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A genomics resource for genetics, physiology, and breeding of West African sorghum. Faye Jacques, Maina Fanna, Akata Eyanawa, Sine Bassirou, Diatta Cyril, Mamadou Aïssata, Marla Sandeep R., Bouchet Sophie, Témé Niaba, Rami Jean-François, Foncéka Daniel, Cissé Ndiaga, Morris Geoffrey P.. 2021. Plant Genome, 14 (2):e20075, 18 p.

Population genomics of sorghum (Sorghum bicolor) across diverse agroclimatic zones of Niger. Maina Fanna, Bouchet Sophie, Marla Sandeep R., Hu Zhenbin, Wang Jianan, Mamadou Aïssata, Abdou Magagi, Saidou Abdoul-Aziz, Morris Geoffrey P.. 2018. Genome (Ottawa), 61 (4) : 223-232.

Massive sorghum collection genotyped with SSR markers to enhance use of global genetic resources. Billot Claire, Ramu Punna, Bouchet Sophie, Chantereau Jacques, Deu Monique, Gardes Laëtitia, Noyer Jean-Louis, Rami Jean-François, Rivallan Ronan, Li Yu, Lu Ping, Wang Tianyu, Folkertsma Rolf T., Arnaud Elizabeth, Upadhyaya Hari D., Glaszmann Jean-Christophe, Hash Charles Tom. 2013. PloS One, 8 (4):e59714, 16 p.

An initial assessment of linkage disequilibrium (LD) in coffee trees: LD patterns in groups of Coffea canephora Pierre using microsatellite analysis. Cubry Philippe, De Bellis Fabien, Avia Komlan, Bouchet Sophie, Pot David, Dufour Magali, Legnaté Hyacinthe, Leroy Thierry. 2013. BMC Genomics, 14 (10), 15 p.

Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) in Vanuatu (Oceania): an appraisal of the distribution of allelic diversity (DAD) with SSR markers. Sardos Julie, Noyer Jean-Louis, Malapa Roger, Bouchet Sophie, Lebot Vincent. 2012. Genetic Resources and Crop Evolution, 59 (5) : 805-820.

Genetic structure, linkage disequilibrium and signature of selection in sorghum: lessons from physically anchored DArT markers. Bouchet Sophie, Pot David, Deu Monique, Rami Jean-François, Billot Claire, Perrier Xavier, Rivallan Ronan, Gardes Laëtitia, Xia Ling, Wenzl Peter, Kilian Andrzej, Glaszmann Jean-Christophe. 2012. PloS One, 7 (3):e33470, 14 p.

Genetic diversity, structure, gene flow and evolutionary relationships within the Sorghum bicolor wild-weedy-crop complex in a western African region. Sagnard Fabrice, Deu Monique, Dembele Dékoro, Leblois Raphaël, Touré Lassana, Diakite Mohamed, Calatayud Caroline, Vaksmann Michel, Bouchet Sophie, Mallé Yaya, Togola Sabine, Traoré Pierre Sibiry. 2011. Theoretical and Applied Genetics, 123 (7) : 1231-1246.

A GCP challenge initiative: Drought tolerance improvement for sorghum in Africa : [Abstract W144]. Rami Jean-François, Témé Niaba, Vaksmann Michel, Lespinasse Denis, Billot Claire, Bouchet Sophie, Hash Charles Tom, Deshpande Santosh, Ramu Punna, Senthilvel S., Upadhyaya Hari D., Weltzien Eva, Rattunde H. Frederick W., Jordan David R., Borrell Andrew, Paterson Andrew H., Kresovich Stephen, Glaszmann Jean-Christophe, Niangado Oumar. 2010. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.

Genomics-based exploitation of germplasm diversity in major tropical crops. Glaszmann Jean-Christophe, Ahmadi Nourollah, Courtois Brigitte, Bouchet Sophie, Deu Monique, Hippolyte Isabelle, Perrier Xavier, Lanaud Claire, Seguin Marc, Le Guen Vincent, Foncéka Daniel, Rami Jean-François, Billot Claire, Mc Grath Sarah, Noyer Jean-Louis. 2010. In : 5th European Plant Science Organisation (EPSO) Conference "Plants for life", 29 August - 02 September 2010, Olos, Finland. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. European Plant Science Organisation (EPSO) Conference. 5, Olos, Finlande, 28 Août 2010/2 Septembre 2010.

Multiple scale analysis of genetic diversity in sorghum. Deu Monique, Barnaud Adeline, Barro-Kondombo Clarisse Pulchérie, Bouchet Sophie, De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Sagnard Fabrice, Glaszmann Jean-Christophe. 2010. In : Final program and abstracts of the 2nd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, Bologna, Italy, 24-27 April 2010. Rome : Bioversity International, Résumé, 39. International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources. 2, Bologne, Italie, 24 Avril 2010/27 Avril 2010.

A consensus genetic map of sorghum that integrates multiple component maps and high-throughput Diversity Array Technology (DArT) markers. Mace Emma S., Rami Jean-François, Bouchet Sophie, Klein Patricia E., Klein Robert R., Kilian Andrzej, Wenzl Peter, Xia Ling, Halloran Kirsten, Jordan David R.. 2009. BMC Plant Biology, 9 (13), 14 p.

