Whole genome sequencing and phylogenetic characterization of a novel bat-associated picornavirus-like virus with an unusual genome organization

Temmam Sarah, Hul Vibol, Bigot Thomas, Bessaud Maël, Chrétien Delphine, Hoem Thavry, Gorman Christopher, Duong Veasna, Dussart Philippe, Cappelle Julien, Eloit Marc. 2020. Whole genome sequencing and phylogenetic characterization of a novel bat-associated picornavirus-like virus with an unusual genome organization. Infection, Genetics and Evolution, 78:104130, 5 p.

https://doi.org/10.1016/j.meegid.2019.104130

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact

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Quartile : Q3, Sujet : INFECTIOUS DISEASES

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Anthropologie-Ethnologie

Résumé : The order Picornavirales is one of the most important viral orders in terms of virus diversity and genome organizations, ranging from a mono- or bi-cistronic expression strategies to the recently described poly-cistronic Polycipiviridae viruses. We report here the description and characterization of a novel picorna-like virus identified in rectal swabs of frugivorous bats in Cambodia that presents an unusual genome organization. Kandabadicivirus presents a unique genome architecture and distant phylogenetic relationship to the proposed Badiciviridae family. These findings highlight a high mosaicism of genome organizations among the Picornavirales.

Mots-clés Agrovoc : Picornavirales, vecteur de maladie, Chiroptera, génome, hôte, phylogénie

Mots-clés libres : Bats, Rectal swabs, Picornavirales, Phylogeny, Nucleotide composition analysis

Classification Agris : L73 - Maladies des animaux
L10 - Génétique et amélioration des animaux

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Auteurs et affiliations