Claverie Sohini, Varsani Arvind, Hoareau Murielle, Filloux Denis, Roumagnac Philippe, Martin Darren Patrick, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel. 2020. Sorghum mastrevirus-associated alphasatellites: New geminialphasatellites associated with an African streak mastrevirus infecting wild Poaceae plants on Reunion Island. Archives of Virology, 165 (8) : 1925-1928.
Version Online first
- Anglais
Accès réservé aux personnels Cirad Utilisation soumise à autorisation de l'auteur ou du Cirad. Claverie_Sorghum alphasatelitte_2020.pdf Télécharger (750kB) | Demander une copie |
|
Version publiée
- Anglais
Accès réservé aux personnels Cirad Utilisation soumise à autorisation de l'auteur ou du Cirad. 596273.pdf Télécharger (710kB) | Demander une copie |
Url - éditeur : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN901967 / Url - jeu de données - Entrepôt autre : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN901975 / Url - éditeur : https://rdcu.be/b5TC4
Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY
Résumé : Nine complete nucleotide sequences of geminialphasatellites (subfamily Geminialphasatellitinae, family Alphasatellitidae) recovered from the wild Poaceae Sorghum arundinaceum collected in Reunion are described and analyzed. While the helper geminivirus was identified as an isolate of maize streak virus (genus Mastrevirus, family Geminiviridae), the geminialphasatellite genomes were most closely related to, and shared ~63% identity with, clecrusatellites. Even though the geminialphasatellite molecules lack an adenine rich-region, they have the typical size of geminialphasatellites, encode a replication-associated protein in the virion sense, and have probable stem-loop structures at their virion-strand origins of replication. According to the proposed geminialphasatellite species and genus demarcation thresholds (88% and 70% nucleotide identity, respectively), the genomes identified here represent a new species (within a new genus) for which we propose the name “Sorghum mastrevirus-associated alphasatellite” (genus “Sorgasalphasatellite”).
Mots-clés Agrovoc : Sorghum arundinaceum, Geminiviridae, séquence nucléotidique, génome
Mots-clés géographiques Agrovoc : La Réunion, France
Mots-clés complémentaires : geminialphasatellites, Mastrevirus
Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes
Agences de financement européennes : European Commission
Auteurs et affiliations
- Claverie Sohini, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
- Varsani Arvind, Arizona State University (USA)
- Hoareau Murielle, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
- Filloux Denis, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
- Roumagnac Philippe, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA) ORCID: 0000-0001-5002-6039
- Martin Darren Patrick, Montpellier SupAgro (FRA)
- Lefeuvre Pierre, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
- Lett Jean-Michel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) - auteur correspondant
Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/596273/)
[ Page générée et mise en cache le 2024-08-30 ]