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CROWN ROOTLESS1 binds DNA with a relaxed specificity and activates OsROP and OsbHLH044 genes involved in crown root formation in rice. Gonin Mathieu, Jeong Kwanho, Coudert Yoan, Lavarenne Jeremy, Hoang Giang Thi, Bes Martine, To Huong Thi Mai, Thiaw Marie-Rose Ndella, Do Toan Van, Moukouanga Daniel, Guyomarc'h Soazig, Bellande Kevin, Brossier Jean-Rémy, Parizot Boris, Nguyen Hieu Trang, Beeckman Tom, Bergougnoux Véronique, Rouster Jacques, Sallaud Christophe, Laplaze Laurent, Champion Anthony, Gantet Pascal. 2022. Plant Journal, 111 (2) : 546-566.

Transcriptome profiling of laser-captured crown root primordia reveals new pathways activated during early stages of crown root formation in rice. Lavarenne Jeremy, Gonin Mathieu, Champion Anthony, Javelle Marie, Adam Hélène, Rouster Jacques, Conejero Geneviève, Lartaud Marc, Verdeil Jean-Luc, Laplaze Laurent, Sallaud Christophe, Lucas Mikaël, Gantet Pascal. 2020. PloS One, 15 (11):e0238736, 15 p.

Crop plants with improved culture and quality traits for food, feed and other uses. Nogue Fabien, Vergne Philippe, Chèvre Anne-Marie, Chauvin Jean-Eric, Bouchabke-Coussa Oumaya, Déjardin Annabelle, Chevreau Elisabeth, Hibrand-Saint Oyant Laurence, Mazier Marianne, Barret Pierre, Guiderdoni Emmanuel, Sallaud Christophe, Foucrier Séverine, Devaux Pierre, Rogowsky Peter. 2019. Transgenic Research, 28 (2), suppl. : 65-73. OECD Conference on Genome Editing: Applications in Agriculture – Implications for Health, Environment and Regulation, Paris, France, 28 Juin 2018/29 Juin 2018.

GENIUS project - Genome ENgineering Improvement for Useful plants of a Sustainable agriculture. [P.06]. Nogue Fabien, Vergne Philippe, Chèvre Anne-Marie, Chauvin Jean-Eric, Bouchabke Oumaya, Déjardin Annabelle, Chevreau Elisabeth, Hibrand-Saint Oyant Laurence, Mazier Marianne, Barret Pierre, Guiderdoni Emmanuel, Mathis L., Sallaud Christophe, Matt Mireille, Pierron Jean-Philippe, Bonnel Eric, Foucrier Séverine, Toppan Alain, Trannoy Laure, Rogowsky Peter. 2015. In : 15èmes Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France, 18-22 janvier 2015. CIRAD ; IRD. s.l. : s.n., Résumé, 64. Rencontres de virologie végétale. 15, Aussois, France, 18 Janvier 2015/22 Janvier 2015.

In-depth molecular and phenotypic characterization in a rice insertion line library facilitates gene identification through reverse and forward genetics approaches. Lorieux Mathias, Blein Mélisande, Lozano Jaime, Bouniol Matthieu, Droc Gaëtan, Diévart Anne, Perin Christophe, Mieulet Delphine, Lanau Nadège, Bes Martine, Rouvière Claire, Gay Céline, Piffanelli Pietro, Larmande Pierre, Michel Corinne, Barnola Isabelle, Biderre-Petit Corinne, Sallaud Christophe, Perez Pascual, Bourgis Fabienne, Ghesquière Alain, Gantet Pascal, Tohmé Joe, Morel Jean-Benoit, Guiderdoni Emmanuel. 2012. Plant Biotechnology Journal, 10 (5) : 555-568.

Oryza Tag Line, a phenotypic mutant database for the genoplante rice insertion line library. Larmande Pierre, Gay Céline, Lorieux Mathias, Perin Christophe, Bouniol Matthieu, Droc Gaëtan, Sallaud Christophe, Perez Pascual, Barnola Isabelle, Biderre-Petit Corinne, Martin Jérôme, Morel Jean-Benoit, Johnson Alexander A.T., Bourgis Fabienne, Ghesquière Alain, Ruiz Manuel, Courtois Brigitte, Guiderdoni Emmanuel. 2008. Nucleic Acids Research, 36 : 1022-1027.

In depth molecular characterization of T-DNA and Tos17 integration patterns in the Génoplante rice insertion collection : [P216]. Piffanelli Pietro, Mieulet Delphine, Bes Martine, Lanau Nadège, Rouvière Claire, Droc Gaëtan, Meynard Donaldo, Bourgeois Emmanuelle, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel. 2005. In : 5th International Rice Genetics Symposium (A platform for exploring developments in rice genetics and their applications) and 3rd International Symposium of Rice Functional Genomics. Abstract. IRRI. Manila : IRRI, Résumé, 99. International Rice Genetics Symposium. 5, Manille, Philippines, 19 Novembre 2005/23 Novembre 2005.

