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The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics

Guignon Valentin, Hueber Yann, Rouard Mathieu, Bocs Stéphanie, Couvin David, De Lamotte Frédéric, Droc Gaëtan, Dufayard Jean François, El Hassouni Nordine, Farcy Cédric, Gkanogiannis Anestis, Hamelin Chantal, Larivière Delphine, Martin Guillaume, Ortega Enrique, Pitollat Bertrand, Pointet Stéphanie, Ruiz Manuel, Gautier Sarah, Summo Marilyne, This Dominique, Ravel Sébastien, Larmande Pierre, Monat Cécile, Sabot François, Tando Ndomassi, Tranchant-Dubreuil Christine, Sempere Guilhem, Dereeper Alexis. 2016. The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics. Current Plant Biology, 7-8 : 6-9.

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Résumé : The South Green Web portal (http://www.southgreen.fr/) provides access to a large panel of public databases, analytical workflows and bioinformatics resources dedicated to the genomics of tropical and Mediterranean crops. The portal contains currently about 20 information systems and tools and targets a broad range of crops such as Banana, Cacao, Cassava, Coconut, Coffee, Grape, Rice and Sugarcane. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Ressource végétale, Ressource génétique végétale, Plante de culture, Zone tropicale, Bioinformatique, Système d'information, Musa, Theobroma cacao, Manihot esculenta, Coffea, Cocos nucifera, Oryza sativa, Vitis vinifera, Saccharum officinarum, Banque de données, Gène, génomique, Amélioration des plantes

Mots-clés géographiques Agrovoc : Région méditerranéenne

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
C30 - Documentation et information
U10 - Méthodes mathématiques et statistiques

Axe stratégique Cirad : Axe 1 (2014-2018) - Agriculture écologiquement intensive

Auteurs et affiliations

  • Guignon Valentin, Bioversity International (FRA)
  • Hueber Yann, Bioversity International (ITA)
  • Rouard Mathieu, Bioversity International (FRA)
  • Bocs Stéphanie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Couvin David, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • De Lamotte Frédéric, INRA (FRA)
  • Droc Gaëtan, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Dufayard Jean François, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • El Hassouni Nordine, INRA (FRA)
  • Farcy Cédric, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Gkanogiannis Anestis, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Hamelin Chantal, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Larivière Delphine, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Martin Guillaume, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0002-1801-7500
  • Ortega Enrique, INRA (FRA)
  • Pitollat Bertrand, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Pointet Stéphanie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Ruiz Manuel, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (COL) ORCID: 0000-0001-8153-276X
  • Gautier Sarah, INRA (FRA)
  • Summo Marilyne, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • This Dominique, Montpellier SupAgro (FRA)
  • Ravel Sébastien, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
  • Larmande Pierre, IRD (FRA)
  • Monat Cécile, IRD (FRA)
  • Sabot François, IRD (FRA)
  • Tando Ndomassi, IRD (FRA)
  • Tranchant-Dubreuil Christine, IRD (FRA)
  • Sempere Guilhem, CIRAD-BIOS-UMR INTERTRYP (FRA)
  • Dereeper Alexis, IRD (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/582681/)

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[ Page générée et mise en cache le 2018-12-03 ]