuel, Ellouz Radhouane, Hassairi Afif. 2012. Molecular Breeding, 30 (1) : 521-533.

Matita, a new retroelement from peanut : Characterization and evolutionary context in the light of the Arachis A-B genome divergence. Nielen Stephan, Vidigal Bruna S., Leal-Bertioli Soraya C.M., Ratnaparkhe Milind B., Paterson Andrew H., Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Guimarães Patricia M., Bertioli David J.. 2012. Molecular Genetics and Genomics, 287 (1) : 21-38.

Microsatellites Cross-Species Amplification across Some African Cichlids. Bezault Etienne, Rognon François, Gharbi Karim, Baroiller Jean-François, Chevassus Bernard. 2012. International Journal of Evolutionary Biology, 2012 (ID 870935), 7 p.

Mutator system derivatives isolated from sugarcane genome sequence. Manetti M.E., Rossi Magdalena, Cruz Guilherme Marcelo Queiroga, Saccaro N.L., Nakabashi M., Altebarmakian V., Rodier-Goud Marguerite, Domingues Douglas S., D'Hont Angélique, Van Sluys Marie-Anne. 2012. Tropical Plant Biology, 5 (3) : 233-243.

Plant epigenetics: beyond the double helix. Rival Alain, Jaligot Estelle, Beulé Thierry. 2012. In : Proceedings of the International Symposium on genomics and genetic transformation of horticultural crops : Proceedings of the XXVIII International Horticultural Congress on Science and Horticulture for People (IHC 2010), Lisbon, Portugal, August 22-27, 20. Litz Richard E. (ed.). Louvain : ISHS [Belgique], 315-325. (Acta Horticulturae, 929) ISBN 978-90-6605-048-8 International Horticultural Congress on Science and Horticulture for People. 28, Lisbonne, Portugal, 22 Août 2010/27 Août 2010.

Quels sont les enjeux au cours de l'évolution du bananier qui ont conduit au maintien de séquences virales de Banana streak virus dans son génome ? Duroy Pierre-Olivier. 2012. Montpellier : UM2, 213 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement (SIBAGHE). Biologie intégrative des plantes : Université Montpellier 2

Role of bioinformatics as a tool. Rouard Mathieu, Carpentier Sébastien Christian, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Argout Xavier, Roux Nicolas, Ruiz Manuel. 2012. In : Genetics, genomics and breeding of bananas. Pillay Michael (ed.), Ude George (ed.), Kole Chittaranjan (ed.). Enfield : Science Publishers, 194-216. (Genetics, genomics and breeding of crop plants) ISBN 978-1-57808-788-4

Tick-borne diseases in cattle: Applications of proteomics to develop new generation vaccines. Marcelino Isabel, De Almeida André Martinho, Ventosa Miguel, Pruneau Ludovic, Meyer Damien, Martinez Dominique, Lefrançois Thierry, Vachiery Nathalie, Coelho Ana Varela. 2012. Journal of Proteomics, 75 (14) : 4232-4250.

Transcriptional response of Pseudomonas aeruginosa to a phosphate-deficient Lolium perenne rhizosphere. Zysko Agnieszka, Sanguin Hervé, Hayes Andrew, Wardleworth Leanne, Zeef Leo A. H., Sim Allan, Paterson Eric, Singh Brajesh K., Kertesz Michael A.. 2012. Plant and Soil, 359 (1-2) : 25-44.

Understanding the recent colonization history of a plant pathogenic fungus using population genetic tools and Approximate Bayesian Computation. Barrès Benoit, Carlier Jean, Seguin Marc, Fenouillet Catherine, Cilas Christian, Ravigné Virginie. 2012. Heredity, 109 : 269-279.

A high-resolution map of the Nile tilapia genome: A resource for studying cichlids and other percomorphs. Guyon Richard, Rakotomanga Michelle, Azzouzi Naoual, Coutanceau Jean-Pierre, Bonillo Céline, D'Cotta Helena, Pepey Elodie, Soler Lucile, Rodier-Goud Marguerite, D'Hont Angélique, Conte Matthieu, Van Bers Nikkie, Penman David J., Hitte Christophe, Crooijmans Richard, Kocher Thomas D., Ozouf-Costaz Catherine, Baroiller Jean-François, Galibert Francis. 2012. BMC Genomics, 13 (222), 17 p.

