Draft genome sequences of 284 Xanthomonas citri pv. citri strains causing Asiatic citrus canker

Richard Damien, Rieux Adrien, Lefeuvre Pierre, Hamza Abdou Azali, Lobin Kanta Kumar, Naiken Marc, Stravens Randy, Boyer Claudine, Boyer Karine, Javegny Stéphanie, Pruvost Olivier. 2021. Draft genome sequences of 284 Xanthomonas citri pv. citri strains causing Asiatic citrus canker. Microbiology Resource Announcements, 10 (1):e01024-20, 2 p.

https://doi.org/10.1128/MRA.01024-20

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Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR11234551 / Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR11234624 / Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR11234626 / Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR11234855 / Url - jeu de données - Dataverse Cirad : https://doi.org/10.18167/DVN1/TOVWWL

Résumé : High-quality Illumina assemblies were produced from 284 Xanthomonas citri pv. citri pathotype A strains mostly originating from the Southwest Indian Ocean region, a subset of which was also sequenced using MinION technology. Some strains hosted chromosomally encoded transcription activator-like effector (TALE) genes, an atypical feature for this bacterium.

Mots-clés Agrovoc : maladie des plantes, génome, Xanthomonas, chancre

Mots-clés complémentaires : Xanthomonas citri pv citri

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Agences de financement européennes : European Regional Development Fund

Agences de financement hors UE : Conseil Régional de La Réunion, Agropolis Fondation, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'Alimentation, de l'Environnement et du Travail, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement

Auteurs et affiliations