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Screening for sugarcane yellow leaf virus in sorghum in Florida revealed its occurrence in mixed infections with sugarcane mosaic virus and a new marafivirus. Boukari Wardatou, Mollov Dimitre S., Wei Chunyan, Tang Lihua, Grinstead Samuel, Nouman Tahir Muhammad, Mulandesa Eva, Hincapie Martha, Beiriger Robert, Rott Philippe. 2021. Crop Protection, 139:105373, 9 p.

Molecular detection of sugarcane striate virus and sugarcane white streak virus and their prevalence in the Miami World Collection of sugarcane and related grasses. Boukari Wardatou, Filloux Denis, Daugrois Jean-Heinrich, Fernandez Emmanuel, Mollov Dimitre S., Kaye Claudia, Hincapie Martha, Sanchez Alexander, Wang Jianping, Roumagnac Philippe, Rott Philippe. 2020. Plant Pathology, 69 (6) : 1060-1069.

Application timing of fungicides for the management of sugarcane orange rust. Chaulagain Bhim, Raid Richard Neil, Dufault Nicholas, van Santen Edzard, Rott Philippe. 2019. Crop Protection, 119 : 141-146.

Comparison of progress of brown rust and orange rust and conditions conducive for severe epidemic development during the sugarcane crop season in Florida. Sanjel Santosh, Chaulagain Bhim, Small Ian M., Comstock Jack C., Hincapie Martha, Raid Richard Neil, Rott Philippe. 2019. Plant Disease, 103 (5) : 825-831.

Evidence of host plant specialization among the U.S. sugarcane aphid (Hemiptera: Aphididae) genotypes. Paudyal Sulochana, Armstrong John Scott, Harris-Shultz Karen, Wang Hongliang, Giles Kristopher, Rott Philippe, Payton Mark. 2019. Trends in Entomology, 15 : 47-58.

Field infection of virus-free sugarcane by Sugarcane yellow leaf virus and effect of yellow leaf on sugarcane grown on organic and on mineral soils in Florida. Boukari Wardatou, Kaye Claudia, Wei Chunyan, Hincapie Martha, LaBorde Chris, Irey Mike S., Rott Philippe. 2019. Plant Disease, 103 : 2367-2373.

Sensitivity of two sugarcane rust fungi to fungicides in urediniospore germination and detached leaf bioassays. Chaulagain Bhim, Dufault Nicholas, Raid Richard Neil, Rott Philippe. 2019. Crop Protection, 117 : 86-93.

Timing and frequency of fungicide applications for the management of sugarcane brown rust. Chaulagain Bhim, Raid Richard Neil, Rott Philippe. 2019. Crop Protection, 124:104826, 8 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas sacchari strain LMG 476. Pieretti Isabelle, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2015. Genome Announcements, 3 (2):e00146, 2 p.

The gyrase inhibitor albicidin consists of p-aminobenzoic acids and cyanoalanine. Cociancich Stéphane, Pesic Alexander, Petras Daniel, Uhlmann Stefanie, Kretz Julian, Schubert Vivien, Vieweg Laura, Duplan Sandrine, Marguerettaz Mélanie, Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Hügelland Manuela, Kemper Sebastien, Mainz Andi, Rott Philippe, Royer Monique, Süssmuth Roderich. 2015. Nature Chemical Biology, 11 : 195-197.

First report of Acidovorax avenae subsp. avenae causing sugarcane red stripe in Gabon. Girard Jean-Claude, Noëll Julie, Larbre François, Roumagnac Philippe, Rott Philippe. 2014. Plant Disease, 98 (5) : 684.

Epiphytic populations of Xanthomonas albilineans and subsequent sugarcane stalk infection are linked to rainfall in Guadeloupe. Champoiseau Patrice, Rott Philippe, Daugrois Jean-Heinrich. 2009. Plant Disease, 93 (4) : 339-346.

An OmpA family outer membrane protein is required for both disease symptom development and sugarcane stalk colonization by Xanthomonas albilineans. Rott Philippe, Fleites Laura, Marlow Gary C., Royer Monique, Gabriel Dean W.. 2009. Phytopathology, 99 (6S), Résumé, S110-S111 2009 APS Annual Meeting, Portland, États-Unis, 1 Août 2009/5 Août 2009.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. BMC Genomics, 10 (616), 15 p.

A diffusible signal factor modulates albicidin biosynthesis by Xanthomonas albilineans. Rott Philippe, Reddy S.L., Marlow Gary C., Royer Monique, Gabriel Dean W.. 2008. Phytopathology, 98 (6S), suppl. 136, Résumé, 1 p. 2008 APS Centennial Meeting, Minneapolis, États-Unis, 26 Juillet 2008/30 Juillet 2008.

