A global view of genetic diversity in cultivated sorghums using a core collection

Deu Monique, Rattunde H. Frederick W., Chantereau Jacques. 2006. A global view of genetic diversity in cultivated sorghums using a core collection. Genome (Ottawa), 49 (2) : 168-180.

https://doi.org/10.1139/G05-092

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact

Version publiée - Anglais
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Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : Une analyse approfondie de la structuration de la diversité génétique des sorghos cultivés est présentée. Une core collection de 210 variétés représentatives de la diversité des races, latitudes, réponses à la durée du jour et systèmes de culture a été analysée au moyen de 74 sondes PLFR réparties sur le génome. Les analyses multivariées ont montré la spécificité des guinea margaritiferum ainsi qu'une structuration géographique et raciale de la diversité génétique. L'analyse "neighbour joining" a montré une différenciation entre variétés africaines du nord et du sud de l'équateur. La présence de variétés asiatiques dans chacun de ces grands pôles géographiques d'évolution des sorghos indique 2 introductions en Asie. La race est aussi un des facteurs impliqués dans la structuration de la diversité génétique des sorghos. Parmi les 10 groupes de variétés identifiés, 8 groupes sont constitués majoritairement d'accessions appartenant à la même race, soit 1 groupe de kafir, 1 de durra, 4 groupes de guinea et 2 groupes de caudatum. Les sorghos guinea, à l'exception des guinea margaritiferum, se répartissent dans trois groupes géographiques, guinea d'Afrique de l'ouest, d'Afrique Australe et d'Asie, les 2 derniers étant les plus proches génétiquement. Les caudatum sont principalement répartis dans 2 groupes, le groupe des variétés originaires de la région des grands lacs d'Afrique et celui constitué par les autres caudatum africains. Cette dernière différenciation apparaît liée à des différences de comportements vis-à-vis de la photopériode. Ces résultats permettent d'optimiser le choix des variétés à utiliser dans un programme de sélection.

Mots-clés Agrovoc : Sorghum, collection de matériel génétique, variation génétique, ressource génétique, variété, RFLP, méthode statistique, carte génétique, distribution géographique, phylogénie, technique analytique