High throughput T-DNA insertion mutagenesis in rice : A first step towards in silico reverse genetics. Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Piegu Benoît, Droc Gaëtan, Regad Farid, Bourgeois Emmanuelle, Meynard Donaldo, Perin Christophe, Sabau Xavier, Ghesquière Alain, Glaszmann Jean-Christophe, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2004. Plant Journal, 39 (3) : 450-464.

Transcription and somatic transposition of the maise En/Spm transposon system in rice. Greco Rafaella, Ouwerkerk Pieter B.F., Taal A.J.C., Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Meijer Annemarie H., Hoge J.H.C., Pereira Andy. 2004. Molecular Genetics and Genomics, 270 (6) : 514-523.

Construction de vecteurs viraux d'expression pour la génomique fonctionnelle du riz et génétique moléculaire du virus de la panachure jaune du riz (RYMV). Sire Christelle, Bangratz Martine, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Hebrard Eugénie, Fargette Denis, Ghesquière Alain, Brugidou Christophe. 2003. In : 9ème Rencontres de virologie végétale. Pierre Yot ; CNRS. Strasbourg : CNRS, Résumé, 54. Rencontres de virologie végétale. 9, Aussois, France, 2 Février 2003/6 Février 2003.

Construction of RYMV-based vectors and study of silencing suppression by P1 protein. Sire Christelle, Bangratz Martine, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Fargette Denis, Ghesquière Alain, Brugidou Christophe. 2003. In : Advances in plant virology, a three day international conference, September 29 to October 10, 2003, Montpellier, France. Montpellier : IRD, 1 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 Septembre 2003/1 Octobre 2003.

Construction of RYMV-based vectors for rice functional genomic. Sire Christelle, Bangratz Martine, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Fargette Denis, Ghesquière Alain, Brugidou Christophe. 2003. In : Advances in plant virology : A three day International conference at CIRAD, Montpellier, France on 29 September - 1 October 2003. AAB, CIRAD-AMIS, INRA, ENSAM, IRD. Warwick : AAB, Résumé, 1 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 Septembre 2003/1 Octobre 2003.

Generation of enhancer trap lines of rice (Oryza sativa L.) expressing GAL4 and GFP in specific cell types [W04-6]. Johnson Alexander, Tester Mark, Hibberd Jullian, Gay Céline, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 466. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Highly efficient production and characterization of T-DNA plants for rice (Oryza sativa L.) functional genomics. Sallaud Christophe, Meynard Donaldo, Van Boxtel Jos, Gay Céline, Bes Martine, Brizard Jean-Paul, Larmande Pierre, Ortega D., Raynal Monique, Portefaix Murielle, Ouwerkerk Pieter B.F., Rueb S., Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 1396-1408.

Identification of five new blast resistance genes in the highly blast-resistant rice variety IR64 using a QTL mapping strategy. Sallaud Christophe, Lorieux Mathias, Roumen E., Tharreau Didier, Berruyer Romain, Svestasrani P., Garsmeur Olivier, Ghesquière Alain, Nottéghem Jean-Loup. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 794-803.

Transpositional behaviour of an Ac/Ds system for reverse genetics in rice. Greco Rafaella, Ouwerkerk Pieter B.F., De Kam Rolf J., Sallaud Christophe, Favalli C., Colombo Lucia, Guiderdoni Emmanuel, Meijer Annemarie H., Hoge J.H.C., Pereira Andy. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 108 : 10-24.

A genome wide library on insertion lines in rice : distribution of T-DNA inserts over the rice genome [S22-21]. Sallaud Christophe, Gay Céline, Larmande Pierre, Bourgeois Emmanuelle, Piegu Benoît, Regad Farid, Bes Martine, Piffanelli Pietro, Perin Christophe, Ghesquière Alain, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. ISPMB. Barcelone : ISPMB Office, Résumé, 320. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, Barcelone, Espagne, 23 Juin 2003/28 Juin 2003.

Creation of a genome-wide collection of insertional mutants in rice. Sallaud Christophe, Regad Farid, Gay Céline, Larmande Pierre, Bourgeois Emmanuelle, Raynal Monique, Ghesquière Alain, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Transposon-mediated generation of T-DNA - and marker-free rice plants expressing a Bt endotoxin gene. Cotsaftis Olivier, Sallaud Christophe, Breitler Jean-Christophe, Meynard Donaldo, Greco Rafaella, Pereira Andy, Guiderdoni Emmanuel. 2002. Molecular Breeding, 10 : 165-180.

