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Diversité génétique d'Elaeis guineensis par marqueurs microsatellites et étude préliminaire du déséquilibre de liaison local

Rekima Samah. 2006. Diversité génétique d'Elaeis guineensis par marqueurs microsatellites et étude préliminaire du déséquilibre de liaison local. Montpellier : CIRAD, 47 p. Mémoire de master : Génétiques et gestion de la biodiversité : Université Pierre et Marie Curie

Mémoire
Texte intégral non disponible.

Résumé : La diversité génétique d'Elaeis guinensis et sa structuration ont été évaluées à l'aide de marqueurs microsatellites. Cette variabilité moléculaire a été étudiée par 13 locus sur 270 individus. Les données ont été soumises à des analyses multivariées AFC et AFTD. L'ensemble du matériel analysé manifeste une importante diversité génétique. Les populations de Côte d'Ivoire (La Mé, Yocoboué et Bingerville) sont nettement séparées des populations de l'ensemble Bénin, Nigeria, Afrique Centrale (Congo, République Démocratique du Congo, Angola, Cameroun). L'ensemble du matériel Deli apparaît moins polymorphe avec une grande homogénéité des populations et les taux d'hétérozygoties les plus faibles. Ces résultats sont en accord avec la base génétique très restreinte supposée dont sont issues ces populations. Notre étude du déséquilibre de liaison local est une étude préliminaire, ayant pour but d'estimer l'existence et l'importance du DL chez le palmier à huile. Il a été étudié par des marqueurs choisis sur le groupe de liaison 8 sur lequel a été localisé un QTL gouvernant la hauteur. Ces trois populations présentent un DL important sur des distances de 10 à 15 cM. Un maillage de 10 à 15 cM sera suffisant dans le cadre d'une sélection assistée par marqueur. Cependant la structuration génétique d'Elaeis guinensis rend difficile l'extrapolation des résultats obtenus sur ces populations.

Mots-clés Agrovoc : Elaeis guineensis, microsatellite, marqueur génétique, variation génétique, gène, locus des caractères quantitatifs, génétique des populations

Mots-clés géographiques Agrovoc : Côte d'Ivoire, Bénin, Nigéria, Afrique centrale

Mots-clés complémentaires : QTL, Linkage disequilibrium

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

  • Rekima Samah, CIRAD-AMIS-UMR PIA (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/535189/)

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