An in planta, Agrobacterium-mediated transient gene expression method for inducing gene silencing in rice (Oryza sativa L.) leaves. Andrieu Aurélie, Breitler Jean-Christophe, Sire Christelle, Meynard Donaldo, Gantet Pascal, Guiderdoni Emmanuel. 2012. Rice, 5 (23), 12 p.

An international reference consensus genetic map with 897 marker loci based on 11 mapping populations for tetraploid groundnut (Arachis hypogaea L.). Gautami Bhimana, Foncéka Daniel, Pandey Manish K., Moretzsohn Márcio C., Sujay Venkataswamy, Qin Hongde, Hong Yanbin, Faye Issa, Chen Xiaoping, BhanuPrakash Amindala, Shah Trushar, Gowda Makanahally V.C., Nigam Shyam N., Liang Xuanqiang, Hoisington David, Guo Baozhu, Bertioli David J., Rami Jean-François, Varshney Rajeev K.. 2012. PloS One, 7 (7):e41213, 11 p.

A reference genetic map of C. clementina hort. ex Tan.; citrus evolution inferences from comparative mapping. Ollitrault Patrick, Terol Javier F., Chen Chunxian, Federici Claire T., Lotfy Samia, Hippolyte Isabelle, Ollitrault Frédérique, Bérard Aurélie, Chauveau Aurélie, Cuenca José, Costantino Gilles, Kacar A.Yildiz, Mu Lisa, Garcia-Lor Andrés, Froelicher Yann, Aleza Pablo, Boland Anne, Billot Claire, Navarro Luis, Luro François, Roose Mikeal L., Gmitter Frederick G. Jr., Talon Manuel, Brunel Dominique. 2012. BMC Genomics, 13 (593), 20 p.

Addressing the fears of the natural rubber supply chain regarding the dissemination of genetically modified rubber trees. Montoro Pascal. 2011. In : IRRDB International Rubber Conference, 14-17 December 2011, Chiang Mai, Thailand. IRRDB. s.l. : s.n., 4 p. IRRDB International Rubber Conference, Chiang Mai, Thaïlande, 14 Décembre 2011/17 Décembre 2011.

Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation of Prunus as an alternative for gene functional analysis in hairy-roots and composite plants. Bosselut Nathalie, Van Ghelder Cyril, Claverie Michel, Voisin Roger, Onesto Jean-Paul, Rosso Marie-Noëlle, Esmenjaud Daniel. 2011. Plant Cell Reports, 30 (7) : 1313-1326.

Hétérois et variétés hybrides chez un Allotetraploïde pérenne (Coffea arabica). Bertrand Benoît. 2011. Montpellier : UM2, 73 p. Habilitation à diriger des recherches : Université Montpellier 2

Identification of microRNAs in normal and mantled oil palm fruit via 454 transcriptome sequencing (P053). Jantasuriyarat Chatchawan, Tangphatsornruang Sithichoke, Piriyapongsa Jittima, Saensuk Chatree, Vanavichit Apichart, Tranbarger Timothy John, Morcillo Fabienne, Tragoonrung Somvong. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

Invasion biologique et isolement reproducteur au sein du complexe Bemisia tabaci sur l'île de la Réunion. Thierry Magalie. 2011. Saint-Denis : s.n., 118 p. Thèse de doctorat : Biologie animale et écologie : Université de la Réunion

Isolation and characterization of microsatellite markers of an endangered tropical tree, Sideroxylon majus, and cross-species amplification in other Sapotaceae species. Dafreville Stéphanie, Payet Guillaume, Simiand Christophe, Risterucci Ange-Marie, Riviere Expédit, Lebreton Gérard, Humeau Laurence, Strasberg Dominique, Chevallier Marie-Hélène. 2011. Conservation Genetics Resources, 3 (4) : 701-704.

