Résultats pour : "herbier"

Herbarium specimen sequencing allows precise dating of Xanthomonas citri pv. citri diversification history. Campos Paola, Pruvost Olivier, Boyer Karine, Chiroleu Frédéric, Cao Thuy Trang, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Utteridge Timothy M. A., Becker Nathalie, Rieux Adrien, Gagnevin Lionel. 2023. Nature Communications, 14:4306, 13 p.

Can artificial intelligence help in the study of vegetative growth patterns from herbarium collections? An evaluation of the tropical flora of the French Guiana forest. Goeau Hervé, Lorieul Titouan, Heuret Patrick, Joly Alexis, Bonnet Pierre. 2022. Plants, 11 (4):530, 22 p.

The ECAT dataset: Expert-validated distribution data of endemic and sub-endemic trees of Central Africa (Dem. Rep. Congo, Rwanda, Burundi). Tack Wesley, Engledow Henry, Veríssimo Pereira Nuno, Amani Christian, Bachman Steven P., Barberá Patricia, Beentje Henk J., Bouka-Dipelet Ulrich Gaël, Cheek Martin, Cosiaux Ariane, Dauby Gilles, De Block Petra, Ewango Corneille, Fischer Eberhard, Gereau Roy E., Hargreaves Serene, Harvey-Brown Yvette, Ikabanga Davy U., Ilunga wa Ilunga Edouard, Kalema James, Kamau Peris, Lachenaud Olivier, Luke Quentin, Mwanga Mwanga Ithe, Ndolo Ebika Sydney T., Nkengurutse Jacques, Nsanzurwimo Aimable, Ntore Salvator, Richards Sophie L., Shutsha Ehata Reddy, Simo-Droissart Murielle, Stévart Tariq, Sosef Marc S.M.. 2022. PhytoKeys, 206 : 137-151.

First historical genome of a crop bacterial pathogen from herbarium specimen: Insights into citrus canker emergence. Campos Paola, Groot Crego Clara, Boyer Karine, Gaudeul Myriam, Baider Claudia, Richard Damien, Pruvost Olivier, Roumagnac Philippe, Szurek Boris, Becker Nathalie, Gagnevin Lionel, Rieux Adrien. 2021. PLoS Pathogens, 17 (7):e1009714, 25 p.

Machine learning using digitized herbarium specimens to advance phenological research. Pearson Katelin D., Nelson Gil, Aronson Myla F.J., Bonnet Pierre, Brenskelle Laura, Davis Charles C., Denny Ellen G., Ellwood Elizabeth R., Goeau Hervé, Heberling J. Mason, Joly Alexis, Lorieul Titouan, Mazer Susan J., Meineke Emily K., Stucky Brian J., Sweeney Patrick W., White Alexander E., Soltis Pamela S.. 2020. BioScience, 70 (7) : 610-620.

New insights on spatial genetic structure and diversity of Coffea canephora (Rubiaceae) in Upper Guinea based on old herbaria. Labouisse Jean-Pierre, Cubry Philippe, Austerlitz Frédéric, Rivallan Ronan, Nguyen Hong Anh. 2020. Plant Ecology and Evolution, 153 (1) : 82-100.

A new fine-grained method for automated visual analysis of herbarium specimens: A case study for phenological data extraction. Goeau Hervé, Mora-Fallas Adán, Champ Julien, Rossington Love Natalie L., Mazer Susan J., Mata-Montero Erick, Joly Alexis, Bonnet Pierre. 2020. Applications in Plant Sciences, 8 (6), n.spéc. Machine Learning in Plant Biology: Advances Using Herbarium Specimen Images:e11368, 11 p.

A new method for counting reproductive structures in digitized herbarium specimens using mask R-CNN. Davis Charles C., Champ Julien, Park Daniel S., Breckheimer Ian, Lyra Goia M., Xie Junxi, Joly Alexis, Tarapore Dharmesh, Ellison Aaron M., Bonnet Pierre. 2020. Frontiers in Plant Science, 11:1129, 13 p.

Accelerating the automated detection, counting and measurements of reproductive organs in herbarium collections in the era of deep learning. Mora-Fallas Adán, Goeau Hervé, Mazer Susan J., Love Natalie, Mata-Montero Erick, Bonnet Pierre, Joly Alexis. 2019. Biodiversity Information Science and Standards, 3:e37341, 3 p. Biodiversity Next: Building a global infrastructure for biodiversity data, Leiden, Pays-Bas, 22 Octobre 2019/25 Octobre 2019.

