Pour une production contrôlée d'agarwood d'Aquilaria crassna Pierre ex Lecomte en Guyane. Approches métagénomique, biochimique et histologique

Zaremski Clara. 2020. Pour une production contrôlée d'agarwood d'Aquilaria crassna Pierre ex Lecomte en Guyane. Approches métagénomique, biochimique et histologique. Kourou : Université de Guyane, 239 p. Thèse de doctorat : Biologie des organismes, biologies animales, végétales et microbiennes : Université de Guyane

Encadrement : Ducousso, Marc ; Amusant, Nadine

Résumé : Les arbres du genre Aquilaria Lam. (Thymelaeaceae), en réaction à un stress mécanique, produisent, en interactions avec des micro-organismes, un bois transformé par sa forte teneur en composés secondaires : l'agarwood (AW). Il est apprécié en parfumerie pour son odeur boisée. Face à la forte demande mondiale, des agriculteurs ont réalisé des plantations expérimentales d'Aquilaria en Guyane (projet Aquil@Guyane) afin de produire une huile essentielle de composition chimique contrôlée, respectueuse de la biologie de l'arbre et de l'environnement. Dans ce contexte, nous avons produit des connaissances académiques pour contribuer au développement de la production d'AW d'Aquilaria crassna en Guyane. Après caractérisation des communautés fongiques présentes dans les arbres d'A. crassna en Guyane, révélant le rôle des Basidiomycètes dans la production d'AW, deux méthodes d'induction d'AW ont été comparées : 1- levée d'écorce et application du sol de la plantation sur la blessure ; 2- inoculation de souches guyanaises de Basidiomycètes. Cette dernière est la plus efficace pour obtenir un AW de qualité proche d'un AW de référence. La Spectrométrie Proche Infrarouge (SPIR) a été utilisée pour différencier le bois sain de l'AW et différentes compositions chimiques d'AW. Les résultats obtenus sont cohérents avec ceux de l'analyse biochimique après hydrodistillation : utiliser la SPIR pour trier et contrôler la qualité de l'AW est envisageable. Une méthode de culture de cals d'Aquilaria a été mise au point pour comprendre les mécanismes moléculaires de la production d'AW. Les résultats indiquent une production de terpènes par les cals d'Aquilaria inoculés par des souches fongiques.

Résumé (autre langue) : Trees of the genus Aquilaria Lam. (Thymelaeaceae) in response to mechanical stress produce, in interaction with microorganisms, a wood transformed by its high content of secondary compounds: agarwood (AW). It is appreciated in perfumery for its woody fragrance. Faced with strong global demand, farmers have carried out experimental plantations of Aquilaria in French Guiana (Aquil@Guyane project) in order to produce an essential oil with a controlled chemical composition, respectful of the biology of the tree and the environment. In this context, we have produced academic knowledge to contribute to the development of AW production of Aquilaria crassna in French Guiana. After characterization of the fungal communities present in A. crassna trees in French Guiana, revealing the role of Basidiomycetes in the production of AW, two methods of induction of AW were compared: 1- lifting of bark and application of the soil of the plantation on the wound; 2- inoculation of Guyanese strains of Basidiomycetes. The latter is the most effective for obtaining a quality AW close to a reference AW. Near Infrared Spectrometry (NIRS) has been used to differentiate healthy wood from AW and different chemical compositions of AW. The results obtained are consistent with those of the biochemical analysis after hydrodistillation: using NIRS to sort and control the quality of AW is possible. An Aquilaria callus culture method has been developed to understand the molecular mechanisms of AW production. The results indicate the production of terpenes by Aquilaria callus inoculated with fungal strains.

Mots-clés Agrovoc : produit forestier, huile essentielle, composition chimique, propriété du bois, composition biochimique

Mots-clés géographiques Agrovoc : Guyane française, France

Mots-clés complémentaires : Aquilaria crassna, Métagénomique

Classification Agris : K50 - Technologie des produits forestiers

Auteurs et affiliations

• Zaremski Clara, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/600632/)

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