Leucine-Rich repeat receptor kinases are sporadically distributed in eukaryotic genomes. Dievart Anne, Gilbert Nicolas, Droc Gaëtan, Attard Agnès, Gourgues Mathieu, Guiderdoni Emmanuel, Perin Christophe. 2011. BMC Evolutionary Biology, 11 (367), 9 p.

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Plant epigenetics : Stories from beyond the double helix. Rival Alain, Jaligot Estelle, Beulé Thierry, Richaud Frédérique, Adler Sophie, Debladis Emilie, Ilbert Pascal, Finnegan Jean. 2011. In : IBC2011. XVIII International Botanical Congress, 23-30 July 2011, Melbourne, Australia. s.l. : s.n., Résumé, 97. International Botanical Congress. 18, Melbourne, Australie, 23 Juillet 2011/30 Juillet 2011.

SNiPlay: a web-based tool for detection, management and analysis of SNPs. Application to grapevine diversity projects. Dereeper Alexis, Nicolas Stéphane, Le Cunff Loïc, Bacilieri Roberto, Doligez Agnès, Péros Jean-Pierre, Ruiz Manuel, This Patrice. 2011. BMC Bioinformatics, 12 (134), 14 p.

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Analyse du transcriptome des souches virulentes et atténuées d'Ehrlichia ruminantium et application au développement de vaccin de deuxième génération. Emboule Loïc. 2010. Pointe-à-Pitre : UAG, 168 p. Thèse de doctorat : Microbiologie moléculaire : Université des Antilles et de la Guyane

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Expression and immunogenicity of the mycobacterial Ag85B/ESAT-6 antigens produced in transgenic plants by elastin-like peptide fusion strategy. Floss Doreen Manuela, Mockey Michael, Zanello Galliano, Brosson Damien, Diogon Marie, Frutos Roger, Bruel Timothée, Rodrigues Valérie, Garzon Edwin, Chevaleyre Claire, Berri Mustapha, Salmon Henri, Conrad Udo, Dedieu Laurence. 2010. Journal of Biomedicine and Biotechnology (ID 274346), 14 p.

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Improved drought and salt stress tolerance in transgenic tobacco overexpressing a novel A20/AN1 zinc-finger "AlSAP" gene isolated from the halophyte grass Aeluropus littoralis. Ben Saad Rania, Zouari Nabil, Ben Ramdhan Walid, Azaza Jalel, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, Hassairi Afif. 2010. Plant Molecular Biology, 72 (1-2) : 171-190.

Multilocus sequence analysis of root nodule isolates from Lotus arabicus (Senegal), Lotus creticus, Argyrolobium uniflorum and Medicago sativa (Tunisia) and description of Ensifer numidicus sp. nov. and Ensifer garamanticus sp. nov. Mérabet Chahinez, Martens M., Mahdhi Mosbah, Zakhia Frédéric, Sy Abdoulaye, Le Roux Christine, Domergue Odile, Coopman R., Bekki Abdelkader, Mars Messaoud, Willems Anne, De Lajudie Philippe. 2010. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 60 (3) : 664-674.

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Tsetse flies, trypanosomes, humans and animals: what is proteomics revealing about their crosstalks? Holzmuller Philippe, Grébaut Pascal, Cuny Gérard, Biron David George. 2010. Expert Review of Proteomics, 7 (1) : 113-126.

The mariner Mos1 transposase produced in tobacco is active in vitro. Thomas Xavier, Hedhili Sabah, Beuf Laurent, Demattéi Marie-Véronique, Laparra Hélène, Khong Ngan Giang, Breitler Jean-Christophe, Montandon Frédéric, Carnus Elodie, Norre Frédéric, Burtin Daniel, Gantet Pascal, Bigot Yves, Renault Sylvaine. 2010. Genetica, 138 (5) : 519-530.

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Construction of a genetic linkage map of the banana fungal pathogen, Mycosphaerella fijiensis, causal agent of Black Sigatoka disease. James Andrew C., Manzo-Sanchez Gilberto, Carlier Jean, Zapater Marie-Françoise, Luna-Martinez Francisco, Conde-Ferraez Laura, Simpson June. 2008. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIth Conference, San Diego, CA (USA), January 12-16, 2008. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 16, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2008/16 Janvier 2008.

Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana). Piffanelli Pietro, Vilarinhos Alberto Duarte, Safar Jan, Sabau Xavier, Dolezel Jaroslav. 2008. Fruits, 63 (6) : 375-379.

Deciphering transcriptional networks that govern Coffea arabica seed development using combined cDNA array and real-time RT-PCR approaches. Salmona Jordi, Dussert Stéphane, Descroix Frédéric, De Kochko Alexandre, Bertrand Benoît, Joët Thierry. 2008. Plant Molecular Biology, 66 (1-2) : 105-124.

Development of genomic resources for Citrus clementina : Characterization of three deep-coverage BAC libraries and analysis of 46,000 BAC end sequences. Terol Javier F., Naranjo Miguel Angel, Ollitrault Patrick, Talon Manuel. 2008. BMC Genomics, 9 (423), 12 p.

Differential strain-specific diagnosis of the heartwater agent: Ehrlichia ruminantium. Vachiery Nathalie, Maganga Gaël Darren, Lefrançois Thierry, Kandassamy Yane, Stachurski Frédéric, Adakal Hassane, Ferraz Conchita, Morgat Anne, Bensaïd Albert, Coissac Eric, Boyer Frédéric, Demaille Jacques, Viari Alain, Martinez Dominique, Frutos Roger. 2008. Infection, Genetics and Evolution, 8 (4) : 459-466. International Congress on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases. 8, Bangkok, Thaïlande, 30 Octobre 2006/2 Novembre 2006.

ESKIMO1 is a gene involved in water economy as well as cold acclimatation and salt tolerance. Bouchabke-Coussa Oumaya, Quashie Marie-Luce, Seoane-Redondo Jose, Fortabat Marie-Noelle, Gery Carine, Yu Agnès, Linderme Daphné, Trouverie Jacques, Granier Fabienne, Téoulé Evelyne, Durand-Tardif Mylène. 2008. BMC Plant Biology, 8 (125), 35 p.

Emergence and potential of high-throughput and integrative approaches in pathology tackling the adaptive evolution of pathogens. Frutos Roger, Viari Alain, Vachiery Nathalie, Boyer Frédéric, Lefrançois Thierry, Martinez Dominique. 2008. Annals of the New York Academy of Sciences, 1149 : 62-65. Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine. 9, Mexico, Mexique, 17 Juin 2007/22 Juin 2007.

Evolution des pararétrovirus endogènes de plantes : le cas des séquences intégrées du Banana streak virus chez le bananier (Musa sp.). Gayral Philippe. 2008. Montpellier : UM2, 250 p. Thèse de doctorat : Biologie de l'évolution et écologie : Université Montpellier 2

Genetical genomics dissection of cotton fiber quality. Lacape Jean-Marc, Jacobs John, Llewellyn Danny. 2008. In : International Cotton Genome Initiative Research Conference (ICGI 2008), Anyang, Chine, July 8-11, 2008. s.l. : s.n., Résumé, 30. (Cotton science, 20) International Cotton Genome Initiative Research Conference, Anyang, Chine, 8 Juillet 2008/11 Juillet 2008.

GreenPhylDB : a database for plant comparative genomics. Conte Matthieu, Gaillard Sylvain, Lanau Nadège, Rouard Mathieu, Perin Christophe. 2008. Nucleic Acids Research, 36, D991-D998

Identification of precursor transcripts for 6 novel miRNAs expands the diversity on the genomic organisation and expression of miRNA genes in rice. Lacombe Séverine, Nagasaki Hiroshi, Santi Carole, Duval David, Piegu Benoît, Bangratz Martine, Breitler Jean-Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Brugidou Christophe, Hirsch Judith, Cao Xiaofeng, Brice Claire, Panaud Olivier, Karlowski Wojciech M., Sato Yutaka, Echeverria Manuel. 2008. BMC Plant Biology, 8 (123), 19 p.