Toward a large‐scale and deep phenological stage annotation of herbarium specimens: Case studies from temperate, tropical, and equatorial floras. Lorieul Titouan, Pearson Katelin D., Ellwood Elizabeth R., Goeau Hervé, Molino Jean-François, Sweeney Patrick W., Yost Jennifer M., Sachs Joel, Mata-Montero Erick, Nelson Gil, Soltis Pamela S., Bonnet Pierre, Joly Alexis. 2019. Applications in Plant Sciences, 7 (3), n.spéc. Emerging Frontiers in Phenological Research:e01233, 14 p.

Automated identification of herbarium specimens at different taxonomic levels. Carranza-Rojas Jose Mario, Joly Alexis, Goeau Hervé, Mata-Montero Erick, Bonnet Pierre. 2018. In : Multimedia tools and applications for environmental and biodiversity informatics. Joly Alexis (ed.), Vrochidis Stefanos (ed.), Karatzas Kostas (ed.), Karppinen Ari (ed.), Bonnet Pierre (ed.). Cham : Springer, 151-167. (Multimedia Systems and Applications)) ISBN 978-3-319-76444-3

Going deeper in the automated identification of Herbarium specimens. Carranza-Rojas Jose Mario, Goeau Hervé, Bonnet Pierre, Mata-Montero Erick, Joly Alexis. 2017. BMC Evolutionary Biology, 17:e181, 14 p.

Historical collections reveal patterns of diffusion of sweet potato in Oceania obscured by modern plant movements and recombination. Roullier Caroline, Benoit Laure, McKey Doyle B., Lebot Vincent. 2013. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110 (6) : 2205-2210.

Mission scientifique paléo anthropologique franco-tchadienne dans le cadre de l'étude de la reconstitution des paléo-environnements des hominidés anciens d'Afrique centrale : mission du 27 septembre au 16 octobre 2010. Poilecot Pierre, Novello Alice. 2010. Montpellier : CIRAD, 95 p.

Phyto-afri : un WebSIG sur les essences forestières commercialisées de l'Afrique tropicale humide. Chevillotte Hervé, Fauvet Nicolas, Valton Catherine. 2010. Le Monde des Cartes (206) : 45-51.

Compte-rendu de mission à l'herbier national de Belgique (Meise) - du 11 au 14 novembre 2009. Arbonnier Michel. 2009. Montpellier : CIRAD, 6 p.

Faire une collection botanique de référence. Poilecot Pierre. 2009. In : Manuel de gestion des aires protégées d'Afrique francophone. Triplet Patrick (ed.). Paris : Awely, 746-750. ISBN 978-29528827-1-2

Rapport de mission à Agadir (Maroc) du 2 au 7 juin 2008 : Compte rendu du cours donné au 3ème cycle d'acridologie : utilisation de la floristique, en zones aride et semi-aride, dans le cadre de l'étude des biotopes acridiens. Duranton Jean-François. 2008. Montpellier : CIRAD-BIOS, 16 p.

L'herbier voyageur : histoire des fruits, légumes et épices du monde. Jeanguyot Michelle, Séguier-Guis Martine. 2004. Toulouse : Ed. Plume de carotte, 168 p. ISBN 2-9516629-7-1

Malherbologie. Gestion de l'enherbement en culture de canne à sucre : rapport de mission au Sénégal auprès de la C.S.S. Compagnie Sucrière Sénégalaise du 11 au 21 juin 2003. Marnotte Pascal. 2003. Montpellier : CIRAD, 100 p.

Le centre de ressources en botanique du CIRAD. César Jean, Daget Philippe, Le Bourgeois Thomas, Poilecot Pierre, Toutain Bernard. 2002. In : Les herbiers : un outil d'avenir. Tradition et modernité, Villeurbanne, 20-22 novembre 2002. Association française pour le conservation des espèces végétales. Villers-les-Nancy : AFCEV, 1 p. ISBN 2-9514620-2-6 Les herbiers : un outil d'avenir. Tradition et modernite, Lyon, France, 20 Novembre 2002/22 Novembre 2002.

