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Crop domestication in the Asia Pacific Region: A review. Okemo Pauline, Wijesundra Upendra, Nakandala Upuli, Dillon Natalie, Chandora Rahul, Campbell Bradley, Smith Millicent, Hardner Craig, Cadorna Charles A., Martin Guillaume, Yahiaoui Nabila, Garsmeur Olivier, Pompidor Nicolas, D'Hont Angélique, Henry Robert. 2024. Agriculture Communications, 2 (1):100032, 10 p.

Unveiling the predominance of Saccharum spontaneum alleles for resistance to orange rust in sugarcane using genome-wide association. Dijoux Jordan, Rio Simon, Hervouet Catherine, Garsmeur Olivier, Barau Laurent, Dumont Thomas, Rott Philippe, D'Hont Angélique, Hoarau Jean-Yves. 2024. Theoretical and Applied Genetics, 137:81, 17 p.

The complex polyploid genome architecture of sugarcane. Healey Adam, Garsmeur Olivier, Lovell John, Shengquiang S., Sreedasyam Avinash, Jenkins Jerry, Plott C.B., Piperidis George, Pompidor Nicolas, Llaca V., Metcalfe Daniel J., Dolezel Jaroslav, Cápal P., Carlson J.E., Hoarau Jean-Yves, Hervouet Catherine, Zini Cyrille, Diévart Anne, Lipzen Anna, Williams M., Boston L.B., Webber J., Keymanesh K., Tejomurthula S., Rajasekar S., Suchecki R., Furtado Agnelo, May G., Parakkal P., Simmons B.A., Barry K., Henry Robert, Grimwood Jane, Aitken Karen S., Schmutz J., D'Hont Angélique. 2024. Nature, 628 : 804-810.

Genetics of nodulation in Aeschynomene evenia uncovers mechanisms of the rhizobium-legume symbiosis. Quilbé Johan, Lamy Léo, Brottier Laurent, Leleux Philippe, Fardoux Joël, Rivallan Ronan, Benichou Thomas, Guyonnet Rémi, Becana Manuel, Villar Irene, Garsmeur Olivier, Hufnagel Barbara, Delteil Amandine, Gully Djamel, Chaintreuil Clémence, Pervent Marjorie, Cartieaux Fabienne, Bourge Mickael, Valentin Nicolas, Martin Guillaume, Fontaine Loïc, Droc Gaëtan, Dereeper Alexis, Farmer Andrew, Libourel Cyril, Nouwen Nico, Gressent Frédéric, Mournet Pierre, D'Hont Angélique, Giraud Eric, Klopp Christophe, Arrighi Jean-François. 2021. Nature Communications, 12:829, 14 p.

Three founding ancestral genomes involved in the origin of sugarcane. Pompidor Nicolas, Charron Carine, Hervouet Catherine, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rivallan Ronan, Manez Aurore, Mitros Therese, Swaminathan Kankshita, Glaszmann Jean-Christophe, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique. 2021. Annals of Botany, 127 (6) : 827-840.

Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence. Wang Zhuo, Miao Hongxia, Liu Juhua, Xu Biyu, Yao Xiaoming, Xu Chunyan, Zhao Shancen, Fang Xiaodong, Jia Caihong, Wang Jingyi, Zhang Jianbin, Li Jing, Xu Yi, Wang Jiashui, Ma Weihong, Wu Zhixiang, Yu Lili, Yang Yulan, Liu Chun, Guo Yu, Sun Silong, Baurens Franc-Christophe, Martin Guillaume, Salmon Frédéric, Garsmeur Olivier, Yahiaoui Nabila, Hervouet Catherine, Rouard Mathieu, Laboureau Nathalie, Habas Rémy, Ricci Sebastien, Peng Ming, Guo Anping, Xie Jianghui, Li Yin, Ding Zehong, Yan Yan, Tie Weiwei, D'Hont Angélique, Hu Wei, Jin Zhiqiang. 2019. Nature Plants, 5 : 810-821.

A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Antonise Rudie, Grimwood Jane, Potier Bernard, Aitken Karen S., Jenkins Jerry, Martin Guillaume, Charron Carine, Hervouet Catherine, Costet Laurent, Yahiaoui Nabila, Healey Adam, Sims David, Cherukuri Yesesri, Sreedasyam Avinash, Kilian Andrzej, Chan Agnes P., Van Sluys Marie-Anne, Swaminathan Kankshita, Town Christopher, Berges Hélène, Simmons Blake, Glaszmann Jean-Christophe, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique. 2018. Nature Communications, 9:2638, 10 p.

