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Telomere-to-telomere gapless chromosomes of banana using nanopore sequencing. Belser Caroline, Baurens Franc-Christophe, Noël Benjamin, Martin Guillaume, Cruaud Corinne, Istace Benjamin, Yahiaoui Nabila, Labadie Karine, Hribova Eva, Dolezel Jaroslav, Lemainque Arnaud, Wincker Patrick, D'Hont Angélique, Aury Jean-Marc. 2021. Communications Biology, 4:1047, 12 p.

Chromosome-scale assemblies of plant genomes using nanopore long reads and optical maps. Belser Caroline, Istace Benjamin, Denis Erwan, Dubarry Marion, Baurens Franc-Christophe, Falentin Cyril, Genete Mathieu, Berrabah Wahiba, Chèvre Anne-Marie, Delourme Régine, Deniot Gwenaëlle, Denoeud France, Duffé Philippe, Engelen Stefan, Lemainque Arnaud, Manzanares-Dauleux Maria J., Martin Guillaume, Morice Jérôme, Noël Benjamin, Vekemans Xavier, D'Hont Angélique, Rousseau-Gueutin Mathieu, Barbe Valérie, Cruaud Corinne, Wincker Patrick, Aury Jean-Marc. 2018. Nature Plants, 4 (11) : 879-887.

Evaluation of the effect of chemical or enzymatic synthesis methods on biodegradability of polyesters. Goujard Laurent, Roumanet Pierre-Jean, Baréa Bruno, Raoul Yann, Ziarelli Fabio, Le Petit Jean, Jarroux Nathalie, Ferré Elisée, Guégan Philippe. 2016. Journal of Polymers and the Environment, 24 (1) : 64-71.

Sequencing of diverse mandarin, pummelo and orange genomes reveals complex history of admixture during citrus domestication. Wu Guohong Albert, Prochnik Simon, Jenkins Jerry, Salse Jérôme, Hellsten Uffe, Murat Florent, Perrier Xavier, Ruiz Manuel, Scalabrin Simone, Terol Javier F., Takita Marco Aurélio, Labadie Karine, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Jabbari Kamel, Cattonaro Frederica, Del Fabbro Cristian, Pinosio Sara, Zuccolo Andrea, Chapman Jarrod, Grimwood Jane, Tadeo Francisco, Estornell Leandro H., Muñoz-Sanz Juan V., Ibáñez Victoria, Herrero-Ortega Amparo, Aleza Pablo, Pérez-Pérez Júlian, Ramón Daniel, Brunel Dominique, Luro François, Chen Chunxian, Farmerie William G., Desany Brian, Kodira Chinnappa, Mohiuddin Mohammed, Harkins Tim, Fredrikson Karin, Burns Paul, Lomsadze Alexandre, Borodovsky Mark, Reforgiato Giuseppe, Freitas-Astúa Juliana, Quetier Francis, Navarro Luis, Roose Mikeal L., Wincker Patrick, Schmutz Jeremy, Morgante Michele, Machado Marcos Antonio, Talon Manuel, Ollitrault Patrick, Gmitter Frederick G. Jr., Rokhsar Daniel S.. 2014. Nature Biotechnology, 32 : 656-662.

The coffee genome provides insight into the convergent evolution of caffeine biosynthesis. Denoeud France, Carretero-Paulet Lorenzo, Dereeper Alexis, Droc Gaëtan, Guyot Romain, Pietrella Marco, Chunfang Zheng, Alberti Adriana, Anthony François, Aprea Giuseppe, Aury Jean-Marc, Bento Pascal, Bernard Maria, Bocs Stéphanie, Campa Claudine, Cenci Alberto, Combes Marie-Christine, Crouzillat Dominique, Da Silva Corinne, Daddiego Loretta, De Bellis Fabien, Dussert Stéphane, Garsmeur Olivier, Gayraud Thomas, Guignon Valentin, Jahn Katharina, Jamilloux Véronique, Joët Thierry, Labadie Karine, Tianying Lan, Leclercq Julie, Lepelley Maud, Leroy Thierry, Lei-Ting Li, Librado Pablo, Lopez Loredana, Muñoz Adriana, Noël Benjamin, Pallavicini Alberto, Perrotta Gaetano, Poncet Valérie, Pot David, Priyono, Rigoreau Michel, Rouard Mathieu, Rozas Julio, Tranchant-Dubreuil Christine, VanBuren Robert, Qiong Zhang, Andrade Alan A., Argout Xavier, Bertrand Benoît, De Kochko Alexandre, Graziosi Giorgio, Henry Robert, Jayarama, Ming Ray, Nagai Chifumi, Rounsley Steve, Sankoff David, Giuliano Giovanni, Albert Victor A., Wincker Patrick, Lashermes Philippe. 2014. Science, 345 (6201) : 1181-1184.

