Genome characterization and diversity of trifolium virus 1: identification of a novel legume-infecting capulavirus

Ma Yuxin, Svanella‑Dumas Laurence, Julian Charlotte, Galzi Serge, Fernandez Emmanuel, Yvon Michel, Pirolles Elodie, Lefebvre Marie, Filloux Denis, Roumagnac Philippe, Candresse Thierry. 2021. Genome characterization and diversity of trifolium virus 1: identification of a novel legume-infecting capulavirus. Archives of Virology, 166 : 2573-2578.

https://doi.org/10.1007/s00705-021-05135-6

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact

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Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY

Résumé : A novel geminivirus was identified in France and Spain in asymptomatic plants of white clover (Trifolium repens) and shrub medick (Medicago arborea). Its genome has the hallmarks of a capulavirus, and its relationship to other capulaviruses was confirmed by phylogenetic analysis. White clover isolates formed a tight cluster in the phylogenetic tree, while shrub medick isolates formed two distinct, more divergent groups with sequence identity values close to the species cutoff. These three groups have likely participated in recombination events involving alfalfa leaf curl virus and French bean severe leaf curl virus. The name "trifolium virus 1" (TrV1) is proposed for this new Capulavirus. Three TrV1 genotypes (TrV1-A, TrV1-B, and TrV1-C) were clearly distinguished.

Mots-clés Agrovoc : Geminiviridae, génome, identification, séquence nucléotidique, indexage des virus des plantes, Trifolium repens, Medicago, Medicago arborea, génome viral

Mots-clés géographiques Agrovoc : France, Espagne

Mots-clés complémentaires : Trifolium Virus 1, Capulavirus, viral genomes (en)

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Auteurs et affiliations