Noyer Jean-Louis, Billot Claire, Brottier Philippe, Quéro Garcia José, Lebot Vincent.
2004. Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers.
In : Third Taro Symposium, 21-23 May 2003, Nadi, Fiji Islands : proceedings of an international scientific meeting. Guarino Luigi (ed.), Taylor Mary B. (ed.), Osborn Tom (ed.). SPC, IPGRI
Titre français : Etude de la diversité génétique du taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) par analyse de marqueurs SSR
Résumé : Le criblage de 96 clones extraits d'une banque enrichie en marqueurs microsatellites a permis d'isoler 49 séquences contenant des motifs répétés. Quinze paires d'amorce ont été créées. Toutes ont révélé un polymorphisme (nombre d'allèles compris entre 2 et 8) dans un sous-ensemble de cinq obtentions de taro. Sept paires d'amorce ont été utilisées pour étudier la diversité génétique de 105 obtentions, et ont permis de révéler 100 allèles. Cet échantillon a été constitué pour couvrir toute la diversité génétique de Colocasia esculenta telle que décrite par des membres du Réseau de recherche sur le taro pour l'Asie du Sud-Est et l'Océanie (TANSAO) à l'aide de marqueurs AFLP. Des dendogrammes ont été réalisés grâce à la méthode NJTree (Neighbor Joining Method) fondée sur une matrice de similitude calculée selon un indice de Dice. Le niveau d'hétérosygotie a été calculé malgré la présence d'obtentions diploïdes et triploïdes. Les résultats sont décrits et commentés.
Mots-clés Agrovoc : Colocasia esculenta, variation génétique, distance génétique, marqueur génétique, microsatellite, hétérozygote, polymorphisme génétique
Mots-clés complémentaires : AFLP
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
Auteurs et affiliations
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Noyer Jean-Louis, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
ORCID: 0000-0002-7389-5621
- Billot Claire, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
- Brottier Philippe, Centre national de séquençage (FRA)
- Quéro Garcia José, CIRAD-CA-CALIM (FRA)
- Lebot Vincent, CIRAD-CA-CALIM (VUT)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/518607/)
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