The coffee genome hub: a resource for coffee genomes. Dereeper Alexis, Bocs Stéphanie, Rouard Mathieu, Guignon Valentin, Ravel Sébastien, Tranchant-Dubreuil Christine, Poncet Valérie, Garsmeur Olivier, Lashermes Philippe, Droc Gaëtan. 2015. Nucleic Acids Research, 43 (D1), D1028-D1035

DNA methylation and expression of the EgDEF1 gene and neighboring retrotransposons in mantled somaclonal variants of oil palm. Jaligot Estelle, Wei Yeng Hooi, Debladis Emilie, Richaud Frédérique, Beulé Thierry, Collin Myriam, Agbessi Mawussé D.T., Sabot François, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Syed Alwee Sharifah Shahrul Rabiah, Rival Alain. 2014. PloS One, 9 (2):e91896, 14 p.

Expansion of banana (Musa acuminata) gene families involved in ethylene biosynthesis and signalling after lineage-specific whole-genome duplications. Jourda Cyril, Cardi Céline, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Bocs Stéphanie, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Yahiaoui Nabila. 2014. New Phytologist, 202 (3) : 986-1000.

Prospecting sugarcane resistance to Sugarcane yellow leaf virus by genome-wide association. Débibakas Sarah, Rocher Solen, Garsmeur Olivier, Toubi Lyonel, Roques Danièle, D'Hont Angélique, Hoarau Jean-Yves, Daugrois Jean-Heinrich. 2014. Theoretical and Applied Genetics, 127 (8) : 1719-1732.

Two evolutionarily distinct classes of paleopolyploidy. Garsmeur Olivier, Schnable James C., Almeida Ana, Jourda Cyril, D'Hont Angélique, Freeling Mike. 2014. Molecular Biology and Evolution, 31 (2) : 448-454.

The coffee genome provides insight into the convergent evolution of caffeine biosynthesis. Denoeud France, Carretero-Paulet Lorenzo, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Guyot Romain, Pietrella Marco, Chunfang Zheng, Alberti Adriana, Anthony François, Aprea Giuseppe, Aury Jean-Marc, Bento Pascal, Bernard Maria, Bocs Stéphanie, Campa Claudine, Cenci Alberto, Combes Marie-Christine, Crouzillat Dominique, Da Silva Corinne, Daddiego Loretta, De Bellis Fabien, Dussert Stéphane, Garsmeur Olivier, Gayraud Thomas, Guignon Valentin, Jahn Katharina, Jamilloux Véronique, Joët Thierry, Labadie Karine, Tianying Lan, Leclercq Julie, Lepelley Maud, Leroy Thierry, Lei-Ting Li, Librado Pablo, Lopez Loredana, Muñoz Adriana, Noël Benjamin, Pallavicini Alberto, Perrotta Gaetano, Poncet Valérie, Pot David, Priyono, Rigoreau Michel, Rouard Mathieu, Rozas Julio, Tranchant-Dubreuil Christine, VanBuren Robert, Qiong Zhang, Andrade Alan A., Argout Xavier, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David, Giuliano Giovanni, Albert Victor A., Wincker Patrick, Lashermes Philippe. 2014. Science, 345 (6201) : 1181-1184.

The banana genome hub. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2013. Database, 2013 (bat035), 14 p.

Chado Controller : Advanced annotation management with a community annotation system. Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Alaux Michael, Baurens Franc-Christophe, Garsmeur Olivier, Poiron Claire, Carver Timothy L.W., Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2012. Bioinformatics, 28 (7) : 1054-1056.

Haplotype structure around Bru 1 reveals a narrow genetic basis for brown rust resistance in modern sugarcane cultivars. Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique. 2012. Theoretical and Applied Genetics, 125 (5) : 825-836.

A High density consensus genetic map of tetraploid cotton that integrates multiple component maps through molecular marker redundancy check. Blenda Anna, Fang David D., Rami Jean-François, Garsmeur Olivier, Luo Feng, Lacape Jean-Marc. 2012. PloS One, 7 (9):e45739, 17 p.

Matita, a new retroelement from peanut : Characterization and evolutionary context in the light of the Arachis A-B genome divergence. Nielen Stephan, Vidigal Bruna S., Leal-Bertioli Soraya C.M., Ratnaparkhe Milind B., Paterson Andrew H., Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Guimarães Patricia M., Bertioli David J.. 2012. Molecular Genetics and Genomics, 287 (1) : 21-38.

The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants. D'Hont Angélique, Denoeud France, Aury Jean-Marc, Baurens Franc-Christophe, Carreel Françoise, Garsmeur Olivier, Noël Benjamin, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Da Silva Corinne, Jabbari Kamel, Cardi Céline, Poulain Julie, Souquet Marlène, Labadie Karine, Jourda Cyril, Lengellé Juliette, Rodier-Goud Marguerite, Alberti Adriana, Bernard Maria, Correa Margot, Ayyampalayam Saravanaraj, Mckain Michael R, Leebens-Mack Jim, Burgess Diane, Freeling Mike, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Chabannes Matthieu, Wicker Thomas, Panaud Olivier, Barbosa Jose, Hribova Eva, Heslop Harrison Pat, Habas Rémy, Rivallan Ronan, François Philippe, Poiron Claire, Kilian Andrzej, Burthia Dheema, Jenny Christophe, Bakry Frédéric, Brown Spencer, Guignon Valentin, Kema Gert H.J., Dita Miguel A., Waalwijk Cees, Joseph Steeve, Diévart Anne, Jaillon Olivier, Leclercq Julie, Argout Xavier, Lyons Eric, Almeida Ana, Jeridi Mouna, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Weissenbach Jean, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Quetier Francis, Yahiaoui Nabila, Wincker Patrick. 2012. Nature, 488 (7410) : 213-217.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Bocs Stéphanie, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Zini Cyrille, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2011. New Phytologist, 189 (2) : 629-642.

