Biochemical and molecular markers

Grivet Laurent, Noyer Jean-Louis. 2003. Biochemical and molecular markers. In : Genetic diversity of cultivated tropical plants. Hamon Perla (ed.), Seguin Marc (ed.), Perrier Xavier (ed.), Glaszmann Jean-Christophe (ed.). Montpellier : CIRAD, 1-29. ISBN 1-57808-264-1

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Résumé : Les marqueurs biochimiques et moléculaires ont de nombreuses applications en génétique des plantes. Ils permettent d'observer, de façon plus ou moins fine, le polymorphisme de séquences de l'ADN d'un certain nombre de sites ou de locus répartis sur le génome. Plus précisément, les marqueurs biochimiques révèlent le polymorphisme des séquences de certaines protéines et donc, de façon indirecte, le polymorphisme des séquences d'ADN à partir desquelles elles sont traduites. Les marqueurs moléculaires révèlent directement le polymorphisme de l'ADN, les séquences ciblées correspondant ou non à des séquences codantes. Ce chapitre vise à préciser les caractéristiques des différentes techniques de marquage biochimique et moléculaire disponibles pour étudier la diversité des collections de matériel génétique chez les plantes. Il existe plus d'une dizaine de techniques de marquage génétique. Cinq techniques, largement répandues ou prometteuses sont abordées : les isoenzymes, les RFLP (restriction fragment lengh polymorphism), les RAPD (random amplified polymorphic DNA), les AFLP (amplified fragment length polymorphism) et les microsatellites. Le principe de chaque technique est brièvement décrit. Après avoir rappelé la structure du génome des plantes, on décrit les aspects méthodologiques - séquences ciblées, nature et niveau du polymorphisme détecté, similarité génétique - et pratiques - coût, rapidité de mise en oeuvre, infrastructures nécessaires - qui différencient ces cinq techniques

Mots-clés Agrovoc : plante de culture tropicale, marqueur génétique, génome, polymorphisme, variation génétique, séquence nucléotidique, banque de gènes, isoenzyme, RFLP, RAPD, microsatellite