La canne aux multiples ressources ! Hébert Anne (ed.), Goebel François-Régis (ed.), Domaingue Robert (ed.), Lebourgeois Valentine (ed.), Fovet-Rabot Cécile (collab.), Bégué Agnès (collab.), Chabalier Pierre (collab.), Chopart Jean-Louis (collab.), Dagallier Jean-Cyril (collab.), Della Mussia Sophie (collab.), D'Hont Angélique (collab.), Girard Jean-Claude (collab.), Langellier-Bellevue Pierre (collab.), Lejars Caroline (collab.), Marnotte Pascal (collab.), Martiné Jean-François (collab.), Marion Daniel (collab.), Mendez Del Villar Patricio (collab.), Oriol Philippe (collab.), Poser Christophe (collab.), Pirot Roland (collab.), Rott Philippe (collab.), Rouzière André (collab.), Todoroff Pierre (collab.), Vercambre Bernard (collab.), Volper Serge (collab.), Leveneur Carole (collab.), Magdeleine Georges (collab.), Neisson Vernant Claudine (collab.). 2008. Montpellier : CIRAD, 15 p. Salon International de l'Agriculture. 45, Paris, France, 23 Février 2008/2 Mars 2008.

Ligation-mediated PCR, a fast and reliable technique for insertion sequence-based typing of Xanthomonas citri pv. citri. Bui Thi Ngoc Lan, Vernière Christian, Belasque José, Vital Karine, Boutry Sébastien, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2008. FEMS Microbiology Letters, 288 (1) : 33-39.

Major results and research challenges in cotton molecular genetics at Cirad (France). Lacape Jean-Marc, Claverie Michel, Dessauw Dominique, Giband Marc, Viot Christopher. 2008. In : International Cotton Genome Initiative Research Conference (ICGI 2008), Anyang, Chine, July 8-11, 2008. s.l. : s.n., Résumé, 16. (Cotton science, 20) International Cotton Genome Initiative Research Conference, Anyang, Chine, 8 Juillet 2008/11 Juillet 2008.

Oryza Tag Line, a phenotypic mutant database for the genoplante rice insertion line library. Larmande Pierre, Gay Céline, Lorieux Mathias, Perin Christophe, Bouniol Matthieu, Droc Gaëtan, Sallaud Christophe, Perez Pascual, Barnola Isabelle, Biderre-Petit Corinne, Martin Jérôme, Morel Jean-Benoit, Johnson Alexander A.T., Bourgis Fabienne, Ghesquière Alain, Ruiz Manuel, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : 1022-1027.

Pathogeno-proteomics: Toward a new approach of host-vector-pathogen interactions. Holzmuller Philippe, Grébaut Pascal, Brizard Jean-Paul, Berthier David, Chantal Isabelle, Bossard Géraldine, Bucheton Bruno, Vezilier Frédéric, Chuchana Paul, Bras-Gonçalves Rachel, Lemesre Jean-Loup, Vicendeau Philippe, Cuny Gérard, Frutos Roger, Biron David George. 2008. Annals of the New York Academy of Sciences, 1149 : 66-70. Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine. 9, Mexico, Mexique, 17 Juin 2007/22 Juin 2007.

Pharmaceutical proteins in plants: A strategic genetic engineering approach for the production of tuberculosis antigens. Frutos Roger, Denise Hubert, Vivares Christian, Neuhaus Jean-Marc, Vitale Sandro, Pedrazzini Emmanuela, Ma Julian, Dix Phil, Gray John, Pezzotti Mario, Conrad Udo, Robinson David. 2008. Annals of the New York Academy of Sciences, 1149 : 275-280. Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine. 9, Mexico, Mexique, 17 Juin 2007/22 Juin 2007.

Phylogenomics of plant genomes : A methodology for genome-wide searches for orthologs in plants. Conte Matthieu, Gaillard Sylvain, Droc Gaëtan, Perin Christophe. 2008. BMC Genomics, 9 (183), 16 p.