BAC libraries construction from the ancestral diploid genomes of the allotetraploid cultivated peanut. Guimarães Patricia M., Garsmeur Olivier, Proite Karina, Leal-Bertioli Soraya C.M., Seijo Guilhermo, Chaine Christian, Bertioli David J., D'Hont Angélique. 2008. BMC Plant Biology, 8 (14), 8 p.

Diploid/polyploid syntenic shuttle mapping and haplotype-specific chromosome walking toward a rust resistance gene (Bru1) in highly polyploid sugarcane (2n ~ 12x ~ 115). Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Pauquet Jérôme, Telismart Hugues, Selvi Athiappan, Grivet Laurent, Philippe Romain, Begum Dilara, Deu Monique, Costet Laurent, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique. 2008. Genetics, 180 (1) : 649-660.

Insights into the Musa genome : Syntenic relationships to rice and between Musa species. Lescot Magali, Piffanelli Pietro, Ciampi Ana, Ruiz Manuel, Blanc Guillaume, Leebens-Mack Jim, Da Silva Felipe, Santos Candice M.R., D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, Vilarinhos Alberto Duarte, Kanamori Hiroyuki, Matsumoto Takashi, Ronning Catherine, Cheung Foo, Haas Brian, Althoff Ryan, Arbogast Tammy, Hine Erin, Pappas Junior Georgios, Sasaki Takuji, Souza Manoel, Miller Roberto Neil Gerard, Glaszmann Jean-Christophe, Town Christopher. 2008. BMC Genomics, 9 (58), 20 p.

Evidence for the dispersal of a unique lineage from Asia to America and Africa in the sugarcane fungal pathogen Ustilago scitaminea. Raboin Louis-Marie, Selvi Athiappan, Oliveira Karine Miranda, Paulet Florence, Calatayud Caroline, Zapater Marie-Françoise, Brottier Philippe, Luzaran Rosalyn, Garsmeur Olivier, Carlier Jean, D'Hont Angélique. 2007. Fungal Genetics and Biology, 44 (1) : 64-76.

Orthologous comparison in a gene-rich region among grasses reveals stability in the sugarcane polyploid genome. Jannoo Nazeema, Grivet Laurent, Chantret Nathalie, Garsmeur Olivier, Glaszmann Jean-Christophe, Arruda Paulo, D'Hont Angélique. 2007. Plant Journal, 50 (4) : 574-585.

Genomic distribution and characterization of EST-derived resistance gene analogs (RGAs) in sugarcane. Rossi Magdalena, Araujo Paula G., Paulet Florence, Garsmeur Olivier, Dias Viviane M., Chen Hui, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2003. Molecular Genetics and Genomics, 269 (3) : 406-419.

Identification of five new blast resistance genes in the highly blast-resistant rice variety IR64 using a QTL mapping strategy. Sallaud Christophe, Lorieux Mathias, Roumen E., Tharreau Didier, Berruyer Romain, Svestasrani P., Garsmeur Olivier, Ghesquière Alain, Nottéghem Jean-Loup. 2003. Theoretical and Applied Genetics, 106 : 794-803.

Comparative mapping of the wheat 5B short chromosome arm distal region with rice, relative to a crossability locus. Lamoureux D., Boeuf C., Regad Farid, Garsmeur Olivier, Charmet Gilles, Sourdille Pierre, Lagoda Pierre, Bernard M.. 2002. Theoretical and Applied Genetics, 105 : 759-765.

A direct comparison between the genetic maps of sorghum and rice. Ventelon M., Deu Monique, Garsmeur Olivier, Doligez Agnès, Ghesquière Alain, Lorieux Mathias, Rami Jean-François, Glaszmann Jean-Christophe, Grivet Laurent. 2001. Theoretical and Applied Genetics, 102 : 379-386.

Mapping, tagging and map-based cloning of simply inherited traits. D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, McIntyre Lynne. 2010. In : Genetics, genomics and breeding of sugarcane. Henry Robert (ed.), Kole Chittaranjan (ed.). Boca Raton : CRC Press, 97-115. (Genetics, genomics and breeding of crop plants) ISBN 978-1-57808-684-9

Toward a reference sequence of the gene-rich part of the highly polypoid sugarcane genome. Garsmeur Olivier, Potier Bernard, Aitken Karen S., Droc Gaëtan, Berkman Paul, Charron Carine, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2014. In : 5th IAPSIT International Sugar Conference (IS-2014) onThe Green Technologies for Sustainable growth of Sugar Industry in Developing Countries, November 25-28, 2014, Nanning, China. Yang-Rui Li, G.P. Rao, S. Solomon, Li-Tao Yang, Zhong Liu, Wei-Zhong He,. Naming : IAPSIT, Résumé, 15. IAPSIT International Sugar Conference IS-2014. 5, Nanning, Chine, 25 Novembre 2014/28 Novembre 2014.

