Genome resources of three west African strains of Pantoea ananatis causing bacterial blight and grain discoloration of rice

Kini Kossi, Lefeuvre Pierre, Poulin Lucie, Silué Drissa, Koebnik Ralf. 2020. Genome resources of three west African strains of Pantoea ananatis causing bacterial blight and grain discoloration of rice. Phytopathology, 110 (9) : 1500-1502.

https://doi.org/10.1094/PHYTO-03-20-0091-A

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact

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Quartile : Q1, Sujet : PLANT SCIENCES

Liste HCERES des revues (en SHS) : oui

Thème(s) HCERES des revues (en SHS) : Psychologie-éthologie-ergonomie

Résumé : Members of the genus Pantoea have been reported as pathogens for many economically important crops, including rice. Little is known about their host−pathogen interactions at the molecular level and the lack of comprehensive genome data impedes targeted breeding strategies toward resistant rice cultivars. Here, we describe the structural and functional annotation of the draft genome sequences of three rice-pathogenic Pantoea ananatis strains, ARC272, ARC310, and ARC311, which were isolated in Burkina Faso, Togo, and Benin, respectively. The genome sequences of these strains will help in developing molecular diagnostic tools and provide new insight into common traits that may enable P. ananatis to infect rice.

Mots-clés Agrovoc : agent pathogène, génome, relation hôte pathogène, pathologie végétale, Oryza sativa

Mots-clés géographiques Agrovoc : Burkina Faso, Togo, Bénin

Mots-clés complémentaires : Pantoea ananatis, Séquencage

Mots-clés libres : Bacteriology, Erwiniaceae, Genome sequence, Pantoea ananatis, Rice pathogen, West Africa

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
H50 - Troubles divers des plantes

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Auteurs et affiliations