Que nous raconte l'analyse des structures génétiques sur la dispersion des champignons phytopathogènes ? Halkett Fabien, Carlier Jean, Dutech Cyril. 2008. In : Journées Jean Chevaugeon, VIIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie, du 20 au 24 janvier 2008 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.). CIRAD, INRA, CNRS, SFP, Bayer cropscience. Montpellier : CIRAD, Résumé, 48. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 7, Aussois, France, 20 Janvier 2008/24 Janvier 2008.

Recent lethal yellowing outbreak: Why is the Malayan Yellow Dwarf Coconut no longer resistant in Jamaica? Lebrun Patricia, Baudouin Luc, Myrie Wayne, Berger Angélique, Dollet Michel. 2008. Tree Genetics and Genomes, 4 (1) : 125-131.

Structure and distribution of a strain-biased tandem repeat element in fall armyworm (Lepidoptera: Noctuidae) populations in Florida, Texas, and Brazil. Nagoshi Rodney N., Armstrong John Scott, Silvie Pierre, Meagher Robert L.. 2008. Annals of the Entomological Society of America, 101 (6) : 1112-1120.

Structure and sequence motifs of siRNA linked with in vitro down-regulation of morbillivirus gene expression. Servan de Almeida Renata, Keita Djénéba, Libeau Geneviève, Albina Emmanuel. 2008. Antiviral Research, 79 (1) : 37-48.

Towards the understanding of the cocoa transcriptome: Production and analysis of an exhaustive dataset of ESTs of Theobroma cacao L. generated from various tissues and under various conditions. Argout Xavier, Fouet Olivier, Wincker Patrick, Gramacho Karina Peres, Legavre Thierry, Sabau Xavier, Risterucci Ange-Marie, Da Silva Corinne, Cascardo Julio Cezar M., Allègre Mathilde, Kuhn David N., Verica Joseph, Courtois Brigitte, Loor Rey Gaston, Babin Régis, Sounigo Olivier, Ducamp Michel, Guiltinan Mark J., Ruiz Manuel, Alemanno Laurence, Machado Regina, Phillips Wilbert, Schnell Raymond J., Gilmour Martin, Rosenquist Eric, Butler David R., Maximova Siela N., Lanaud Claire. 2008. BMC Genomics, 9 (512), 19 p.

Transferability of the EST-SSRs developed on Nules clementine (Citrus clementina Hort ex Tan) to other Citrus species and their effectiveness for genetic mapping. Luro François, Costantino Gilles, Terol Javier F., Argout Xavier, Allario Thierry, Wincker Patrick, Talon Manuel, Ollitrault Patrick, Morillon Raphaël. 2008. BMC Genomics, 9 (287) : 1-13.

Using of molecular tools in a non-invasive approach for population genetic analysis in wild bovids of Vietnam. Pham Doan Lan, Le Quang Nam, Riviere Taiana, Pedrono Miguel, Ha Minh Tuan, Vu Chi Cuong, Michaux Johan, Maillard Jean-Charles. 2008. Genetics and Applications (Spec.) : 69. International Conference on Reproductive Biotechnologies for conservation of Biodiversity and Sustainable Development, Hanoi, Viet Nam, 17 Décembre 2007/18 Décembre 2007.

The generation challenge programme comparative plant stress-responsive gene catalogue. Wanchana Samart, Thongjuea Supat, Jun Ulat Victor, Anacleto Mylah, Mauleon Ramil P., Conte Matthieu, Rouard Mathieu, Ruiz Manuel, Krishnamurthy Nandini, Sjolander Kimmen, Van Hintum Theo, Bruskiewich Richard. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : 943-946.

A novel cloning strategy for isolating, genotyping and phenotyping genetic variants of geminiviruses. Urbino Cica, Thébaud Gaël, Granier Martine, Blanc Stéphane, Peterschmitt Michel. 2008. Virology Journal, 5 (135), 10 p.

The rice defensome database: Centralizing and unifying R-genes, resistance QTL mapping and defence gene expression for rice blast. Ballini Elsa, Vergne Emilie, Droc Gaëtan, Courtois Brigitte, Price Adam H., Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier, Morel Jean-Benoit. 2008. In : Journées Jean Chevaugeon, VIIe rencontres de phytopathologie - mycologie de la Societé française de phytopathologie, du 20 au 24 janvier 2008 [Résumés]. Fernandez Diana (ed.), Carlier Jean (ed.). CIRAD, INRA, CNRS, SFP, Bayer cropscience. Montpellier : CIRAD, 109. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 7, Aussois, France, 20 Janvier 2008/24 Janvier 2008.