Evolutionary dynamics of hom(oe)ologous chromosome segments within the highly polyploid sugarcane genome. D'Hont Angélique, Charron Carine, Garsmeur Olivier, Vilela Marianne, Hervouet Catherine, Vincentz Michel. 2012. In : 58° Congresso Brasileiro de Genética "Genética e Sustentabilidade", 11 a 14 de setembro 2012, Foz do Iguaçu, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Congresso Brasileiro de Genética. 58, Foz do Iguaçu, Brésil, 9 Septembre 2012/11 Septembre 2012.

A Reference Sequence of the Monoploid Genome of Sugarcane. [W889]. Garsmeur Olivier, Aitken Karen S., Potier Bernard, Grimwood Jane, Charron Carine, Droc Gaëtan, Berkman Paul, Martin Guillaume, Berges Hélène, Van der Vossen Edwin, Simmons Blake, Schmutz Jeremy, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2017. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXV Conference. San Diego : PAG, 1 p. Plant and Animal Genome Conference. 25, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2017/18 Janvier 2017.

Genome-wide association studies (GWAS) in sugarcane context: Experience from a case study and questions about ways of optimization of GWAS. MO11. Hoarau Jean-Yves, Débibakas Sarah, Garsmeur Olivier, Roques Danièle, Rocher Solen, Glaszmann Jean-Christophe, Daugrois Jean-Heinrich, D'Hont Angélique. 2015. In : Pushing the frontiers of sugarcane improvement. ISSCT. Saint-Gilles : ISSCT, Résumé, 49. Germplasm and Breeding ISSCT Workshop. 11, Saint-Gilles, Réunion, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.

South Green bioinformatics platform: Update 2015. Armero A., Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie, Breil A., De Lamotte Frédéric, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Garsmeur Olivier, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Hueber Yann, Kougbeadjo Ayite, Larivière Delphine, Larmande Pierre, Lorenzo Jonathan, Martin Guillaume, Monat Cécile, Ndomassi T., Ortega Abboud Enrique, Pitollat Bertrand, Ravel Sébastien, Ranwez Vincent, Rouard Mathieu, Ruiz E., Sabot François, Sarah Gautier, Sempere Guilhem, Summo Marilyne, This Dominique, Tranchant-Dubreuil Christine, Vallier Félix. 2015. In : Plant Genomics Congress. Global Engage. Londres : Global Engage, 51. Plant Genomics Congress. 3, Londres, Royaume-Uni, 11 Mai 2015/12 Mai 2015.

Toward a reference sequence of the sugarcane genome. [MO04]. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Potier Bernard, Aitken Karen S., Berkman Paul, Droc Gaëtan, Martin Guillaume, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2015. In : Pushing the frontiers of sugarcane improvement. ISSCT. Saint-Gilles : ISSCT, Résumé, 42. Germplasm and Breeding ISSCT Workshop. 11, Saint-Gilles, Réunion, 1 Juin 2015/5 Juin 2015.

The South Green Genome Hubs. Droc Gaëtan, Argout Xavier, Bocs Stéphanie, Comte Aurore, Dereeper Alexis, Dufayard Jean François, Garsmeur Olivier, Gkanogiannis Anestis, Guignon Valentin, Hamelin Chantal, Lopez David, Oubda Nicolas, Martin Guillaume, Ravel Sébastien, Ruiz Manuel, Summo Marilyne, Thomas Coline, Tranchant-Dubreuil Christine, Rouard Mathieu. 2020. . SFBI, IFB, GDR-BIM. Montpellier : SFBI, 1 p. Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématique (JOBIM 2020), Montpellier, France, 30 Juin 2020/3 Juillet 2020.

Banana genome hub. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2013. In : 6th International Biocuration Conference, Cambridge, Royaume-Uni, april 07-10 2013. s.l. : s.n., 1 p. International Biocuration Conference. 6, Cambridge, Royaume-Uni, 7 Avril 2013/10 Avril 2013.

GNPAnnot Project 2010. Droc Gaëtan, Guignon Valentin, Baurens Franc-Christophe, Jouffe Vincent, Poiron Claire, Lengellé Juliette, Garsmeur Olivier, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Alaux Michael, Brigitte Leatitia, Steinbach Samson Delphine, Kimmel Erik, Pommier Cyril, Luyten Isabelle, Terrier Nancy, Leroy Philippe, Quesneville Hadi, Amselem Joelle, Brault Baptiste, Simon Adeline, Dominguez del Angel Victoria, Hoede Claire, Fillinger Sabine, Meyer Michel, Rouxel Thierry, Lebrun Marc-Henri, Legeai Fabrice, Kerbellec Goulven, Collin Olivier, Gauthier Jean-Pierre, D'Alençon Emmanuelle, Cousserans François, Fournier Philippe, Tagu Denis. 2010. In : Séminaire Génoplante, Pont-Royal en Provence, France, 29-31 mars 2010. s.l. : s.n., 1 p. Séminaire Génoplante, Pont-Royal Provence, France, 29 Mars 2010/31 Mars 2010.