The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants. D'Hont Angélique, Denoeud France, Aury Jean-Marc, Baurens Franc-Christophe, Carreel Françoise, Garsmeur Olivier, Noël Benjamin, Bocs Stéphanie, Droc Gaëtan, Rouard Mathieu, Da Silva Corinne, Jabbari Kamel, Cardi Céline, Poulain Julie, Souquet Marlène, Labadie Karine, Jourda Cyril, Lengellé Juliette, Rodier-Goud Marguerite, Alberti Adriana, Bernard Maria, Correa Margot, Ayyampalayam Saravanaraj, Mckain Michael R, Leebens-Mack Jim, Burgess Diane, Freeling Mike, Mbéguié-A-Mbéguié Didier, Chabannes Matthieu, Wicker Thomas, Panaud Olivier, Barbosa Jose, Hribova Eva, Heslop Harrison Pat, Habas Rémy, Rivallan Ronan, François Philippe, Poiron Claire, Kilian Andrzej, Burthia Dheema, Jenny Christophe, Bakry Frédéric, Brown Spencer, Guignon Valentin, Kema Gert H.J., Dita Miguel A., Waalwijk Cees, Joseph Steeve, Diévart Anne, Jaillon Olivier, Leclercq Julie, Argout Xavier, Lyons Eric, Almeida Ana, Jeridi Mouna, Dolezel Jaroslav, Roux Nicolas, Risterucci Ange-Marie, Weissenbach Jean, Ruiz Manuel, Glaszmann Jean-Christophe, Quetier Francis, Yahiaoui Nabila, Wincker Patrick. 2012. Nature, 488 (7410) : 213-217.

Diversité de choix et inégalités d'accès aux services publics : le paradoxe de l'écologisation de la politique agricole à la Réunion. Daré William's, Queste Jérôme. 2011. Lien Social et Politiques, RIAC (66) : 225-243.

The genome of Theobroma cacao. Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pitollat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. Nature Genetics, 43 (2) : 101-108.

Learning about interdependencies and dynamics. Daré William's, Van Paassen Annemarie, Ducrot Raphaèle, Mathevet Raphaël, Queste Jérôme, Trébuil Guy, Barnaud Cécile, Lagabrielle Erwann. 2014. In : Companion modelling: A participatory approach supporting sustainable development. Etienne, Michel (ed.). Dordrecht : Springer, 233-262. ISBN 978-94-017-8556-3

BAC sequencing analyses in the hexaploid Spartina maritima (Poaceae): Homoeolog divergence and microsynteny in the grass family. Charron Carine, Rousseau-Gueutin Mathieu, Ferreira de Carvalho Julie, Chelaifa Houda, Boutte Julien, Droc Gaëtan, Fourment Joëlle, Bellec Arnaud, Berges Hélène, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Mangenot Sophie, Wincker Patrick, Salmon Armel, D'Hont Angélique, Ainouche Malika Lily. 2014. In : International Conference on Invasive Spartina (ICI-Spartina 2014), July 7-10, 2014, Rennes, France. s.l. : s.n., 1 p. International Conference on Invasive Spartina. 4, Rennes, France, 7 Juillet 2014/10 Juillet 2014.

Sequencing the Cocoa criollo genome : An international initiative of the ICGS (International Cocoa Genome Sequencing) consortium (P050). Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Mournet Pierre, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pittolat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.

BAC sequencing analyses in the hexaploid Spartina maritima (Poaceae): Homoeolog divergence and microsynteny in the grass family. Charron Carine, Rousseau-Gueutin Mathieu, Ferreira de Carvalho Julie, Chelaifa Houda, Boutte Julien, Droc Gaëtan, Fourment Joëlle, Bellec Arnaud, Berges Hélène, Poulain Julie, Couloux Arnaud, Mangenot Sophie, Wincker Patrick, Salmon Armel, D'Hont Angélique, Ainouche Malika Lily. 2014. In : Réunion annuelle du Groupe polyploïdie-cytogénétique, Clermont-Ferrand, France, 22-23 mai 2014. s.l. : s.n., Diaporama, (23 vues) Réunion annuelle du groupe polyploïdie-cytogénétique, Clermont-Ferrand, France, 22 Mai 2014/23 Mai 2014.

Deciphering the genome structure of Theobroma cacao (W107). Argout Xavier, Salse Jérôme, Aury Jean-Marc, Guiltinan Mark J., Droc Gaëtan, Gouzy Jérôme, Allègre Mathilde, Chaparro Christian, Legavre Thierry, Maximova Siela N., Abrouk Michael, Murat Florent, Fouet Olivier, Poulain Julie, Ruiz Manuel, Roguet Yolande, Rodier-Goud Marguerite, Barbosa-Neto Jose Fernandes, Sabot François, Kudrna Dave, Ammiraju Jetty Siva S., Schuster Stephan C., Carlson John E., Sallet Erika, Schiex Thomas, Dievart Anne, Kramer Melissa, Gelley Laura, Shi Zi, Bérard Aurélie, Viot Christopher, Boccara Michel, Risterucci Ange-Marie, Guignon Valentin, Sabau Xavier, Axtell Michael J., Ma Zhaorong, Zhang Yufan, Brown Spencer, Bourge Mickael, Golser Wolfgang, Song Xiang, Clément Didier, Rivallan Ronan, Tahi G.Mathias, Akaza Joseph Moroh, Pittolat Bertrand, Gramacho Karina Peres, D'Hont Angélique, Brunel Dominique, Infante Diogenes, Kébé Ismael S., Costet Pierre, Wing Rod A., Mc Combie William Richard, Guiderdoni Emmanuel, Quetier Francis, Panaud Olivier, Wincker Patrick, Bocs Stéphanie, Lanaud Claire. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genomes Conference. 19, San Diego, États-Unis, 15 Janvier 2011/19 Janvier 2011.