Rice genomics: Present and future. Delseny Michel, Salses J., Cooke Richard, Sallaud Christophe, Regad Farid, Lagoda Pierre, Guiderdoni Emmanuel, Ventelon M., Brugidou Christophe, Ghesquière Alain. 2001. Plant Physiology and Biochemistry, 39 : 323-334.

Transformation génétique du riz via Agrobacterium : un outil pour l'amélioration variétale et des études modèles de génomique. Guiderdoni Emmanuel, Bes Martine, Bourgeois Emmanuelle, Breitler Jean-Christophe, Brizard Jean-Paul, Gay C., Meynard Donaldo, Portefaix Murielle, Royer Monique, Sallaud Christophe, Vila Ujaldon L., Van Boxtel Jos. 2001. In : Des modèles biologiques à l'amélioration des plantes. Hamon Serge (ed.). AUF. Paris : IRD, 809-810. (Colloques et séminaires / IRD) ISBN 2-7099-1472-7 Journées scientifiques du réseau AUF "Biotechnologies végétales : amélioration des plantes et sécurité alimentaire". 7, Montpellier, France, 3 Juillet 2000/5 Juillet 2000.

Transposon insertional mutagenesis in rice. Greco Rafaella, Ouwerkerk Pieter B.F., Sallaud Christophe, Kohli A., Colombo Lucia, Puigdomenech Pere, Guiderdoni Emmanuel, Christou Paul, Hoge J.H.C., Pereira Andy. 2001. Plant Physiology, 125 : 1175-1177.

Transposons and functional genomics in rice. Greco Rafaella, Ouwerkerk Pieter B.F., Sallaud Christophe, Kohli A., Favalli C., Beguiristain T., Colombo Lucia, Pè Enrico, Puigdomenech Pere, Guiderdoni Emmanuel, Christou Paul, Hoge J.H.C., Pereira Andy. 2001. In : Rice genetics IV. Khush Gurdev S. (ed.), Brar D.S. (ed.), Hardy Bill (ed.). IRRI. Metro Manila : IRRI, 263-277. ISBN 971-220-155-4 International Rice Genetics Symposium. 4, Los Baños, Philippines, 22 Octobre 2000/27 Octobre 2000.

Mutagénèse insertionnelle chez le riz (Oryza sativa L.). Guiderdoni Emmanuel, Sallaud Christophe, Bourgeois Emmanuelle, Gay Céline, Brizard Jean-Paul, Legavre Thierry, Bes Martine, Portefaix Murielle. 2000. In : IXèmes Entretiens d'Agropolis : apport des outils biotechnologiques à l'amélioration variétale des plantes méditerranéennes et tropicales. Lundi 22 mai 2000, Montpellier. Agropolis. Montpellier : Agropolis, Résumé, 19. Entretiens d'Agropolis : Apport des outils biotechnologiques à l'amélioration variétale des plantes méditerranéennes et tropicales. 9, Montpellier, France, 22 Mai 2000.

Organization of t-DNA integration in a large population of transgenic rice. Sallaud Christophe. 2000. . s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 8, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2000/12 Janvier 2000.

T-DNA as a potential insertional mutagen in rice. Sallaud Christophe, Meynard Donaldo, Brizard Jean-Paul, Bes Martine, Gay Céline, Raynal Monique, Bourgeois Emmanuelle, Hoge Harry, Delseny Michel, Guiderdoni Emmanuel. 2000. In : 4th International Rice Genetics Symposium - International Rice Research Institute, Los Baños, Laguna, Philippines, 22-27 october 2000. s.l. : s.n., 111. International Rice Genetics Symposium. 4, Los Baños, Philippines, 22 Octobre 2000/27 Octobre 2000.

Transposons and functional genomics in rice. Greco Rafaella, Ouwerkerk Pieter B.F., Sallaud Christophe, Kohli A., Favalli C., Beguiristain T., Colombo Lucia, Pè Enrico, Puigdomenech Pere, Guiderdoni Emmanuel, Christou Paul, Hoge J.H.C., Pereira Andy. 2000. In : 4th International Rice Genetics Symposium - International Rice Research Institute, Los Baños, Laguna, Philippines, 22-27 october 2000. s.l. : s.n., 20. International Rice Genetics Symposium. 4, Los Baños, Philippines, 22 Octobre 2000/27 Octobre 2000.

The distribution of T-DNA in the genomes of transgenic Arabidopsis and rice. Barakat Abdelali, Gallois Patrick, Raynal Martine, Mestre-Ortega Dominique, Sallaud Christophe, Guiderdoni Emmanuel, Delseny Michel, Bernardi Giorgio. 2000. FEBS Letters (471) : 161-164.