QTL tagging in sorghum with the view to cloning genes of generic interest : development of an SSR and BAC molecular back-up. Deu Monique, Cardi Céline, Berger Angélique, Thibivilliers Sandra, Garsmeur Olivier, Lagoda Pierre, Piffanelli Pietro, Glaszmann Jean-Christophe. 2001. In : Génoplante, Poitiers, 01-03 octobre 2001. s.l. : s.n., 1 p. Génoplante, Poitiers, France, 1 Octobre 2001/3 Octobre 2001.

Exploiting Erianthus diversity to enhance sugarcane cultivars.[W1024]. Piperidis Nathalie, Tom Chris, Garsmeur Olivier, Aitken Karen S., Atkin Felicity, Piperidis George. 2020. In : Abstracts workshops of the PAG XXVIII. San Diego : PAG, Résumé, 446. Plant and Animal Genome. 28, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2020/15 Janvier 2020.

Leveraging multiple sequencing technologies to generate a haplotype specific assembly of sugarcane R570. [W1018]. Healey Adam, Lovell John, Garsmeur Olivier, Jenkins Jerry, Grimwood Jane, Aitken Karen S., Henry Robert, D'Hont Angélique, Schmutz Jeremy. 2020. In : Abstracts workshops of the PAG XXVIII. San Diego : PAG, Résumé, 443. Plant and Animal Genome. 28, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2020/15 Janvier 2020.

A monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Aitken Karen S., Potier Bernard, Van Sluys Marie-Anne, Hervouet Catherine, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique. 2018. . Okinawa : ISSCT, 1 p. ISSCT joint Breeding & Germplasm and Molecular Biology Workshops, Okinawa, Japon, 22 Octobre 2018/26 Octobre 2018.

A mosaic monoploid reference sequence for the highly complex genome of sugarcane. Garsmeur Olivier. 2018. . Evry : INRA, Résumé, 1 p. Colloque EPGV 2018 « Détection, Gestion et Analyse du Polymorphisme des Génomes Végétaux », Evry, France, 3 Octobre 2018/5 Octobre 2018.

A reference sequence of the monoploid genome of sugarcane. [W950]. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Grimwood Jane, Potier Bernard, Aitken Karen S., Jenkins Jerry, Charron Carine, Martin Guillaume, Van der Vossen Edwin, Kilian Andrzej, Berges Hélène, Simmons Blake, Schmutz Jeremy, D'Hont Angélique. 2018. In : Proceedings Plant and Animal Genome XXVI Conference. PAG. San Diego : PAG, Résumé, 1 p. Plant and Animal Genomes Conference. 26, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2018/17 Janvier 2018.

Toward a reference sequence of the gene-rich part of the highly polyploid sugarcane genome. [W714]. Garsmeur Olivier, Potier Bernard, Aitken Karen S., Berkman Paul, Droc Gaëtan, Charron Carine, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Van der Vossen Edwin, Henry Robert, D'Hont Angélique. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

A story of flasks and flowers: new perspectives in the search for markers of the mantled somaclonal variation of oil palm [W552]. Jaligot Estelle, Wei Yeng Hooi, Richaud Frédérique, Agbessi Mawussé D.T., Yen Yen Kwan, Beulé Thierry, Collin Myriam, Debladis Emilie, Sabot François, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Alwee Sharifah Shahrul Rabiah Syed, Rival Alain. 2015. In : Plant and Animal Genomes Conference XXIII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 10-14, 2015. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 23, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2015/14 Janvier 2015.

The Banana Genome Hub : [W079]. Droc Gaëtan, Larivière Delphine, Guignon Valentin, Yahiaoui Nabila, This Dominique, Garsmeur Olivier, Dereeper Alexis, Hamelin Chantal, Argout Xavier, Dufayard Jean-François, Lengellé Juliette, Baurens Franc-Christophe, Cenci Alberto, Pitollat Bertrand, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Whole genome profiling to generate a core physical map of the gene rich part of the sugarcane genome : [W778]. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Woltinge Dennis, Van-Oeveren Jan, Martin Guillaume, Harrison Bandie, Charron Carine, Van der Vossen Edwin, D'Hont Angélique. 2014. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

Comparison of hom(oe)ologous chromosome segments in the highly polyploid interspecific genome of sugarcane. Charron Carine, Garsmeur Olivier, Hervouet Catherine, Droc Gaëtan, Sidibé-Bocs Stéphanie, D'Hont Angélique. 2013. In : Polyploïde et cytogénétique, Rennes, France, 16-17 mai 2013. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Polyploïdie et cytogénétique, Rennes, France, 16 Mai 2013/17 Mai 2013.

