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Modeling the effect of multiple pests on ecosystem services provided by fruit crops: Application to apple. Lacroix Octave, Lescourret Françoise, Génard Michel, Memah Mohamed-Mahmoud, Vercambre Gilles, Valsesia Pierre, Bevacqua Daniele, Grechi Isabelle. 2024. Agricultural Systems, 213:103808, 15 p.
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Target enrichment sequencing coupled with GWAS identifies MdPRX10 as a candidate gene in the control of budbreak in apple. Watson Amy E., Guitton Baptiste, Soriano Alexandre, Rivallan Ronan, Vignes Hélène, Farrera Isabelle, Huettel Bruno, Arnaiz Catalina, da Silveira Falavigna Vítor, Coupel-Ledru Aude, Segura Vincent, Sarah Gautier, Dufayard Jean François, Sidibe-Bocs Stéphanie, Costes Evelyne, Andres Fernando. 2024. Frontiers in Plant Science, 15:1352757, 19 p.
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The influence of long-term storage on the epiphytic microbiome of postharvest apples and on Penicillium expansum occurrence and patulin accumulation. Al Riachy Reem, Strub Caroline, Durand Noel, Chochois Vincent, Lopez-Lauri Félicie, Fontana Angélique, Schorr-Galindo Sabine. 2024. Toxins, 16 (2), n.spéc. Toxins: 15th Anniversary:102, 28 p.
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Apple cultivation and its major challenging constraints in the Central Highlands of Madagascar. Ranaivozandriny M., Ravelomanantsoa Santatra, Rasolofoarivao Henriette, Raveloson Ravaomanarivo L. H., Delatte Hélène. 2023. Fruits, 78 (3), 13 p.
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Modelling transport of inhibiting and activating signals and their combined effects on floral induction: Application to apple tree. Belhassine Fares, Fumey Damien, Chopard Jérôme, Pradal Christophe, Martinez Sébastien, Costes Evelyne, Pallas Benoît. 2020. Scientific Reports, 10:13085, 14 p.
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MuSCA: A multi-scale source–sink carbon allocation model to explore carbon allocation in plants. An application to static apple tree structures. Reyes F., Pallas Benoît, Pradal Christophe, Vaggi Federico, Zanotelli Damiano, Tagliavini Massimo, Gianelle Damiano, Costes Evelyne. 2020. Annals of Botany, 126 (4), n.spéc. Functional-Structural Plant Growth Modelling : 571-585.
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Multi-scale high-throughput phenotyping of apple architectural and functional traits in orchard reveals genotypic variability under contrasted watering regimes. Coupel-Ledru Aude, Pallas Benoît, Delalande Magalie, Boudon Frédéric, Carrie Emma, Martinez Sébastien, Regnard Jean-Luc, Costes Evelyne. 2019. Horticulture Research, 6:52, 15 p.
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Growth and carbon balance are differently regulated by tree and shoot fruiting contexts: An integrative study on apple genotypes with contrasted bearing patterns. Pallas Benoît, Bluy Sylvie, Ngao Jérôme, Martinez Sébastien, Clément-Vidal Anne, Kelner Jean-Jacques, Costes Evelyne. 2018. Tree Physiology, 38 (9) : 1395-1408.
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Comprendre et accompagner l'évolution des stratégies de conduite des vergers dans les exploitations arboricoles. Application à la protection phytosanitaire de la pomme en France. Pissonnier Solène. 2017. Montpellier : Montpellier SupAgro, 182 p. Thèse de doctorat : Ecologie fonctionnelle et sciences agronomiques : Montpellier SupAgro
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Methodology to design agroecological orchards: Learnings from on-station and on-farm experiences. Simon Sylvaine, Lesueur Jannoyer Magalie, Plénet Daniel, Lauri Pierre-Eric, Le Bellec Fabrice. 2017. European Journal of Agronomy, 82 (Part B) : 320-330.
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Field phenotyping of water stress at tree scale by UAV-sensed imagery: New insights for thermal acquisition and calibration. Gomez-Candon David, Virlet Nicolas, Labbé Sylvain, Jolivot Audrey, Regnard Jean-Luc. 2016. Precision Agriculture, 17 (6) : 786-800.
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A new GLM framework for analysing categorical data : Application to plant structure and development. Peyhardi Jean. 2014. Montpellier : UM2, 146 p. Thèse de doctorat : Biostatistique : Université Montpellier 2
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New insights for estimating the genetic value of segregating apple progenies for irregular bearing during the first years of tree production. Durand Jean-Baptiste, Guitton Baptiste, Peyhardi Jean, Holtz Yan, Guédon Yann, Trottier Catherine, Costes Evelyne. 2013. Journal of Experimental Botany, 64 (16) : 5099-5113.
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Deciphering the ontogeny of a sympodial tree. Costes Evelyne, Guédon Yann. 2012. Trees, 26 (3) : 865-879.
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Effects of pruning on the apple tree: from tree architecture to modelling. Fumey Damien, Lauri Pierre-Eric, Guédon Yann, Godin Christophe, Costes Evelyne. 2011. In : Proceedings of the Ninth International Symposium on Integrating canopy, rootstock and environmental physiology in orchard systems, Geneva, New York, USA, August 4-8, 2008. Robinson Terence L. (ed.). ISHS. Louvain : ISHS [Belgique], 597-602. (Acta Horticulturae, 903) ISBN 978-90-6605-297-0 International Symposium on Integrating canopy, rootstock and environmental physiology in orchard systems. 9, Geneva, États-Unis, 4 Août 2008/8 Août 2008.