Caractérisation des translocations dans le génome de la banane par cytogénétique moléculaire. Bakry Frédéric, D'Hont Angélique. 2007. In : La plate-forme de recherches avancées Agropolis : génomique et biotechnologie = Agropolis advanced research platform. Genomics & Biotechnology. Savidan Yves (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis, 23-27. (Les dossiers d'Agropolis International, 5)

Caractérisation, au cours de croisement génétiques, de l'expression de séquences pathogènes du Banana streak virus intégrées dans le génome du bananier. Le Provost Grégoire, Lheureux Fabrice, Dielen Anne Sophie, Laboureau Nathalie, Teycheney Pierre-Yves, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 Janvier 2007/1 Février 2007.

Characterisation of recombinant Hevea brasiliensis allene oxide synthase : effects of cycloxygenase inhibitors, lipoxygenase inhibitors and salicylates on enzyme activity. Norton Gareth J., Pappusamy Arokiaraj, Yusof Faridah, Pujade-Renaud Valérie, Perkins Mark, Griffiths David, Jones Heddwyn. 2007. Plant Physiology and Biochemistry, 45 : 129-138.

Characterization of the expression of pathogenic Banana streak virus sequences integrated in the genome of banana during genetic crosses. Le Provost Grégoire, Lheureux Fabrice, Dielen Anne Sophie, Laboureau Nathalie, Teycheney Pierre-Yves, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : First ISHS : ProMusa ProMusa Symposium: Recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods, White River, South Africa, 10-14 september 2007. ISHS. Montpellier : Cirad, Résumé, 1 p. International Symposium on recent advances in banana crop protection for sustainable production and improved livelihoods. 1, White River, Afrique du Sud, 10 Septembre 2007/14 Septembre 2007.

Diversité génétique des bégomovirus responsables de la mosaïque du manioc dans les archipels des Comores et des Seychelles : évidence d'une nouvelle espèce, fruit d'une recombinaison interspécifique ancestrale. Villar Emilie, Lefeuvre Pierre, Delatte Hélène, Martin Darren Patrick, Reynaud Bernard, Lett Jean-Michel. 2007. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 Janvier 2007/1 Février 2007.

Déterminisme génétique et localisation de composantes physiologiques de la productivité de l'hévéaculture par approche QTL en Thaïlande. Clément-Demange André. 2007. In : La plate-forme de recherches avancées Agropolis : génomique et biotechnologie = Agropolis advanced research platform. Genomics & Biotechnology. Savidan Yves (ed.). Agropolis. Montpellier : Agropolis International, 14-17. (Les dossiers d'Agropolis International, 5)

Evolution of hazardous integrations of Banana streak virus in the genome of the wild banana (Musa balbisiana). Gayral Philippe, Laboureau Nathalie, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : 11th Evolutionary Biology Meeting, September 18-21, 2007, Marseilles. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Evolutionary Biology Meeting. 11, Marseille, France, 18 Septembre 2007/21 Septembre 2007.

Fréquence de mutation et production de molécules défectives chez le Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). Urbino Cica, Granier Martine, Macia Jean Luc, Froissart Rémi, Blanc Stéphane, Peterschmitt Michel. 2007. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, 84. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 Janvier 2007/1 Février 2007.

Genetic structure of domestic and natural populations of the Nile tilapia, Oreochromis niloticus in Burkina Faso, West Africa. Toguyeni Aboubacar, Thevenon Sophie, Soara E., D'Cotta Helena, Baroiller Jean-François, Rognon Xavier. 2007. Aquaculture, 272suppl.1, Résumé, S314-S315 International Symposium on Genetics in Aquaculture. 9, Montpellier, France, 26 Juin 2006/30 Juin 2006.

