The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics

Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

https://doi.org/10.1016/j.cpb.2016.12.002

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Résumé : The South Green Web portal (http://www.southgreen.fr/) provides access to a large panel of public databases, analytical workflows and bioinformatics resources dedicated to the genomics of tropical and Mediterranean crops. The portal contains currently about 20 information systems and tools and targets a broad range of crops such as Banana, Cacao, Cassava, Coconut, Coffee, Grape, Rice and Sugarcane.

Mots-clés Agrovoc : ressource végétale, ressource génétique végétale, plante de culture, zone tropicale, bioinformatique, système d'information, Musa, Theobroma cacao, Manihot esculenta, Coffea, Cocos nucifera, Oryza sativa, Vitis vinifera, Saccharum officinarum, banque de données, gène, génomique, amélioration des plantes