Cryopreservation of French plant genetic resource collections (CRYOVEG). Engelmann Florent, Balsemin Emilie, Barreneche Teresa, Chatelet Philippe, Chauvin Jean-Eric, Couturon Emmanuel, Curk Franck, Dantec Marie-Ange, Dantec Jean-Paul, Dussert Stéphane, Feugey Laurence, Froelicher Yann, Fouilhaux Lydie, Gamiette Franciane, Grapin Agnès, Grisoni Michel, Guérif Philippe, Guyarder Arnaud, Label Alain, Luro François, Moulin Bernard, Muller Martine, Peyrière André, Prigent Yvon, Renard Michel, Roux-Cuvelier Michel, Roques Danièle, Rubens Suzia, Sapotille Jocelyne, Souchet Catherine, Teyssedre David. 2009. Cryobiology, 59 (3), Résumé : 411.
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A modelling approach to explore nitrogen fertilisation practices of growers and their consequences in apple orchards. Nesme Thomas, Lescourret Françoise, Bellon Stéphane, Habib Robert. 2009. Agricultural Systems, 99 (2-3) : 76-85.
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MAppleT : simulation of apple tree development using mixed stochastic and biomechanical models. Costes Evelyne, Smith Colin, Renton Michael, Guédon Yann, Prusinkiewicz Przemyslaw, Godin Christophe. 2008. Functional Plant Biology, 35 (10) : 936-950. International Workshop on Functional-Structural Plant Models. 5, Napier, Nouvelle-Zélande, 4 Novembre 2007/9 Novembre 2007.
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Shaping the shoot: the relative contribution of cell number and cell shape to variations in internode length between parent and hybrid apple trees. Ripetti Véronique, Escoute Jacques, Verdeil Jean-Luc, Costes Evelyne. 2008. Journal of Experimental Botany, 59 (6) : 1399-1407.
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Integrating markov chain models and L-systems to simulate the architectural development of apple trees. Renton Michael, Costes Evelyne, Guédon Yann, Godin Christophe. 2006. In : Proceedings of the Seventh International Symposium on Modelling in fruit research and orchard management, Copenhagen, Denmark, June 20-24, 2004. Braun P. (ed.). ISHS. Louvain : ISHS [Belgique], 63-70. (Acta Horticulturae, 707) ISBN 90-6605-460-3 International Symposium on Modelling in Fruit Research and Orchard Management. 7, Copenhague, Danemark, 20 Juin 2004/24 Juin 2004.

Similarities and gradients in growth unit branching patterns during ontogeny in Fuji apple trees : a stochastic approach. Renton Michael, Guédon Yann, Godin Christophe, Costes Evelyne. 2006. Journal of Experimental Botany, 57 (12) : 3131-3143.
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Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden markov tree models. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2005. New Phytologist, 166 (3) : 813-825.
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Méthodes et modèles statistiques pour l'analyse de la croissance et de la structure des plantes. Guédon Yann. 2005. Montpellier : UM2, 174 p. Habilitation à diriger des recherches : Biostatistique : Université Montpellier 2

Analysis of the plant architecture via tree-structured statistical models : The hidden Markov trees. Durand Jean-Baptiste, Guédon Yann, Caraglio Yves, Costes Evelyne. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 61-64. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

Simulating the architectural development of apple trees. Renton Michael, Costes Evelyne, Guédon Yann, Godin Christophe. 2004. In : Proceedings of the 4th International workshop on functional-structural plant models (FSPM), abstracts of papers and posters, 7-11 June 2004, Montpellier, France. Godin Christophe (ed.), Hanan Jim (ed.), Kurth Winfried (ed.), Lacointe André (ed.), Takenaka Akio (ed.), Prusinkiewicz Przemyslaw (ed.), Dejong Thedore M. (ed.), Beveridge Christine (ed.). CIRAD-AMIS-UMR AMAP. Montpellier : CIRAD-AMAP, 266. International Workshop on Functional-Structural Plant Models (FSPM). 4, Montpellier, France, 7 Juin 2004/11 Juin 2004.