Achieving sustainable cultivation of sugarcane. Volume 1: Cultivation techniques, quality and sustainability. Rott Philippe (ed.). 2017. Cambridge : Burleigh Dodds Science Publishing, 379 p. (Burleigh Dodds Series in Agricultural Science, 37) ISBN 978-1-78676-144-6

Recent progress in understanding three major bacterial diseases of sugarcane: gumming, leaf scald and ratoon stunting. Royer Monique, Pieretti Isabelle, Cociancich Stéphane, Rott Philippe. 2018. In : Achieving sustainable cultivation of sugarcane. Volume 2: Breeding, pests and diseases. Rott Philippe (ed.). Cambridge : Burleigh Dodds Science Publishing, 311-336. ISBN 978-1-78676-148-4

Controlling epidemic diseases in sugarcane : Foresting durable resistance. Daugrois Jean-Heinrich, Rott Philippe. 2008. In : Sugarcane = Canne à sucre. CIRAD-PERSYST-UPR Systèmes canniers. Montpellier : CIRAD, 2 p.

Lutter contre les maladies à caractère épidémique de la canne à sucre : favoriser la durabilité de la résistance. Daugrois Jean-Heinrich, Rott Philippe. 2008. In : Canne à sucre = Sugarcane. CIRAD-PERSYST-UPR Systèmes canniers. Montpellier : CIRAD, 2 p.

Mosaic diseases in sugarcane. Rott Philippe, Fernandez Emmanuel, Girard Jean-Claude. 2008. In : Characterization, diagnosis and management of plant viruses. Industrial crops. Rao Govind P. (ed.), Paul Khurana S.M. (ed.), Lenardon Sergio L. (ed.). Houston : Studium Press LLC, 99-110. (Plant pathogens series, 1) ISBN 1-933699-31-0

Genomics and functional studies of pathogenicity factors of Xanthomonas albilineans, an unusual xanthomonad causing sugarcane leaf scald [Abstract]. Rott Philippe. 2009. In : Xanthomonas Genomics Conference 2009, Pingree Park, USA, July 13-15 2009. s.l. : s.n., Résumé, 6. Xanthomonas Genomics Conference 2009, Pingree Park, États-Unis, 13 Juillet 2009/15 Juillet 2009.

Improvements in virus detection at CIRAD's sugarcane quarantine using both viral metagenomics and PCR-based approaches. Fernandez Emmanuel, Ferdinand Romain, Filloux Denis, Guinet Isabelle, Julian Charlotte, Rott Philippe, Roumagnac Philippe, Daugrois Jean-Heinrich. 2019. In : Proceedings of the XXX International Society of Sugar Cane Technologists Congress. ISSCT. Tucuman : ISSCT, 345-351. ISBN 978-616-92761-0-4 ISSCT Congress. 30, Tucuman, Argentine, 2 Septembre 2019/5 Septembre 2019.

Genomic characterization of sugarcane mild mosaic virus. Filloux Denis, Fernandez Emmanuel, Mollov Dimitre S., Julian Charlotte, Rott Philippe, Roumagnac Philippe, Daugrois Jean-Heinrich. 2018. In : Book of Abstracts XII ISSCT Pathology Workshop. Coimbatore : ISSCT, 26-27. ISSCT Pathology Workshop. 12, Coimbatore, Inde, 3 Septembre 2018/7 Septembre 2018.

L'analyse du polymorphisme de loci CRISPR permet de mieux comprendre l'évolution de Xanthomonas albilineans : Poster 36. Pieretti Isabelle, Marguerettaz Mélanie, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2014. In : 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. Paris : SFP, Résumé, 114. Rencontres plantes-bactéries. 11, Aussois, France, 3 Février 2014/7 Février 2014.

Towards identification of mutations associated with variation in pathogenicity among nine genetically closely related strains of Xanthomonas albilineans from Guadeloupe : Poster 38. Pieretti Isabelle, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Lefeuvre Pierre, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2014. In : 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. Paris : SFP, Résumé, 116. Rencontres plantes-bactéries. 11, Aussois, France, 3 Février 2014/7 Février 2014.

Genome sequencing of the sugarcane orange rust pathogen Puccinia kuehnii. Cardenas Daniela E., Cano Liliana M., Oppelaar T.S., Hincapie Martha, Sood Sushma, Huguet-Tapia Jose, Comstock Jack C., Rott Philippe. 2019. . Point Clear : ASSCT, 1 p. Annual Joint Meeting of the American Society of Sugar Cane Technologists Annual Meeting. 49, Point Clear, États-Unis, 26 Juin 2019/28 Juin 2019.

Sugarcane cultivars susceptible to orange rust can host sub-populations of Puccinia kuehnii capable of infecting resistant cultivars. Ecker G., Porto L., Arias R.S., Cano Liliana M., Rott Philippe, Urashima Alfredo Seiiti. 2019. In : Plant health 2019 Abstracts of presentations. American Phytopathological Society. Cleveland : The American Phytopathological Society, 171. American Phytopathological Society 2019 Annual Meeting, Cleveland, États-Unis, 3 Août 2019/7 Août 2019.

