Agritrop
Accueil

The Windblown: Possible explanations for dinophyte DNA in forest soils

Gottschling Marc, Czech Lucas, Mahé Frédéric, Adl Sina, Dunthorn Micah. 2021. The Windblown: Possible explanations for dinophyte DNA in forest soils. Journal of Eukaryotic Microbiology, 68 (1):e12833, 6 p.

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact
[img]
Prévisualisation
Version Online first - Anglais
Sous licence Licence Creative Commons.
jeu.12833.pdf

Télécharger (241kB) | Prévisualisation
[img]
Prévisualisation
Version publiée - Anglais
Sous licence Licence Creative Commons.
597387.pdf

Télécharger (248kB) | Prévisualisation

Quartile : Q3, Sujet : MICROBIOLOGY

Résumé : Dinophytes are widely distributed in marine‐ and fresh‐waters, but have yet to be conclusively documented in terrestrial environments. Here, we evaluated the presence of these protists from an environmental DNA metabarcoding dataset of Neotropical rainforest soils. Using a phylogenetic placement approach with a reference alignment and tree, we showed that the numerous sequencing reads that were phylogenetically placed as dinophytes did not correlate with taxonomic assignment, environmental preference, nutritional mode, or dormancy. All the dinophytes in the soils are rather windblown dispersal units of aquatic species and are not biologically active residents of terrestrial environments.

Mots-clés Agrovoc : Dinophyceae, sol de forêt, adn

Mots-clés libres : Biodiversity, Biogeography, Dinoflagellates, Environmental DNA, Phylogeny

Classification Agris : P34 - Biologie du sol
M40 - Écologie aquatique

Champ stratégique Cirad : CTS 1 (2019-) - Biodiversité

Auteurs et affiliations

  • Gottschling Marc, Ludwig-Maximilians-Universität (DEU)
  • Czech Lucas, Heidelberg Institute for Theoretical Studies (DEU)
  • Mahé Frédéric, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA) ORCID: 0000-0002-2808-0984
  • Adl Sina, University of Saskatchewan (CAN)
  • Dunthorn Micah, Universität Duisburg-Essen (DEU) - auteur correspondant

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/597387/)

Voir la notice (accès réservé à Agritrop) Voir la notice (accès réservé à Agritrop)

[ Page générée et mise en cache le 2024-12-18 ]