Amélioration génétique du caféier Coffea canephora Pierre : connaissances acquises, stratégies et perspectives

Montagnon Christophe, Cubry Philippe, Leroy Thierry. 2012. Amélioration génétique du caféier Coffea canephora Pierre : connaissances acquises, stratégies et perspectives. Cahiers Agricultures, 21 (2-3) : 143-153.

https://doi.org/10.1684/agr.2012.0556

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Titre anglais : Coffee Coffea canephora Pierre genetic improvement: Acquired knowledge, strategies and perspectives

Quartile : Q3, Sujet : AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY / Quartile : Q3, Sujet : AGRONOMY

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Géographie-Aménagement-Urbanisme-Architecture

Résumé : L'amélioration variétale de Coffea canephora représente un grand défi pour augmenter la productivité de cette espèce et assurer un meilleur revenu aux planteurs. Les opportunités sont nombreuses : la diversité génétique de cette espèce est bien documentée, les paramètres génétiques sont relativement bien établis pour les principaux caractères d'intérêt et les ressources génomiques disponibles s'accumulent. Toutefois, des contraintes sont également à considérer : en particulier, l'histoire spécifique de la mise en culture et de la sélection a conduit à une inégalité des sélectionneurs à travers le monde pour l'accès à l'ensemble de la diversité génétique de l'espèce. Ainsi, la sélection récurrente réciproque (SRR) qui représente une innovation majeure en termes d'utilisation raisonnée des ressources génétiques n'a pu être menée qu'en Côte d'Ivoire qui seule dispose d'un ensemble complet et référencé des ressources génétiques de base de C. canephora. Cette stratégie est adaptée à une sortie variétale sous la forme de semences hybrides, plus adaptées à une diffusion de masse que les boutures clonales. En dehors de la Côte d'Ivoire, une sélection massale clonale sur des populations en recombinaison plus ou moins bien décrites reste souvent l'axe des programmes de création variétale. Par ailleurs, le génome de C. canephora est sur le point d'être séquencé et les ressources génomiques sont maintenant suffisantes pour venir en appui des programmes de sélection. Les choix stratégiques qui permettront d'utiliser au mieux ces ressources au service de l'amélioration génétique doivent être l'objet d'une réflexion approfondie, tenant compte de l'expérience acquise pour d'autres plantes : les clés de ces choix sont discutées.

Résumé (autre langue) : Coffea canephora coffee varietal improvement stands as a huge challenge towards better productivity and hence better income for producers. Opportunities are numerous : the genetic diversity of the species is well documented, genetic parameters are well established for the main characteristics of interest and genomic resources are accumulating. However, constraints are also present: in particular, the specific history of C. canephora growing and breeding has led to an unequal access to the whole genetic diversity among breeders around the world. For instance, only Côte d'Ivoire could implement a Reciprocal Recurrent Selection (RRS) programme, representing a major innovation for the comprehensive use of genetic resources, as only this country has the whole genetic diversity available in its field collections. This RRS strategy is adapted to hybrid seed varietal release, more suitable than clonal cuttings for a massive varietal diffusion. Apart from Côte d'Ivoire, countries are often relying on clonal mass selection from recombining populations whose genetic background is not always clearly described. C. canephora genomic resources are now sufficient to support breeding programmes. The coffee genome is about to be sequenced. Strategic choices for optimal use of these resources towards better genetic gains deserve deep reflexion based on the acquired experience with other crops: key elements for these choices are discussed.

Mots-clés Agrovoc : Coffea canephora, génétique quantitative, amélioration des plantes, sélection, génétique des populations, ressource génétique végétale, variation génétique, choix des variétés, gain génétique, paramètre génétique, vigueur hybride, distribution géographique