Temporal dispersal of brown and orange rust spores of sugarcane in Florida. Chaulagain Bhim, Kanaan M., Raid Richard Neil, Comstock Jack C., Rott Philippe. 2019. In : Plant health 2019 abstracts of presentations. American Phytopathological Society. Cleveland : The American Phytopathological Society, 33-34. American Phytopathological Society 2019 Annual Meeting, Cleveland, États-Unis, 3 Août 2019/7 Août 2019.

Metagenomic screening of the sugarcane virome in Florida. [P.36]. Fernandez Emmanuel, Filloux Denis, Comstock Jack C., ElSayed Abdelaleim, Roumagnac Philippe, Rott Philippe. 2015. In : 15èmes Rencontres de Virologie Végétale, Aussois, France, 18-22 janvier 2015. CIRAD ; IRD. s.l. : s.n., Résumé, 94. Rencontres de virologie végétale. 15, Aussois, France, 18 Janvier 2015/22 Janvier 2015.

Quorum sensing genes rpfF and xanB2 are not essential for albicidin production nor sugarcane colonization by Xanthomonas albilineans. Rott Philippe, Fleites Laura, Marlow Gary C., Royer Monique, Gabriel Dean W.. 2009. In : Abstracts of the XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, July 19-23, 2009, Quebec City, Canada. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 14, Québec, Canada, 19 Juillet 2009/23 Juillet 2009.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Abstracts of the XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, July 19-23, 2009, Quebec City, Canada. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 14, Québec, Canada, 19 Juillet 2009/23 Juillet 2009.

Detection of Sugarcane yellow leaf virus and Sugarcane mosaic virus in arthropods collected from corn, sorghum and sugarcane in Florida. Tang Lihua, Boukari Wardatou, Sood Sushma, Hincapie Martha, Rott Philippe. 2019. . ASCCT. Point Clear : ASCCT, Résumé, 1 p. American Society of Sugar Cane Technologists Annual Meeting (ASSCT 2019). 49, Point Clear, États-Unis, 26 Juin 2019/28 Juin 2019.

Evidence of host plant specialization among the U.S. sugarcane aphid(Hemiptera: Aphididae) genotypes. Paudyal Sulochana, Armstrong John Scott, Harris-Shultz Karen, Wang Hongliang, Giles Kristopher, Rott Philippe, Payton Mark. 2019. In : Program and proceedings of the 67th Annual Meeting of the Southwestern Branch of the Entomological Society of America. Entomological Society of America. Tulsa : ESA, Résumé, 31. Annual Meeting of the Southwestern Branch of the Entomological Society of America. 67, Tulsa, États-Unis.

Sugarcane mosaic and sorghum mosaic are caused by two different strains of Sugarcane mosaic virus in the Everglades Agricultural Area. Hincapie Martha, Sood Sushma, Mollov Dimitre S., Rott Philippe. 2019. . ASSCT. Point Clear : ASSCT, Résumé, 1 p. American Society of Sugar Cane Technologists Annual Meeting (ASSCT 2019). 49, Point Clear, États-Unis, 26 Juin 2019/28 Juin 2019.

Towards structure elucidation of albicidin, a potent DNA gyrase inhibitor produced by the plant pathogen Xanthomonas albilineans [Poster 19]. Cociancich Stéphane, Pesic Alexander, Uhlmann Stefanie, Petras Daniel, Kretz Julian, Schubert Vivien, Vieweg Laura, Duplan Sandrine, Marguerettaz Mélanie, Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Hügelland Manuela, Kemper Sebastien, Rott Philippe, Royer Monique, Süssmuth Roderich. 2014. In : Proceedings of the 4th International Symposium on Antimicrobial Peptides (AMP 2014), June 4-6, 2014, Lorient, France. s.l. : s.n., Résumé, 95. International Symposium on AntimicrobiaI Peptides. 4, Lorient, France, 4 Juin 2014/6 Juin 2014.

Visacane, the Cirad quarantine tool for the exchange of pest and disease-free sugarcane germplasm. Guinet-Brial Isabelle, Girard Jean-Claude, Roumagnac Philippe, Daugrois Jean-Heinrich, Fernandez Emmanuel, Rott Philippe. 2014. In : 5th IAPSIT International Sugar Conference (IS-2014) onThe Green Technologies for Sustainable growth of Sugar Industry in Developing Countries, November 25-28, 2014, Nanning, China. Yang-Rui Li, G.P. Rao, S. Solomon, Li-Tao Yang, Zhong Liu, Wei-Zhong He,. Naming : IAPSIT, Résumé, 363. IAPSIT International Sugar Conference IS-2014. 5, Nanning, Chine, 25 Novembre 2014/28 Novembre 2014.