GNPAnnot: a community annotation system applied to sugarcane sequences : W745. Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Guignon Valentin, Charron Carine, D'Hont Angélique, Ruiz Manuel, Bocs Stéphanie. 2013. In : Plant and Animal Genome XXI conference, San Diego, USA, January 12-16 2013,. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant and Animal Genome conference. 21, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2013/16 Janvier 2013.

Paleoploidization events in the Musa (banana) lineage. Garsmeur Olivier, Denoeud France, Baurens Franc-Christophe, Aury Jean-Marc, Wincker Patrick, D'Hont Angélique. 2013. In : Polyploïde et cytogénétique, Rennes, France, 16-17 mai 2013. s.l. : s.n., 1 p. Polyploïdie et cytogénétique, Rennes, France, 16 Mai 2013/17 Mai 2013.

Regulation of the EgDEF1 gene in the mantled homeotic variant of oil palm. Debladis Emilie, Hooi Wei Yeng, Richaud Frédérique, Beulé Thierry, Collin Myriam, Sabot François, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Rival Alain, Jaligot Estelle. 2013. . Presqu'île de Giens : ENS, Résumé, 1 p. Workshop on Molecular Mechanisms Controlling Flower Development, Presqu'île de Giens, France, 8 Juin 2013/12 Juin 2013.

Detailed analyses of 12 hom(oe)ologous chromosome segments in the highly polyploid sugarcane genome. Charron Carine, Hervouet Catherine, Garsmeur Olivier, Droc Gaëtan, Bocs Stéphanie, D'Hont Angélique. 2012. In : International Conference on Polyploidy, Hybridization, and Biodiversity ICPHB 2012, Prague, Czech Republic, 7-10 May 2012. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, Prague, République tchèque, 7 Mai 2012/10 Mai 2012.

Evolutionary dynamics of hom(oe)ologous chromosome segments within the highly polyploid sugarcane genome. D'Hont Angélique, Charron Carine, Garsmeur Olivier, Hervouet Catherine, Droc Gaëtan, Bocs Stéphanie. 2012. In : International Symposium of New Paradigms of Sugarcane Research, Coimbatore, Inde October 15-18, 2012. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Symposium on New Paradigms in Sugarcane Research, Coimbatore, Inde, 15 Octobre 2012/18 Octobre 2012.

Marqueurs moléculaires utilisables en sélection chez la canne à sucre : cas de la résistance à la rouille brune. Costet Laurent, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Raboin Louis-Marie, Hervouet Catherine, Toubi Lyonel, Telismart Hugues, Garsmeur Olivier, Rousselle Yves, Pauquet Jérôme, Nibouche Samuel, Glaszmann Jean-Christophe, Hoarau Jean-Yves, D'Hont Angélique. 2012. In : La canne à sucre source de développement et d'innovation : Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, 10-14 septembre 2012, Saint Denis, La Rénion et du 15 au 19 septembre 2012 à Maurice. ARTAS ; AFCAS. s.l. : s.n., 10 p. Congrès sucrier ARTAS-AFCAS, Saint Gilles, Réunion, 10 Septembre 2012/14 Septembre 2012.

Molecular marker redundancy check and construction of a high density genetic map of tetraploid cotton. Lacape Jean-Marc, Fang David D., Luo Feng, Hamelin Chantal, Droc Gaëtan, Rami Jean-François, Garsmeur Olivier, Blenda Anna. 2012. In : International Cotton Genome Initiative Research Conference (ICGI 2010), Raleigh, USA, 9-12 October 2012. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Cotton Genome Initiative Research Conference, Raleigh, États-Unis, 9 Octobre 2012/12 Octobre 2012.

GNPAnnot community annotation system applied to sugarcane bac clone sequences (W572). Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Garsmeur Olivier, Charron Carine, D'Hont Angélique, Bocs Stéphanie. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane. Charron Carine, Garsmeur Olivier, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2011. In : 9th Plant Genomics European Meetings (Plant GEM), May 04-07, 2011, Istanbul, Turkey. Sabanci University. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Plant Genomics European Meetings. 9, Istanbul, Turquie, 4 Mai 2011/7 Mai 2011.

High homologous gene conservation despite extreme autopolyploid redundancy in sugarcane (W315). D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier (collab.), Charron Carine (collab.), Zini Cyrille (collab.), Bocs Stéphanie (collab.), Jouffe Vincent (collab.), Samain Sylvie (collab.). 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

Carte R570. Garsmeur Olivier. 2010. In : Journées génétique canne à sucre, 1-2 avril 2010, Montpellier, France. s.l. : s.n., Diaporama, (6 vues) Journées Génétiques Canne à Sucre, Montpellier, France, 1 Avril 2010/2 Avril 2010.