Resistance to biotic stress in fruit trees. Lespinasse Yves, Durel Charles Eric, Eskes Albertus, Esmenjaud D., Poëssel Jean-Luc. 2003. In : Genetics and breeding of tree fruits and nuts : a proceedings of the XXVI International Horticultural Congress, Toronto, Canada, 11-17 August, 2002. Janick Jules (ed.), Sansavini Silviero (ed.). CSHS, ISHS. Wageningen : ISHS, 303-315. (Acta Horticulturae, 622) ISBN 90-6605-189-2 International Horticultural Congress. 26, Toronto, Canada, 11 Août 2002/17 Août 2002.

Diversité génétique et structuration des populations de Venturia inaequalis dans des vergers de pommiers où le gène de résistance majeur Vf et contourné. Guérin Fabien, Devaux Martine, Gaudin Jacqueline, Le Cam Bruno. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Etude de deux sous-classes de gènes de la famille PR-10 chez le pommier : induction par des facteurs abiotiques et par l'agent de la tavelure, Venturia inaequalis. Poupard Pascal, Campion C., Parisi Luciana, Gaudin Jacqueline, Simoneau Philippe. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Etude des bases génétiques de la résistance partielle du pommier à plusieurs races de Venturia inaequalis. Calenge Fanny, Faure A., Vallet N., Joly M.P., Ruiz E., Labit H., Fouillet A., Parisi Luciana, Laurens François, Durel Charles Eric. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Influence de la résistance partielle de différents cultivars de pommiers sur le déroulement des épidémies de tavelure. Brun Laurent, Boucher Delphine, Didelot Frédérique, Parisi Luciana. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Oïdium du pommier : variabilité du pouvoir pathogène et résistance variétale Pl2. Caffier Valérie, Laurens François, Durel Charles Eric, Parisi Luciana. 2002. In : Journées Jean Chevaugeon : IVe rencontres de phytopathologie - mycologie du 13 au 17 mars 2002. [Résumés]. CIRAD-MIDEC, INRA, CNRS, SFP. Montpellier : CIRAD, Résumé, 1 p. Journées Jean Chevaugeon, Rencontres de phytopathologie-mycologie. 4, Aussois, France, 13 Mars 2002/17 Mars 2002.

Analyse et modélisation de la répartition des rameaux axillaires et des floraisons chez les arbres fruitiers. Costes Evelyne, Guédon Yann, Fournier D.. 1999. Fruits, 54 (6) : 431-440.
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Breeding for fruits. Lespinasse Yves, Bakry Frédéric. 1999. In : Proceedings of the World Conference on Horticultural Research (WCHR), Rome, Italy, 17-20 June 1998. Sansavini Silviero (ed.), Cantliffe D.J. (ed.), Corelli Grappadelli L. (ed.), Verzoni D. (ed.), Avermaete U. (ed.), Ganry Jacky (ed.), Robitaille H. (ed.), Janick Jules (ed.). ISHS, ASHS. Wageningen : ISHS, 251-271. (Acta Horticulturae, 495) ISBN 90-6605-931-1 World Conference on Horticultural Research. 1, Rome, Italie, 17 Juin 1998/20 Juin 1998.

Réflexion sur la conduite du pommier et du manguier. Eléments de recherches et d'applications. Lauri Pierre-Eric, Goguey Thierry. 1999. Fruits, 54 (5) : 359-369.
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A method for describing plant architecture which integrates topology and geometry. Godin Christophe, Costes Evelyne, Sinoquet Hervé. 1999. Annals of Botany, 84 (3) : 343-357.
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Analyse de la répartition des rameaux axillaires chez de jeunes scions de pommiers. Costes Evelyne, Guédon Yann. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 66-74. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. 11ème Colloque sur les Recherches Fruitières, Montpellier, 5 et 6 Mars 1998. INRA - FRA, CTIFL - FRA, CIRAD - FRA, ENSAM [Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier] - FRA. 1998. Montpellier : INRA, 332 p. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Breeding for fruits. Lespinasse Yves, Bakry Frédéric. 1998. In : Working group 2 : Current status of world horticultural research. I. Overview of research. II. Case studies. Ganry Jacky, Hugon Rémy. ISHS, ASHS. Wageningen : ISHS, 69-89. World Conference on Horticultural Research. 1, Rome, Italie, 17 Juin 1998/20 Juin 1998.

