Massé Delphine, Filloux Denis, Candresse Thierry, Massart Sébastien, Marals Armelle, Verdin Eric, Cassam Nathalie, Fernandez Emmanuel, Roumagnac Philippe, Teycheney Pierre-Yves, Lefeuvre Pierre, Lett Jean-Michel. 2022. Identification of a novel vitivirus from pineapple in Reunion Island. Archives of Virology, 167 : 2355-2357.
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Résumé : We report the complete genome sequence of a novel member of the genus Vitivirus (family Betaflexiviridae, subfamily Trivirinae) infecting pineapple. The complete genome sequence of this virus was obtained from total RNA extracted from pineapple leaf samples collected in Reunion Island, using a combination of high-throughput sequencing technologies. The viral genome is 6,757 nt long, excluding the poly(A) tail, and shares all the hallmarks of vitiviruses. Phylogenetic analysis performed on the replication-associated protein and capsid protein gene sequences unambiguously place this new virus, for which we propose the name “pineapple virus A”, in the genus Vitivirus.
Mots-clés Agrovoc : Vitivirus, Ananas (genre), génome, séquence nucléotidique, phylogénie, séquençage à haut débit
Mots-clés géographiques Agrovoc : La Réunion, France
Mots-clés complémentaires : viral genomes (en), Pineapple Virus A
Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes
Agences de financement européennes : European Regional Development Fund
Auteurs et affiliations
- Massé Delphine, ANSES-LSV (REU)
- Filloux Denis, CIRAD-BIOS-UMR PHIM (FRA)
- Candresse Thierry, INRAE (FRA)
- Massart Sébastien, GxABT (BEL)
- Marals Armelle, Université de Bordeaux (FRA)
- Verdin Eric, INRAE (FRA)
- Cassam Nathalie, ANSES-LSV (REU)
- Fernandez Emmanuel, CIRAD-BIOS-UMR PHIM (FRA)
- Roumagnac Philippe, CIRAD-BIOS-UMR PHIM (FRA) ORCID: 0000-0001-5002-6039
- Teycheney Pierre-Yves, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0002-9754-0745
- Lefeuvre Pierre, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
- Lett Jean-Michel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) - auteur correspondant
Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/601565/)
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