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Recherche de séquences apparentées aux gènes de la famille des ADN-methyltransferases chez le palmier à huile : alliance 2002, projet N°03958NB

Jaligot Estelle. 2002. Recherche de séquences apparentées aux gènes de la famille des ADN-methyltransferases chez le palmier à huile : alliance 2002, projet N°03958NB. Montpellier : CIRAD-CP, 22 p. N° de rapport : CP_SIC 1511

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Abstract : La méthylation de l'ADN est une modification biologique réversible qui touche les cytosines (C) chez les organismes eucaryotes. Un nombre croissant d'études (Fînnegan et al., 1993 et 2000) postulent que ce phénomène est lié à la régulation de l'expression des gènes. Notamment, il a été observé que des variations de sa densité et de sa localisation dans le génome interviennent au cours du développement ou en réponse à des contraintes environnementales. En outre, les perturbations du plan de methylation au sein de certaines séquences individuelles (codantes et/ou régulatrices) sont corrélées avec l'apparition d'anomalies phénotypiques sévères. Plus particulièrement, Burn et al. (1993) ont pu montrer que l'inactivation du gène MET1 codant pour lADN-methyltransferase majeure d'Arabidopsis thaliana provoque conjointement un important déficit de methylation à l'échelle génornique, ainsi que l'émergence d'anomalies morphologiques. Parmi ces dernières, il est frappant de constater que les anomalies de l'organogenèse florale sont analogues au phénotype des variants somaclonaux "mantled" observés chez le palmier à huile, en ce qu'elles consistent en la transformation d'un des deux genres d'organes reproducteurs. Les gènes appartenant à cette famille apparaissent par conséquent comme des cibles privilégiées dans le cadre de la recherche des acteurs potentiels de la variation somaclonale chez le palmier à huile. Les deux équipes participant au Projet ont chacune entrepris indépendamment de rechercher des séquences apparentées aux gênes de la famille des ADN-methyltransferases chez le palmier à huile. Dans ce but, différents jeux d'amorces de PCR ont eté dessinés, sur la base des similarités détectées entre les produits peptidiques putatifs des gènes végétaux isoles. Dans les deux groupes de recherche, aucune amplification n'a permis l'isolement des gènes désirés. Afin d'optimiser les chances de faire aboutir cette approche, basée sur l'amplification par PCR, les jeux d'amorces mis en oeuvre séparément par les deux équipes ont été combinés et utilisés sur des ADN génomiques issus de différentes lignées clonales de palmier à huile. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Elaeis guineensis, ADN, Méthylation, Gène, PCR, Arabidopsis thaliana, Transférase

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding

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Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/509306/)

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