Exploration et analyse de l'architecture des arbres fruitiers. Godin Christophe, Guédon Yann, Costes Evelyne. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 33-45. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Hidden semi-Markov chains : a new tool for analyzing nonstationary discrete sequences. Guédon Yann. 1998. In : Proceedings of the 2nd international symposium on semi-markov models : theory and applications = [Actes du 2ème symposium international sur les semi-modèles de Markov : théorie et applications]. Janssen J. (ed.), Limnios N. (ed.). Compiègne : UTC, 1-7. International symposium on semi markov models: theory and applications. 2, Compiègne, France, 9 Décembre 1998/11 Décembre 1998.

Integrating topological and geometric information for digitizing plant architecture. Godin Christophe, Costes Evelyne, Sinoquet Hervé. 1998. Montpellier : CIRAD-AMIS, 27 p. (Documents de travail du programme modélisation des plantes, 4)

La digitalisation 3D de l'architecture aérienne de pommiers : son utilisation pour étudier la variabilité de la qualité des pommes dans l'arbre, en relation avec leur contexte végétatif. Costes Evelyne, Sinoquet Hervé, Godin Christophe, Kelner J.J.. 1998. In : Architecture et modélisation en arboriculture fruitière. INRA, CTIFL, CIRAD, ENSAM. Montpellier : INRA, 278-285. Colloque sur les recherches fruitières. 11, Montpellier, France, 5 Mars 1998/6 Mars 1998.
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Modelling the Sylleptic branching on one-year-old trunks of apple cultivars. Costes Evelyne, Guédon Yann. 1997. Journal of the American Society for Horticultural Science, 122 (1) : 53-62.
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Produits phytosanitaires homologués 1996 : Pommier - Poirier. Savio A., Favareille J., Faure Jacques, Reboulet J.N.. 1996. Paris : CTIFL, 323 p.

Contenu hivernal des bourgeons de pommier. Pena G.. 1995. Montpellier : CIRAD, 25 p. Mémoire de fin d'études : Université Paul Valéry

Mise en place d'un protocole d'étude des effets d'une arcure provoquée sur le devenir de branches fruitières de pommier. Lauri Pierre-Eric, Lespinasse J.M., Fourcaud Thierry. 1995. In : Architecture, structure, mécanique de l'arbre : actes du 5ème congrès. USTL. Montpellier : Université de Montpellier 2, 6-11. Architecture, structure, mécanique de l'arbre. 8, Montpellier, France, 12 Juillet 1995/13 Juillet 1995.

Modélisation de la croissance et de la ramification chez quelques cultivars de pommier. Costes Evelyne, Lauri Pierre-Eric, Lespinasse J.M.. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 27-39. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Processus de croissance en relation avec la ramification sylleptique et la floraison chez le pommier. Costes Evelyne, Lauri Pierre-Eric. 1995. In : Architecture des arbres fruitiers et forestiers. Bouchon Jean (ed.). INRA. Paris : INRA, 41-50. ISBN 2-7380-0623-X Colloque sur l'architecture des arbres fruitiers et forestiers, Montpellier, France, 23 Novembre 1993/25 Novembre 1993.

Analyse diallèle. Comparaison de différentes méthodes. Application à l'amélioration des arbres. Raboin Louis-Marie. 1991. Rennes : Université de Rennes 1, 21 p. Synthèse Bibliographique DEA : Biologie et Agronomie. Option Amélioration des Plantes : Université de Rennes I

L'arboriculture fruitière dans la région Centrale des Hautes Terres de Madagascar : Potentiels et contraintes. Rougier N.. 1991. Montpellier : CIRAD-DSA, 100 p. Mémoire DAA : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

Deuxième Séminaire international sur les fruitiers tempérés en zone tropicale. Gaillard Jean-Pierre. 1986. Fruits, 41 (2) : 121-123. Séminaire International sur les Fruitiers Tempérés en Zone Tropicale. 2, Cagua, Venezuela, 9 Décembre 1985/14 Décembre 1985.
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Comportement de quelques variétés de pommiers à l'Ile de la Réunion. Lichou J., Thiery D., Fournier Patrick, Cozon O.. 1981. Fruits, 36 (5) : 317-326.
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Attempts to culture and characterize mycoplasma - like organismy from apple proliferation affected fruit. Summary. Vignault J.C., Saillard Colette, Tully Joseph G., Mauches C., Bové Joseph M., Bernhard R.. 1980. In : International Organization for Mycoplasmology Meeting. s.l. : s.n. International Organization for Mycoplasmology Meeting, Custer, États-Unis, 3 Septembre 1980/9 Septembre 1980.

Contribution à l'amélioration de quelques fruitiers des hauts-plateaux malgaches. Loisy M.. 1968. L'Agronomie Tropicale. Série 1, Riz et Riziculture et Cultures Vivrières Tropicales, 23 (8) : 872-875.

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