Genomic and molecular physiology of citrus tolerance to abiotic stresses; A strong component of the euro-mediterranean initiative CIBEWU 6th PCRD INCO MPC project on rootstock breeding for the Mediterranean Basin. Ollitrault Patrick, Talon Manuel, Lotfy Samia, Belfalah Zina, Ben Mimoun Mehdi, Yesiloglu Turgut. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.

Genomic structure and phylogeny of the plant pathogen Ralstonia solanacearum inferred from gene distribution analysis. Guidot Alice, Prior Philippe, Schoenfeld Jens, Carrère Sébastien, Genin Stéphane, Boucher Christian. 2007. Journal of Bacteriology, 189 (2) : 377-387.

Identification and sequencing of ESTs from the halophyte grass Aeluropus littoralis. Zouari Nabil, Ben Saad Rania, Legavre Thierry, Azaza Jalel, Sabau Xavier, Jaoua Mohamed, Masmoudi Khaled, Hassairi Afif. 2007. Gene, 404 : 61-69.

Large-scale characterization of Tos17 insertion sites in a rice T-DNA mutant library. Piffanelli Pietro, Droc Gaëtan, Mieulet Delphine, Lanau Nadège, Bes Martine, Bourgeois Emmanuelle, Rouvière Claire, Gavory Fréderick, Cruaud Corinne, Ghesquière Alain, Guiderdoni Emmanuel. 2007. Plant Molecular Biology, 65 (5) : 587-601.

Les bégomovirus des cultures maraîchères du Sud Ouest de l'Océan Indien : un melting-pot viral. Lefeuvre Pierre, Naze Florence, Delatte Hélène, Martin Darren Patrick, Reynaud Bernard, Lett Jean-Michel. 2007. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 Janvier 2007/1 Février 2007.

Modern elite rice varieties of the 'Green Revolution' have retained a large introgression from wild rice around the Pi33 rice blast resistance locus. Ballini Elsa, Berruyer Romain, Morel Jean-Benoit, Lebrun Marc-Henri, Nottéghem Jean-Loup, Tharreau Didier. 2007. New Phytologist, 175 (1) : 340-350.

Molecular characterization of an ethylene receptor gene (CcETR1) in coffee trees, its relationship with fruit development and caffeine content. Bustamante-Porras José, Campa Claudine, Poncet Valérie, Noirot Michel, Leroy Thierry, Hamon Serge, De Kochko Alexandre. 2007. Molecular Genetics and Genomics, 277 : 701-712.

Possible roles of endogenous plant viral sequences and transgenes containing viral sequences in both virus resistance and virus emergence. Teycheney Pierre-Yves, Tepfer Mark. 2007. Environmental Biosafety Research, 6 (4) : 219-221.

SAT, a flexible and optimized Web application for SSR marker development. Dereeper Alexis, Argout Xavier, Billot Claire, Rami Jean-François, Ruiz Manuel. 2007. BMC Bioinformatics, 8 (465), 10 p.

The Triticum aestivum non-specific lipid transfer protein (TaLtp) gene family : Comparative promoter activity of six TaLtp genes in transgenic rice. Boutrot Freddy, Meynard Donaldo, Guiderdoni Emmanuel, Joudrier Philippe, Gautier Marie-Françoise. 2007. Planta, 225 (4) : 843-862.

A class I KNOX gene from the palm species Elaeis guineensis (Arecaceae) in associated with meristem function and a distinct mode of leaf dissection. Jouannic Stefan, Collin Myriam, Vidal Benjamin, Verdeil Jean-Luc, Tregear James. 2007. New Phytologist, 174 (3) : 551-568.

The exploration of the pathosystem BSV/Musa sp. : How does it work? Gayral Philippe, Lheureux Fabrice, Noa-Carrazana Juan Carlos, Lescot Magali, Piffanelli Pietro, Carreel Françoise, Jenny Christophe, Iskra Caruana Marie-Line. 2007. In : First Biosafenet Seminar, 6-8 June 2007, Venice, Italy. ICGEB. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Biosafenet Seminar. 1, Venise, Italie, 6 Juin 2007/8 Juin 2007.

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