Chado Controller a database monitor for confidentiality, quality and tracking of genomic annotations. Guignon Valentin, Droc Gaëtan, Poiron Claire, Lengellé Juliette, Garsmeur Olivier, Baurens Franc-Christophe, Bocs Stéphanie. 2010. In : Journées ouvertes biologie informatique mathématique (JOBIM), Montpellier, France, 07-09 septembre 2010. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Journées ouvertes biologie informatique mathématique, Montpellier, France, 7 Septembre 2010/9 Septembre 2010.

Comparison of seven homoeologous haplotypes (BAC) within the high polyploid sugarcane genome : [Abstract W604]. Charron Carine, Garsmeur Olivier, Jouffe Vincent, Bocs Stéphanie, Samain Sylvie, Couloux Arnaud, Droc Gaëtan, Glaszmann Jean-Christophe, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2010. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 09-13, 2010. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 18, San Diego, États-Unis, 9 Janvier 2010/13 Janvier 2010.

Characterization of the Bru1 (brown rust resistance) locus ; Distribution in modern sugarcane cultivars : [Abstract W242]. Garsmeur Olivier, Le Cunff Loïc, Royaert Stefan, Zini Cyrille, Raboin Louis-Marie, Hoarau Jean-Yves, Telismart Hugues, Hervouet Catherine, Nibouche Samuel, Costet Laurent, D'Hont Angélique. 2009. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVII Conference, San Diego, CA (USA), January 10-14, 2009. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 17, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2009/14 Janvier 2009.

Complexities of chromosome landing in a highly polyploid, aneuploid, interspecific genome: Towards map-based cloning of a resistance gene (bru1) in sugarcane (2n=ca 115). Zini Cyrille, Garsmeur Olivier, Lecunff L., Hervouet Catherine, Costet Laurent, D'Hont Angélique. 2009. In : International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, May 17 - 20, 2009, Saint-Malo, France, program and abstracts. Université de Rennes 1. Rennes : Université de Rennes 1, Résumé, 146. International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, Saint-Malo, France, 17 Mai 2009/20 Mai 2009.

Evolutionary dynamics of hom(oe)ologous haplotypes (bacs) within the highly polyploid sugarcane genome. Garsmeur Olivier, Charron Carine, Jouffe Vincent, Samain Sylvie, Hervouet Catherine, Van Sluys Marie-Anne, Sidibé-Bocs Stéphanie, D'Hont Angélique. 2009. In : International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, May 17 - 20, 2009, Saint-Malo, France, program and abstracts. Université de Rennes 1. Rennes : Université de Rennes 1, Résumé, 54. International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, Saint-Malo, France, 17 Mai 2009/20 Mai 2009.

GnpAnnot community annotation system : Features, qualifiers, values. Sidibé-Bocs Stéphanie, Legeai Fabrice, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Alaux Michael, Leroy Philippe, Fournier P., Terrier Nancy, Baurens Franc-Christophe, Garsmeur Olivier, Poiron Claire, Guignon Valentin, Simon A., Hoede Claire, Steinbach Samson Delphine, Lebrun Marc-Henri, Tagu Denis, Quesneville H., Amselem Joelle. 2009. In : 3rd International Biocuration Conference, 16-19 March 2009, Berlin, Germany. s.l. : s.n., Résumé, 66. International Biocuration Conference. 3, Berlin, Allemagne, 16 Avril 2009/19 Avril 2009.

A snapshot of the epigenetic mechanisms at work in "mantled" oil palm inflorescences. Jaligot Estelle, Gastou Marc, Beulé Thierry, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Finnegan Jean, Tregear James, Rival Alain. 2009. In : The Role Of The Environment And Epigenetic Mechanisms In Behavior, Health, And Disease. Gordon Research Conferences, Holderness, Etats-Unis, August 9-14, 2009. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Gordon Research Conferences, Holderness, États-Unis, 9 Août 2009/14 Août 2009.

Characterization of the Bru1 (brown rust resistance) locus; distribution in sugarcane cultivars. Royaert Stefan, Le Cunff Loïc, Costet Laurent, Raboin Louis-Marie, Hoarau Jean-Yves, Telismart Hugues, Hervouet Catherine, Garsmeur Olivier, Nibouche Samuel, D'Hont Angélique. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT ; CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

Comparison of hom(oe)ologous regions containing clusters of duplicated RGAs within Musa species and with rice. Sidibé-Bocs Stéphanie, Pappas Junior Georgios, Rouard Mathieu, Legeai Fabrice, Droc Gaëtan, Jouffe Vincent, Garsmeur Olivier, Cardi Céline, D'Hont Angélique, Matsumoto Takashi, Miller Roberto Neil Gerard, Baurens Franc-Christophe. 2007. In : 8 èmes Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Marseille, France, 10-12 juillet 2007. s.l. : s.n., 4 p. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM). 8, Marseille, France, 10 Juillet 2007/12 Juillet 2007.

