Epidemiology of yam viruses in Guadeloupe: Role of cropping practices and seed-tuber supply

Diouf Mame Boucar, Guyader Sébastien, Gaspard Olyvia, Francius Eric, Teycheney Pierre-Yves, Umber Marie. 2022. Epidemiology of yam viruses in Guadeloupe: Role of cropping practices and seed-tuber supply. Viruses, 14 (11), n.spéc. Plant Virus Epidemiology and Control 2022:2366, 18 p.

https://doi.org/10.3390/v14112366

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Résumé : The epidemiology of yam viruses remains largely unexplored. We present a large-scale epidemiological study of yam viruses in Guadeloupe based on the analysis of 1124 leaf samples collected from yams and weeds. We addressed the prevalence of cucumber mosaic virus (CMV), Cordyline virus 1 (CoV1), Dioscorea mosaic associated virus (DMaV), yam asymptomatic virus 1 (YaV1), yam mosaic virus (YMV), yam mild mosaic virus (YMMV), badnaviruses, macluraviruses and potexviruses, and the key epidemiological drivers of these viruses. We provide evidence that several weeds are reservoirs of YMMV and that YMMV isolates infecting weeds cluster together with those infecting yams, pointing to the role of weeds in the epidemiology of YMMV. We report the occurrence of yam chlorotic necrosis virus (YCNV) in Guadeloupe, the introduction of YMMV isolates through the importation of yam tubers, and the absence of vertical transmission of YaV1. We identified specific effects on some cropping practices, such as weed management and the use of chemical pesticides, on the occurrence of a few viruses, but no crop-related factor had a strong or general effect on the overall epidemiology of the targeted viruses. Overall, our work provides insights into the epidemiology of yam viruses that will help design more efficient control strategies.

Mots-clés Agrovoc : Dioscorea, virus, épidémiologie, surveillance, pratique culturale, mauvaise herbe, plante hôte

Mots-clés géographiques Agrovoc : Guadeloupe, France

Mots-clés libres : Dioscorea spp., Viruses, Epidemiology, Cropping practices, Viral diversity, Vertical transmission, Weeds, Réservoirs

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Agences de financement européennes : European Commission

Agences de financement hors UE : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Conseil Regional de la Guadeloupe, Conseil Général de La Réunion

Projets sur financement : (EU) Maladies infectieuses humaines, animales et végétales en milieu insulaire tropical : surveillance, diagnostic, contrôle et impact, (EU) DPP SantéBiodiv

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