Analyse multiéchelle de la diversité génétique des sorghos : compréhension des processus évolutifs pour la conservation in situ. Sagnard Fabrice, Barnaud Adeline, Deu Monique, Barro Clarisse, Luce Claude, Billot Claire, Rami Jean-François, Bouchet Sophie, Dembele Dékoro, Pomies Virginie, Calatayud Caroline, Rivallan Ronan, Joly Hélène, Vom Brocke Kirsten, Touré Aboubacar, Chantereau Jacques, Bezançon Gilles, Vaksmann Michel. 2008. Cahiers Agricultures, 17 (2) : 114-121.

Balayage du génome et évaluation du déséquilibre de liaison chez le sorgho à l'échelle mondiale et à l'échelle régionale du Mali. Bouchet Sophie. 2008. Montpellier : UM2, 178 p. Thèse de doctorat : Evolution, écologie, ressources génétiques, paléontologie : Université Montpellier 2

Analyse multi-échelle de la diversité génétique des sorghos : implications pour la conservation in situ. Sagnard Fabrice, Barnaud A., Deu Monique, Barro-Kondombo Clarisse Pulchérie, Dembele Dékoro, Luce Claude, Bouchet Sophie, Rivallan Ronan, Calatayud Caroline, Pomies Virginie, Billot Claire, Rami Jean-François, Vom Brocke Kirsten, Chantereau Jacques, Touré Aboubacar, Joly Hélène, Bezançon Gilles, Vaksmann Michel. 2007. In : Agrobiodiversités, colloque international sur la gestion des ressources génétiques en zone de savanes d'Afrique de l'Ouest, Bamako, Mali, 15-18 mai 2007 : diaporamas. Bazile Didier (ed.), Weltzien Eva (ed.). CIRAD, ICRISAT, IER, INERA, AOPP. Montpellier : CIRAD, Diaporama, (28 vues) Colloque International sur la Gestion des Ressources Génétiques en Zone de Savanes d¿Afrique de l¿Ouest, Bamako, Mali, 15 Mai 2007/18 Mai 2007.

Exploring genetic diversity in sorghum. Rami Jean-François, Alencar Lucio, Bouchet Sophie, Billot Claire, Deu Monique, Hash Charles Tom, Li Yu, Kilian Andrzej, Courtois Brigitte, Glaszmann Jean-Christophe. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.

Nucleotide diversity of genes involved in sucrose metabolism. Towards the identification of candidates genes controlling sucrose variability in Coffea sp. Pot David, Bouchet Sophie, Marraccini Pierre, De Bellis Fabien, Cubry Philippe, Jourdan Isabelle, Perreira Luiz Filipe Protasio, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Ferreira Lucia Pires, Musoli Chungason Pascal, Legnaté Hyacinthe, Leroy Thierry. 2007. In : 21st International Conference on Coffee Science, Montpellier (France), 11th - 15th September 2006 = 21ème Colloque scientifique international sur le café ; 21. Internationales Wissenshaftliches Kolloquium über Kaffee ; 21e Coloquio Cientifico Internacional sobre el Café. ASIC. Montpellier : ASIC, 679-686. ISBN 2-900212-20-0 Colloque Scientifique International sur le Café. 21, Montpellier, France, 11 Septembre 2006/15 Septembre 2006.

Polimorfismos nucleotidicos de genes envolvidos nas caracteristicas quimicas do grão de café, complementaridade das estratégias In silico e in vivo. Lannes Sérgio Dias, Bouchet Sophie, Ferreira Lucia Pires, Leroy Thierry, Ivamoto Suzana Tiemi, Marraccini Pierre, Perreira Luiz Filipe Protasio, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Pot David. 2007. In : 5° Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, Aguas de lindoia, Brasil, May 7-11, 2007. EMBRAPA. s.l. : s.n., 4 p. Simposio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 5, Aguas de Lindoia, Brésil, 7 Mai 2007/11 Mai 2007.

Whole genome scan and linkage disequilibrium evaluation on a sorghum core collection. Bouchet Sophie, Billot Claire, Deu Monique, Rami Jean-François, Xia Ling, Kilian Andrzej, Glaszmann Jean-Christophe. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.

Diversité nucléotidique et évolution moléculaire de cinq gènes impliqués dans la voie de biosynthèse du saccharose au sein du genre Coffea. Bouchet Sophie. 2005. Rennes : Université de Rennes I, 64 p. Mémoire de master : Biologie. Spécialité Génétique, adaptation et productions végétales : Université de Rennes I

Nucleotide diversity and molecular evolution of 5 genes involved in the sucrose biosynthesis pathway of Coffea canephora. Bouchet Sophie, Marraccini Pierre, Jourdan Isabelle, Leroy Thierry, Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Ferreira Lucia Pires, Musoli Chungason Pascal, Pot David. 2005. In : 4th Plant Genomics European Meetings, 20-23 September 2005, Amsterdam, The Netherlands. s.l. : s.n., 1 p. Plant Genomics European Meetings. 4, Amsterdam, Pays-Bas, 20 Septembre 2005/23 Septembre 2005.