Diagnostic sur les espèces spontanées à Mayotte. Perception et utilisation de ces espèces par les paysans : quelques conséquences sur la mise au point de systèmes agroécologiques. Vandamme Antoine. 2001. Cergy-Pontoise : ISTOM, 80 p. Mémoire : Ecole supérieure d'agro-économie internationale

La gestion de l'enherbement et l'emploi des herbicides dans les systèmes de cultrue en zone soudano-sahélienne : rapport de mission au Guinée, formation aurprès de l'IRAG du 28 mai au 10 juin 2001. Marnotte Pascal. 2001. Montpellier : CIRAD-CA, 36 p.

L'herbier ALF en ligne. Daget Philippe, Frohlich Cornélie. 2000. In : Plant systematics and phytogeography for the understanding of African biodiversity : actes du seizième (XVIe) Congrès de l'AETFAT = La systématique des plantes et la phytogéographie pour une meilleure connaissance de la biodiversité africaine : actes du seizième (XVIe) Congrès de l'AETFAT. Robbrecht E. (ed.), Degreef J. (ed.), Friis I. (ed.). AETFAT. Meise : Jardin Botanique National de Belgique, 363-364. (Systematics and Geography of Plants, 71) AETFAT Congress. 16, Meise, Belgique, 28 Août 2000/2 Septembre 2000.

Méthodologie pour les inventaires forestiers (partie flore et végétation). Lejoly Jean. 1993. Pointe-Noire : CIRAD-Forêt, 53 p.

Herbier et semencier. Merlier H.. 1992. Montpellier : CIRAD-IRCT, 70 p.

Rapport de mission botanique au Paraguay. 23/11/90-08/12/90. Grard Pierre. 1991. Montpellier : CIRAD-IRCT, 15 p.

Le projet régional de malherbologie. Le Bourgeois Thomas. 1990. Coton et Fibres Tropicales, 45 (4) : 287-294.

Mission d'appui près d'A. Ickowicz : agropastoraliste FAC au laboratoire de Farcha, N' Djamena (Tchad) (13-26 mars 1989). Gaston André. 1989. Maisons-Alfort : CIRAD-IEMVT, 21 p.

Seconde mission d'appui près d'A. Ickowicz, agropastoraliste FAC au Laboratoire de Farcha N'Djamena (Tchad). 25 Septembre au 5 Octobre 1989. Gaston André. 1989. Maisons-Alfort : CIRAD-IEMVT, 18 p.

Une symbiose exemplaire : agropastoralisme et botanique en Afrique sèche Nord-équatoriale. Lebrun Jean-Pierre. 1988. Bulletin de la Société Botanique de France. Actualités Botaniques, 135 (2) : 91-99.

Introduction à la connaissance de la flore d'Afrique. Lebrun Jean-Pierre. 1987. Maisons-Alfort : CIRAD-IEMVT, 143 p. ISBN 2-85985-140-2

Herbier et semencier. CIRAD-IRCT-Laboratoire de malherbologie - FRA. 1986. Montpellier : CIRAD-IRCT, 51 p.

Troisième supplément au "Catalogue des plantes vasculaires du Tchad méridional". Lebrun Jean-Pierre, Gaston André. 1986. Bulletin de la Société Botanique de France. Lettres Botaniques, 133 (4-5) : 387-392.

Herbiers et littérature. Bases de la botanique. Application au Congo. Mabiala J.. 1984. Maisons-Alfort : GERDAT-IEMVT, 100 p. Mémoire DESS : Productions Animales en Régions Chaudes : Université de Paris-Val-de-Marne

Résultats phytosociologiques et floristiques africains acquis à l'IEMVT de début 1974 à fin 1977. Gaston André, Lebrun Jean-Pierre. 1979. In : Taxonomic aspects of African economic botany = [Aspects taxonomiques de la botanique économique africaine]. Kundel G. s.l. : s.n., 173-176. Plenary Meeting of AETFAT. 9, Las Palmas de Gran Canaria, Espagne, 18 Mars 1978/23 Mars 1978.

Rapport annuel 1972. GERDAT - COG. 1972. Pointe-Noire : GERDAT-CTFT, 110 p.

Rapport annuel 1972. Les Recherches Outre-Mer au Centre Technique Forestier Tropical. GERDAT - COG. 1972. Nogent-sur-Marne : GERDAT-CTFT, 90 p.

Rapport annuel 1970. GERDAT - COG. 1970. Nogent-sur-Marne : GERDAT-CTFT, 45 p.