Caractérisation des virus de la maladie de Newcastle (APMV-1), circulant sur les hautes terres de Madagascar

Maminiaina Olivier Fridolin. 2011. Caractérisation des virus de la maladie de Newcastle (APMV-1), circulant sur les hautes terres de Madagascar. Antananarivo : Université d'Antananarivo, 178 p. Thèse de doctorat : Sciences de la vie. Biochimie appliquée aux sciences médicales : Université d'Antananarivo

Thèse

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Encadrement : Albina, Emmanuel ; Andriantsimahavandy, Abel A.

Résumé : La maladie de Newcastle (MN) est une maladie infectieuse des volailles essentiellement les gallinacees. L'agent causal de cette maladie est une forme virulente des paramyxovirus aviaires type 1 (APMV-1). Les APMV-1 sont des virus a ARN negatif monocatenaire non segmente, dans la famille des Paramyxoviridae, genre Avulavirus. Le genome de ce virus code pour six proteines structurales dont l'ARN polymerase ARNdependant (L gene), la hemagglutinine-neuraminidase (gene de HN), la fusion (gene de F) et les proteines de matrice (gene de M), la phosphoproteine (gene de P) et la nucleoproteine (gene du NP). Avant les resultats menes dans le cadre des activites de cette etude, les APMV-1 sont classifies phylogenetiquement en deux classes (I et II). Les souches responsables des epizooties de la MN, en generale, appartiennent a la classe II qui est encore subdivise en dix genotypes differents (I a X). Actuellement, les souches dans le genotype VII sont les plus prevalentes en Asie, en Europe et en Afrique. A Madagascar, depuis la premiere description de la MN en 1946, aucune donnee phylogenetique et moleculaire sur les souches d'APMV-1 apathogene et virulente circulantes n'est disponible. Pourtant, cette maladie est l'une des majeures contraintes de l'aviculture. Au cours de cette etude, des echantillons seriques, ecouvillonnages et organes, provenant des oiseaux sauvages et des volailles domestiques de deux sites d'etude (lac alaotra et Antananarivo) de 2008 a 2010, ont ete recoltes et analyses. Des analyses biologiques d'epreuve virulente et de test de pathogenicite ont ete faites pour determiner la pathogenicite des souches isolees et aussi pour elucider les cas sporadiques de la MN dans l'elevage de poulet type commercial qui ont vaccine leurs volailles. Les resultats serologiques, virologiques, phylogenetique ainsi que moleculaires obtenu nous ont montre l'existence des souches d'APMV-1 virulentes et apathogenes appartenant a quatre genotypes I, III, VII et XI differents, circulant dans les trois compartiments et inter-compartiment des avifaunes aquatiques (compartiment I) et des volailles domestiques (compartiment II et III). Ces analyses phylogenetiques et moleculaires montrent que les souches isolees dans le genotype III, dans le compartiment I, ont derive probablement des souches vaccinales Mukteswar. Pour les cas des souches dans le genotype I, l'analyse des resultats montre l'existence des souches apathogenes co-circulant dans les trois compartiments I, II et III. Cependant, aucune souche virulente n'a ete isolee jusqu'a maintenant dans le compartiment des oiseaux sauvages (III). Cette etude a montre que les differentes souches APMV-1 virulentes, responsables des foyers de la maladie de Newcastle dans les deux sites d'etude aussi bien dans les elevages de volaille type villageoise que les cas sporadiques dans les elevages de type commercial, appartiennent a un nouveau cluster. Ces souches dans ce nouveau cluster que nous avons appele genotype XI, possedent des multiples substitutions specifiques par rapport aux autres genotypes. Parmi ces specifiques substitutions sont le site de clivage type virulente inedite forme par 5 arginines (112RRRRR?F117) et la presence de double codon d'initiation (ATGATG ?0MM1) sur la proteine de fusion (F). L'epreuve vaccinale avec les souches La Sota, Hitchner B1 et Mukteswar, realisee sur des poulets de race local (FOFIFA/DRZV - Antananarivo) avec la souche MG-1992 (IPIC=1,9 - genotype XI) et avec des poulets EOPS avec la souche MG-725/08 (IPIC=1,9 - genotype XI) par rapport a une souche de reference europeenne Herts/33 (ANSES - Ploufragan France) montrent que les poulets sont proteges contre la morbidite et mortalite mais n'ont pas contre l'excretion virale par voie oropharyngien.

Mots-clés Agrovoc : maladie de Newcastle, virus maladie de newcastle, pouvoir pathogène, vaccin, phylogénie, élevage de volailles, animal sauvage, Paramyxovirus aviaire

Mots-clés géographiques Agrovoc : Madagascar

Mots-clés géographiques complémentaires : Lac Alaotra

Classification Agris : L73 - Maladies des animaux

Champ stratégique Cirad : Axe 4 (2005-2013) - Santé animale et maladies émergentes

Auteurs et affiliations