Progress of musa (banana and plantain) genetic diversity and genome analysis at Agropolis-CIRAD. Hippolyte Isabelle, Bakry Frédéric, Carreel Françoise, Jenny Christophe, Arnaud Elizabeth, Roux Nicolas, Glaszmann Jean-Christophe, Risterucci Ange-Marie, Garsmeur Olivier, D'Hont Angélique, Baurens Franc-Christophe. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 15, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2007/17 Janvier 2007.

Analysis of Ustilago scitaminea genetic diversity using microsatellite markers provides evidence of selfing and dispersal of a unique lineage over America and Africa. Raboin Louis-Marie, Selvi Athiappan, Miranda Oliveira K., Paulet Florence, Calatayud Caroline, Zapater Marie-Françoise, Brottier Philippe, Garsmeur Olivier, Carlier Jean, D'Hont Angélique. 2006. In : VIIIth ISSCT Pathology Workshop Petit-Bourg, Guadeloupe (FWI), 23-27 January 2006, programme and abstracts. Daugrois Jean-Heinrich. ISSCT, CIRAD-CA. Réduit : ISSCT, Résumé ISSCT Pathology Workshop. 8, Petit-Bourg, Guadeloupe, 23 Janvier 2006/27 Janvier 2006.

Complexities of chromosome landing in a highly polyploid, aneuploid, interspecific genome: Towards map-based cloning of a resistance gene (Bru1) in sugarcane (2n=Ca 115). Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Pauquet Jérôme, Raboin Louis-Marie, Philippe Romain, Telismart Hugues, D'Hont Angélique. 2006. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIVth Conference, San Diego, CA (USA), January 14-18, 2006. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 14, San Diego, États-Unis, 14 Janvier 2006/18 Janvier 2006.

A step towards association studies for amylose and protein contents in sorghum. De Alencar Figueiredo Lucio Flavio, Courtois Brigitte, Deu Monique, Rami Jean-François, Fliedel Geneviève, Mestres Christian, Davrieux Fabrice, Chantereau Jacques, Garsmeur Olivier, Grabulos Joël, Fallet Véronique, Glaszmann Jean-Christophe. 2005. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIIIth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2005. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 13, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2005/19 Janvier 2005.

Construction of a sugarcane BAC contig the target resistance gene Bru1 through exploitation of synteny with sorghum and rice [Workshop : ICSB. W120]. Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Grivet Laurent, Glaszmann Jean-Christophe, D'Hont Angélique. 2004. . s.l. : s.n. Plant and Animal Genomes Conference. 12, San Diego, États-Unis, 10 Janvier 2004/14 Janvier 2004.

Genome distribution and characterization of EST derived sugarcane resistance gene analogs. Rossi Magdalena, Araujo Paula G., Paulet Florence, Garsmeur Olivier, Dias Viviane M., Chen Hui, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 9. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Genome distribution and characterization of sugarcane resistance gene analogs. Rossi Magdalena, Araujo Paula G., Garsmeur Olivier, Dias Viviane M., Paulet Florence, Chen Hui, Van Sluys Marie-Anne, D'Hont Angélique. 2003. . s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 11, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2003/15 Janvier 2003.

Map based cloning of a rust resistance gene in cultivar R570 exploiting the colinearity with sorghum and rice. Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Raboin Louis-Marie, Grivet Laurent, D'Hont Angélique. 2003. In : IVth Molecular biology workshop, Montpellier, France, 7-11 April 2003 [Abstracts]. ISSCT, Languedoc-Roussillon-Conseil régional, CIRAD-CA. Montpellier : CIRAD-CA, Résumé, 16. Molecular Biology Workshop. 4, Montpellier, France, 7 Avril 2003/11 Avril 2003.

Exploitation of sorghum molecular for map-based cloning of a major rust resistance gene in sugarcane. D'Hont Angélique, Le Cunff Loïc, Garsmeur Olivier, Paulet Florence, Begum Dilara, Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe. 2002. In : Plant, Animal and Microbe Genomes 10th Conference. Abstracts. New York : Scherago International Plant, Animal and Microbe Genomes Conference. 10, San Diego, États-Unis, 12 Janvier 2002/16 Janvier 2002.

Walk towards a major rust resistance gene in sugarcane cultivar R570 (2n=ca115). D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, Collot Jean Marc, Tomkins Jeffery P., Wing Rod A., Glaszmann Jean-Christophe. 2001. . s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 9, San Diego, États-Unis, 13 Janvier 2001/17 Janvier 2001.

Final report on the ICSB project " Map-based cloning of a rust resistance gene in sugarcane. I ". D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, Glaszmann Jean-Christophe, Begum Dilara, Wing Rod A.. 2001. Montpellier : CIRAD-CA, 18 p.

A new era for sugarcane breeding. D'Hont Angélique, Garsmeur Olivier, Rio Simon, Hervouet Catherine, Hoarau Jean-Yves. 2023. In : French sugarcane expertise. Cirad, eRcane. Montpellier : CIRAD-eRcane, 22-23.