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Isolation and characterization of a satellite DNA family in the Saccharum complex

Alix Karine, Baurens Franc-Christophe, Paulet Florence, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique. 1998. Isolation and characterization of a satellite DNA family in the Saccharum complex. Genome (Ottawa), 41 : 854-864.

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact
Texte intégral non disponible.

Autre titre : Isolement et caractérisation d'une famille d' ADN satellites chez le complexe Saccharum

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : La migration électrophorétique, sur gel d'agarose, de fragments résultant d'une restriction par l'endonucléase Taql d'ADN génomique, a permie d'isoler un ADN satellite de 371 pb spécifique du genre #Erianthus#, EaCIRI. Cette séquence présente 77% d'homologie avec un ADN satellite de 365 pb spécifique de #Helictotrichon convolutum#, ainsi que 72% d'homologie avec une séquence répétée en tandem de 353 pb spécifique de #Oryza sativa#. Des amorces PCR définies dans les zones conservées de ces séquences répétées ont permis d'isoler d'autres ADN satellites chez différents représentants du complexe #Saccharum# : SoCIRI chez #Saccharum officinarum#. SrCIR1 chez #Sacharum robustum#, SsCIR1 et SsCIR2 chez #Saccharum spontaneum# ainsi que MsCIR1 chez #Miscanthus sinensis#. EaCIR1 et SoCIR1 ont été localisés dans les régions subtélométriques des chromosomes, par hybridation #in situ# en fluorescence. La réalisation d'hybridations de type Southern, en utilisant deux représentants de cette famille de séquences répétées comme sondes, a illustré l'existence de la spécificité d'espèce de ces satellites, et démontré l'existence d'éléments répétés similaires chez le sorgho et la maïs.

Mots-clés Agrovoc : Saccharum, adn, électrophorèse, Erianthus, séquence nucléotidique, PCR, Miscanthus sinensis, hybridation

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/391117/)

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