Hadfield James, Linderme Daphné, Shepherd Dionne Natalie, Bezuidenhout Marion, Lefeuvre Pierre, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind. 2011. Complete genome sequence of a dahlia common mosaic virus isolate from New Zealand. Archives of Virology, 156 (12) : 2297-2301.
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Version publiée
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Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY
Résumé : Dahlia mosaic disease of the ornamental flowering plant Dahlia is caused by two caulimoviruses, dahlia mosaic virus (DMV) and dahlia common mosaic virus (DCMV). We used a rolling-circle amplification method to amplify, clone and determine for the first time the full genome sequence of a DCMV isolate from New Zealand (DCMV-NZ). Within the 7949-bp circular double-stranded retro-transcribing DCMV-NZ DNA, we identified six putative open reading frames, typical of all genomes in the family Caulimoviridae. The availability of the complete DCMV sequence provides a reference genome against which all others can be compared.
Mots-clés Agrovoc : Dahlia, Caulimovirus, séquence nucléotidique, génome
Mots-clés géographiques Agrovoc : Nouvelle-Zélande
Mots-clés complémentaires : Séquencage
Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique
Auteurs et affiliations
- Hadfield James, University of Canterbury (NZL)
- Linderme Daphné, UCT (ZAF)
- Shepherd Dionne Natalie, UCT (ZAF)
- Bezuidenhout Marion, UCT (ZAF)
- Lefeuvre Pierre, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
- Martin Darren Patrick, Institute of Infectious Diseases and Molecular Medicine (ZAF)
- Varsani Arvind, University of Canterbury (NZL)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/562752/)
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