La séquence complète du génome de Xanthomonas albilineans apporte un éclairage nouveau sur l'évolution des Xanthomonadaceae dont l'habitat est limité au xylème. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 90. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

Plusieurs métabolites secondaires synthétisés par des NRPSs sont impliqués dans la pathogénie de Xanthomonas albilineans. Marguerettaz Mélanie, Darroussat Marie-Josée, Duplan Sandrine, Muller Marc, Pieretti Isabelle, Girard Jean-Claude, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 113. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

Progrès récents dans la caractérisation structurale de l'albicidine, un puissant inhibiteur de l'ADN gyrase A. Cociancich Stéphane, Nachtigal Jonny, Schneider Kathrin, Duplan Sandrine, Dean Gabriel, Süssmuth Roderich, Rott Philippe, Royer Monique. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 97. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

Analyse de risques et impact sur la gestion des maladies, le cas de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre en Guadeloupe. Daugrois Jean-Heinrich, Champoiseau Patrice, Rott Philippe. 2008. In : 4ème Rencontre internationale francophone, 11 au 14 mars 2008, Le Gosier, Guadeloupe. AFCAS. Le Gosier : AFCAS, 9 p. Rencontre internationale francophone de l'AFCAS. 4, Le Gosier, Guadeloupe, 11 Mars 2008/14 Mars 2008.

Improved detection of sugarcane yellow leaf based on genetic diversity studies of Sugarcane yellow leaf virus. Girard Jean-Claude, Fernandez Emmanuel, Royer Monique, Daugrois Jean-Heinrich, Edon-Jock Carine, Rott Philippe. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT ; CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 11. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 Janvier 2008/18 Janvier 2008.

Leaf surface colonization and stalk infection by Xanthomonas albilineans of sugarcane varieties grown under high rainfall conditions. Daugrois Jean-Heinrich, Oriol Philippe, Rott Philippe. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT, CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

Modern tools for safe detection of diseases in sugarcane quarantine. Girard Jean-Claude, Fernandez Emmanuel, Royer Monique, Rott Philippe. 2008. In : 3rd International IAPIST Conference. Meeting the Challenges of Sugar Crops and Integrated Industrin Developing Countries, 11-14 September 2008, AI Arish, Egypt. s.l. : s.n., 439. International IAPIST Conference. 3, Al Arish, Égypte, 11 Septembre 2008/14 Septembre 2008.

Status of sugar cane yellow leaf disease in the French West Indies and in other islands of the Carribean. Daugrois Jean-Heinrich, Edon-Jock Carine, Fernandez Emmanuel, Girard Jean-Claude, Rott Philippe. 2008. In : Proceedings of the XXIX West Indies Sugar Technologists' Association Conference. Montego Bay : Sugar Association of the Caribbean, 6 p. West Indies Sugar Technologists' Conference. 29, Montego Bay, Jamaïque, 21 Avril 2008/28 Avril 2008.

Variation of sugar cane yellow leaf disease status in the French West Indies. Daugrois Jean-Heinrich, Edon-Jock Carine, Fernandez Emmanuel, Girard Jean-Claude, Rott Philippe. 2008. In : Advances and challenges in sugarcane biotechnology and plant pathology : proceedings : Joint ISSCT IX Plant Pathology and VI Molecular Biology Workshop, Cali, Colombia, 23-27 june 2008. ISSCT ; CENICANA. Cali : ISSCT, Résumé, 1 p. ISSCT Plant Pathology Workshop. 9, Cali, Colombie, 23 Juin 2008/27 Juin 2008.

La canne aux multiples ressources ! Hébert Anne (ed.), Goebel François-Régis (ed.), Domaingue Robert (ed.), Lebourgeois Valentine (ed.), Fovet-Rabot Cécile (collab.), Bégué Agnès (collab.), Chabalier Pierre (collab.), Chopart Jean-Louis (collab.), Dagallier Jean-Cyril (collab.), Della Mussia Sophie (collab.), D'Hont Angélique (collab.), Girard Jean-Claude (collab.), Langellier-Bellevue Pierre (collab.), Lejars Caroline (collab.), Marnotte Pascal (collab.), Martiné Jean-François (collab.), Marion Daniel (collab.), Mendez Del Villar Patricio (collab.), Oriol Philippe (collab.), Poser Christophe (collab.), Pirot Roland (collab.), Rott Philippe (collab.), Rouzière André (collab.), Todoroff Pierre (collab.), Vercambre Bernard (collab.), Volper Serge (collab.), Leveneur Carole (collab.), Magdeleine Georges (collab.), Neisson Vernant Claudine (collab.). 2008. Montpellier : CIRAD, 15 p. Salon International de l'Agriculture. 45, Paris, France, 23 Février 2008/2 Mars 2008.