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Complete genome sequence of a dahlia common mosaic virus isolate from New Zealand

Hadfield James, Linderme Daphné, Shepherd Dionne Natalie, Bezuidenhout Marion, Lefeuvre Pierre, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind. 2011. Complete genome sequence of a dahlia common mosaic virus isolate from New Zealand. Archives of Virology, 156 (12) : 2297-2301.

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact
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Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY

Résumé : Dahlia mosaic disease of the ornamental flowering plant Dahlia is caused by two caulimoviruses, dahlia mosaic virus (DMV) and dahlia common mosaic virus (DCMV). We used a rolling-circle amplification method to amplify, clone and determine for the first time the full genome sequence of a DCMV isolate from New Zealand (DCMV-NZ). Within the 7949-bp circular double-stranded retro-transcribing DCMV-NZ DNA, we identified six putative open reading frames, typical of all genomes in the family Caulimoviridae. The availability of the complete DCMV sequence provides a reference genome against which all others can be compared.

Mots-clés Agrovoc : Dahlia, Caulimovirus, séquence nucléotidique, génome

Mots-clés géographiques Agrovoc : Nouvelle-Zélande

Mots-clés complémentaires : Séquencage

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations

  • Hadfield James, University of Canterbury (NZL)
  • Linderme Daphné, UCT (ZAF)
  • Shepherd Dionne Natalie, UCT (ZAF)
  • Bezuidenhout Marion, UCT (ZAF)
  • Lefeuvre Pierre, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
  • Martin Darren Patrick, Institute of Infectious Diseases and Molecular Medicine (ZAF)
  • Varsani Arvind, University of Canterbury (NZL)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/562752/)

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